• 한국컴퓨터정보학회논문지
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• 제21권1호
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• pp.107-113
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• 2016

In this paper, by managing the biometric data is changed with the passage of time, a systematic and scientifically propose a framework to increase the bio-vector generation efficiency of the smart health care. Increasing the development of human life as a medicine and has emerged smart health care according to this. Organic and efficient health management becomes possible to generate a vector when the biological domain to the wireless communication infrastructure based on the measurement of the health status and to take action in accordance with the change of the physical condition. In this paper, we propose a framework to create a bio-vector that contains information about the current state of health of the person. In the proposed framework, Bio vectors may be generated by collecting the biometric data such as blood pressure, pulse, body weight. Biometric data is the raw data from the bio-vector. The scope of the primary data can be set to active. As the collecting biometric data from multiple items of the bio-recognition vectors may increase. The resulting bio-vector is used as a measure to determine the current health of the person. Bio-vector generating the proposed framework, it can aid in the efficiency and systemic health of healthcare for the individual.

• 대한전기학회:학술대회논문집
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• 대한전기학회 2007년도 심포지엄 논문집 정보 및 제어부문
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• pp.423-425
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• 2007

In this paper, Medium Access Control(MAC) protocol designed for Wireless Body area Sensor Network(Bio-MAC) is proposed, Because in WBSN, the number of node is limited and each node has different characteristics. Also, reliability in transmitting vital data sensed at each node and periodic transmission should be considered so that general MAC protocol cannot satisfy such requirements of biomedical sensors in WBSN. Bio-MAC aims at optimal MAC protocol in WBSN. For this, Bio-MAC used Pattern -SuperFrame, which modified IEE E 802.15.4-based SuperFrame structurely. Bio-MAC based on TDMA uses Medium Access-priority and Pattern eXchange -Beacon method for dynamic slot allocation by considering critical sensing data or power consumption level of sensor no de etc. Also, because of the least delay time. Bio-MAC is suitable in the periodic transmission of vital signal data. The simulation results demonstrate that a efficient performance in WBSN can be achieved through the proposed Bio-MAC.

• 정보처리학회논문지:소프트웨어 및 데이터공학
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• 제2권2호
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• pp.97-106
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• 2013

인간 게놈 프로젝트의 완성 이후 유전체 분석 비용은 매우 빠르게 감소하고 있다. 이에 따라 인간 유전체 분석 요구가 급증할 것으로 예상된다. 인간 유전체 분석과 같은 대규모 바이오 데이터 분석을 고속으로 수행하기 위해서는 비IT 전문가들이 다양한 특성의 바이오 응용들을 고성능컴퓨팅 시스템을 통해 효과적으로 실행할 수 있어야 한다. 이를 위해서는 여러 응용들이 조합되어 순서를 갖고 실행되어야 하는 바이오 응용들을 워크플로우 형태로 쉽게 정의할 수 있어야 하며, 이 워크플로우를 HPC 클러스터 시스템에서 최적 자원을 할당 받아 분산 병렬 수행시켜야 한다. 이를 통해 바이오 데이터 분석 성능과 응답시간의 개선을 기대할 수 있다. 본 논문에서는 HPC 환경에 익숙하지 않은 비IT 바이오 연구자들이 쉽게 바이오 데이터 분석을 할 수 있도록 바이오 워크플로우를 쉽게 정의하고 실행할 수 있는 바이오 특화된 워크플로우 기반 대규모 데이터 분석 시스템을 제안한다.

• 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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• 제34권7호
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• pp.667-680
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• 2007

생체데이타 프로세싱이란 인간개체로부터 얻을 수 있는 고유의 생체 신호를 이용하여 다양한 목적으로 사용하는 것으로, 최근 이에 대한 요구가 높아지고 있다. 생체데이타는 도메인의 특성상, 클래스의 수는 많고 해당 클래스 내의 데이타는 상당히 제한적일 수 있어서 그만큼 데이타 내에 포함된 노이즈에 민감하게 된다. 따라서 기존의 패턴 인식과 분류 방법을 그대로 적용하여 개발된 시스템의 경우는 높은 일반화 성능을 기대하기 힘들다. 이를 해결하기 위해 본 논문에서는 생체데이타가 가지는 특성을 고려하여 각 클래스 고유의 특성에 영향을 미치는 클래스 요인과 노이즈와 같이 전체 데이타에 영향을 미치는 환경 요인으로 구성된 변형된 팩터 분석 모델로 생체데이타 생성 모델을 정의한다. 이를 바탕으로 분류에 필요한 데이타간 이격(inter-data discrepancy) 정보를 추출하고 새로운 유사도 함수를 정의하여 분류기에 적용한다. 제안하는 방법은 분류 대상이 되는 클래스의 정보 팔용을 극대화 하여 적은 수의 데이터로부터 노이즈에 강인한 결과를 얻을 수 있다. 실제 생체데이타를 적용한 실험에서 제안하는 방법이 기존의 방법 보다 우수한 분류 성능을 보임을 확인할 수 있었다.

• Journal of Information Processing Systems
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• 제15권3호
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• pp.645-654
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• 2019

The purpose of this study was to collect and analyze personal bio data and social network services (SNS) data, derive user preference and user life pattern, and propose intuitive and precise user modeling. This study not only tried to conduct eye tracking experiments using various smart devices to be the ground of the recommendation system considering the attribute of smart devices, but also derived classification preference by analyzing eye tracking data of collected bio data and SNS data. In addition, this study intended to combine and analyze preference of the common classification of the two types of data, derive final preference by each smart device, and based on user life pattern extracted from final preference and collected bio data (amount of activity, sleep), draw the similarity between users using Pearson correlation coefficient. Through derivation of preference considering the attribute of smart devices, it could be found that users would be influenced by smart devices. With user modeling using user behavior pattern, eye tracking, and user preference, this study tried to contribute to the research on the recommendation system that should precisely reflect user tendency.

• Genomics & Informatics
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• 제7권1호
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• pp.49-51
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• 2009

Although abundant biology data have been accumulated in public biology databases, such as GenBank and PIR, few easy-interface services are provided for users to access or update them. We have developed a system, named BioStore, that is composed of several programs to aid users to not only access public data but also share their own data easily. The service can be used for maintaining a local database as a repository of raw data files of several public databases and distributing the data files to other users. Currently, BioStore manipulates major bio-databases and will expand to include more databases and more useful interfaces.

• Molecules and Cells
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• 제43권3호
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• pp.286-297
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• 2020

Mammalian patatin-like phospholipase domain containing proteins (PNPLAs) play critical roles in triglyceride hydrolysis, phospholipids metabolism, and lipid droplet (LD) homeostasis. PNPLA7 is a lysophosphatidylcholine hydrolase anchored on the endoplasmic reticulum which associates with LDs through its catalytic region (PNPLA7-C) in response to increased cyclic nucleotide levels. However, the interaction of PNPLA7 with LDs through its catalytic region is unknown. Herein, we demonstrate that PNPLA7-C localizes to the mature LDs ex vivo and also colocalizes with pre-existing LDs. Localization of PNPLA7-C with LDs induces LDs clustering via non-enzymatic intermolecular associations, while PNPLA7 alone does not induce LD clustering. Residues 742-1016 contains four putative transmembrane domains which act as a LD targeting motif and are required for the localization of PNPLA7-C to LDs. Furthermore, the N-terminal flanking region of the LD targeting motif, residues 681-741, contributes to the LD targeting, whereas the C-terminal flanking region (1169-1326) has an anti-LD targeting effect. Interestingly, the LD targeting motif does not exhibit lysophosphatidylcholine hydrolase activity even though it associates with LDs phospholipid membranes. These findings characterize the specific functional domains of PNPLA7 mediating subcellular positioning and interactions with LDs, as wells as providing critical insights into the structure of this evolutionarily conserved phospholipid-metabolizing enzyme family.

• BMB Reports
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• 제46권6호
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• pp.305-309
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• 2013

The determination of relatedness between individuals in a family is crucial in analysis of common complex diseases. We present a method to infer close inter-familial relationships based on SNP genotyping data and provide the relationship coefficient of kinship in Korean families. We obtained blood samples from 43 Korean individuals in two families. SNP data was obtained using the Affymetrix Genome-wide Human SNP array 6.0 and the Illumina Human 1M-Duo chip. To measure the kinship coefficient with the SNP genotyping data, we considered all possible pairs of individuals in each family. The genetic distance between two individuals in a pair was determined using the allele sharing distance method. The results show that genetic distance is proportional to the kinship coefficient and that a close degree of kinship can be confirmed with SNP genotyping data. This study represents the first attempt to identify the genetic distance between very closely related individuals.

• 전자공학회논문지
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• 제50권10호
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• pp.21-29
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• 2013

본 논문에서는 U-헬스케어를 위한 무선 매쉬 네트워크에서 고 신뢰성 있는 응급 생체 데이터 관리를 위한 정책기반의 신원 인증 및 전송 구조를 제시한다. U-헬스케어 모니터링 서비스에서 모니터링 되는 응급 생체 데이터는 생명과 직결되기 때문에 고 신뢰성 있는 생체 데이터 관리 뿐만 아니라 데이터 전송 관리가 요구된다. 좀 더 구체적으로, 측정된 생체 데이터의 신원 인증 기술과 인증된 생체 데이터의 개인 맞춤형 응급 상태 진단 기술, 응급 데이터 전송 기술이 무엇보다 중요하다. 이를 위해, 본 논문에서는 무선 매쉬 네트워크 환경에서 IEEE 11073 PHD를 확장한 정책기반 신원 인증 관리 구조 및 프로토콜, 고 신뢰성 있는 관리를 위한 정책 기반 응급 데이터 관리 구조, 신뢰성 있는 데이터 전송을 위한 무선 매쉬 네트워크 기반의 Resilient 라우팅 프로토콜을 제시한다.

• 한국생물정보학회:학술대회논문집
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• 한국생물정보시스템생물학회 2001년도 제2회 생물정보 워크샵 (DNA Chip Bioinformatics)
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• pp.151-163
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• 2001

- Overview of Bioinformatics and vision of Samsung SDS on it - Overview of Bio Chip and its market - Product roadmap with "Expert system for DNA chip data " - "UniBIO "as an integrated package of DNA chip data analysis - Demo of UniBIO