• 한국식품영양과학회지
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• 제31권1호
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• pp.1-6
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• 2002

강낭콩을 가열한 후 B. subtilis ATCC 51189로 발효시켜 새로운 활성 단백질의 생성여부를 확인하였다. 생강낭콩의 수용성 단백질은 열처리에 의하여 감소하였으며, 발효과정에서 단백질의 양은 변화하지 않았으나, 새로운 아미노산이 합성되었다. 생강낭콩의 수용성 단백질(raw protein, RP)은 분자량 118 kDa의 PHA(phytohemagglutinin)의 전형적인 모습을 보였으나, 열처리한 단백질(heated protein, HP)의 경우, RP의 band는 사라지고, 저분자 peptide로 변화되었으며, 발효과정에 의하여 분자량 18.0 kDa의 새로운 단백질(fermented protein, FP)이 생성된 것을 확인하였다. 또한, RP는 128 HU, HP는 4HU, FP는 32HU의 적혈구응집효과를 보였으며, 위암세포(SNU-1)에 대하여 RP 및 FP는 비교적 높은 농도($IC_{50}$/ $\mu\textrm{g}$/mL)에서 항암활성을 보였다. 그리고, RP 및 FP의 경우 1 $\mu\textrm{g}$/mL에서 림프구 증식효과를 보였고, IFN-${\gamma}$, IL-12의 분비를 촉진하였다. 그러나 HP는 항암효과, 림프구 증식효과, cytokine의 분비촉진효과를 보이지 않았다. 따라서, 강낭콩 lectin은 가열에 의하여 활성물질이 파괴되나, B. subtilis에 의한 발효과정에서 새로운 cytokine 분비촉진물질이 생성되는 것을 확인할 수 있었다.

• 미생물학회지
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• 제34권3호
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• pp.87-90
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• 1998

우리 나라의 전통 대두발효식품인 된장으로부터 혈전용해능을 가진 미생물을 분리하였다. 그 중 5종류의 균주를 Bergey's manual of systematic bacteriology에 의거하여 동정한 결과 Bacillus sp. 균주로 밝혀졌다. 분리된 Bacillus 속 미생물을 효소 유도배지에서 배양한 결과 B. amyloliquefaciens는 2.46 plasmin unit/ml, B pantothenticus는 3.82 plasmin unit/ml 의 혈전용해능을 가지고 있었고, B. subtilis는 4.94 plasmin unti/ml의 높은 혈전용해효소 생산능을 보여주었다. 분리 균주에 의하여 생산된 세포외 단백질을 SDS-PAGE와 reverse fibrin zymogram 활성측정법에 의해 확인한 결과 각 균주별로 서로 다른 혈전용해효소가 생산되었음을 확인하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제16권5호
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• pp.389-392
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• 1988

Escheriachia coli pSL 2-1 clone은 Bacillus sphaericus 1593의 모기살충 유전자를 클로닝한 재조합 DNA이다. 이 클론이 생산하는 살충독소 단백질의 분자량을 SDS-polyacrylamide gel을 이용하여 측정했다. B. sphaericus 1593균이 생산하는 독소결정체를 분리하여 전기영동을 한 결과는 6개의 단백질밴드(43, 58, 64, 100, 113, 130Kd)가 형성되었으나, 독소결정체를 알칼리 pH로 용해하여 전기영동을 하면 2개의 단백질 밴드(43과 64Kd)만이 나타났다. 그러나 대장균 pSL2-1균이 생산하는 독소단백질을 Sephadex G-200으로 정제하여 모기유충에 살충력이 있는 단백질을 전기영동한 결과는 42Kd만이 나타났다. LC50은 2 $\mu\textrm{g}$/$m\ell$이었다. B. sphaericus와 pSL2-1 clone 생산하는 살충단백질은 42Kd 단백질인 것으로 생각된다.

• 생명과학회지
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• 제28권12호
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• pp.1416-1423
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• 2018

Biotin에 강한 결합 친화력($K_D=10^{-14}M$)과 함께 streptavidin의 tetramer 특징은 VHH 항체를 streptavidin에 융합시키게 하여 biotinylated horseradish peroxidase를 사용하는ELISA 와Western blot analysis 등의 면역분석법에서 VHH 항체의 항원결합력을 증가시키는데 응용 가능하다. 이를 응용하기 위해 우리는 Streptomyces avidinii 염색체 DNA로부터 PCR을 통해 streptavidin유전자를 증폭하고 이를 green fluorescent protein항원에 특이적으로 결합하는 8B9 VHH 항체유전자에 융합시켰다. 대장균에서 수용성 융합단백질로 발현시키기 위해 pUC119 플라스미드에 기초한 발현시스템을 사용하였다. 즉 lacZ promoter를 사용하여 IPTG에 의해 단백질발현을 유도하게 하였으며, 아미노말단에 pelB leader를 두어 발현된 단백질의 periplasmic space로 이동하게 하여 수용성 단백질형태의 분비를 촉진하였으며 카르복시말단에 6개의 polyhistidine tags를 두어 $Ni^+$-NTA-agarose column을 사용하여 발현된 단백질을 정제하였다. Streptavidin이 biotin에 강하게 결합함으로 대장균에 독성을 나타냄에도 불구하고 본 수용성 융합단백질은 성공적으로 발현되었다. SDS-PAGE에서 가열하는 경우 변성되어 30.6 kDa를, 가열하지 않는 경우에는 자연 상태의 122.4 kDa을 나타내었다. 이는 8B9 VHH항체에 융합된 streptavidin moiety에 의해 monomer subunit가 비공유결합으로 tetramerization됨을 제시해준다. 또한 본 융합단백질은 ELISA와 Westernblot analysis에서 보여진 것처럼 parental streptavidin과 유사한 biotin결합력과 green fluorescent protein항원 결합력을 모두 나타내었다. 결론적으로 streptavidin에 융합된 8B9 VHH 항체형태의 융합단백질은 대장균에서 수용성 tetramer로 성공적으로 발현 및 정제되었으며 biotin과 green fluorescent protein 항원에 동시에 결합함으로써 tetrameric and bifunctional VHH 항체제조의 가능성을 제시해주었다.

• 생명과학회지
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• 제9권6호
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• pp.722-727
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• 1999

본 연구는 연어 뇌 연접의 단백질구성에 대한 기초연구로서, 기억형성에 중요한 역활을 하는 NMDA 수용체의 분포와 PTK에 의한 인산화에 대하여 조사하였다. 본 실험에 사용한 연어 뇌의 PSD 분획에서는 Coomassie로 염색할 경우 20여개 분명한 단백질띠를 확인할 수 있었으며, 소량으로 존재하여 전체적으로 도말되어 보이는 펩타이드의 수는 알 수 없었다. 이들 중 180kD 크기의 단백질은 phosphotyrosine 특이성 항체에 상대적으로 잘 인식이 되었다. 또한 이 180 kDa의 단백질들은 쥐에 있어서의 NR2A 및 NR2B의 위치인 분자량 약 180kD의 위치와 동일한 것으로 보아 연어에 있어서도 후각기능에 관계하는 NR2A 및 NR2B가 존재함을 추정할 수 있다.

• 한국식품과학회지
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• 제23권6호
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• pp.656-660
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• 1991

해바라기 종실제품(종실, 착유박, 농축단백, 분리단백)의 수분흡착열을 $10,\;20,\;30^{\circ}C$에서 측정한 등습곡선(isostere)으로부터 구하였고, 수분함량에 따른 흡착열의 변화를 Hunter 방정식에 의거하여 해석하였다. Hunter 방정식에 의한 예측치는 실측결과와 잘 일치하였으며 단백질함량이 증가할수록 정확도가 높았다. 흡착열은 수분함량이 높을수록 감소하였으며, 단백질함량이 높을수록 증가하였다. 해바라기종실의 흡착열은 건물기준 수분함량 4-12%에서 11.8-10.6 kcal/mole이었으며 분리 단백의 경우 수분함량 6-20%에서 12.4-11.0kcal/mole 이었다.

• 아시안잔디학회지
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• 제4권1호
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• pp.12-23
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• 1990

The chlorophyll-protein complexes were separated from thylakoid membranes of Spinach oleracea and Zoysia japonica by two gel Systems of LiDodSO4-PAGE and LiDodSo4/Urea- PAGE under nondenaturing conditions. Seven chlorophyll~protein complexes of CPI*, CPI, CPII*. CP47, CP43, CP29 and CPII were fractionated from both S,oleracea and Zjaponica by LiDodSO4-PAGE. CPI, CP47 and CP43 contained more chlorophyll a than chlorophyll b. The patterns of their absorption spectra at room temperature were similliar to that of chlorophyll a, judging by their UV-spedtroscopy. On the other hand, CPII* and CPII contained approximately equim-olar quantities of chlorophyll a and b. Additional five chlorophyll-protein complexes not separated in the LiDodSO4-PAGE system were electrophoretically isolated from both S, oleracea and Zjaponica by LiDodSO4/Urca-PAGE. The chlorophyll-protein complex just above LRCII $\alpha$in the gel appears CCII-RC separeted recently. 23 kDa and 20 kDa cho-protein complexes is probably LHCIa and LHCIb as judged from their molecular weight. Two novel chlorophyll~protein complexes designated "CPI7" and "CPI6" were fractionate by this gel system. Their molecular weights respectively. Although the stoichiometry of their components and their roles in thylakoid membranes are not apparant, It is thought that they are another kinds of LHCI.other kinds of LHCI.

• 한국균학회지
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• 제23권2호통권73호
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• pp.121-128
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• 1995

Agrocybe cylindracea의 톱밥배양 균사체로부터 항암효과가 있는 것으로 알려진 단백다당류를 분리, 정제하였으며 그 특성을 조사하였다. Agrocybe cylindracea 균사체로부터 열수추출한 조단백다당류(Fr.CB)의 수율은 ethanol 농도가 95%일 때 2.974 g으로서 원재료인 톱밥균사체를 기준으로 0.74%였다. 이 조단백다당류(Fr.CB)를 박막여과, ion exchange chromatography, 그리고 gel filtration에 의해 정제하였다. 조단백다당류 Fr.CB를 박막여과하여 분획한 결과 분자량 30만 이상의 분획(Fr.B)이 38.6%를 차지하여 고분자 단백다당류가 주성분임을 알 수 있었다. Fr.B를 ion exchange chromatography로 분리한 결과 2개의 분획이 17.4%(Fr.B-1), 10.3%(Fr.B-2)의 수율로 얻어졌다. 이들 분획을 농축한 다음 gel filtration한 결과 거의 순수한 단일 단백다당류의 peak를 얻을 수 있었다. Fr.B-1을 분리하여 얻은 $Fr.B-1-{\beta}$ 분획의 수율은 Fr.B-1을 기준으로 42.5%였다. 항암효과의 가능성이 가장 높은 것으로 판단되는 최종 정제된 분획인 $Fr.B-1-{\beta}$의 분자량은 710 KDa 부근이었으며 단당류의 조성을 HPLC로 분석한 결과, glucose가 주성분이었고 그외 fucose, galactose도 검출되었다. 또한 아미노산 조성을 분석한 결과 glutamic acid, alanine이 비교적 많이 검출되었고 cysteine은 검출되지 않았다.

• Interdisciplinary Bio Central
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• 제1권2호
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• pp.8.1-8.6
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• 2009

Introduction: It is a challenge to design a protein score function which stabilizes the native structures of many proteins simultaneously. The coarse-grained description of proteins to construct the pairwise-contact score function usually ignores the backbone directionality of protein structures. We propose a new two-body score function which stabilizes all native states of 1,006 proteins simultaneously. This two-body score function differs from the usual pairwise-contact functions in that it considers two adjacent amino acids at two ends of each peptide bond with the backbone directionality from the N-terminal to the C-terminal. The score is a corresponding propensity for a directional alignment of two adjacent amino acids with their local environments. Results and Discussion: We show that the construction of a directional adjacency-score function was achieved using 1,006 training proteins with the sequence homology less than 30%, which include all representatives of different protein classes. After parameterizing the local environments of amino acids into 9 categories depending on three secondary structures and three kinds of hydrophobicity of amino acids, the 32,400 adjacency-scores of amino acids could be determined by the perceptron learning and the protein threading. These could stabilize simultaneously all native folds of 1,006 training proteins. When these parameters are tested on the new distinct 382 proteins with the sequence homology less than 90%, 371 (97.1%) proteins could recognize their native folds. We also showed using these parameters that the retro sequence of the SH3 domain, the B domain of Staphylococcal protein A, and the B1 domain of Streptococcal protein G could not be stabilized to fold, which agrees with the experimental evidence.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제13권2호
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• pp.157-162
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• 1985

Bacillus sphaericus 1593 K-5 균주의 Culex pallens 모기유충에 대한 LC$_{50}$(cells/$m\ell$)은 2.6$\times$$10^2$이었다. B. sphericus 1593 K-5 Spo-D 1216 균주는 Culex pallens 모기유충에 대해 독성을 나타내지 않았다. B. sphaericus 1593 K-5 균주는 포자가 형성되어 가면서 독성이 증가함을 보였다. B. sphaericus 1593 K-5 균주의 세포질을 Sep-hadex G-100 컬럼상에서 gel permeation 크로마토그래피를 행하였을 때 3개의 단백질 분획을 보였으며 이 중 한 분획이 활성분획있다. 이 활성 분획을 DEAE-Sepha dex A-50 컬럼상에서 ion-exchange 크로마토그래피를 행하였을 때 4개의 단백질 분획을 보였으며 이중 한 분획이 활성분획이었다. B. sphericus 1593 K-5 Spo-D1216균주의 세포질은 Sephadex G-100 컬럼상에서 gel permeation 크로마토그래피를 행하였을 때 2개의 단백질 분획을 보였으며 이 분획 모두가 활성이 없음이 생체실험 결과 밝혀졌다.다.