• 한국미생물·생명공학회지
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• 제40권4호
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• pp.333-338
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• 2012

지의류는 곰팡이, 조류 및 남조균류의 공생체이다. 본 연구팀은 최근 북극 지의류로부터 분리한 몇몇 미생물 종의 항산화 활성에 대하여 연구하였고, 그들의 높은 항산화 활성을 확인하였다. 본 연구에서는 Cladonia sp., Sterocaulon sp., Umbilicaria sp. 및 Cetraria sp. 총 4종류의 지의류로부터 5종의 미생물을 새롭게 분리하였고 배양 후, 다양한 용매 추출법으로 그들의 항산화능을 조사하였다. DPPH와 ABTS 자유 라디컬 소거능 측정법 및 FRAP 분석 등을 수행하였다. 또한 총 폴리페놀함량과 총플라보노이드 함량 분석 역시 수행하였다. 지의류 유래 미생물 배양 추출액 중, Burkholderia sordidicola S5-B(T) 유사 미생물 종의 에틸아세테이트 추출액은 DPPH 분석에서 대조군인 아스코르빈산 (51.3%)에 비해 72.9%로 높은 항산화 활성을 보였을 뿐만 아니라, 높은 플라보노이드와 폴리페놀 함량을 나타내었다. 결과적으로, 이러한 지의류 유래 미생물 종들은 잠재적으로 천연 항산화제의 원천소재로서 이용가능할 것이다.

• 미생물학회지
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• 제53권1호
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• pp.64-66
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• 2017

Caballeronia sordidicola strain PAMC 26592 was isolated from Umbilicaria sp., a lichen material collected from Svalbard Archipelago in the Arctic Ocean. We report the draft genome sequence of the strain PAMC 26592, a metabolic generalist. As we have observed in previous genomic studies in the genus Caballeronia draft genomic sequences of PAMC 26592 had an assortment of genes of ecological importance and of bio-technical potentials, which include diverse metabolic genes for carbohydrates, aromatic compounds, amino acids, and vitamins, and genes for nitrogen / sulfur metabolisms, stress responses, membrane transporters, antibiotic resistance, and heavy metal resistance.

• 미생물학회지
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• 제55권1호
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• pp.17-24
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• 2019

극지에 서식하는 세균은 강한 빛과 자외선을 받는다. 이 연구에서 우리는 북극에 서식하는 지의류 Cetraria sp.에서 분리한 호냉성 세균 Sphingomonas sp. PAMC 26621의 생장에 빛이 미치는 영향을 조사하였다. 이 세균은 암조건에서 명조건에서 보다 생장이 느렸다. 놀랍게도, 이 세균은 M9 최소배지에 티아민 혹은 아스코브르산을 첨가하면 명조건에서 생장이 증가하였지만, N-acetylcysteine을 첨가한 배지에서는 생장의 변화가 없었다. 첨가한 티아민과 아스코브르산은 포도당-6 인산 탈수소효소와 항산화 효소의 활성을 증가시켰다. 이 연구의 결과는 지의류와의 공생에서 제공된 티아민이 Sphingomonas sp. PAMC26621의 빛에 의한 산화적 스트레스를 완화시키는 항산화제 역할을 함을 의미한다. 이 연구는 강한 빛과 자외선이 만연한 북극에 서식하는 세균에 대한 생리적, 생화학적 관점에서 고찰할 점을 제시한다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제41권3호
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• pp.350-357
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• 2013

지의류는 사막에서 북극지방까지 이르는 극한 환경에서도 생존 가능한 곰팡이, 조류 또는 시아노박테리아 등으로 구성된 공생체이다. 몇몇 지의류 공생체들은 항균, 항곰팡이, 항바이러스, 항암, 항산화 및 항염증 등과 같은 많은 생물학적 활성을 지닌 넓은 범위의 이차대사물질을 생산한다. 지의류와 공생 관계인 박테리아에 관하여는 아주 일부 알려져 있다. 최근 본 연구팀은 북극 지의류 Stereocaulon spp로부터 4종류의 미생물을 분리하였으며, DPPH와 ABTS 측정법을 이용하여 그들의 항산화능을 조사하였다. 또한 총 폴리페놀 함량과 총 플라보노이드 함량 분석 등도 측정되었다. 강력한 라디컬 소거능은 지의류 추출물을 이용하여 수행하였다. 본 연구에서 조사된 4종류 중, Bosea vestrisii 36546(T)의 에틸아세테이트 추출액은 DPPH 분석에서 86.8% 그리고 ABTS 분석에서 75.2%에 달하는 억제력과 함께 가장 강력한 자유 라디컬 소거능을 보여주었다. 따라서 이러한 결과들로부터 지의류 유래 박테리아 종들이 천연 항산화제로서 잠재적인 소재가 될 수 있다는 것을 제안한다.

• 미생물학회지
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• 제53권2호
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• pp.141-143
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• 2017

Caballeronia sordidicola 균주 PAMC 26577은 다산 기지 근처에서 채집된 지의류인 Cladonia 종에서 분리되었다. Illumina 방식으로 분석한 균주 PAMC 26577의 초안 유전체 서열은 182개의 콘티그로 이루어졌으며, N50값은 159,226 염기쌍 길이에 해당하였다. 초안 유전체로 총 8,334,211 염기쌍을 확인하였으며, 59.4% G+C 함량을 나타냈다. 유전체는 단백질을 코드하지 않는 8개의 rRNA 유전자와 51개의 tRNA 유전자를 포함하였다. 8,065개의 단백질 유전자는 기본 대사 과정뿐 아니라 부탄올/부티르산 생합성, 폴리하이드록시부티르산 대사, serine cycle methylotrophy 및 글라이코겐 대사 유전자들을 가지고 있었다. 2백개 이상의 막 전달 단백질은, 인산화 전달 시스템과 TRAP 전달시스템이 부재하였다. PAMC 26577은 CRISPR 관련 서열 및 단백질이 없었으며, 파아지 유전자의 감염흔적으로 인한 11개의 파아지 관련 유전자를 찾아낼 수 있었다.

• 미생물학회지
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• 제53권2호
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• pp.137-140
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• 2017

Caballeronia sordidicola 균주 PAMC 26510은 남극 킹조지섬의 바톤반도에서 채집된 지의류인 Psoroma sp.에서 분리되었다. 균주 PAMC 26510의 초안 유전체 서열은 224개의 콘티그로 이루어졌으며, 총 7,872,143 염기쌍은 59.7% G+C 함량을 나타냈다. 유전체는 7,580개의 단백질 유전자, 6개의 rRNA 유전자와 46개의 tRNA 유전자를 포함하였다. 균주 PAMC 26510는 이전에 연구한 Caballeronia sordidicola에 속하는 북극 균주와 마찬가지로 대사능력에 있어서 광범위한 능력을 가지고 있는 것으로 여겨진다. PAMC 26510의 초안 유전체는 6개의 CRISPR arrays를 각각의 콘티그 상에 가지고 있으며, 이중 두 개의 콘티그 상에 CRISPR-관련 유전자가 연결되어 있었다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제40권4호
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• pp.380-388
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• 2012

북극 지의류로부터 서로 다른 5종의 극지 미생물을 분리하였고, 그들의 생리활성 물질들은 아세톤, 물, 클로로포름, 다이에틸에테르, 에탄올, 에틸아세테이트, 메탄올 및 페트롤륨 에테르 등 다양한 용매를 이용하여 균 배양액으로부터 추출되었다. 이러한 추출물들의 항균성은 Staphylcoccus aureus, Bacillus subtilis, Micrococcus luteus, Enterobacter cloacae, Pseudomonas aeruginosa 및 Escherichia coli 등 6종의 병원체에 대한 디스크 확산법과 최소억제농도 측정법에 의해 조사되었다. 여러 추출 샘플 중, Burkholderia sordidicola S5-$B^T$ (KOPRI 26644) 유사미생물 종의 에틸아세테이트 추출물이 표적박테리아에 대한 높은 항균활성을 나타내었다(억제대, 7-10 mm; 최소억제농도, $57.5{\rightarrow}1000{\mu}g/ml$). 또한, 다양한 추출 용매 중, 클로로포름 추출물에서 약하지만 분명한 활성을 나타내었다.