• 제목/요약/키워드: Antibiotic resistance gene

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Prevalence, Serotype Diversity, Genotype and Antibiotic Resistance of Listeria monocytogenes Isolated from Carcasses and Human in Korea

  • Oh, Hyemin;Kim, Sejeong;Lee, Soomin;Lee, Heeyoung;Ha, Jimyeong;Lee, Jeeyeon;Choi, Yukyung;Choi, Kyoung-Hee;Yoon, Yohan
    • 한국축산식품학회지
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    • 제38권5호
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    • pp.851-865
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    • 2018
  • This study investigated the prevalence of Listeria monocytogenes in slaughterhouses, and determined serovars and genotypes, and antibiotic resistance of the isolates obtained from slaughterhouses and humans in Korea. Two hundred ninety samples were collected from feces (n=136), carcasses [n=140 (cattle: n=61, swine: n=79)], and washing water (n=14) in nine slaughterhouses. Eleven human isolates were obtained from hospitals and the Korea Center for Disease Control and Prevention. Listeria monocytogenes was enriched and identified, using polymerase chain reaction (PCR) and 16S rRNA sequencing. Serovars and presence of virulence genes were determined, and genetic correlations among the isolates were evaluated by the restriction digest patterns of AscI. Antibiotic resistance of L. monocytogenes isolates were examined against 12 different antibiotics. Of 290 slaughterhouse samples, 15 (5.17%) carcass samples were L. monocytogenes positive. Most L. monocytogenes isolates possessed all the virulence genes, while polymorphisms in the actA gene were found between carcass and human isolates. Serovars 1/2a (33.3%) and 1/2b (46.7%) were the most frequent in carcass isolates. Genetic correlations among the isolates from carcass and clinical isolates were grouped within serotypes, but there were low geographical correlations. Most L. monocytogenes isolates were antibiotic resistant, and some strains showed resistance to more than four antibiotics. These results indicate that L. monocytogenes are isolated from carcass and human in Korea, and they showed high risk serotypes and antibiotic resistance. Therefore, intensive attentions are necessary to be aware for the risk of L. monocytogenes in Korea.

경상남도 유통 어패류와 해양환경에서 분리된 비브리오균속 (Vibrio spp.) 분포 및 항생제 내성 특성 (Distribution and Antibiotic Resistance of Vibrio spp. Isolated from Fishery Products and Coastal Areas in Gyeongsangnam-do)

  • 탁진영;박정길;엄지영;최수완;황나람;김미숙;김제동
    • 한국수산과학회지
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    • 제56권5호
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    • pp.626-633
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    • 2023
  • Vibrio spp. are aquatic bacteria that are ubiquitous in warm estuarine and marine environments. Especially, V. vulnificus and V. cholerae are currently known to cause potentially fatal infections in humans. This study investigated the distribution and antibiotic resistance of V. vulnificus and V. cholerae isolated from coastal areas of Gyeongsangnam-do in 2022. A total of 252 samples of water, shellfish and coastal sediment were collected from 7 locations along the coast, and 124 samples of fishery products were collected from markets. Among the 252 samples, forty-four V. vulnificus (11.7%) and fourteen V. cholerae non-O1/non-O139 (3.7%), none of which carried the ctx gene, were isolated. Out of the 124 samples, 6 (4.8%) tested positive for V. vulnificus and V. cholerae was not detected. The isolation rates of V. vulnificus and V. cholerae showed a significant correlation with environmental factors such as seawater temperature and salinity. In an antibiotic resistance test, V. vulnificus was susceptible to amikacin, gentamicin, imipenem trimethoprim/sulfamethoxazole, and ciprofloxacin, but resistant to cefoxitin (100.0%), followed by tetracycline (9.1%). Multidrug resistance was also observed. Continuous monitoring of Vibrio pathogens with water temperature and salinity is expected to help reduce the outbreaks, and rational use of antibiotic agents is needed to prevent the accession of antibiotic-resistant microorganisms in aquatic ecosystems.

어류, 수족관수 및 환자에서 분리된 Vibrio vulnificus의 독소유전자 분포 및 항생제 내성 (Prevalence of Toxin Genes and Profiles of Antibitoc Resistance in Vibrio vulnificus Isolates from Fish, Fish Tanks, and Patients)

  • 윤연희;박숙;김진영;이예주;전두영;최경철;박종수;김중범
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제35권1호
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    • pp.6-12
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    • 2020
  • 본 연구에서는 비브리오 패혈증 예방과 치료에 유용한 항생제를 제시하기 위해 V. vulnificus의 독소유전자 분포와 항생제 내성을 분석하였다. 2015년부터 2017년까지 3년간 전남지역에서 발생한 비브리오 패혈증 환자로부터 분리되어 보관된 18균주와 전남지역에서 채취된 어패류 및 횟집 수족관수에서 분리된 5균주, 총 23균주를 대상으로 하였다. 실험에 사용된 V. vulnificus 23균주 모두 V. vulnificus로 재확인되었다. V. vulnificus 균주의 독소유전자를 분석한 결과, 23균주 중 19균주(82.6%)에서 RtxA 독소유전자가 확인되었고, 23균주 모두에서 viuB와 vvhA 독소유전자가 검출되었다. 이러한 결과는 독소유전자의 검출율이 기존 보고에 비해 높은 것이며, 실험에 사용한 모든 V. vulnificus 균주가 1개 이상의 독소유전자를 보유한 것으로 생선회 섭취와 상처를 통한 비브리오 패혈증 감염의 위험성이 상존하고 있었다. 따라서 횟집 종사자 등에 대한 비브리오 패혈증 예방 교육이 필요한 것으로 판단되었다. V. vulnificus에 대한 항생제 내성 실험결과 cefoxitin 항생제에 94.4%가 내성을 나타내었고, chloramphenicol과 tetracycline 등 14종의 항생제에 감수성을 나타내었다. 비브리오 패혈증 치료에 chloramphenicol과 tetracycline 항생제를 사용하는 현 치료법이 유용한 것으로 판단되었다.

NaCl Concentration-Dependent Aminoglycoside Resistance of Halomonas socia CKY01 and Identification of Related Genes

  • Park, Ye-Lim;Choi, Tae-Rim;Kim, Hyun Joong;Song, Hun-Suk;Lee, Hye Soo;Park, Sol Lee;Lee, Sun Mi;Kim, Sang Hyun;Park, Serom;Bhatia, Shashi Kant;Gurav, Ranjit;Sung, Changmin;Seo, Seung-Oh;Yang, Yung-Hun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제31권2호
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    • pp.250-258
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    • 2021
  • Among various species of marine bacteria, those belonging to the genus Halomonas have several promising applications and have been studied well. However, not much information has been available on their antibiotic resistance. In our efforts to learn about the antibiotic resistance of strain Halomonas socia CKY01, which showed production of various hydrolases and growth promotion by osmolytes in previous study, we found that it exhibited resistance to multiple antibiotics including kanamycin, ampicillin, oxacillin, carbenicillin, gentamicin, apramycin, tetracycline, and spectinomycin. However, the H. socia CKY01 resistance pattern to kanamycin, gentamicin, apramycin, tetracycline, and spectinomycin differed in the presence of 10% NaCl and 1% NaCl in the culture medium. To determine the mechanism underlying this NaCl concentration-dependent antibiotic resistance, we compared four aminoglycoside resistance genes under different salt conditions while also performing time-dependent reverse transcription PCR. We found that the aph2 gene encoding aminoglycoside phosphotransferase showed increased expression under the 10% rather than 1% NaCl conditions. When these genes were overexpressed in an Escherichia coli strain, pETDuet-1::aph2 showed a smaller inhibition zone in the presence of kanamycin, gentamicin, and apramycin than the respective control, suggesting aph2 was involved in aminoglycoside resistance. Our results demonstrated a more direct link between NaCl and aminoglycoside resistance exhibited by the H. socia CKY01 strain.

원유 시료에서 분리한 장알균속 세균의 다중약물 유출 펌프(Multidrug Efflux Pump) 유전자의 분포도와 항생제 내성 패턴 (Distribution of Multidrug Efflux Pump Genes in Enterococci spp. Isolated from Bovine Milk Samples and Their Antibiotic Resistance Patterns)

  • 강소원;이상진;최성숙
    • 미생물학회지
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    • 제49권2호
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    • pp.126-130
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    • 2013
  • 원유시료에서 분리한 장알균속 세균 245균주의 항생제 내성에 관여하는 다중약물 유출 펌프 유전자 분포도와 항생제 내성 패턴을 연구하였다. 그 결과 245 장알균속 균주의 ampicillin에 대한 내성률은 44.1%, erythromycin에 대한 내성률은 79.2%, tetracycline에 대한 내성률은 76.3%, chloramphenicol에 대한 내성률은 36.3%였으며 vancomycin과 ciprofloxacin에 대해서는 모두 감수성임을 알 수 있었다. 내성 관련 유전자 중 MFS타입의 eme(A)는 82.1%의 장알균에 분포하였으며, ABC 타입의 유전자인 efr(A)는 72.7%, efr(B)는 77.1%, lsa는 71.8%의 장알균에 분포하였다. 특히 이러한 유전자의 기원 세균인 Enterococcus faecalis의 경우 eme(A)는 92.5%, efr(A)는 87.4%, efr(B)는 88.4%, lsa는 88.4%의 분포도를 나타내었다. 한편 동일한 장알균속이지만 종이 다른 장알균에서 eme(A)는 E. faecium 4균주, E. avium 7균주, E. durans 4균주 및 E. raffinosus 2균주에 분포하고 있었다. efr(A)는 E. faecium 2균주와 E. durans 2균주에 분포하였으며, efr(B)는 E. faecium 4균주, E. avium 5균주 및 E. durans 4균주에 분포하였다. 본 연구는 우리나라 원유시료에서 분리한 장알균속의 여러 종의 세균에서 동일한 다중약물 유출 펌프(multidrug efflux pump)의 분포에 대한 첫 번째 보고라 사료되며 E. faecalis 이외의 장알균속에서 이러한 유전자의 분포는 서로 다른 종간의 유전자의 수평적인 이동의 가능성을 시사한다.

급식실 실내공기에서 분리된 황색포도상구균과 바실러스 세레우스의 독소 유전자 및 항생제 내성 (Toxin Gene and Antibiotic Resistance of Staphylococcus aureus and Bacillus cereus Isolated from Indoor Air in Cafeteria)

  • 오도경;조아현;김찬영;정은선;김중범
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제36권6호
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    • pp.520-527
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    • 2021
  • 본 연구에서는 보육시설 실내공기에서 분리된 식중독 균주의 독소 유전자 분포와 항생제 내성을 분석하여 보육시설 실내공기에 의한 식중독 발생을 사전 예방하고 식중독 발생 시 적절한 치료를 위한 기초자료를 제공하고자 하였다. 어린이집 실내공기에서 분리된 Staphylococcus aureus 16주, Bacillus cereus 37주를 실험대상으로 하였다. S. aureus와 B. cereus 독소 유전자는 PCR 방법으로 검출하였다. 항생제 감수성 실험은 Clinical and Laboratory Standard Institute의 디스크 확산법에 따라 실험하였다. S. aureus 16 균주 중 11 균주(68.6%)에서 seg와 sei 독소 유전자가 검출되었다. B. cereus 37 균주 모두에서 nheA와 nheB 독소 유전자가 검출되었다. B. cereus 독소 유전자 패턴은 총 12개로 나타났으며 nheA-nheB-nheC 독소 유전자가 가장 중요한 패턴으로 나타났다. S. aureus 16 균주의 항생제 감수성실험 결과 ampicillin과 penicillin 항생제에 93.8%, 87.5% 내성을 나타내었으나 methicillin resistance Staphylococcus aureus와 vacomycin resistance Staphylococcus aureus는 검출되지 않았다. B. cereus 37 균주의 항생제 감수성 실험 결과 ampicillin과 penicillin 항생제에 100% 내성을 나타냈었다. 이러한 결과를 종합하여 볼 때 보육시설 실내공기에 오염된 S. aureus와 B. cereus에 의한 식중독을 발생을 예방하기 위하여 주기적인 환기와 공기 질 관리가 필요한 것으로 판단되었다.

해수에서 분리한 장염비브리오의 항생제 내성 및 암피실린 내성 유전자의 동정 (Antibiotic-Resistance Profiles and the Identification of the Ampicillin-Resistance Gene of Vibrio parahaemolyticus Isolated from Seawater)

  • 이근우;박권삼
    • 한국수산과학회지
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    • 제43권6호
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    • pp.637-641
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    • 2010
  • The antibiotics-resistance profiles of 28 strains of Vibrio parahaemolyticus isolated from seawater were investigated. All of the strains studied were resistant to ampicillin (100%), but susceptible to 12 other antibiotics. The minimum inhibitory concentration (MIC) of V. parahaemolyticus to ampicillin was as high as $1,024-2,048\;{\mu}g{\cdot}mL^{-1}$. The phenotype of strain 8 changed from ampicillin-resistant to susceptible with an in-frame deletion mutant of VPA0477, a putative ${\beta}$-lactamase gene, and the MIC for ampicillin of the mutant strain was $1{\mu}g{\cdot}mL^{-1}$. In conclusion, our findings suggest that the VPA0477 gene acts as a ${\beta}$-lactamase in ampicillin-resistant V. parahaemolyticus strains.

도시하수 및 그 주변 하천 환경 중 항생제 내성 세균 노출 특성 (Characteristics of Antibiotic Resistant Bacteria in Urban Sewage and River)

  • 오향균;박준홍
    • 대한환경공학회지
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    • 제31권3호
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    • pp.232-239
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    • 2009
  • 본 연구는 도시 하수처리장의 미생물 군집 내 항생제 내성 세균의 특징과 하천으로의 항생제 내성 세균 노출의 계절적 변화의 특성을 평가하였다. 일반 종속영양세균 배양을 위한 R2A agar (R2A)와 대장균군을 선택하여 배양하는 MacConkey sorbitol agar (MSA)에 항생제를 첨가 하여 제작한 배지에 하수처리장 시료를 도말하여 배양한 결과 모든 시료에서 다제 항생제 내성 세균을 검출 해 낼 수 있었다. Ampicillin과 sulfathiazole의 내성률이 다른 나라에 비해 높게 측정 되었으며 시료내 유기물의 정도, 사용된 배지에 따라 내성률이 다름을 볼 수 있었다. R2A 배지에서 분리된 다제 항생제 내성 세균은 모두 기존에 알려진 병원성 세균과 그 염기서열이 유사한 것으로 볼 때 병원성 세균의 항생제 내성 정도가 일반 세균보다 높음을 본 연구 결과로 보일 수 있었다. 또한 본 연구에서는 하수처리장이 하천에 미치는 유해성을 계절별로 관찰하여 전체 미생물중 항생제 내성 세균의 비율은 수온과 비례한다는 결과를 얻었다. 이 결과는 지구 온난화가 미생물 유해성을 증가시킬 가능성을 시사한다.

Antibiotic Resistant Pattern of Helicobacter Pylori Infection Based on Molecular Tests in Laos

  • Vannarath, Sengdao;Vilaichone, Ratha-korn;Rasachak, Bouachanh;Mairiang, Pisaln;Yamaoka, Yoshio;Mahachai, Varocha
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제17권1호
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    • pp.285-287
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    • 2016
  • Background: The efficacy of standard treatment of Helicobacter pylori (H. pylori) is declining because of antibiotic resistance. Clarithromycin resistance is also increasing in many Asian countries. The aim of this study was to determine the antibiotic susceptibility patterns of H. pylori infection and clinical association in Laos. Materials and Methods: A total of 329 Lao dyspeptic patients who underwent gastroscopy at Mahosot Hospital, Vientiane, Laos during December 2010-March 2012 were enrolled in this study. During gastroscopy, 4 biopsies were collected (2 each from the antrum and body) for CLO-test and histopathology. Only the positive CLO-test gastric tissues was stored at $-80^{\circ}C$ in a freezer until DNA was extracted and a GenoType$^{(R)}$HelicoDR test was conducted for detecting mutations in the rrl gene encoding 23S rRNA (clarithromycin resistance) and mutations in gyrA gene (fluoroquinolone resistance). Results: Of the total, 119 Lao patients (36.2%) were infected with H. pylori including 59 males (49.6%) and 60 females (50.4%) with a mean age of 46 years. Clarithromycin and fluoroquinolone resistance of H. pylori infection was demonstrated in 15 (12.6%) and 16 strains (13.4%) respectively. In clarithromycin resistance, the number of patients who had education above primary school and $BMI{\geq}25kg/m^2$ were significantly higher than those who had education below primary school and BMI<$25kg/m^2$ (23.1% vs 7.5%, P-value= 0.036 and 20.5% vs 8%, P-value= 0.048, respectively). In fluoroquinolone resistance, the number of lowland Lao was significantly higher than those of non-lowland (highland and midland) Lao ethnic groups (16.7% vs 0%, P-value= 0.039). Conclusions: H. pylori infections remain common in Laos. Clarithromycin and fluoroquinolone resistance with H. pylori infection are growing problems. Education above primary school and $BMI{\geq}25kg/m^2$ might be predictors for clarithromycin resistance and lowland Lao ethnicity might be predictors for fluoroquinolone resistance with H. pylori infection in Laos.