• 식물병연구
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• 제27권4호
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• pp.180-186
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• 2021

경남과 전남의 육묘중인 수박과 정식한 포장의 유묘에서 황색의 둘레무리와수침상의 갈색 및 검은색의 반점의 병반이 관찰되었다. 병반에서 분리한 분리균은 수박과 쥬키니에서 높은 병원성을 보여주었다, 분리균은 4개의 속생모를 가진 막대형 세균이었다. 분리균은 그람음성으로 LOPAT group 1a에 속하였으며, King'B 배지에서 형광성이 없었다. 16S rRNA 유전자 염기서열을 이용한 계통수 분석과 4개의 항존유전자 염기서열(gapA, gltA, gyrB, rpoD)을 이용한 multi-locus sequencing typing 분석 결과 분리균들은 Pseudomonas syringae pv. syringae와 가장 높은 상동성을 보여주었고, 같은 그룹(clade)으로 묶이었다. 또한 이들은 P. syringae genomospecies group 1에 속하였다. 수박의 잎점무늬병징에서 분리한 세균의 형태적, 생리적, 유전적 특징은 이들이 P. syringae pv. syringae임을 제시한다. 본 논문은 한국에서 P. syringae pv. syringae가 수박에서 점무늬병을 일으키는 최초의 보고이다.

• 한국동물위생학회지
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• 제46권4호
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• pp.269-281
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• 2023

In this study, a new triplex real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (tqRT-PCR) assay was developed for the rapid and differential detection of three feline viral pathogens including feline calicivirus (FCV), feline herpesvirus 1 (FHV-1), and influenza A virus (IAV) in a single reaction. The assay specifically amplified three targeted viral genes with a detection limit of below 10 copies/reaction. The assay showed high repeatability and reproducibility, with intra- and inter-assay coefficients of variation of less than 1%. Based on the diagnostic results of the assay using 120 clinical samples obtained from cats with feline respiratory disease complex (FRDC)-suspected signs, the prevalence of FCV, FHV-1, or IAV was 43.3%, 22.5%, or 0%, respectively, indicating that the diagnostic sensitivity was comparable or superior to those of previously reported monoplex qRT-PCR/qPCR assays. The dual infection rate for FCV and FHV-1 was 8.3%. These results indicate that FCV and FHV-1 are widespread and that co-infection with FCV and FHV-1 frequently occur in the Korean cat population. The developed tqRT-PCR assay will serve as a promising tool for etiological and epidemiological studies of these three bacterial pathogens, and the prevalence data for three feline viruses obtained in this study will contribute to expanding knowledge about the epidemiology of FRDC in the current Korean cat population.

• 한국임상수의학회지
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• 제34권2호
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• pp.140-145
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• 2017

The goal of this study was to investigate risk factors associated with porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) in pig farms in the Republic of Korea using logistic regression and a multilevel model. A cross-sectional study was applied to 305 pig farms with a questionnaire-based interview by veterinarians between March 2014 and February 2015. The questionnaire comprised eight categories: proximity to neighbors, disinfection, visitors, vehicles, insecticides, wild animals, gilts, and feeding. In total, 61 questions in eight categories related to pig farm biosecurity were investigated. Farms were classified as PRRS stable or unstable based on the results of an antibody test and PCR. For univariate analysis, keeping production records with computers (OR = 0.283, 95% CI = 0.056 - 1.425), accredited farm with no use of antibiotics (OR = 0.412, 95% CI = 0.134 - 1.269), reviewing health record of semen prior to purchasing (OR = 0.492, 95% CI = 0.152 - 1.589), complete isolation of runt pigs (OR = 0.264, 95% CI = 0.084 - 0.829), compulsory registering for visitors (OR = 0.424, 95% CI = 0.111 - 1.612), keeping records of insecticide history (OR = 0.406, 95% CI = 0.089 - 1.846), routine on-farm monitoring by veterinarians (OR = 0.314, 95% CI = 0.069 - 1.423), and use of on-farm checklist for biosecurity monitoring (OR = 0.313, 95% CI = 0.063 - 1.553) were found to decrease the probability of PRRS infection. Multivariate and multilevel analysis revealed only two factors, complete isolation of runt pigs (OR = 0.165, 95% CI = 0.045 - 0.602 and OR = 0.208, 95% CI = 0.055 - 0.782) and compulsory registering for visitors (OR = 0.106, 95% CI = 0.017 - 0.655 and OR = 0.119, 95% CI = 0.017 - 0.809) were found to decrease the probability of PRRS infection. The intracluster correlation coefficient of a province for multilevel model was 0.05. The results of this study might facilitate biosecurity measures for individual farms to reduce the probability of PRRS infection.

• 한국환경과학회지
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• 제29권9호
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• pp.925-933
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• 2020

To develop eco-friendly microbial inoculants, siderophore-producing bacteria were isolated and identified, and their production characteristics and plant growth-promoting abilities were investigated. A strain S21 was isolated from rhizosphere of Korean perilla (Perilla frutescens) and identified as Enterobacter amnigenus by phenotypic properties and 16S rRNA gene sequencing. The highest siderophore production was obtained in a medium containing 0.5% fructose, 0.1% urea, 0.5% K₂HPO₄ and 0.1% succinic acid. By using this improved medium, siderophore production increased by 2.5 times compared to that of basal medium. The strain S21 showed insoluble phosphate solubilizing, ammonification and antifungal activities, and also produced hydrolytic enzymes (protease and lipase), indoleacetic acid and 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase. Our data suggest that E. amnigenus S21 is a potential candidate that can be used as eco-friendly biocontrol agent and biofertilizer.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제62권4호
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• pp.543-552
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• 2020

For efficient prevention and treatment of enteric colibacillosis, understanding about latest virulence factors and antimicrobial resistance of Escherichia coli is essentially needed. The aim of this study was to survey antimicrobial resistance and determine the prevalence of fimbriae and enterotoxin genes among 118 pathogenic E. coli isolates obtained from Korean pigs with diarrhea between 2016 and 2017. The genes for the toxins and adhesins were amplified by polymerase chain reaction (PCR). The susceptibility of the E. coli isolates to antimicrobials were tested using the standard Kirby-Bauer disk diffusion method. The most prevalent fimbrial antigen was F18 (40.7%), followed by F4 (16.9%), and the most prevalent combinations of toxin genes were Stx2e (21.2%), STb:EAST-1 (19.5%), and STa:STb (16.9%), respectively. Among the pathotypes, enterotoxigenic E. coli (ETEC) was the most predominant (67.8%), followed by Shiga-toxin producing E. coli (STEC, 23.7%). We confirmed high resistance rates to chloramphenicol (88.1%), tetracycline (86.4%), streptomycin (86.4%), and ampicillin (86.4%). And the majorities of isolates (90.7%) showed multi-drug resistance which means having resistance to 3 or more subclasses of antimicrobials. Results of this study can be a source of valuable data for investigating the epidemiology of and control measures for enteric colibacillosis in Korean piggeries.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제57권2호
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• pp.141-144
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• 2014

국가간 농산물의 수출입 검역시 새로운 기술로 인정받고 있는 전자빔 조사시 귤가루깍지벌레와 복숭아혹진딧물의 방제효과를 조사한 결과, 저선량의 전자선 조사(30, 60, 90 및 120 Gy)는 복숭아혹진딧물과 귤가루깍지벌레의 직접적인 방제효과는 나타나지 않았으나, 발육 및 생식 억제에 크게 영향을 끼쳐 해충에 대한 불활성화 효과를 나타내었다. 이 같은 결과는 국가간 농산물 수출입 검역현장에서 전자선 조사기술이 메틸브로마이드와 같은 화학적 병해충 방제를 대체할 새로운 가능성을 확인해 주는 결과이다.

• 식물병연구
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• 제22권4호
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• pp.269-275
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• 2016

E. pyrifoliae에 의한 과수 가지검은마름병은 국내에서 1995년 최초 발생이래 2016년까지 꾸준히 발생하여 과수농가에 피해를 주고 있는 세균병해이다. 가지검은마름병 발생 농가의 폐원조치 및 공적방제로 인한 경제적 피해 감소를 위하여, 병징이 관찰되는 이병조직 및 건전조직 내의 병원 세균을 검출하여 효율적 관리방안을 마련하고자 본 연구를 수행하였다. 가지검은마름병원세균의 검출은 genomic DNA 추출과정을 생략한 순수 균총만을 이용하는 colony-PCR을 이용하였으며, 이를 위해 ERIC 지역에서 제작된 가지검은마름병원세균 특이 프라이머 EpSPF/EpSPR 프라이머쌍을 선발하였다. 특이 프라이머를 활용한 colony-PCR 방법으로 2014-2015년 4-10월까지 사과나무 생육기간 동안 가지검은마름병 발생상황을 모니터링한 결과, $25^{\circ}C$ 일 평균 온도 기간인 5월 중순부터 7월 초순까지 발병이 가장 빈번하였다. 발병가지 내 병원세균의 존재유무 검정 결과 병징 부위와 이로부터 20 cm 내 건전조직에서만 병원세균이 지속적으로 검출되었다. 따라서 이미 발생한 가지검은마름병을 효율적으로 관리하기 위해 이병조직과 건전조직 경계 부위로부터 20 cm 이상에서 가지치기를 하는 것이 매우 적절할 것으로 판단된다.

• 한국환경생태학회지
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• 제33권1호
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• pp.1-8
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• 2019

고방오리는 국내에 도래하는 주요 월동 조류이며, 고병원성 조류인플루엔자(HPAI)의 주요매개체로 알려져 있다. 본 연구는 국내에서 월동하는 고방오리의 행동권과 서식지 이용을 파악하여 수조류 서식지 보호 관리에 필요한 자료를 제공하기 위하여 이루어졌다. 연구에 이용된 시료는 2015년 월동기에 Cannon-net을 이용하여 포획된 6개체이며, GPS-이동통신 시스템을 기반으로 하는 야생동물위치추적장치(WT-300)를 부착한 후 조사되었다. 행동권은 GIS용 SHP 파일과 ArcGIS 9.0 Animal Movement Extension을 이용하여 분석하였으며, 커널밀도측정법(Kernel Density Estimation : KDE)과 최소볼록다각형법(Minimum Convex Polygon Method : MCP)을 이용하였다. 고방오리의 행동권은 최소볼록다각형법에 의해서 평균 $677.3km^2$이었다. 커널밀도측정법(KDE)로는 평균 $194.7km^2$(KDE 90%), $77.4km^2$(KDE 70%), $35.3km^2$(KDE 50%)로 나타났다. 서식지 이용은 해양수, 내륙습지와 같은 수계지역을 가장 많이 이용하는 것으로 나타났으며, 주간보다 야간에 농경지를 더 많이 이용하는 것으로 나타났다. 연구를 통해 얻은 월동기 행동권과 서식지 이용률 등과 같은 결과는 종 보호와 서식지 관리 및 고병원성 조류 인플루엔자 발병 시 대응을 위한 자료로 널리 활용될 것이라 판단된다.

• 식물병연구
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• 제20권3호
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• pp.227-233
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• 2014

초산(acetic acid)과 젖산(lactic acid)의 혼합액(MX)의 심비디움 배양토에 오염된 소나무재선충(Bursaphelenchus xylophilus)의 방제효과를 조사하였다. 실내실험에서 초산과 혼합액은 5.0-1.0% (pH 2.6-4.2)에서 젖산은 5.0%에서만 100%가까운 살선충율을 나타내었고 이보다 낮은 농도(0.5-0.1%, pH 5.1-6.9)에서는 초산과 혼합액보다 젖산에서 살선충력이 유의적으로 낮아졌다. 대부분의 농도에서 혼합액의 살선충율이 초산과 젖산의 평균보다 유의적으로 높게 나타나 혼합액의 살선충력 상승효과가 있을 것으로 판단된다. 폿트실험에서 유기산 혼합액(0.5%, 0.25%), 살선충제(fosthiazate, 표준량, 배량) 및 길항세균(Paenibacillus polymyxa GBR-1) 배양 희석액($10^7CFU/ml$) 등의 처리에 의해 심비디움 배양토에서의 소나무재선충의 밀도가 처리간에는 유의적인 차이가 없이 무처리에 비해 유의적으로 감소하였다. 모든 처리에서 약해가 나타나지 않았고, 처리 후 시기별 pH와 2년생 심비디움의 생육에 무처리 대조구와 유의적인 차이가 나타나지 않았다. 이러한 결과와 이들 식용 유기산의 안전성과 가격을 종합하여 볼 때, 심비디움의 재배 관리 중 생육단계에 따라 이 유기산 혼합액의 지속적인 사용은 검역해충의 방제에 있어서 친환경적이고 실제적으로 유효한 하나의 방법일 것이다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제27권5호
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• pp.909-915
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• 2017

Bifidobacterium bifidum BGN4 (BGN4) has many proven beneficial effects, including antiallergy and anticancer properties. It has been commercialized and used in several probiotic products, and thus strain-specific identification of this strain is very valuable for further strain-dependent physiological study. For this purpose, we developed novel multiplex polymerase chain reaction (PCR) primer sets for strain-specific detection of BGN4 in commercial products and fecal samples of animal models. The primer set was tested on seven strains of B. bifidum and 75 strains of the other Bifidobacterium species. The BGN4-specific regions were derived using megaBLAST against genome sequences of various B. bifidum databases and four sets of primers were designed. As a result, only BGN4 produced four PCR products simultaneously whereas the other strains did not. The PCR detection limit using BGN4-specific primer sets was $2.8{\times}10^1CFU/ml$ of BGN4. Those primer sets also detected and identified BGN4 in the probiotic products containing BNG4 and fecal samples from a BGN4-fed animal model with high specificity. Our results indicate that the PCR assay from this study is an efficient tool for the simple, rapid, and reliable identification of BGN4, for which probiotic strains are known.