• 제목/요약/키워드: Animal and Plant Quarantine Agency

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감자T바이러스 검정을 위한 RT-PCR 및 Nested PCR 진단시스템 개발 (Development of a diagnostic system to detect potato virus T using RT-PCR and nested PCR)

  • 이시원;신용길;이진영;김영석;양미희;최인철
    • 농업과학연구
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    • 제42권2호
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    • pp.99-103
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    • 2015
  • Potato virus T (PVT) is a plant pathogen in the family Betaflexiviridae, group IV single-stranded positive sense RNA viruses. The major host of PVT is potato, and it has been reported in Ullucus tuberosus, Oxalis tuberosa and Tropaeolum tuberosum. This study aimed at developing reverse transcription (RT)-polymerase chain reaction (PCR) and nested PCR techniques for specific detection of PVT. Finally, Two RT-PCR primer sets were developed and verified. The RT-PCR products were amplified to 734 (PVT RT-PCR primer set 6) and 828 bp (PVT RT-PCR primer set 29) long to detect PVT. The nested PCR primer sets [PVT-N70/C20 ($734{\rightarrow}315bp$) and PVT-N75/C30 ($828{\rightarrow}529bp$)] were developed which are high sensitivity and verification for detection of PVT. Furthermore, a modified-positive control plasmid is use to verify contamination of laboratory in PVT detection. This study supported the diagnose PVT in potato or PVT related hosts.

수출분재 주요 해충인 알락하늘소와 유리알락하늘소에 대한 포스핀 훈증 효과 검정 (Evaluation of Phosphine Efficacy on Anoplophora chinensis and A. glabripennis in Export Bonsai)

  • 이상명;정영학;이병호;김봉수;박민구;이동운
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제57권3호
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    • pp.151-160
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    • 2018
  • 알락하늘소(Anoplophora chinensis)와 유리알락하늘소(A. glabripennis)는 전 세계적으로 검역상 중요한 하늘소과 해충이다. 우리나라에서 이들은 자연 기주목과 분재에서 피해를 주고 있다. 본 연구에서는 분재에서 phosphine의 이들 두 하늘소에 대한 방제효과를 조사하였다. Phosphine은 솔수염하늘소 유충과 알에 대해 높은 훈증효과를 보였다. $2g/m^3$ 농도의 phosphine을 24시간 훈증처리 시 유리알락하늘소와 알락하늘소 난은 부화하지 못하였고, 알락하늘소 유충은 동일농도에 168시간 훈증처리 시 100% 치사되었다. 분재 생육기(2월)나 휴면기(1월) 모두에서 phosphine 훈증제는 $2g/m^3$ 농도에서 두 알락하늘소를 100% 치사시켰다. 그러나 2월에 각 분재목[단풍나무(Acer palmatum)와 소사나무(Carpinus turczaninowii), 아그배나무(Malus sieboldii)]을 대상으로 훈증처리 시, 세 수종 모두에서 잎과 꽃잎의 크기가 작아지고, 꽃의 개화가 지연되는 약해가 발생되었다.

뉴캣슬병 바이러스 검출 및 병원성 감별을 위한 Duplex RT-PCR법 개발 (Development of a Duplex RT-PCR Assay for the Simultaneous Detection and Discrimination of Avirulent and Virulent Newcastle Disease Virus (NDV))

  • 김지예;이현정;장일;이희수;윤성준;박지성;설재구;김승환;홍지무;;;최강석
    • 한국가금학회지
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    • 제44권2호
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    • pp.93-102
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    • 2017
  • 본 연구에서 NDV의 L유전자와 F유전자를 표적 부위로 각각 제작한 primer 세트를 사용함으로써 하나의 PCR 튜브에서 NDV 검출(386 bp의 증폭 크기)과 함께 병원성 NDV(229 bp의 증폭 크기)를 동시에 감별 증폭할 수 있는 dRT-PCR 검사법을 개발하였다. 개발된 dRT-PCR검사법은 NDV를 특이적으로 검출하고, 병원성을 감별하였다. 특히 국내 병성감정 실시기관에서 적용 중인 기존의 RT-PCR 상용키트에서는 검출하지 못하는 class I NDV과 PPMV(class II 유전형 VI형)을 NDV를 검출함과 동시에 병원성 NDV도 감별가능하였다. 개발된 dRT-PCR 검사법의 검출 민감도는 약 $10^{3.0}EID_{50}/0.1mL$로 평가되었다. 또한 ND발생국의 야외 시료에 적용했을 때, NDV 공통항원 검출율은 94.4%였으며, 병원성 NDV 검출율은 100%이었다. 그러므로 본 연구에서 개발한 dRT-PCR 검사법은 의심축 사례에서 ND를 신속 정확하게 진단하는 데 유용할 진단 방법을 제공할 수 있을 것으로 판단된다.

Comparison of X-ray computed tomography and magnetic resonance imaging to detect pest-infested fruits: A pilot study

  • Kim, Taeyun;Lee, Jaegi;Sun, Gwang-Min;Park, Byung-Gun;Park, Hae-Jun;Choi, Deuk-Soo;Ye, Sung-Joon
    • Nuclear Engineering and Technology
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    • 제54권2호
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    • pp.514-522
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    • 2022
  • Non-destructive testing (NDT) technology is a widely used inspection method for agricultural products. Compared with the conventional inspection method, there is no extensive sample preparation for NDT technology, and the sample is not damaged. In particular, NDT technology is used to inspect the internal structure of agricultural products infested by pests. The introduction and spread of pests during the import and export process can cause significant damage to the agricultural environment. Until now, pest detection in agricultural products and quarantine processes have been challenging because they used external inspection methods. However, NDT technology is advantageous in these inspection situations. In this pilot study, we investigated the feasibility of X-ray computed tomography (X-ray CT) and magnetic resonance imaging (MRI) to identify pest infestation in agricultural products. Three kinds of artificially pest-infested fruits (mango, tangerine, and chestnut) were non-destructively inspected using X-ray CT and MRI. X-ray CT was able to identify all pest infestations in fruits, while MRI could not detect the pest-infested chestnut. In addition, X-ray CT was superior to the quarantine process than MRI based on the contrast-to-noise ratio (CNR), image acquisition time, and cost. Therefore, X-ray CT is more appropriate for the pest quarantine process of fruits than MRI.

청둥오리와 흰뺨검둥오리의 월동기 행동권 비교 연구 (Home-Range of Mallard and Spot-billed Duck in Korea)

  • 신용운;신만석;이한수;강용명;정우석;최지다;윤하정;오홍식
    • 한국환경생태학회지
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    • 제30권2호
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    • pp.165-172
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    • 2016
  • 청둥오리와 흰뺨검둥오리는 대표적인 월동 수조류로 수계를 중심으로 넓은 농경지를 월동지로 이용한다. 중부지역에 위치한 만경강과 동진강에서 월동하는 청둥오리와 흰뺨검둥오리에 대하여 행동권과 월동지에서의 일일 이동거리를 파악하고자 한다. 2015년 월동기에 Cannon-net을 이용하여 포획된 청둥오리 5개체와 흰뺨검둥오리 5개체에 야생동물 위치추적기(WT-300)를 부착하였다. 일일 이동거리는 전체 평균 0.89km이었으며, 최대 31.09km이었다. 청둥오리의 일일 이동거리는 0.97km이었으며, 최대 28.78km이었다. 흰뺨검둥오리의 일일 이동거리는 0.80km이었으며 최대 33.39km이었다. 행동권 분석은 GIS용 SHP 파일과 ArcGIS 9.0 Animal Movement Extension을 이용하였으며, 최소볼록다각형법(MCP)과 커널밀도측정법(Kernel Density Estimation : KDE)을 이용하여 분석하였다. 오리 2종의 행동권은 최소 볼록다각형법(MCP)에 의해 $490.34km^2$ ($SD=311.20km^2n=10$)이었으며, 핵심서식지인 커널밀도측정법(KDE 50%)은 $42.24km^2$ 이었다. 청둥오리의 행동권(MCP)은 $568.02km^2$로 흰뺨검둥오리 행동권(MCP) $397.13km^2$ 보다 비교적 넓었으며, 청둥오리의 핵심서식지(KDE 50%)는 $53.05km^2$로 흰뺨검둥오리의 핵심서식지(KDE 50%) $29.26km^2$ 보다 비교적 넓었다.

Hemorrhagic disease caused by bovine viral diarrhea virus-2a in Korean Indigenous Cattle: case reports

  • Hyung-Chul Cho;Byoung-Soo Kim;Dong-Hun Jang;Kyung-Hyun Lee;Kyoung-Seong Choi
    • 대한수의학회지
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    • 제63권1호
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    • pp.7.1-7.5
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    • 2023
  • Two 1-year-old Korean native steers in the same herd presented severe hemorrhagic diarrhea. Case 1 had severe dehydration and died after 3 days, whereas case 2 had anorexia, depression, and severe diarrhea with mucus and blood. Only case 2 was necropsied, and bovine viral diarrhea virus-2a (BVDV2a) was detected in the tissues of its alimentary tract. Gross lesions, including erosion, ulceration, and extensive hemorrhage, were observed in the digestive tract mucosa. Immunohistochemistry revealed marked positive staining for BVDV2a antigen in the large intestine. These findings are indicative of hemorrhagic disease caused by BVDV2a in a native Korean steer.

흰뺨검둥오리의 지역간 월동서식지이용 비교분석 (Interzonal Comparative Analysis of the Wintering Habitat of Spot-billed Duck (Anas poecilorhyncha))

  • 황종경;신만석;강용명;윤하정;최지다;정우석;이준우
    • 한국환경생태학회지
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    • 제30권4호
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    • pp.676-683
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    • 2016
  • 본 연구는 야생동물위치추적기(WT-300, GPS-Mobile Phone Based Telemetry, KoEco)를 이용하여 도심지역과 농촌지역에서 월동하는 흰뺨검둥오리의 서식지 이용을 파악하여 국내 수조류 서식지 보호 관리의 기초자료로 활용하고자 수행하였다. 연구지역은 경기도 안성시의 도심하천인 안성천과 해남의 산수저수지로 지역별로 각각 흰뺨검둥오리 5개체에 위치추적기를 부착하였다. 흰뺨검둥오리의 행동권 분석은 GIS용 SHP 파일과 ArcGIS 9.x Animal Movement Extension을 이용하였으며, 커널밀도측정법(Kernel Density Estimation : KDE)과 최소볼록다각형법(Minimum Convex Polygon Method : MCP)을 이용하여 분석하였다. 흰뺨검둥오리의 행동권은 최소볼록다각형법에 의하면 안성은 $250.8km^2$(SD=195.3, n=5), 해남은 $89.1km^2$(SD=69.6, n=5)이였다. 커널밀도측정법에 의한 50% 이용면적은 안성은 $21.8km^2$(SD=26.9, n=5), 해남은 $3.5km^2$(SD=2.2 n=5)로 해남지역에서 좁은 행동권을 보였다. 흰뺨검둥오리의 서식지 이용을 보면 안성과 해남지역 모두 내륙습지와 논을 주로 이용하였다. 하지만 해남에서는 주간에, 안성에서는 야간에 논 이용률이 높았으며, 월동후기로 갈수록 해남에서는 주간에, 안성에서는 야간에 논 이용률이 증가하는 경향을 보였다.

한국산 가루이과 종의 추가보고 및 종 검색표 작성 (노린재목, 가루이과) (Additions to the Whitefly Fauna of Korea with a Key to Species (Hemiptera: Aleyrodidae))

  • 서수정
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제51권2호
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    • pp.163-170
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    • 2012
  • Aleurolobus marlatti (Quaintance), Massilieurodes formosensis (Takahashi) 및 Pealius rhododendri Takahashi는 한국에서 처음으로 기록된다. 이들 종에 대한 요약된 정보 및 사진자료와 함께 한국에 발생하는 가루이과 종 검색표를 업데이트하였다.

Andean potato latent virus 검출을 위한 PCR 기반 진단시스템 개발 (Development of PCR-base Diagnostic System for the Detection of Andean potato latent virus)

  • 이진영;김진호;김은실;이시원
    • 농업과학연구
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    • 제42권2호
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    • pp.105-109
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    • 2015
  • Andean potato latent virus (APLV)는 Group IV (+) sense ssRNA viruses, Tymovirus속으로 분류되는 식물 병원성 바이러스로, 주로 감자에 감염되며 국내 관리급 검역바이러스로 지정되어 있다. 본 연구에서는 검역현장에서 APLV를 신속 정확하게 진단할 수 있는 2개의 RT-PCR 프라이머 조합[조합 2 (404 bp)와 23 (501 bp)]과 각각의 nested PCR 조합($404{\rightarrow}259bp$$501{\rightarrow}349bp$)을 선발하였다. 또한, 진단에 양성대조군으로 활용할 수 있는 유전자변형 양성대조구를 개발하여 실험실 오염에 대한 검증이 가능하도록 하였다. 본 연구에서 개발한 PCR 기반 진단시스템은 향후 검역 현장에서 APLV를 검출하여 우리나라 식물검역에 기여할 것이라고 기대된다.

A case of nonserotypable Escherichia coli infection in a Korean rabbit farm

  • Camer, Gerry A.;Roh, Yoon-Seok;Cho, A-Ra;Kim, Jong-Won;Umanets, Alexander;Kim, Bum-Seok;Lim, Suk-Kyung;Lee, Hee-Soo;Lim, Chae-Woong
    • 한국동물위생학회지
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    • 제35권1호
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    • pp.69-71
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    • 2012
  • Rabbits are highly susceptible to colibacillosis, and no treatment is able to control the disease effectively. Rabbits raised in a farm in Chonbuk province presenting persistent diarrhea and death were submitted for diagnosis. Ninety percent of the infected animals died; weanlings suffered the most mortality. Necropsies showed prominent hemorrhagic foci along the intestinal and cecal serosae. In histopathological examination, rod-shaped bacteria were observed in the necrotic areas of the tips of villi in the small intestine and neutrophils infiltration was found around the necrotic villous areas. The affected animals consistently yielded Escherichia coli isolates from the intestines. The isolated organism was atypically indole-negative and was nonserotypable using 62 known O group-typing sera. Further microbiological and epidemiological works to recognize and control colibacillosis infection in farmed rabbits in Korea is therefore critical.