• 제목/요약/키워드: Acute respiratory infections

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Comparative Analysis of the Complete Genome of Lactobacillus plantarum GB-LP2 and Potential Candidate Genes for Host Immune System Enhancement

  • Kwak, Woori;Kim, Kwondo;Lee, Chul;Lee, Chanho;Kang, Jungsun;Cho, Kyungjin;Yoon, Sook Hee;Kang, Dae-Kyung;Kim, Heebal;Heo, Jaeyoung;Cho, Seoae
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권4호
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    • pp.684-692
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    • 2016
  • Acute respiratory virus infectious diseases are a growing health problem, particularly among children and the elderly. Much effort has been made to develop probiotics that prevent influenza virus infections by enhancing innate immunity in the respiratory tract until vaccines are available. Lactobacillus plantarum GB-LP2, isolated from a traditional Korean fermented vegetable, has exhibited preventive effects on influenza virus infection in mice. To identify the molecular basis of this strain, we conducted a whole-genome assembly study. The single circular DNA chromosome of 3,284,304 bp was completely assembled and 3,250 protein-encoding genes were predicted. Evolutionarily accelerated genes related to the phenotypic trait of anti-infective activities for influenza virus were identified. These genes encode three integral membrane proteins, a teichoic acid export ATP-binding protein and a glucosamine - fructose-6-phosphate aminotransferase involved in host innate immunity, the nonspecific DNA-binding protein Dps, which protects bacteria from oxidative damage, and the response regulator of the three-component quorum-sensing regulatory system, which is related to the capacity of adhesion to the surface of the respiratory tract and competition with pathogens. This is the first study to identify the genetic backgrounds of the antiviral activity in L. plantarum strains. These findings provide insight into the anti-infective activities of L. plantarum and the development of preventive probiotics.

2018년도에 분리된 닭 전염성기관지염 바이러스에 대한 병원성 시험 (Determining Pathogenicity of Infectious Bronchitis Virus Isolated in Korea 2018)

  • 박담희;윤하나;주효선;김규직;고성혜;이다예;송창선
    • 한국가금학회지
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    • 제46권4호
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    • pp.263-269
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    • 2019
  • IBV는 전세계적으로 양계산업에 문제시되고 있는 호흡기성 질병으로 육계 및 산란계의 생산성에 큰 영향을 미치고 있다. 본 연구는 2018년도에 분리된 3개의 IBV의 병원성을 확인하였다. 동물실험을 통해서 염증정도, 섬모소실도 그리고 폐사율의 결과를 바탕으로 2018년도 분리주인 QX-like IBV형은 병아리에게서 충분한 병원성을 지닌 것을 확인하였다.

인간 코로나 바이러스를 중심으로 2017-2019년 소아청소년 호흡기 바이러스 감염증의 역학 및 특성: 경기 북서부지역 단일기관의 후향적 연구 (Epidemiology and Characteristics of Pediatric Respiratory Virus Infection From 2017 to 2019 Focusing on Human Coronavirus: A Retrospective Study of a Single Center in Northwestern Gyeonggi-do)

  • 박형석;조경원;정유진;김종민;송준혁;김광남
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제30권2호
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    • pp.62-72
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    • 2023
  • 목적: Coronavirus disease 2019 (COVID-19) 발생 이후 인간 코로나바이러스를 포함한 호흡기 바이러스의 패턴에 변화가 있을 것으로 생각되어, COVID-19 발생 이전 경기도 명지병원에 급성 호흡기 감염증으로 입원한 소아청소년을 대상으로 바이러스 감염의 패턴을 보고하였다. 방법: 2017년 1월부터 2019년 12월까지 급성 호흡기 감염증으로 명지병원에 입원한 18세 이하 소아청소년을 대상으로 하였고 real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) 결과를 바탕으로 후향적으로 의무기록을 고찰하였다. 결과: 총 3,557명 중에서 중복감염 포함하여 3,686건의 바이러스가 검출되었고 평균 양성률은 78.6%이었으며 여름에 비해 겨울에 PCR 양성률이 높았다. 파라인플루엔자바이러스, 메타뉴모바이러스, 보카바이러스는 4-6월에 주로 검출되고, 인간엔테로바이러스는 7-9월에, 호흡기세포융합바이러스와 인플루엔자바이러스는 겨울철에 주로 검출되었다. 진단별로 인두편도염에서는 아데노바이러스가 가장 많았고 폐렴에서는 호흡기세포융합바이러스가 가장 많이 검출되었다. 인간 코로나 바이러스는 겨울철에 주로 검출되었으며, 크루프 환자 중에서 3번째 높은 빈도로 나타났다. 결론: 본 연구결과가 이전에 보고되었던 소아청소년의 호흡기 바이러스 역학과 크게 다르지 않았다. 또한 COVID-19 발생 이후 호흡기 바이러스 패턴 비교 연구에 도움이 되고자 COVID-19 발생 이전 호흡기 바이러스 역학정보를 보고하는 바이다.

부산지역에서 유행한 호흡기 바이러스(2004년-2006년) (Epidemiology of acute viral resp iratory tract infections in Busan (2004-2006))

  • 강요한;이동준;조경순;정우식
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제14권2호
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    • pp.179-187
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    • 2007
  • 목 적 : 바이러스는 급성 호흡기 감염증의 가장 흔한 원인이며 특히 소아에서 잘 이환되고, 상기도 감염뿐 아니라 하기도 감염을 일으켜 모세기관지염, 폐렴, 크룹, 기관기관지염 등을 일으킨다. 이러한 원인이 되는 바이러스들의 유행을 조사하기 위해 본 연구를 시작하였다. 방 법 : 2004년 1월부터 2006년 12월까지 만 3년 동안 부산지역 26개소 병원, 의원, 보건소에 급성 호흡기 증상으로 내원하였던 0-18세의 환자 중 기침, 콧물, 발열, 인후통을 보였던 환자들을 대상으로 하였고, 8,974명에서 비인두 면봉법으로 검체를 채취하였으며 이 중 281례(3.0%)에서 바이러스가 분리되었다. 결 과 : 1) A형 인플루엔자 바이러스가 131례(46.6%)로 가장 많았으며 2004년 봄에 특히 많이 검출되었다. 그 이외에도 RS 바이러스가 40례(14.2%), B형 인플루엔자 바이러스가 37례(13.2%), 아데노바이러스가 23례(8.2%), 장내바이러스가 37례(13.2%) [콕사키바이러스 20례(7.1%), 비정형 장내바이러스 9례(3.2%), 폴리오바이러스 4례(1.4%), 에코바이러스 4례(1.4%)], 파라인플루엔자 바이러스가 2례(0.7%), 그리고 코로나바이러스, 보카바이러스가 각각 1례(0.4%) 검출되었다. 2) 대상이 되었던 8,974명의 환아에서 281례의 양성결과 중 남아에서 163례(56%), 여아에서 123례(44%)로 남녀 성비는 약 1.3:1로 남자에서 약간 더 많았다. 연령별로는 0-1세에서 195례(69%), 2-10세에서 78례(28%), 11-18세에서 8례(3%)가 분리되었다. 3) RS 바이러스는 매년 분리되었으나 주로 10월에서 2월에 많았고, A형 인플루엔자 바이러스는 매년 12월에서 4월에 주로 분리되었으며. B형 인플루엔자 바이러스는 2-4월에 분리되었다. 아데노바이러스는 연중 고루 발생하였으며, 장내바이러스(비정형 장내바이러스, 콕사키바이러스, 에코바이러스 등)는 5-9월 사이 특히 7-8월에 집중적으로 발생하였다. 파라인플루엔자 바이러스는 주로 5-7월에 발생하였다. 결 론 : 저자들은 부산지역에서 최근 3년간 유행한 급성 호흡기 질환의 원인 바이러스를 분석하여 역학적 특징을 규명하였으며, 향후 이러한 바이러스에 의한 급성 호흡기 질환을 예방하고 치료하는데 도움이 될 수 있도록 발생 시기와 유행 양상에 대한 더 많은 보고와 연속적인 연구가 필요할 것이다.

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한국인에서 처음 분리된 Chlamydia pneumoniae (The First Isolation of Chalamydia pneumoniae from a Korean Patient)

  • 이승준;정해혁;김숙경;최대희;한선숙;남의철;원준연;박원서;이명구;정기석
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제53권5호
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    • pp.569-576
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    • 2002
  • 연구배경 : C pneumoniae는 상하기도 감염을 일으키는 주요균으로, 균의 임상검체로부터의 분리는 균이 가진 몇가지 특성으로 매우 어려운 것으로 보고되었다. 최근 연구자들은 급성 인두염으로 내원한 22세 여자환자에서 채취한 비인두 스왑으로부터 국내 최초로 C pneumoniae를 분리, 배양하는데 성공하였다. 방 법 : Hep-2 세포주를 24시간 배양한 뒤, 환자로부터 얻은 비인두 스왑 검체를 넣어, 900g에서 한시간 동안 원심분리한 뒤, 72시간 동안 배양하였다. 본 환자의 검체는 8대째 계대배양에서 처음으로 봉입체가 관찰되었고, 이를 통정하기 위해 종특이 직접면역형광 검사와 종특이 PCR을 시행하였다. 그 밖에 전자현미경 소견도 관찰하였다. 결 과 : 종특이 면역형광염색과 PCR은 모두 C. pneumoniae에 합당한 소견을 보여, 본 분리 균주가 C. pneumoniae임을 알 수 있었다. 전자현미경 소견은 서양의 표준 균주가 배모양입에 비해, 일본 균주과 유사한 원형을 나타내었다. 결 론 : 국내 최초로 연구자들은 22세 여자 급성인두염 환자로부터, C. pneumoniae 분리에 성공하였다. 형태학적으로 일본 균주와 같은 원형임은 서양의 보고와는 다르다. 향후 본 균주는 국내 C. pneumoniae 다양한 연구에 활용될 수 있을 것이다.

SARS-CoV-2 IgG Antibody Seroprevalence in Children from the Amritsar District of Punjab

  • Kaur, Amandeep;Singh, Narinder;Singh, Kanwardeep;Sidhu, Shailpreet Kaur;Kaur, Harleen;Jain, Poonam;Kaur, Manmeet;Jairath, Mohan
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제54권3호
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    • pp.173-178
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    • 2022
  • The majority of the children experience milder coronavirus disease 2019 (COVID-19) symptoms. Children represent a significant source of community transmission. Children under 18 years of age account for an estimated 4.8% of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infections globally. However, no conclusive statements pertaining to the multi-fold aspects of the virus in children could be drawn due to the lower prevalence of pediatric cases. The present study was conducted to identify the indirect impact of SARS-CoV-2 infections on developing herd immunity among children in the age group 3 to 18 years by investigating their antibody levels. In the study, 240 children aged 3~18 years were recruited by the Department of Pediatrics, Government Medical College and Hospital, Amritsar, India, and quantification of the antibodies was performed at the Viral Research and Diagnostic Laboratory (VRDL), Government Medical College (GMC), Amritsar, India. Out of the 240 serum samples, 197 (82.08%) showed seropositivity, while 43 (17.92%) were seronegative. When stratified, it was observed that in the age group 3~6 years, 22.33% of children were found to have anti-SARS-CoV-2 antibodies while in the age groups 7~10 years, 11~14 years, and 15~18 years, respectively, 37.06%, 30.46%, and 10.15% were seropositive. Although there was seroconversion among children which was useful for predicting the next wave, no differences in seropositivity were observed between adults and children.

Development of a Single Nucleotide Polymorphism DNA Microarray for the Detection and Genotyping of the SARS Coronavirus

  • Guo, Xi;Geng, Peng;Wang, Quan;Cao, Boyang;Liu, Bin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제24권10호
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    • pp.1445-1454
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    • 2014
  • Severe acute respiratory syndrome (SARS), a disease that spread widely in the world during late 2002 to 2004, severely threatened public health. Although there have been no reported infections since 2004, the extremely pathogenic SARS coronavirus (SARS-CoV), as the causative agent of SARS, has recently been identified in animals, showing the potential for the re-emergence of this disease. Previous studies showed that 27 single nucleotide polymorphism (SNP) mutations among the spike (S) gene of this virus are correlated closely with the SARS pathogenicity and epidemicity. We have developed a SNP DNA microarray in order to detect and genotype these SNPs, and to obtain related information on the pathogenicity and epidemicity of a given strain. The microarray was hybridized with PCR products amplified from cDNAs obtained from different SARS-CoV strains. We were able to detect 24 SNPs and determine the type of a given strain. The hybridization profile showed that 19 samples were detected and genotyped correctly by using our microarray, with 100% accuracy. Our microarray provides a novel method for the detection and epidemiological surveillance of SARS-CoV.

전문가 조사를 활용한 약제급여 적정성 평가 항목 및 지표 확대방안 도출 (Priority Therapeutic Groups to Expand Development of Prescribing Indicators using a Consensus Group of Health Care Professionals)

  • 전하림;김동숙;김보연
    • 약학회지
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    • 제59권4호
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    • pp.190-200
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    • 2015
  • Evaluation Project on Appropriate Prescribing (EPAP) which is analysing prescribing pattern and providing physicians feedback has begun in 2001. EPAP indicators are related to antibiotics for acute respiratory tract infections, overuse of injection, polypharmacy (no. of drugs prescribed together, no. of prescriptions with 6 or more drugs), prescribing of specific medication group (drugs for acid related disorders, NSAIDs, corticosteroids) and medication expenditure per prescription day. The aim of this study was to suggest a development plan for EPAP indicators suitable for domestic situation. A consensus group consisting of seventeen health care professionals evaluated significance of each therapeutic class for EPAP indicators expansion considering information such as magnitude of issue, prescribing indicators of foreign countries, reimbursement criteria by each therapeutic class. Based on the data and group survey, 5 classes were selected as candidates for prescribing indicators and we presented 24 indicators regarding 5 classes. The results suggested that we need to augment evaluation indicators of additional area.

A Computerized Doughty Predictor Framework for Corona Virus Disease: Combined Deep Learning based Approach

  • P, Ramya;Babu S, Venkatesh
    • KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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    • 제16권6호
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    • pp.2018-2043
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    • 2022
  • Nowadays, COVID-19 infections are influencing our daily lives which have spread globally. The major symptoms' of COVID-19 are dry cough, sore throat, and fever which in turn to critical complications like multi organs failure, acute respiratory distress syndrome, etc. Therefore, to hinder the spread of COVID-19, a Computerized Doughty Predictor Framework (CDPF) is developed to yield benefits in monitoring the progression of disease from Chest CT images which will reduce the mortality rates significantly. The proposed framework CDPF employs Convolutional Neural Network (CNN) as a feature extractor to extract the features from CT images. Subsequently, the extracted features are fed into the Adaptive Dragonfly Algorithm (ADA) to extract the most significant features which will smoothly drive the diagnosing of the COVID and Non-COVID cases with the support of Doughty Learners (DL). This paper uses the publicly available SARS-CoV-2 and Github COVID CT dataset which contains 2482 and 812 CT images with two class labels COVID+ and COVI-. The performance of CDPF is evaluated against existing state of art approaches, which shows the superiority of CDPF with the diagnosis accuracy of about 99.76%.

The pros and cons of entry restrictions: are entry restrictions really effective in preventing the spread of SARS-CoV-2?

  • Park, Donghwi;Boudier-Reveret, Mathieu;Chang, Min Cheol
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • 제39권4호
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    • pp.344-346
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    • 2022
  • Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has rapidly spread worldwide, leading the World Health Organization to declare coronavirus disease 2019 (COVID-19) a pandemic. To curb the unchecked spread of SARS-CoV-2 infection, most countries have enforced travel restrictions. However, it is debatable whether such restrictions are effective in containing infections and preventing pandemics. Rather, they may negatively impact economies and diplomatic relationships. Each government should conduct an extensive and appropriate analysis of its national economy, diplomatic status, and COVID-19 preparedness to decide whether it is best to restrict entering travelers. Even if travelers from other countries are allowed entry, extensive contact tracing is required to prevent the spread of COVID-19. In addition, governments can implement "travel bubbles," which allow the quarantine-free flow of people among countries with relatively low levels of community transmission. An accurate evaluation of the benefits and losses due to entry restrictions during the COVID-19 pandemic would be helpful in determining whether entry restrictions are an effective measure to reduce the spread of infection in future pandemics.