이소부틸렌 2가 음이온 및 디리티오이소보틸렌 이성질체들에 대하여 STO-3G최적화 계산을 수행하여 이들 화학종의 기하구조, 에너지, Mulliken 점유도등을 고찰하였다. 이들 화학종의 생성과 관련되는 몇 가지 isodesmic반응의 반응에너지 및 그로부터 추정된 상대적 생성에너지로부터 Y-형 2가 음이온에 대한 "Y-방향족성"의 기여와 이들 2가 음이온 유사체를 거치는 알킬화 반응을 좌우하는 구조적 요인을 고찰하였다.
Molecular geometries for the cationic and neutral species of OXO (X=Cl, Br, and I) are optimized using the Hartree-Fock (HF) theory, the second order Moller-Plesset perturbation theory (MP2), the density functional theory with the B3LYP hybrid functional (B3LYP), and the coupled cluster theory using single and double excitation with a perturbational treatment of triplet excitation (CCSD[T]) methods, with two basis sets of triple zeta plus polarization quality. The single point calculations for these species are performed at the CCSD(T,Full) level. The harmonic vibrational frequencies for these species are calculated at the HF, MP2, B3LYP and CCSD(T) levels. The adiabatic ionization potential for OIO is calculated to be 936.7 kJ/mol at the CCSD(T,Full) level and the correct value is estimated to be around 945.4 kJ/mol.
반도체 특성을 가지는 이차원 전이금속 칼코겐 화합물 $MoS_2$와 강자성이면서 금속성을 가지는 $VS_2$로 이루어진 수평접합 구조를 기반으로 해서, 0%부터 10%까지 2% 간격으로 변형에 따른 쇼트키 장벽(Schottky Barrier) 변화를 밀도 범함수 이론 계산을 통해 연구하였다. 그 결과, 홀의 쇼트키 장벽이 전자의 쇼트키 장벽에 비해 훨씬 작고, 홀의 쇼트키 장벽 높이가 변형에 따라 선형적으로 감소함을 발견하였다. 특히, 8% 이후의 변형에서 홀의 스핀 업 쇼트키 장벽의 높이가 0에 가까워지는 임계 변형값이 존재함을 발견하였고, 이 임계 변형값 이상에서는 스핀 업 성분의 홀이 $MoS_2/VS_2$ 수평접합구조를 통해 쇼트키 장벽 없이 쉽게 흐르게 됨을 알게 되었다. 이러한 연구 결과는 향후, 변형을 통한 이차원 전이금속 칼코겐 수평 접합구조 기반 소자 특성 최적화에 중요한 기초자료로 이용될 것으로 기대한다.
The proton transfer energies of gas phase glycine and alanine and those of hydrated glycine and alanine were calculated both with Hartree-Fock and $M{\Phi}ller-Plesset$ ab initio molecular orbital (MO) calculations with 6-31G** basis set. The transition states of the proton transfer of gas phase glycine was also investigated. For zwitterions, both for glycine and alanine, the water bound to -NH3+ site stabilize the complex more compared with the water bound to -CO2-. The proton transfer energy, ΔEpt, of glycine, alanine, mono-hydrated glycine, mono-hydrated alanine, di-hydrated glycine and di-hydrated alanine were obtained as 30.78 (MP2: 22.57), 31.43, 23.99 (MP2: 17.00), 24.98, 22.87, and 25.63 kcal/mol, respectively. The activation energy for proton transfer from neutral (Nt) glycine to zwitterion (Zw) glycine, Ea, was obtained as 16.13 kcal/mol and that for reverse process, Ear, was obtained as 0.85 kcal/mol. Since the transition state of the proton transfer of gas phase glycine locate near the glycine zwitterion on the potential energy surface and the shape of the potential well of the zwitterion is shallow, the zwitterion easily changed to neutral glycine through the proton transfer.
Methyl hydro-peroxide의 methyl group과 O-H에 F를 치환 시킨 fluoromethyl fluoroperoxide($CH_nF_{3-n}OOF$)의 안정한 conformers와 isomers에 대하여 MP2/6-311G(d,p) 방법과 B3LYP/6-311++G(d,p) 방법으로 최적화 계산을 수행하였고 vibrational frequencies를 구하였다. $CH_3OOF$와 $CH_2FOOF$, $CHF_2OOF$, $CF_3OOF$ 분자 모두 가장 안정한 형태는 skew 구조로 나타났으며 $CH_3OOH$와 비교할 때 대단히 짧은 O-O 결합길이를 갖는다. Trans, cis conformers의 경우 skew 형태보다 8-12 kcal/mol 정도 높은 에너지를 갖으며 O-O 결합길이는 훨씬 길어진다. $CH_2FOOF$, $CHF_2OOF$, $CF_3OOF$ 분자들은 methyl group의 F에 의한 induction 효과로 짧은 C-O 결합길이를 갖고 O-F 결합길이는 길어지나 치환된 F 원자의 수에 따른 구조변화는 그리 크지 않다.
Acetic acid와 SO2의 상호작용에 의해 생성되는 안정한 복합체를 알아보기 위해 MP2, B3LYP 방법으로 6-311++G(d,p), aug-cc-pVDZ, aug-cc-pVTZ basis set을 사용하여 계산하였다. Syn-acetic acid와 SO2는 세 종류의 안정한 두 자리 복합체를 형성하였으며 anti-acetic acid도 SO2와 세 복합체를 보였으나 이들 중 둘은 한자리 복합체로 syn-acetic acid에 비해 안정성이 떨어진다. 가장 안정한 복합체는 SO2의 S와 syn-acetic acid의 C=O가 상호작용하여 S⋯O=C 결합과 SO2의 O와 acetic acid의 O-H가 상호작용하여 O⋯H-O 결합을 갖는 두 자리 복합체, C1, C3이다. 이중 C1이 가장 큰 결합에너지 −7.38 kcal/mol을 갖는다. 이 복합체의 안정성은 S⋯O와 O⋯H 거리가 van der Waals 반지름의 합보다 훨씬 짧다는 것으로도 알 수 있다. Vibrational frequencies의 변화에서도 이 원자들의 상호작용을 볼 수 있었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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