유전자발현 자료로터 유용한 생물학적 정보를 얻기 위해 여러 시각화 방법이 개발되어 왔다. 본 논문에서는 평행좌표 플롯(parallel coordinate plot: PCP)을 이용하여 유전자발현 패턴을 찾아내어 표현하고자 하였다. 평행좌표 플롯의 두 변형인 ePCP(enhanced parallel coordinate plot)와 APCP(Andrews' type parallel coordinate plot)를 림포마(lymphoma) 자료에 적용하여 62개 샘플을 의미있게 배열하고 300개 유전자를 평활 곡선으로 표현하였다.
Lee, Juri;Lee, Cheol Woo;Yong, Hae In;Lee, Hyun Jung;Jo, Cheorun;Jung, Samooel
한국축산식품학회지
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제37권4호
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pp.477-485
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2017
Novel, effective methods to control and prevent spoilage and contamination by pathogenic microorganisms in meat and meat products are in constant demand. Non-thermal pasteurization is an ideal method for the preservation of meat and meat products because it does not use heat during the pasteurization process. Atmospheric pressure cold plasma (APCP) is a new technology for the non-thermal pasteurization of meat and meat products. Several recent studies have shown that APCP treatment reduces the number of pathogenic microorganisms in meat and meat products. Furthermore, APCP treatment can be used to generate nitrite, which is an essential component of the curing process. Here, we introduce the effectiveness of APCP treatment as a pasteurization method and/or curing process for use in the meat and meat product processing industry.
Lee Kye-Nam;Paek Kwang-Hyun;Ju Won-Tae;Lee Yeon-Hee
Journal of Microbiology
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제44권3호
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pp.269-275
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2006
Atmospheric-pressure cold plasma (APCP) using helium/oxygen was developed and tested as a suitable sterilization method in a clinical environment. The sterilizing effect of this method is not due to UV light, which is known to be the major sterilization factor of APCP, but instead results from the action of reactive oxygen radicals. Escherichia coli, Staphylococcus aureus, and Saccharomyces cerevisiae deposited on a nitrocellulose filter membrane or Bacillus subtilis spores deposited on polypropylene plates were exposed to helium/oxygen plasma generated with AC input power at 10 kHz, 6 kV. After Plasma treatment, nitrocellulose filter membranes were overlaid on fresh solid media and CFUs were counted after incubation overnight. D-values were 18 sec for E. coli, 19 sec for S. aureus, 1 min 55 sec for S. cerevisiae, and 14 min for B. subtilis spores. D-values of bacteria and yeast were dependent on the initial inoculation concentration, while the D-value of B. subtilis spores showed no correlation. When treated cells were observed with a scanning electron microscope, E. coli was more heavily damaged than S. aureus, S. cevevisiae exhibited peeling, and B. subtilis spores exhibited shrunken morphology. Results showed that APCP using helium/oxygen has many advantages as a sterilization method, especially in a clinical environment with conditions such as stable temperature, unlimited sample size, and no harmful gas production.
In this study, we attempted to characterize the biomolecular effects of an atmospheric-pressure cold plasma (APCP) system which utilizes helium/oxygen $(He/O_2)$. APCP using $He/O_2$ generates a low level of UV while generating reactive oxygen radicals which probably serve as the primary factor in sterilization; these reactive oxygen radicals have the advantage of being capable to access the interiors of the structures of microbial cells. The damaging effects of plasma exposure on polypeptides, DNA, and enzyme proteins in the cell were assessed using biochemical methods.
국소한냉자극이 전신 및 국소혈액순환에 미치는 영향과 동계에 있어서 한냉에 대한 적응을 관찰하기 위하여 동계 및 하계에 편균연령 21세의 남녀 대학생 각 60명 및 50명을 대상으로 $5^{\circ}C$의 냉수에 일측 손을 담구어 3분간 국소한냉자극을 가하였다. 침수 1, 2, 3분과 회복기 1, 3, 5분에 침수한 측과 침수 반대측에서 평균혈압, 분시심박수, 광전 모세혈관 맥박의 파고, 피부전기저항을 관찰하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 국소한냉자극시 혈압은 증가하였고 하계에서 동계보다 더 큰 증가를 보였다. 회복기에 동계는 서서히 대조치로 회복되나 하계에는 대조치보다 유의하게 감소하였다. 분시심박수는 침수시 증가하며 하계에서 동계보다 더 증가하였고 회복기에는 동계 및 하계 모두 대조치보다 감소하였다. 광전 모세혈관 맥박의 파고는 동계에는 침수 및 침수 반대측 모두 감소하였으나 침수한 측에서 더 크게 감소하였으며 이는 침수한 측에 있어서 한냉의 국소효과에 기인한 것으로 보인다. 하계에는 동계보다 작은 감소를 보였으며 회복기에는 더 빠른 회복을 보여 대조치보다 증가하였다. 피부전기저항은 침수시 침수 반대측에서는 감소하나 침수한 측에서는 유의하게 증가하였다가 회복기에 서서히 감소하였다. 침수 반대측의 감소는 동통에 의한 반응이 한냉에 의한 반응에 첨가되어 나타난 것으로 보이며, 침수한 측은 한냉에 의한 국소효과가 크기 때문인 것으로 보인다. 이상으로 $5^{\circ}C$의 국소한냉자극시 전신적 반응은 한냉자극에 의한 동통성 stress에 기인한 반응이 우세한 것으로 생각되며 김 등$^{39)}$의 보고와는 달리 동계 및 하계의 반응의 차이는 계절에 따른 한냉자극에 대한 주관적 감각의 차이에 의한 것으로 동계에서 한냉기후에 의한 국소한냉자극의 적응현상은 나타나지 않는 것으로 사료된다.
로켓 추진기관의 해체 시 발생하는 고농도 암모늄 퍼클로레이트(AP)를 액상소각 처리 후 추가로 발생하는 저농도의 AP처리를 위해 NF/RO 멤브레인 공정을 적용하였고, 이때 AP제거 특성에 영향을 미치는 인자를 도출하기 위해 다양한 수리화학적 조건에서 전량여과방식으로 실험을 진행하였다. 고체 추진제에서 추출된 용액을 GC/MS와 FTIR분석을 통해 규산염 계열의 실록산 등을 검출하였으나, 이는 극미량이 포함되어 NF/RO 멤브레인 공정에 큰 영향을 미치지 않는 것으로 판단되었다. 상대적으로 낮은 압력의 운용조건에서는 높은 압력조건과 비교하여, 회수율 증가에 따라 농축된 AP의 삼투압 기작이 투과플럭스에 영향을 미치게 되어 13~17% 가량 플럭스가 감소됨을 확인하였다. 또한 AP의 제거율은 수리화학적 운영조건의 변화(압력 및 교반 속도 등)에 따라 크게 좌우됨을 알 수 있었고, 이 경우 NF와 RO 멤브레인 제거율은 각각 10~70%와 26~87% 가량 크게 달라짐을 확인하였다. 본 논문을 통해 NF/RO 멤브레인 공정을 적용한 AP 제거 기작에서 수리화학적 운영조건의 변화에 따른 농도분극, 멤브레인 선택성 및 삼투압 영향이 중요 지배 기작이었으며, 이는 'NF/RO 멤브레인의 물질이동과 선택성'의 기존 이론적 모델과 부합하였다.
본 연구는 인공신경망의 성능을 향상시키기 위한 여러 가지 방법들 중의 하나인 입력변수 선정기법에 관한 연구로서, 일반적으로 널리 사용되고 있는 상관계수를 이용한 입력변수 선정기법 외에 상호정보량을 활용한 방법을 적용하여 인공신경망의 성능을 향상시키고자 하였다. 대상자료는 기상청에서 제공하는 RDAPS자료의 152개 출력값으로 지상강우량의 예측값인 APCP를 포함하고 있으며, 강우관측값간의 상호정보량을 구해 가장 영향력이 큰 변수를 입력변수로 사용하였다. 기존연구결과, 그리고 상관계수만을 이용해서 입력변수를 선정한 결과와 비교해볼 때, 상호정보량을 적용한 경우 입력변수는 주로 바람과 관련된 변수들이 선정되었으며, 평균제곱근오차, 평균제곱근상대오차, 그룹별로 구분한 경우의 절대오차, 그리고 구간별로 구분한 경우의 상대오차를 비교한 경과 상호정보량을 이용한 입력변수 선정방법의 정확도가 전반적으로 높은 것으로 나타났으며, 특히 강우량이 상대적으로 큰 경우의 오차를 많이 감소시킬 수 있는 것으로 나타났다.
The coat protein (CP) gene of Apple mosaic virus (ApMV), a member of the genus Ilarvirus, was selected for the design of virus-specific primers for amplification and molecular detection of the virus in cultivated apple. A combined assay of reverse transcription and polymerase chain reaction (RT-PCR) was performed with a single pair of ApMV-specific primers and crude nucleic acid extracts from virus-infected apple for rapid detection of the virus. The PCR product was verified by restriction mapping analysis and by sequence determination. The lowest concentration of template viral RNA required for detection was 100 fg. This indicates that the RT-PCR for detection of the virus is a 10$^3$times more sensitive, reproducible and time-saving method than the enzyme-linked immunosorbent assay. The specificity of the primers was verified using other unrelated viral RNAs. No PCR product was observed when Cucumber mosaic virus (Cucumovirus) or a crude extract of healthy apple was used as a template in RT-PCR with the same primers. The PCR product (669 bp) of the CP gene of the virus was cloned into the plasmid vector and result-ant recombinant (pAPCP1) was selected for molecule of apple transformation to breed virus-resistant transgenic apple plants as the next step. This method can be useful for early stage screening of in vitro plantlet and genetic resources of resistant cultivar of apple plants.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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