• 제목/요약/키워드: AMP Structure

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온도변화에 의한 cAMP 수용성 단백질(CRP)의 구조 (Study on the structure of cAMP receptor protein(CRP) by temperature change)

  • 주종호;구미자;강종백
    • 생명과학회지
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    • 제10권3호
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    • pp.279-285
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    • 2000
  • cAMP 수용성 단백질인 CRP는 Escherichia coli에서 대사와 관련된 유전자의 전사를 조절한다. 본 연구는 야생형과 돌연변이 CRP 단백질의 열적 안정성과 온도에 따른 단백질의 구조변화를 관찰하기 위 하여 proteolytic digestion, UV spectrophotometer, CD spectrapolarimeter 등의 방법을 사용하였다. cAMP가 없을 때에는 야생형, S83G, S128A CRP가 열적 안정성에서 큰 차이를 보이지 않았지만, cAMP가 존재할 때 야생형 CRP가 다른 돌연변이 CRP보다 열적으로 더욱 안정함을 보였다. 그리고 protease digestion 실험을 통하여 높은 온도에서 cAMP의 존재와 무관하게 돌연변이 CRP에서 단백질 의 변성으로 인한 절단된 단백질띠를 관찰할 수 있었다. 그리고 55$^{\circ}C$에서 측정한 CD 스펙트럼에서 단백 질의 2차 구조인 $\alpha$-helix 구조가 부분적으로 파괴되었음이 관찰되었다.

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The influence of ultrasound and adenosine 5'-monophosphate marination on tenderness and structure of myofibrillar proteins of beef

  • Zou, Ye;Yang, Heng;Zhang, Muhan;Zhang, Xinxiao;Xu, Weimin;Wang, Daoying
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제32권10호
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    • pp.1611-1620
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    • 2019
  • Objective: The aim was to investigate the influence of ultrasound and adenosine 5'-monophosphate (AMP) marination (UAMP) on tenderness and structure of myofibrillar proteins of beef. Methods: Five groups, the untreated meat (Control), deionized water marination (DW), ultrasound followed by DW (UDW), AMP marination (AMP), and ultrasound followed by AMP (UAMP) were studied. Myofibrillar fragmentation, cooking loss, shear force, thermograms, histological observation of meats and myofibrillar proteins properties were investigated in these different treatments. Results: The results showed that UAMP significantly increased myofibrillar fragmentation index from 152 (Control), 231 (AMP), and 307 (UDW) to 355 (p<0.05), respectively. The lowest cooking loss, shear force and peak denaturation temperature were observed in UAMP. In histological observation, UDW and UAMP had more fragmented muscular bundles than the others. Furthermore, a drastic increase in ${\alpha}$-helix and decrease in ${\beta}$-sheet of myofibrillar proteins was observed in UAMP, implying the disaggregation of protein samples. The synchronous fluorescence spectra of myofibrillar proteins in UAMP suggested the combination of ultrasound and AMP could accelerate the unfolding molecular structure and destroying hydrophobic interactions. The results of circular dichroism and synchronous fluorescence spectra for myofibrillar proteins coincided with the microstructures of beef. Conclusion: The results indicate that ultrasound combined with AMP improved meat tenderness not only by disruption in muscle integrity, increasing water retention, but also altering their spatial structure of myofibrillar proteins.

압축 센싱 신호 복구를 위한 AMP(Approximate Message Passing) 알고리즘 소개 및 성능 분석 (Introduction and Performance Analysis of Approximate Message Passing (AMP) for Compressed Sensing Signal Recovery)

  • 백형호;강재욱;김기선;이흥노
    • 한국통신학회논문지
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    • 제38C권11호
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    • pp.1029-1043
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    • 2013
  • CS(Compressed Sensing)는 오늘날 신호 처리 영역에서 많은 주목을 받고 있는 이론 중의 하나이다. 이 CS 분야에서 효과적인 복구 알고리즘을 설계하는 것은 가장 큰 도전적 연구 중의 하나로 인식되고 있다. 이에 따라 다양한 복구 알고리즘이 많은 문헌을 통해서 제안 되었으며 최근에 Maleki와 Donoho에 의해 제안된 AMP(Approximation Message Passing) 알고리즘은 기존에 제시된 알고리즘에 비해 간단한 구조를 가지고 있지만 좋은 성능을 보여줌으로써 상당한 주목을 받고 있다. 기존의 (BP) Belief Propagation 알고리즘은 오직 희소(Sparse) 센싱 행렬에서만 좋은 성능을 보여 준 것에 반해, AMP 알고리즘은 밀집(Dense) 센싱 행렬에 기초를 둔 Belief Propagation 알고리즘임에도 불구하고 이와 비슷한 성능을 보여준다. 본 논문은 다양한 영역에서 AMP 알고리즘이 적용되기 위하여 이에 대한 지침 및 기존의 고전적 Message Passing 알고리즘과의 관계에 대해 분석하였다. 또한 기존의 알고리즘과의 비교 분석을 통해 AMP 알고리즘의 우수성을 제시하였다.

Stability and Structure of S128A Mutant cAMP Receptor Protein

  • Choi, Young;Gang, JongBack
    • 통합자연과학논문집
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    • 제4권3호
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    • pp.222-226
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    • 2011
  • Cyclic AMP receptor protein(CRP) is involved in the activation of many genes corresponding to catabolite enzymes in Escherichia coli. In this study, mutant CRP(S128A) was used to elucidate the effect of Ser 128 on the cAMP-induced structural change. Based on the protease digestion and thermal analysis, serine 128 in CRP affects the cAMP binding capability and then structural change of CRP protein. In addition, CD spectra in near UV region revealed that S128A CRP retained the sensitive conformation to thermal effect relative to that of wild-type CRP, in spite of identical Tm values in the absence of cAMP.

Intracellular cAMP-modulated Gate in Hyperpolarization Activated Cation Channels

  • Park, Kyung-Joon;Shin, Ki-Soon
    • Animal cells and systems
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    • 제11권2호
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    • pp.169-173
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    • 2007
  • Hyperpolarization-activated nonselective cation channels (HCNs) play a pivotal role in producing rhythmic electrical activity in the heart and the nerve cells. In our previous experiments, voltage-dependent $Cd^{2+}$ access to one of the substituted cysteines in S6, T464C, supports the existence of an intracellular voltage-dependent activation gate. Direct binding of intracellular cAMP to HCN channels also modulates gating. Here we attempted to locate the cAMP-modulated structure that can modify the gating of HCN channels. SpHCN channels, a sea urchin homologue of the HCN family, became inactivated rapidly and intracellular cAMP removed this inactivation, resulting in about eight-fold increase of steady-state current level. T464C was probed with $Cd^{2+}$ applied to the intracellular side of the channel. We found that access of $Cd^{2+}$ to T464C was strongly gated by cAMP as well as voltage. Release of bound $Cd^{2+}$ by DMPS was also gated in a cAMP-dependent manner. Our results suggest the existence of an intracellular cAMP-modulated gate in the lower S6 region of spHCN channels.

Balanced CMOS Complementary Folded Cascode OP-AMP의 최적설계에 관한 연구 (A Study on the Optimum Design of Balanced CMOS Complementary Folded Cascode OP-AMP)

  • 우영신;배원일;최재욱;성만영
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 1995년도 하계학술대회 논문집 C
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    • pp.1108-1110
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    • 1995
  • This paper presents a balanced CMOS complementary folded cascode OP-AMP topology that achieves improved DC gain using the gain boosting technique, a high unity-gain frequency and improved slew rate using the CMOS complementary cascode structure and a high PSRR using the balanced output stage. Bode-plot measurements of a balanced CMOS complementary folded cascode OP-AMP show a DC gain of 80dB, a unity-gain frequency of 110MHz and a slew rate of $274V/{\mu}s$(1pF load). This balanced CMOS complementary folded cascode OP-AMP is well suited for high frequency analog signal processing applications.

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Dibutyryl Cyclic AMP에 의해 成熟이 抑制된 Mouse 卵子의 微細構造에 관한 硏究 (Studies on the Fine Structures of Mouse Oocyte Whose Maturation has been suppressed in Vitro by Dibutyryl Cyclic AMP)

  • 崔林淳
    • 한국동물학회지
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    • 제18권2호
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    • pp.87-101
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    • 1975
  • dbcAMP에 의한 卵子의 核 崩壞 抑制作用을 電子顯微鏡的으로 究明하기 위하여 생쥐 濾胞卵子의 微細構造를 관찰하였던 바 다음과 같은 結論을 얻었다. 1. 實驗群에서의 核膜의 彎曲은 對照群의 것에 비하여 얼마간 줄고 있으며 2種의 核膜이 정상적으로 유지되고 있으나, 核膜을 따라 무수히 많은 核膜孔이 나타나고 있다. 이는 核 崩壞 抑制와 연관성이 있는 것으로 추정할 수 있다. 2. mitochondria는 對照群에서는 細胞質 전체에 산재해 있고, cristae의 構造가 뚜렷하지 못한 未分化 혹은 移行型의 것들이 많은 반면, 實驗群에서는 mitochondria가 대체로 核 周邊部에 모여 있으며 cristae가 얼마간 발달한 상태를 나타내고 있다. 3. Iysosome은 實驗群에서 그 構造도 보다 단순하고 또 그 數도 對照群에 비하여 얼마간 減少하고 있다. 4. Golgi complex는 對照群에서는 전현적인 顆粒, 層板狀 構造를 하고있으나, 實驗群에서의 것은 그다지 뚜렷하지가 않다. 5. multivesicular body는 兩群이 모두 다수 나타나고 있으며, tonofilament도 무수히 존재하고, 細胞質 전반에 걸쳐 free ribosome이 존재하고 있다. 6. 細胞膜의 microvilli의 形態는 實驗群에서는 無定形으로 변하고 있으며, perivitellin space도 상당히 넓어지고 있다. 7. 以上의 觀察結果로 미루어 보아 dbcAMP를 處理하여 24시간 배양한 卵子와, 卵巢에서 직접 採取한 卵子의 電子顯微鏡的 構造에는 근본적인 변화는 볼 수 없으며, 實驗群의 卵子에서 核膜孔의 數가 뚜렷이 증가하고 있는 것은 dbcAMP가 核膜의 透過性에 어떠한 영향을 미치므로써 卵子의 成熟을 억제하고 있는 것이 아닌가 보인다.

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cAMP와 표면 소수성에 의한 도열병균의 부착기 형성 (Uniformity Among Magnaporthe grisea Isolates on Appressorium Formation by cDNA and Hydrophobicity of Contact Surface)

  • 이용환;최우봉
    • 한국식물병리학회지
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    • 제10권4호
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    • pp.254-260
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    • 1994
  • Magnaporthe grisea, a causal agent of blast, forms a specialized infection structure, an appressorium, to infect host. Hydrophobicity of contact surface and cAMP have been suggested as a primary environmental signal and a second messenger to trigger and mediate appressorium formation in this fungus, respectively. To generalize these factors in field isolates of M. girsea, twenty isolates originated from rice and other gramineous hosts were tested. Seventeen including rice and non-rice isolates formed appressoria on hydrophobic surface, but none of isolates formed appressoria on hydrophilic surface. Eighteen isolates formed appressoria on hydrophilic surface in the presence of IBMX, an inhibitor of phosphodiesterase, except two rice isolates. These results strongly support the hypothesis that appressorium formation by M. grisea is induced by hydrophobic hard surface and regulated by the endogenous level of cAMP in the cells. Understanding fungal development is not only of biological interest but provides new targets for novel disease control strategies.

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Serratia marcescens에서 cAMP receptor protein(CRP) 유전자의 클로닝 해석 (Analysis and cloning of cAMP receptor protein(CRp) gene in Serratia marcescens)

  • 유주순;김혜선;문종환;정수열;최용락
    • 생명과학회지
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    • 제8권3호
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    • pp.263-271
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    • 1998
  • 전사조절인자로서 잘 알려져 있는 cAMP receptor protein(CRP)은 cAMP와 DNA에 결합하는 특별한 활성을 가지고 있으며, cAMP-CRP complex를 형성하여 수많은 유전자의 발현조절에 관여한다. 이러한 측면에서 cAMP-CRP의 조절은 어떤 면에서 총체적 조절체계라고까지 한다.본 연구는 Serratia 균주에서 crp 유전자의 분자적 특성 및 cAMP에 의한 발현조절을 받는 분자기구를 해석하고자 유전자를 클로닝하고 발현을 확인하였다. MacConkey 배지에서 maltose를 탄소원으로 충분히 이용하지 못하는 대장균 TP2139(${\Delta}crp$,${\Delta}lac$를 숙주로 이용하고, 염색체 DNA를 library로 작성하여 얻은 형질전환체 약 일만개의 콜로니에서 red colony를 나타내는 5종류의 양성 클론을 얻었다. 이들 클론을 Southern 방법으로 확인한 결과 3kh의 단편을 가진 pCKB12클론이 crp유전자를 coding하고 있음을 확인하였다. glpD-lacZ 융합 plasmid인 pLDC6의 BamHI부위에 pCKB12의 3kb 단편을 삽입시킨 재조합 plasmid pLDC6-Scrp를 작성하여, 클로닝된 Serratia의 crp유전자가 대장균에서 유전자 전사조절에 미치는 영향을 확인한 결과 cAMP-CRP 복합체 형성에 의한 전사조절 기능이 확인되어졌다.

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TFT-LCD 구동회로를 위한 High Slew-rate Two-stage OP-AMP (A High Slew-rate Two-stage OP-AMP for TFT-LCD Driver ICs)

  • 유용수;권모경
    • 대한전자공학회:학술대회논문집
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    • 대한전자공학회 2003년도 하계종합학술대회 논문집 II
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    • pp.1011-1014
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    • 2003
  • We proposed a new two-stage operational amplifier that increases the slew rate by adding some simple circuitry to the conventional structure. The proposed circuit is simulated by HSPICE and the slew rate of the proposed circuit is improved more than 10 times than that of conventional one in slewing state without considerable increments in area and power consumption.

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