• 한국가금학회지
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• 제50권4호
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• pp.283-291
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• 2023

지방산 결합 단백질(FABP)은 LCFA 수송, 지질 합성, 저장을 용이하게 하고, 염증을 포함한 다양한 경로에 영향을 미치는 신호 분자로 작용한다. 특히 FABP4는 혈관 및 심장관련 질환과 관련이 있으며, 대식세포 매개 염증 반응에서 역할을 한다. 이전의 연구들은 FABP4를 지방 생성을 위한 대표적인 바이오 마커일 뿐만 아니라, 면역 반응과도 상관관계가 있는 것으로 확인하였다. 본 연구는 톨-유사 수용체 3(TLR3) 활성화에 의한 닭 FABP4(chFABP4) 유전자의조절을 조사하고 chFABP4 전사 조절에 관여하는 신호 경로를 결정하는 것을 목표로 한다. 우리는 TLR3 자극 DF-1 세포에서 chFABP4의 전사 조절을 분석하였다. 결과는 TLR3 리간드인 폴리이노신-폴리시티딜산(PIC)으로 자극 시 chFABP4가 상향 조절되었음을 보여주었다. 특히 chFABP4 전사는 NF-κB 신호 경로에서 독립적으로 조절되었다. p38 억제에서 상향 조절되어 p38 신호 경로가 TLR3 활성화 DF-1 세포 내에서 chFABP4 전사를 억제할 수 있음을 보여주었다. 이와는 대조적으로, JNK 신호 경로 억제에서는 chFABP4 발현이 하향 조절되었으며, 이는 대식세포의 연구 결과와 일치하며, TLR3 활성화에 반응하여 DF-1 세포에서 chFABP4 전사를 위한 JNK 신호 전달 경로의 긍정적인 조절을 시사한다. MEK 경로 억제는 NF-κB 신호 전달과 유사한 조절을 초래하였다. 이러한 결과는 각 MAPK가 TLR3 활성화에 반응하여 DF-1 세포에서 chFABP4의 전사 조절에 차별적으로 기여함을 시사한다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제20권12호
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• pp.1812-1819
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• 2007

Heart fatty acid-binding protein gene (H-FABP) is an important candidate gene for meat quality. One of the objectives of this study was to screen single nucleotide polymorphisms (SNP) of chicken H-FABP gene among 252 individuals that included 4 Chinese domestic chicken breeds (Fengkai Xinghua (T04), Huiyang Huxu (H), Qingyuan Ma (Q), Guangxi Xiayan (S1)), 2 breeds developed by the Institute of Animal Science, Guangdong Academy of Agricultural Sciences (Lingnan Huang (DC), dwarf chicken (E4)) and one introduced broiler (Abor Acre (AA)). Another objective of this study was to analyze the associations between polymorphisms of the H-FABP gene and fat deposition traits in chickens. PCR-SSCP was used to analyze SNPs in H-FABP and 4 SNPs (T260C, G675A, C783T and G2778A) were detected. Associations between polymorphic loci and intramuscular fat (IMF), abdominal fat weight (AFW) and abdominal fat percentage (AFP) were analyzed by ANCOVA method. The results showed that the T260C genotypes were significantly associated with IMF (p = 0.0233) and AFP (p = 0.0001); the G675A genotypes were significantly associated with AFW, AFP (p<0.01) and IMF (p<0.05); at the C783T locus, AFW and AFP differed highly between genotypes. However, the G2778A loci did not show any significant effect on fat deposition traits in this study. In addition, we found that there were some differences between AFP and definite haplotypes through a nonparametric statistical method, so the haplotypes based on the SNPs except G2778A loci were also significantly associated with IMF, AFW (g) (p<0.05) and AFP (%) (p<0.001). Significantly and suggestively dominant effects of H4H4 haplotype were observed for IMF and the H2H3 was dominant for AFW (g) and AFP (%). The results also revealed that H5H7 haplotype had a negative effect on IMF, while the H5H6 had a positive effect on AFW (g) and AFP (%).

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제48권3호
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• pp.345-352
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• 2006

지방합성이 왕성하게 진행되는 비육후기의 근육내 지방합성에 있어서, 지방산 및 당의 이용경로 및 이에 따른 근육내 지방합성과정을 규명하기 위해서 지방산 및 당 운반 유전자인 FABP4, GLUT4와 근육내 지방대사 주요유전자인 ACL, ACC, LPL 및 SCD 유전자의 mRNA 발현양상을 분석하였다. 한우 비육전기 및 후기 각 3두를 공시하여 total RNA 추출 및 1st cDNA 합성하여 SYBR green을 이용하여 real-time PCR 분석을 각 유전자별로 3반복씩 수행하였다. FABP4 유전자는 비육전기에 비해 비육후기에 있어서, 3배 이상 유전자 발현이 증가함을 확인할 수 있었고, GLUT4 유전자는 비육전기 및 비육후기에서 큰 차이를 보이지 않았다. 또한 근육내 지방합성 주요유전자인 ACL, ACC, LPL 및 SCD 유전자의 발현량은 비육후기에서 ACL 유전자가 3.8배, ACC 유전자는 2.7배, LPL 유전자는 3.5배, 그리고 SCD 유전자는 7.5배 발현량이 증가하였다. 따라서 본 연구를 통하여 한우의 비육후기에서 근육내 지방합성은 FABP4에 의한 지방산 유입의 증가와 더불어 ACL 유전자에 의해서 지방산 합성의 중간대사물인 acetyl-CoA가 합성되고, 이 중간 대사물을 이용하여 ACC 및 SCD 유전자에 의해서 긴 사슬 지방산 합성이 왕성하게 일어남을 알 수 있었다.

• 응용통계연구
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• 제29권7호
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• pp.1247-1255
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• 2016

Kim과 Lee (2015)는 한우의 등급과 지방산을 향상시키는 우수한 FABP4 유전자를 선별하였다. 본 연구의 목적은 유전자를 확장하여 한우의 경제형질에 영향을 미치는 우수한 유전자형을 선별하는 것이다. 확장된 유전자는 한우의 등급과 지방산과 깊은 연관이 있다고 밝혀진 FABP4, SCD, FASN, SREBPs이다. 우리는 환경적인 요인을 제거하여 보정된 경제형질 값을 활용하여 보정된 경제형질 값에 다중인자차원축소 방법을 적용한다. 그 결과 한우의 등급, 지방산을 향상시키는 우수한 유전자와 유전자형을 선별했다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제28권10호
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• pp.1380-1387
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• 2015

This study aims to determine the polymorphism and mRNA expression pattern of the heart-type fatty acid-binding protein (H-FABP) gene and their association with intramuscular fat (IMF) content in the breast and leg muscles of Baicheng oil chicken (BOC). A total of 720 chickens, including 240 black Baicheng oil chicken (BBOC), 240 silky Baicheng oil chicken (SBOC), and 240 white Baicheng oil chicken (WBOC) were raised. Three genotypes of H-FABP gene second extron following AA, AB, and BB were detected by polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP) strategy. The G939A site created AA genotype and G956A site created BB genotype. The content of IMF in AA genotype in breast muscle of BBOC was significantly higher than that of AB (p = 0.0176) and the genotype in leg muscle of WBOC was significantly higher than that of AB (p = 0.0145). The G939A site could be taken as genetic marker for higher IMF content selecting for breast muscle of BBOC and leg muscle of WBOC. The relative mRNA expression of H-FABP was measured by real-time PCR at 30, 60, 90, and 120 d. The IMF content significantly increased with age in both muscles. The mRNA expression level of H-FABP significantly decreased with age in both muscles of the three types of chickens. Moreover, a significant negative correlation between H-FABP abundance and IMF content in the leg muscles of WBOC (p = 0.035) was observed. The mRNA expression of H-FABP negatively correlated with the IMF content in both breast and leg muscles of BOC sat slaughter time.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제53권4호
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• pp.311-317
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• 2011

본 연구는 한우에서 소 염색체 14번(BTA14)에서 근내지방도 및 도체중과 관련성이 보고된 QTL영역(48-58cM) 내의 FABP5 유전자를 대상으로 SNP를 발굴하고 도체형질과의 관련성 분석을 위하여 수행하였다. PCR 및 염기서열결정법을 통해 FABP5 유전자내 4개의 SNP (-1141A>G, 949A>G, 969A>G, 1085C>G)를 발굴하였고, 이중 promoter 영역에 위치하는 SNP의 경우 미 보고된 신규 SNP로 확인되었다. 발굴된 4개의 SNP를 대상으로 표현형 기록치를 보유한 후대검정후 583두에 대하여 유전자형 분석 및 관련성 분석을 수행하였다. 분석 결과 4개의 SNP중 SNP1(-1141A>G)은 근내지방도에 있어서 G유전자형이 A유전자형에 비해서 근내지방도가 2.2 정도 높았고, SNP2 (949A>G)는 배최장근 단면적에 있어서 G유전자형이 A유전자형보다 배장근단면적에 있어서 3 $cm^2$ 만큼 높은 효과를 보였다. 본 결과에 대해 추후 지속적인 연구가 요구되어지며, FABP5의 SNPs은 한우의 도체 및 육질 관련 형질을 위한 유전자 마커로서 활용 가능할 수 있을 것으로 사료된다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제55권6호
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• pp.551-557
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• 2013

This study was conducted to analyze the genotypes and genes of FABP3 (Fatty-acid Binding Protein 3) in pigs using MSPI restriction enzyme and electrophoresis. Analysis of data collected from a total of 210 crossbred pigs (LYD or YLD) in Chungcheongnam-do, Korea, revealed the following. The AA genotypes of FABP3 were detected in the 750 bp and 100 bp bands, while the Aa heterotype appeared in the 850, 750 and 100 bp bands and the aa recessive homotype was detected in a single band of 850 bp. The genotype frequency of AA, Aa and aa was 46.67%, 51.43% and 1.90%, respectively. The genetic equilibrium of this population showed a significant difference (p<0.001) based on a ${\chi}^2$-test. The carcass weight, backfat thickness, marbling score, pH, drip loss, cooking loss, and meat color based on the CIE $L^*$, and $b^*$ values according to genotypes of FABP3 did not differ significantly (p>0.05); however, the CIE $a^*$ values did (p<0.05).

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제52권6호
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• pp.475-480
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• 2010

The bovine fatty acid binding protein 4 (FABP4) plays an important role to uptake intracellular fatty acid. It has been previously reported as a positional candidate gene for marbling score in livestock. The re-sequencing of FABP4 gene detected a polymorphic AT repeated sequence in intron II of FABP4 gene. Allelic distribution for this microsatellite marker was examined in other cattle breeds. A total of 8 alleles were detected with diverse repeat units (14 to 21 AT repeat) in Hanwoo and 7 breeds. Of the 8 alleles, the predominant alleles were $[AT]_{16}$, $[AT]_{18}$ and $[AT]_{19}$ in the Hanwoo and 7 cattle breeds. The linear mixed model for genotypic effect (3237AT) on carcass traits showed a significant effect on marbling score (MAR P=0.025) and live weight (LWT; P=0.04) in the 583 Hanwoo cattle population. Live weight (LW) was highest in the homozygous $(AT)_{17}$ genotype ($557.5{\pm}6.94$) and lowest in the heterozygous $(AT)_{16/17}$ genotype ($521.7{\pm}7.70$). On the other hand, the homozygous $(AT)_{17}$ genotype ($3.0{\pm}0.15$) has the highest effect on marbling score and the lowest effect was in homozygous (AT)$_{18}$ genotype ($2.2{\pm}0.15$). The marbling score difference between both groups was 0.8 which is around two times higher than SNP genotype effect on marbling score in Limousin $\times$ Wagyu crosses.

• 농업과학연구
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• 제38권4호
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• pp.673-680
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• 2011

The aim of this study was to identify the polymorphism on fatty acid binding protein (FABP4) gene promoter region and its association with carcass traits in Hanwoo. We performed PCR-direct sequencing of FABP4 promoter region to identify single nucleotide polymorphism (SNPs) using unrelated 24 Hanwoo bulls. Four SNPs (-298A>G, -472A>G, -887A>G, -862A>G) were detected in the promoter region and genotyped on 583 Hanwoo steers. A linear mixed model revealed an association of three SNPs (-298A>G, -472A>G and -862A>G) with carcass weight and marbling score in dominance model (P<0.05). The animals with AA genotypes for the three SNPs were heavier carcass weight (5 kg) than animals with GG genotypes in the statistical analysis. For the marbling score, the AA genotype was lower effect of marbling score (0.21) than GG genotypes. In conclusion, this study indicates an important role for three SNPs detected in promoter region of FABP4 in determining carcass weight and marbling score in Hanwoo.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제48권1호
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• pp.21-28
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• 2006

지방세포 내에서 자유 지방산과의 결합수송과 근내지방의 축적에 핵심적인 역할을 담당하는 지방세포 지방산결합단백질 유전자(A-FABP)의 promoter 영역에서 다형성(T-406C)를 SSCP에 이은 DNA 염기서열 분석을 통해 돼지 Duroc 품종에서 확인하였다. 이 돌연변이 406C는 전사인자 nuclear factor 1의 결합 활성을 변화시킬 수 있는 돌연변이로 확인되었다. Duroc 집단에서 HinfⅠ-RFLP 방법으로 유전자형을 결정한 결과 세 종류(TT, TC, CC)의 유전자형을 확인하였고, 빈도는 각각 42.3, 44.3, 13.4%로 확인되었다. 발견된 유전자형과 성장형질간의 상관관계를 통계적으로 유의성을 분석했을 때, 406C/ (TC와 CC)인 돼지의 20주령 체중이 TT인 돼지에서보다 더 무거운 양상을 보이며 유의한 차이를 보였고(P<0.05), 생시체중, 3주령, 10주령 체중에서는 유의한 차이가 발견되지 않았다. 동형접합인 406C/C 돼지들은 406T/인 돼지들에 비해 일당증체량, 90kg 도달일령, 사료효율 면에서 유의적인 차이를 나타내었다. 또한, 등지방두께의 변화와는 무관하게 등심단면적과 정육률에서 유의적인 차이를 확인하였고, CC 동형접합인 돼지에서 더 높은 수치를 나타내었다(P<0.05). 이상의 결과들을 토대로, A-FABP 유전자의 promoter 상에서 발견된 돌연변이인 T-406C는 생육 후반기에서 체중과 등심단면적의 증가에 중요한 역할을 담당하고 있다고 사료되며, 생육 후기 근내지방의 축적과 관련되어 있는 것으로 사료된다. 본 연구에서 발견한 유전자의 다형성은 Duroc 품종의 육종을 위한 분자 marker로서 유용하게 이용될 것으로 사료된다.