• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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• 제11권3호
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• pp.245-250
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• 2006

The effects of aliphatic hydrocarbons (n-hexadecane and n-dodecane) on the volumetric oxygen mass transfer coefficient $(k_L\;a)$ were studied in flat alveolar airlift reactor and continuous stirred tank reactors (CSTRs). In the flat alveolar airlift reactor, high aeration rates (>2vvm) were required in order to obtain efficient organic-aqueous phase dispersion and reliable $k_La$ measurements. Addition of 1% (v/v) n-hexadecane or n-dodecane increased the $k_La$ 1.55- and 1.33-fold, respectively, compared to the control (superficial velocity: $25.8{\times}10^{-3}m/s$, sparger orifice diameter: 0.5 mm). Analysis of the gas-liquid interfacial area a and the liquid film mass transfer coefficient $k_L$ suggests that the observed $k_La$ increase was a function of the media's liquid film mass transfer. Addition of 1% (v/v) n-hexadecane or n-dodecane to analogous setups using CSTRs led to a $k_La$ increase by a factor of 1.68 and 1.36, respectively (superficial velocity: $2.1{\times}10^{-3}m/s$, stirring rate: 250 rpm). These results propose that low-concentration addition of oxygen-vectors to aerobic microbial cultures has additional benefit relative to incubation in purely aqueous media.

• 한국자원식물학회지
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• 제18권3호
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• pp.441-449
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• 2005

광계II(PSII)는 고등식물의 chloroplast에서 두 개의 광합성 반응중심 중의 하나이다. Chlorophyll a/b 광수확 복합체는 광계II를 위한 안테나 역할을 수행한다. 본 연구에서는 인삼의 잎조직을 제작한 cDNA library로부터 chlorophyll a/b-binding protein (Cab) 유전자를 분리하였다. 인삼 Cab유전자는 935 bp의 염기와 265개의 아미노산 잔기(pI 5.63)로 구성된 한 개의 ORF를 포함하고 있으며, 단백질의 분자량은 28.6 kDa으로 추정되었다. 인삼에서 분리한 Cab 유전자는 기존에 식물에서 보고된 유전자들과 유사성을 나타내었으며, 유사도는 $68-92\%$로 나타났다. 아미노산 서열을 비교하여 유연관계를 분석한 결과 인삼의 Cab 유전자는 비교된 P. persica (AAC34983), A.thaliana (AAD28771), G. hirsutum (CAA38025), G. max (AAL29886), V. radiata (AAF89205) 등과 동일한 그룹으로 분리되었다.

• 미생물학회지
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• 제43권2호
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• pp.83-90
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• 2007

유류오염 토양에서 난분해성 물질인 PAH (polycyclic aromatic hydrocarbon)들을 잘 분해하는 균주 중 SOD (superoxide dismutase) 활성이 높은 균주인 Sphingomonas sp. KS 301의 SOD특성을 알아보기 위하여 Ammonium sulfate 침전, DEAE-Sepharose 크로마토그래피, Superose-12 겔 여과 크로마토그래피, Uno-Q1 이온교환 크로마토그래피를 이용하여 SOD 단백질을 정제하였다. Sphingomonas sp. KS 301은 DEAE-Sepharose 크로마토그래피로 분석한 결과, 기존의 알려진 세균들과는 달리 서로 다른 5가지의 SOD 활성을 가지고 있는 것으로 나타났으며 본 연구에서는 그중 SOD III를 부분 정제하였다. 정제한 SOD III는 Mn type 및 Fe type Escherichia coli SOD와 비교했을 때 비활성도(specific activity)가 5배로 높게 나타났다. SOD III의 분자량은 SDS-PAGE에서는 23 kDa으로 측정되었으며 Superose-12겔 여과 크로마토그래피 후 native 상태의 분자량은 71 kDa으로 정제한 SOD는 3개의 소단위체로 구성되어 있는 것으로 보여진다. 정제한SOD III의 최적 pH는 7.0 이었고 $20^{\circ}C$에서 최적의 활성을 보였다. 또한 SOD의 종류를 알 수 있는 억제물질 $NaN_{3},\;H_{2}O_{2},\;KCN$를 이용한 억제효과를 살펴보았더니 $NaN_{3}$에만 억제되어 Mn type의 SOD임을 알 수 있었다. 또한 이 효소의 아미노 말단의 아미노산 서열은 Psudomonase ovalis 및 Vibrio cholerae의 SOD와 가장 유사하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제6권2호
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• pp.79-85
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• 1996

By using a T7 expression system, a large amount of Bacillus stearothermophilus endo-xylanase A (XynA) could be produced in Escherichia coli cells. The overproduced enzyme formed inclusion bodies, and so the protein could be more easily purified to homogeneity. The molecular weight of the purified enzyme was estimated to be 22 kDa by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis and 43 kDa by Sephacryl S-200 gel filtration, suggesting that the native enzyme was a homodimer. The pI value was determined to be 8.4. The Michaelis constants for birchwood xylan and oat spelts xylan were calculated to be 3.83 mg/ml and 5.03 mg/ml, respectively, and the $V_{max}$ max/ values for both xylans were 2.86 $\mu mole$/min. The purified enzyme was most active at $55^{\circ}C$ and pH 8.0, and stable up to $60^{\circ}C$ and in the near neutral pH range. From the zymogram, Bacillus stearothermophilus was found to have at least three xylanases and the purified one was the smallest among them.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제18권2호
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• pp.283-286
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• 2008

The methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase (MTHFDC) from the thermoacidophilic archaeon Thermoplasma acidophilum is a 30.6kDa molecular-mass enzyme that sequentially catalyzes the conversion of formyltetrahydrofollate to methylenetetrahydrofolate, with a preference for NADP as a cofactor, rather than NAD. In order to elucidate the functional and structural features of MTHFDC from archaeons at a molecular level, it was overexpressed in Escherichia coli and crystallized in the presence of its cofactor, NADP, at 295K using polyethylene glycol (PEG) 4000 as a precipitant. The crystal is a member of the monoclinic space group $P2_1$, with the following unit cell parameters: $a=66.333{\AA},\;b=52.868{\AA},\;c=86.099{\AA},\;and\;{\beta}=97.570^{\circ}$, and diffracts to a resolution of at least $2.40{\AA}$ at the synchrotron. Assuming a dimer in the crystallographic asymmetric unit, the calculated Matthews parameter $(V_M)\;was\;2.44{\AA}^3/Da$ and the solvent content was 49.7%.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제50권4호
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• pp.196-201
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• 2007

An intracellular invertase was purified to homogeneity from the cell extract of an alkalophilic and thermophilic Bacillus sp. TA-11, which was classified as a new species belonging to Bacillus cereus based on chemotaxanomic and phylogenetic analyses. The purified enzyme with a recovery of 26.6% was determined to be a monomeric protein with a molecular weight of 23 kDa by SDS-PAGE and 26 kDa by gel filtration. The maximum enzyme activity was observed at pH 7.0 and $50^{\circ}C$, and the purified enzyme was stable at the pH range of 5.0 to 8.0 and below $60^{\circ}C$. $K_m$ and $V_{max}$ values of the enzyme for sucrose were 370 mM and 3.0 ${\mu}M$ per min, respectively. The enzyme activity was significantly inhibited by bivalent metal ions ($Hg^{2+}$, $Cd^{2+}$ and $Cu^{2+}$) and sugars (glucose and fructose).

• 한국수산과학회지
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• 제32권1호
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• pp.75-82
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• 1999

탈염된 참치 자숙액 중에 함유되어 있는 정미성분 및 단백질등의 유용성분을 이용할 목적으로 막반응기 장치에서 자숙액을 효소로 가수분해하여 분자량별로 분획하였으며, 그 가수분해물의 정미성을 검색하여 천연 복합조미료 및 조미간장으로서 이용 가능성을 검토하였다. 참치 자숙액 및 그 가수분해물의 주요 분자량은 9,800Da (TBH-10K TBEH-10K), 3,000 Da (TBE-5K TBEH-5K 및 TBE-1K) 및 990Da (TBE-1K TBEH-1K)으로 나타났다. 핵산관련물질 중에서 ATP 및 ADP는 검출되지 않았으며, IMP의 함량이 23.75$\mu$mole/g 으로 가장 많았고, 다음으로 inosine이 9.07 $\mu$mole/g이 였다. 분자량별로 분획된 자숙액 분말엑기스 및 가수분해물의 구성아미노산조성은 차이가 없었으나 유리 아미노산 조성의 함량은 10K, 5K, 1K 순으로 증가하였다. 자숙액의 분말 엑기스중 TBEH-1K아미노산 함량은 glycine ($20.57\%$), glutamic acid ($13.26\%$), alanine ($9.38\%$), proline ($9.06\%$), aspartic acid ($7.35\%$)의 순으로 함량이 많았으며, 이들 아미노산 조성이 전체 아미노산의 약 $60\%$ 정도를 차지하고 있는 것으로 나타났다. 그리고 glycine, proline, alanine, serine의 함량은 약 $42\%$, 감칠맛과 신맛을 내는 아미노산 glutamic acid, aspartic acid의 함량은 $21\%$로 전체 아미노산의 $63\%$가 조미료 개발에 유용한 아미노산으로 이루어져 있었다. 자숙액 가수분해물 중 TBEH-1K는 양호한 맛과 관련된 아미노산들의 함량이 약 $62\%$ 였다. 여러 가지 시판효소로 참치 자숙액을 가수분해시킨 가수분해물들은 관능평가에서 큰 차이는 볼 수 없었지만 분자량별로 분획한것 중에서 TBEH-lK가 가장 높은 점수를 얻었다 복합조미료에 대한 관능평가에서 TBEH-1K는 SCS 및 BCS보다는 낮았지만 $5\%$ 유의수준내에서 관능적으로 유의차가 없었으며, ACS보다는 좋은 평가를 얻었다. 그리고 자숙액 및 그 가수분해물로 제조된 조미간장 원액의 관능평가에서 TBEH-1K가 가장 우수하였으며, TBEH-1K로 제조된 조미간장 원액과 양조간장을 50 : 50(v/v)로 혼합한 혼합간장은 현재 시판되고 있는 산분해 화학간장의 대체품으로 이용할 수 있을 것으로 판단되었다.

• 천문학회보
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• 제44권1호
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• pp.67.4-67.4
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• 2019

We present preliminary results of our long-term (2009-2017) observing campaign using the NASA IRTF at Mauna Kea, to obtain $2-5{\mu}m$ spectroscopy of ~200 red point sources in the line of sight to the Galactic center. Point sources in our sample were selected from the mid-infrared images of the Spitzer Space telescope, and include candidate massive young stellar objects, which have previously been identified from our Spitzer/IRS spectroscopy. We show high foreground extinction of these sources from deep $3.1{\mu}m$ H2O ice and aliphatic hydrocarbon absorption features, suggesting that they are likely located in the central 300 pc region of the Galactic center. While many sources reveal photospheric $2.3{\mu}m$ gas CO absorption, few of them clearly indicate $3.54{\mu}m$ CH3OH ice absorption, possibly indicating a large dust column density intrinsic to a massive young stellar object.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제25권5호
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• pp.696-703
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• 2015

A gamma-aminobutyric acid (GABA)-producing microorganism was isolated from jeot-gal (anchovy), a Korean fermented seafood. The isolate, A156, produced GABA profusely when incubated in MRS broth with monosodium glutamate (3% (w/v)) at 37℃ for 48 h. A156 was identified as Lactobacillus sakei by 16S rRNA gene sequencing. The GABA conversion yield was 86% as determined by GABase enzyme assay. The gadB gene encoding glutamate decarboxylase (GAD) was cloned by PCR. gadC encoding a glutamate/GABA antiporter was located immediately upstream of gadB. The operon structure of gadCB was confirmed by RT-PCR. gadB was overexpressed in Escherichia coli BL21(DE3) and recombinant GAD was purified. The purified GAD was 54.4 kDa in size by SDS-PAGE. Maximum GAD activity was observed at pH 5.0 and 55℃ and the activity was dependent on pyridoxal 5'-phosphate. The K_m and V_max of GAD were 0.045 mM and 0.011 mM/min, respectively, when glutamate was used as the substrate.

• 한국수산과학회지
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• 제31권5호
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• pp.637-644
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• 1998

우리나라 근해에 많이 분포하고 있는 말똥성게 (sea urchin, Hemicentrotus pulcherrimus)의 내장으로부터 Triton X-100을 이용하여 $\beta$-galactosidase를 추출하고, $40\~80\%$ (w/v) $(NH_4)_2SO_4$, DEAE-Sephadex A-25 및 CM-Cellulose 이온교환 크로마토그래피, Con A-Sepha-rose 4B 친화성 크로마토그래피를 사용하여 분리, 정제하여 그 생화학적 특성을 조사한 결과는 다음과 같다. 정제된 $\beta$-galactosidase는 단일의 단백질로 이루어진 효소로 판명되었고, 효소의 정제도는 조효소에 비해 384.6배 증가하였고, 수율은 $1.26\%$이었다. 정제효소의 최적 pH와 온도는 각각 3.0 및 $50^{\circ}C$ 이었다. 효소의 활성은 $Ba^{2+}$와 같은 금속이온에 의해 촉진되었고, $Hg^{2+},\;Sn^{2+}$ 및 DFP에 의해 현저하게 저하되었으며, 당인 galactose 와 lactose에 의해 저하되어 기질 저해 효과가 나타남을 알 수 있었다. 효소의 분자량은 SDS-PAG 전기이동과 Sephadex G-150 겔여과를 실시한 결과 97 kDa로 나타났다. 합성기질인 PNPG를 사용하여 효소의 속도론적 상수를 측정한 결과 $K_m$은 15.0mM, $V_{max}$는 $\mu$mole/min$\cdot$mg$\cdot$protein으로 나타났다.