There has been a number of attempts to apply 3D CAD data created in the design stage of product life cycle to various applications of the other stages in related industries. But, 3D CAD data requires a large amount of computing resources for data processing, and it is not suitable for post applications such as distributed collaboration, marketing tool, or Interactive Electronic Technical Manual because of the design information security problem and the license cost. Therefore, various lightweight visualization formats and application systems have been suggested to overcome these problems. However, most of these lightweight formats are dependent on the companies or organizations which suggested them and cannot be shared with each other. In addition, product structure information is not represented along with the product geometric information. In this paper, we define a dataset called prod-X3D(Enhanced X3D Dataset for Web-based Visualization of 3D CAD Product Model) based on the international standard graphic format, X3D, which can represent the structure information as well as the geometry information of a product, and propose a translation method from 3D CAD data to an prod-X3D.
BldD, a developmental transcription factor from Streptomyces coelicolor, is a homodimeric, DNA-binding protein with 167 amino acids in each subunit. Each monomer consists of two structurally distinct domains, the N-terminal domain (BldD-NTD) responsible for DNA-binding and dimerization and the C-terminal domain (BldD-CTD). In contrast to the BldD-NTD, of which crystal structure has been solved, the BldD-CTD has been characterized neither in structure nor in function. Thus, in terms of structural genomics, structural study of the BldD-CTD has been conducted in solution, and in the present work, mainchain NMR assignments of the recombinant BldD-CTD (residues 80-167 of BldD) could be achieved by a series of heteronuclear multidimensional NMR experiments on a [$^{13}C/^{15}N$]-enriched protein sample. Finally, the secondary structure prediction by CSI and TALOS+ analysis using the assigned chemical shifts data identified a ${\beta}-{\alpha}-{\alpha}-{\beta}-{\alpha}-{\alpha}-{\alpha}$ topology of the domain. The results will provide the most fundamental data for more detailed approach to the atomic structure of the BldD-CTD, which would be essential for entire understanding of the molecular function of BldD.
Transactions of the Korean Society of Automotive Engineers
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v.20
no.3
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pp.67-76
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2012
In this paper, collision analysis of the full rake for the Next Generation High-speed EMU is conducted using a 3D/1D hybrid model, which combines 3-dimensional (3D) front-end structure of finite element model and 1-dimensional (1D) multi-body dynamics model in order to analyze train collision with a standard 3D deformable obstacle. The crush forces, passengers' accelerations and energy absorptions of a full rake train can be easily obtained through a simulation of a 1D dynamics model composed of nonlinear springs, dampers and masses. Also the obtained simulation results are very similar to those of a 3D model if an overriding behavior does not occur during collision. The standard obstacle in TSI regulation has been changed from a rigid body to a deformable body, and therefore 3D collision simulations should be conducted because their simulation results depends on the front-end structure of a train. According to the obstacle collision analysis of this study, the obstacle collides with the driver's upper structure after overriding over the front-end module. The 3D/1D hybrid model is effective to evaluate a main energy-absorbing module that is frequently changed during design process and reduce the need time of the modeling and analysis when compared to a 3D full car body.
The Journal of Korean Institute of Electromagnetic Engineering and Science
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v.22
no.9
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pp.919-925
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2011
In this paper, we designed and analyzed a 3D isotropic bulk structure consisting of thin wires and SRR's(Split Ring Resonator) with which the permittivity and permeability can be controlled at the same time. For the 3D isotropic bulk structure, first of all, the geometry seen by three main axes must look alike. Thus, we adopted the orthogonal thin wires and symmetrical SRR's. As a result, we constructed metamaterial bulk structures of which effective relative permittivity and permiability are about -0.6 and -1.5, respectively. Its refractive index is about -0.95 in each direction(x, y and z direction). The computed Brillouin dispersion diagram also showed that the proposed structure is almost near isotropic.
This paper presents a double excited three degree-of-freedom (3DOF) motor. The proposed 3DOF motor is designed with a laminated structure, making it easy to manufacture. In addition, it has windings on the stator and rotor, and does not require an expensive permanent magnet. We explain the structure, principle of motion, and design of the proposed motor, and perform an analysis of the static characteristics using the two- and three-dimensional finite element methods (3D FEM). The feasibility of 3D FEM analysis is confirmed by comparing the 3D FEM analysis and experimental results for the rolling and pitching motion. We also confirm the occurrence of holding torque in every motion.
Maisha Tasneem;Shipan Das Gupta;Monira Binte Momin;Kazi Modasser Hossain;Tasnim Binta Osman;Fazley Rabbi
Genomics & Informatics
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v.21
no.1
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pp.7.1-7.11
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2023
The gram-positive bacterium Listeria monocytogenes is an important foodborne intracellular pathogen that is widespread in the environment. The functions of hypothetical proteins (HP) from various pathogenic bacteria have been successfully annotated using a variety of bioinformatics strategies. In this study, a HP Imo0888 (NP_464414.1) from the Listeria monocytogenes EGD-e strain was annotated using several bioinformatics tools. Various techniques, including CELLO, PSORTb, and SOSUIGramN, identified the candidate protein as cytoplasmic. Domain and motif analysis revealed that the target protein is a PemK/MazF-like toxin protein of the type II toxin-antitoxin system (TAS) which was consistent with BLASTp analysis. Through secondary structure analysis, we found the random coil to be the most frequent. The Alpha Fold 2 Protein Structure Prediction Database was used to determine the three-dimensional (3D) structure of the HP using the template structure of a type II TAS PemK/MazF family toxin protein (DB ID_AFDB: A0A4B9HQB9) with 99.1% sequence identity. Various quality evaluation tools, such as PROCHECK, ERRAT, Verify 3D, and QMEAN were used to validate the 3D structure. Following the YASARA energy minimization method, the target protein's 3D structure became more stable. The active site of the developed 3D structure was determined by the CASTp server. Most pathogens that harbor TAS create a crucial risk to human health. Our aim to annotate the HP Imo088 found in Listeria could offer a chance to understand bacterial pathogenicity and identify a number of potential targets for drug development.
Recently, as a part of the production of spatial information by smart cities, three-dimensional reproduction of structures for reverse engineering has been attracting attention. In particular, terrestrial LiDAR is mainly used for 3D reproduction of structures, and 3D reproduction research by UAS has been actively conducted. However, both technologies produce blind spots due to the shooting angle. This study deals with vertical structures. 3D model implemented through SfM-based image analysis technology using UAS and reproducibility and effectiveness of 3D models by terrestrial LiDAR-based laser scanning are examined. In addition, two 3D models are merged and reviewed to complement the blind spot. For this purpose, UAS based image is acquired for artificial rock wall, VCP and check point are set through GNSS equipment and total station, and 3D model of structure is reproduced by using SfM based image analysis technology. In addition, Through 3D LiDAR scanning, the 3D point cloud of the structure was acquired, and the accuracy of reproduction and completeness of the 3D model based on the checkpoint were compared and reviewed with the UAS-based image analysis results. In particular, accuracy and realistic reproducibility were verified through a combination of point cloud constructed from UAS and terrestrial LiDAR. The results show that UAS - based image analysis is superior in accuracy and 3D model completeness and It is confirmed that accuracy improves with the combination of two methods. As a result of this study, it is expected that UAS and terrestrial LiDAR laser scanning combination can complement and reproduce precise three-dimensional model of vertical structure, so it can be effectively used for spatial information construction, safety diagnosis and maintenance management.
The purpose of this study was to develop a 3D mesh-type impact protection pad with excellent motion adaptability and functionality by applying 3D printing technology. The hexagonal 3D mesh, which constitutes the basic structure of the pad, comprises two types: small and large. The bridge connecting the basic units was designed as the I-type, V-type, IV-type, and VV-type. After evaluating the characteristics of the bridge, it was found that the V-type bridge had the highest flexibility and tensile elongation. The hip joint pad and knee pad were completed by combining the hexagonal 3D mesh structure with the optimal bridge design. The impact protection pad was printed using a fused deposition modeling-type 3D printer with a filament made of thermoplastic polyurethane material, and the protection pad's performance was evaluated. When an impact force of approximately 6,500N was applied to the pad, the force attenuation percentage was 78%, and when an impact force of approximately 8,000N was applied, the force attenuation percentage was 75%. Through these results, it was confirmed that the 3D-printed impact protection pad with a hexagonal 3D mesh structure connected by a V-shaped bridge developed in this study can adapt to changes in the body surface according to movement and provides excellent impact protection performance.
Proceedings of the Korea Electromagnetic Engineering Society Conference
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2005.11a
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pp.293-296
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2005
This paper presents the design of linear and circular polarization baseball- shaped circular microstrip antenna (BCMA) with 3-dimensional structure using perturbation effect to reduce its size, which runs at 1.575GHz frequency bandwidth. As a result, the size of linear polarized antenna could be reduced up to 23.7% in patch diameter and 41.8% in its area. Linear polarized antenna has -26.04dB of return loss, 69MHz(4.38%) of -l0dB bandwidth, 4.51dBd of gain, and its -3dB beamwidth are 99$^{\circ}$ in E-plane, 83$^{\circ}$ in H-plane. Circular polarized antenna has -17.43dB of return loss, 113.7MHz(7.2%) of -l0dB bandwidth, 2dBd of gain, 2dB of axial ratio and its -3dB beamwidth are 87$^{\circ}$, 86$^{\circ}$ x-axis polarized, 80$^{\circ}$, 84$^{\circ}$ y-axis polarized. It has 82mm of diameter, which is 28.5% of linear polarized CMPA. Therefore, in this paper we verified that baseball-shaped 3-dimensional structure of circular microstrip patch antenna applied with perturbation effect is appropriate for miniaturization.
As increasing interests for cultural content, 3D restoration about the valuable traditional architectures is in progress, nowadays. Digital restoration is generally performed with using new IT technology and equipments such as 3D scanner. From the view points of making better use of the 3D data, the methodology for 3D restoration leaves much room for improvement. When using 3D scanner, it is possible to get precise 3D data for exterior of the building but huge data size and insufficient information for the wooden intra structure might be obstacles for using them as a source of various digital contents. In traditional wooden structure, the binding rules for corresponding architectural components are important factor for realizing the architectural culture at that times. In this paper, we develop a design tool and architectural components reflecting the wooden intra structure. Moreover, we propose a new 3D restoration method from the design tool, which is good for making contents offering useful information for processes of construction and binding rule in a real time just at a glance.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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