• Title/Summary/Keyword: 탐침자

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Recent Progress in Multiplexed Detection of Biomarkers Based on Quantum Dots (양자점 기반 다중 바이오마커 검출법의 연구동향)

  • Kim, Yerin;Choi, Yu Rim;Kim, Bong-Geun;Na, Hyon Bin
    • Applied Chemistry for Engineering
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    • v.33 no.5
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    • pp.451-458
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    • 2022
  • Semiconductor quantum dots (QDs) are optical probes with excellent fluorescence properties. Therefore, they have been applied to various bio-medical imaging techniques and biosensors. Due to the unique optical characteristics of wide absorption and narrow fluorescence energy bands, multiple types of signals can be generated by the combination of fluorescence wavelengths from different QDs, which enables the simultaneous detection of more than two biomarkers. In this review, the advantages and applications of QDs and QD nanobeads (QBs) in multiple biomarker assays were described, and new developments or improvements in multiplexed biomarker detection techniques were summarized. In particular, recent reports were summarized, focusing on the design strategies in immunoassay construction and signal transducing materials for fluorescence-linked immunosorbent assays using QDs and immunochromatographic assays using QBs. New detection platforms will be developed for early diagnosis of diseases and other fields if multiplexed detection technologies of excellent accuracy and sensitivity are combined with artificial intelligence algorithms.

The $Fc{\gamma}$ receptor III genotype as a risk factor for aggressive periodontitis in Korean patients (한국인 급진성 치주염 환자의 위험요소로서 $Fc{\gamma}$ III 수용기의 유전형)

  • Kim, Myung-Hyun;Shin, Seung-Yun;Kim, Tae-Il;Seol, Yang-Jo;Lee, Yong-Moo;Rhyu, In-Chul;Chung, Chong-Pyoung;Han, Soo-Boo;Ku, Young
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • v.36 no.1
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    • pp.113-123
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    • 2006
  • 연구배경 IgG에 대한 $Fc{\gamma}$ 수용기는 치주병인균에 대한 숙주 반응에 있어서 중요한 역할을 하는데, 이 중 $Fc{\gamma}RIIIa$는 NK 세포, 대식세포, 단핵구, ${\gamma}{\delta}T$세포에서 발현되며, EC2 도메인에서 158 아미노산 부위의 valine (V)-phenylalanine (F)의 유전자다형성을 보인다. $Fc{\gamma}RIIIb$는 특이적으로 중성구에 발현되는데, extracellular (ECl) Ig-like 도메인 내 4개의 아미노산 치환(substitutions)에 의한 NA1-NA2 유전자다형성을 보인다. 이 연구의 목적은 한국인에서 급진성 치주염 환자와 $Fc{\gamma}III$ 수용기의 유전자다형성과의 관련성을 알아보는 것이다. 연구방법 및 재료 치주적으로 건강한 90명 (대조군, 남자 64명, 여자 26명)과 서울대학교 치과병원 지주과에 내원하여 급진성 치주염으로 진단된 환자 43명 (aggressive periodontitis patients: AgP, 남자 30명, 여자 13명)을 대상으로 하였다. 모든 실험 대상자는 임상 실험에 대해 동의 하였고, 초진 시 전자 탐침(Florida Probe(R) Co. Gainesville, FL)을 이용하여 탐침 시 치주낭 깊이 (PPD), 임상부착수준 (CAL), 치태지수(PI), 탐침 후 출혈지수 (BOP)를 측정하였다. 또한 이들의 정맥혈에서 추출한 DNA를 PCR법, 전기영동법 등을 이용하여 $Fc{\gamma}RIIIa$, $Fc{\gamma}RIIIb$의 대립 유전자의 존재여부를 확인하였다. 이를 바탕으로 $Fc{\gamma}RIII$ 복합 유전형을 확인하여 각 군 간을 비교하였다. 연구 결과 1. $Fc{\gamma}RIIIa$에 대한 유전자다형성 연구 결과 대조군과 급진성 치주염 환자 군(AgP)사이에서는 대립 유전자 분포가 서로 유의성 있는 차이를 나타내었고 (P<0.05), $Fc{\gamma}RIIIb$에서는 유의성 있는 차이를 발견할 수 없었다. (P>0.05) 2. $Fc{\gamma}RIIIa$ 158F 대립형질이 급진성 치주염 환자에서 유의성 있게 많이 발견되어졌다. (P<0.05) 결론 이 연구를 통하여 $Fc{\gamma}RIIIa$ 유전자의 분석이 한국인의 급진성 치주염에 대한 감수성의 위험요소의 표지자로 활용할 수 있을 것으로 사료되며, 향 후 더 많은 환자를 대상으로 히는 추가 연구가 필요하다고 생각된다.

The Prevalence of Oral Spirochetes in Korean Adult Periodontitis (한국인 성인성 치주염 환자에서의 구강 스피로헤타의 분포)

  • Kim, Hay-Hyun;Choi, Bong-Kiu;Choi, Seong-Ho;Chai, Jung-Kiu;Kim, Chong-Kwan;Cho, Kyoo-Sung
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • v.28 no.4
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    • pp.659-678
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    • 1998
  • In the present study, oligonucleotide probes based on 16S rRNA were taken to investigate the diversity of oral spirochetes without culture method. This is the first study that revealed oral spirochetes of both presently cultivable and uncultured oral spirochetes in Korean adult periodontitis patients. Subgingival plaque samples were taken from diseased sites(probing depth ${\geq}6\;mm$, experimental group, n=116) and healthy sites(probing depth${\leq}3mm$, control 1 group, n=28) in 29 patients with adult periodontitis, and from 20 periodontally healthy subjects(probing depth${\leq}3mm$, control 2 group, n=100). Following being examined under phase-contrast microscope, all samples were submitted to dot-blot hybridization after polymerase chain reacton with eubacterial primers. 5 species-specific probes(TVIN, TDEN, TMAL, TSOC, and TPEC) and 7 group-specific probes(TRE I, TRE II, TRE III, TRE IV, TRE V, TRE VI, and TRE VII) were used one by one for the identification of both cultivable and so far uncultivable oral spirochetes. All probes were labeled with digoxigenin(DIG)-ddUTP and detected by chemilumininescence. The following results were obtained. 1. Under phase-contrast microscope, 91.37% and 14.28% of oral spirochetes were observed in the experimental and control 1 groups, respectively. None of oral spirochetes were observed in control 2 group. 2. With universal probe, 98.27%, 46.42%, and 22.0% of oral spirochetes were observed in experimental, control 1, and control 2 groups, respectively. 3. With specific probe, 95.68%, 35.71%, and 19.0% of oral spirochetes were observed in experimental, control 1, and control 2 groups, respectively. 4. With species-specific probes, T. socranskii were recovered in a high percentage of sites(81.89%) examined, followed by T. maltophilum(50.0%), T. vincentii(36.20%), T. denticola(13.79%), respectively. With group- specific probes, TRE IV was recovered in a high percentage of sites(85.34%) examined, followed by TRE II(77.58%), TRE I(56.89%), TRE III(25.86%), TRE VI(5.17%), and TRE V(2.58%), respectively. 5. T. vincentii were only observed in the diseased sites, not in the healthy sites. 6. Neither T. pectinovorum nor group VII oral spirochetes were observed in any sites. The findings warrant further investgations of the recovered spirochetes to elucidate the possible associations of oral spirochetal prevalence in race and types of periodontitis, pathogenesis of T. vincentii and the possible distributional change of oral spirochetes before and after treatments.

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Clinical effect of smoking on the healing response following scaling and root planing (흡연이 비외과적 치주치료 후 치유반응에 미치는 임상적 영향)

  • Shim, Ji-Yeon;Kim, Tae-Il;Seol, Yang-Jo;Lee, Yong-Moo;Ku, Young;Rhyu, In-Chul;Chung, Chong-Pyoung;Han, Soo-Boo
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • v.36 no.1
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    • pp.125-137
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    • 2006
  • 1. 목적 흡연은 치주질환의 주요한 위험 인자 중의 하나이다. 일반적으로 흡연자는 비흡연자보다 비외과적 및 외과적 치주치료에 대한 반응이 덜 효과적인 것으로 알려져 있다. 이 연구에서는 중등도의 만성 치주염이 존재하는 한국인 흡연자와 비흡연자를 대상으로 하여, 비외과적 치주치료인 치석 제거술과 치근 활택술을 시행한 후 6개윌 동안의 임상적 치유 반응을 비교해 보고자 하였다. 2. 방법 20명의 중등도 만성 치주염 환자(흡연자 10명, 비흡연자 10명)를 대상으로 치주낭 깊이(Probing Pocket Depth, PPD), 치은퇴축(GR), 치주탐침시 출혈유무(BOP), #16, 12, 24, 32, 36, 44의 치태지수(Plaque Index, Silness & $L{\"{o}}e$ 1964)를 임상변수로 측정하였다. 치주낭 깊이 (PD)와 치은퇴축(GR)은 전자 탐침(Florida $Probe^{(R)}$ Co. Gainesville, FL)을 이용하여 각 치아당 6군데를 측정하였다. 임상적 부착 수준(CAL)은 치주낭 깊이(PD)와 치은퇴축(GR)의 합으로 계산하였다. 초진시에 전악 임상 검사를 시행하였고, 초진시의 치주낭 깊이에 따라 조사 대상이 되는 치아 부위를 선정하였다. 치주적으로 건강한 부위 $(PD{\leq}3mm)$를 대조군인 1군으로 하고 치주낭 깊이가 4 mm를 초과하고 5 mm 미만인 부위를 2군, 5 mm 이상의 치주낭 깊이를 가지는 부위를 3군으로 설정하였다. 비외과적 치주치료인 치석 제거술, 치근 활택술과 구강위생 교육을 시행하였고 2개월(T1), 4개윌(T2), 6개윌(T3)에 선정된 해당 치아 부위에 대해 임상 재검사를 시행하였다. 3. 결과 BOP와 Plaque Index는 초진, 2, 4, 6개월에 흡연자와 비흡연자 간에 유의할 만한 차이가 없었으나 전반적으로 감소하는 경향이 나타났다. 대조군인 l군에 서는 흡연자와 비흡연자 간에 모든 시기에서 PD, GR, CAL에 유의할 만한 차이가 없었다. 치주낭 깊이가 4 mm를 초과하고 5 mm 미만인 2군에서는 비흡연자에서 6개월에 유의할 만한 치주낭 깊이 감소가 나타났으며, 4개월과 6개윌에 유의할 만한 부착수준의 증가가 관찰되었다(p<0.05). 치주낭 깊이가 5 mm이상인 3군에서는 비흡연자에서 치주낭 깊이 감소가 일관되게 더 많이 나타났으나 통계학적으로 유의할 만한 차이는 6개월째에서만 관찰되었다. 2군과 유사하게 치주낭 갚이 감소는 흡연자보다 비흡연자에서 0.6 mm 더 크게 나타났다. 부착수준의 획득은 2군에서는 4, 6개월째에, 3군에서는 6개월째에 비흡연자에서 유의하게 더 많이 일어났다. 초진시의 치주낭 깊이와 각 시기별 ${\Delta}PD$ 간의 상관관계에서는 치주낭 갚이가 5mm 이상인 3군에서 비흡연자의 경우 6개월째에 가장 강한 상관성이 나타났다($r_s=0.43$, p<0.05). 흡연자에서는 3군에서 어떠한 유의한 상관관계도 나타나지 않았다. 결론적으로 중등도 만성 치주염 환자를 대상으로 한 6개윌의 단기간 연구에서 비외과적 치주치료 후 흡연자에서 비흡연자보다 치주낭 깊이 감소의 개선과 부착수준의 획득이 더 적게 나타나 임상적 치유반응이 좋지 않음을 확인하였다. 이는 흡연이 숙주의 치유반응 부정적인 영향을 주기 때문으로 생각된다.

표준기용 Spectroscopic Ellipsometer 제작

  • 조용재;조현모;김현종;신동주;이윤우;이인원
    • Proceedings of the Korea Crystallographic Association Conference
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    • 2002.11a
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    • pp.38-39
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    • 2002
  • Spectroscopic ellipsometer(SE)는 박막의 두께, 굴절률, 흡수율, 에너지 갭, 결정상태, 밀도, 표면 및 계면의 거칠기 등에 관한 유용한 정보들을 제공한다. (1-3) SE는 빛을 탐침으로 사용하기 때문에 비파괴적이고 비접촉식 박막물성 측정방법이며 편광변화에 대한 상대적 물리량을 측정함으로써 정밀도와 재연성이 매우 높은 장점들을 갖고 있다. 따라서 SE는 반도체 메모리 소자, 평판 디스플레이, DVD와 CD와 같은 데이터 저장장치 등을 제작하는 공정에서 박막에 관련된 공정계측장비로 사용되고 있다. 특히, 최근의 차세대 반도체 소자 개발에 관한 연구 등(4-6)에서는 수 nm 두께의 다양한 초박막들에 관한 물성연구가 주관심사이기 때문에 최고의 성능을 갖는 계측장비와 기술이 요구되고 있다. 따라서 본 연구에서는 그림과 같은 편광자(polarizer)-시료(sample)-검광자(analyzer)로 구성된 PSA구조의 표준기용 rotating-analyzer SE를 제작하게 되었다. 현재까지 개발된 ellipsometer의 수많은 종류들 중에서 null 형, rotating element 형, 그리고 phase modulation 형이 가장 많이 사용되고 있다. 여기서 element란 polarizer, analyzer, 또는 compensator와 같은 광 부품들을 지칭하는데 이 중 하나 또는 둘을 회전시키기 때문에 그 종류 또한 매우 많다. 이들 중에서 회전검광자형 ellipsometer는 입사각 정렬이 우수하고, 파장에 무관한 편광기만 사용하므로 비교적 넓은 광량자 에너지영역에서 정확도 높은 데이터를 얻을 수 있기 때문에 박막 상수의 정밀측정에 가장 적합하다. 특히, 본 연구에서 제작된 ellipsometer에는 간섭계 장치, polarizer tracking,(2) zone average,(1) 그리고 low-pass filter 등을 사용함으로써 측정오차를 최대한 줄이는 노력을 하였다.

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MLPA Applications in Genetic Testing (유전자진단에 있어서 Multiplex Ligation Dependent Probe Amplification (MLPA)의 이론과 실제)

  • Kim, Gu-Hwan;Lee, Beom-Hee;Yoo, Han-Wook
    • Journal of Genetic Medicine
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    • v.6 no.2
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    • pp.146-154
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    • 2009
  • Multiplex ligation dependent probe amplification (MLPA) is a PCR-based method to detect gene dosage. Since its introduction, MLPA has been used to test a large number of genes for major deletions or duplications. Genetic testing, as a diagnostic tool for genetic disease, has been used primarily to identify point mutations, including base substitutions and small insertions/deletions, using PCR and sequence analysis. However, it is difficult to identify large deletions or duplications using routine PCR- gel based assays, especially in heterozygotes. The MLPA is a more feasible method for identification of gene dosage than another routine PCR-based methods, and better able to detect deleterious deletions or duplications. In addition to detection of gene dosage, MLPA can be applied to identify methylation patterns of target genes, aneuploidy during prenatal diagnoses, and large deletions or duplications that may be associated with various cancers. The MLPA method offers numerous advantages, as it requires only a small amount of template DNA, is applicable to a wide variety of applications, and is high-throughput. On the other hand, this method suffers from disadvantages including the possibility of false positive results affected by template DNA quality, difficulties identifying SNPs located in probe sequences, and analytical complications in quantitative aspects.

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Transcriptional Regulation of the Murine Dopamine Receptor Regulating Factor (DRRF) Gene (생쥐 도파민 수용쳬 조절인자 (DRRF) 유전자의 전사조절)

  • Kim Ok Soo;Lee Young-Choon;Lee Sang-Hyeon
    • Journal of Life Science
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    • v.15 no.1 s.68
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    • pp.55-60
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    • 2005
  • The murine dopamine receptor regulating factor (DRRF) gene is transcribed from a TATA-less promoter that has several putative Sp1 binding sites. The present investigation identifies functional transcription factors that modulate the expression of this gene, In the $D_2-expressing$ NB41A3 cells, Spl potently activates transcription from the DRRF promoter in pCAT-DRRF-1153/+17, but DRRF effectively inhibits it. Deletion of the 31 bp fragment between -1153 and -1122 decreased transcription down to about $60\%$. This fragment contains a functional API binding site. In addition, deletion of the 129 bp region between -901 and -772 further decreased transcription. The latter region has a functional AP2 binding site. Using a DRRF_AP1 (bases -1153 to -1121) probe, a specific retarded band was observed, and the unlabeled AP1 consensus competitor could effectively compete away this retarded band. In addition, using a DRRF_AP2 (bases -873 to -846), a specific retarded band was observed, and the unlabeled AP2 consensus competitor could effectively compete away this retarded band. The present observations suggest that Spl and DRRF regulate the DRRF promoter and that both API and AP2 also modulate this gene.

Measurement of Polymer Chain Depletion Layer in the Poly(vinyl alcohol)/Dimethyl Sulfoxide/Polystyrene Latex System by Dynamic Light Scattering (동적 광산란법에 의한 폴리(비닐 알코올)/디메틸설폭사이드/폴리스티렌 라텍스 계에서의 고분자 사슬 배제층 측정)

  • Eom, Hyo-Sang;Park, Il-Hyun
    • Polymer(Korea)
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    • v.36 no.5
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    • pp.628-636
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    • 2012
  • The polymer concentration dependence of depletion layer was investigated by means of dynamic light scattering after the very small amount of polystyrene spherical latex particles was added into the matrix solution of poly(vinyl alcohol)(PVA)/dimethyl sulfoxide. At the dilute regime, the magnitude of depletion layer kept constant at the level of $63{\pm}3%$ of the radius of gyration of the corresponding PVA chain. Next, at the early semi-dilute regime of $1.5{\leq}C[{\eta}]{\leq}3$, polymer concentration dependence of the layer thickness ${\delta}$ was obtained as ${\delta}{\sim}C^{-0.8}$, and this experimental value was very close to theoretical one of -0.75. However it was observed above $C[{\eta}]$ >3 that its thickness decreased abruptly, and this was ascribed to aggregation effect of latex particles which was driven by Oosawa type attractive interaction.

A Study on Polymeric Membranes for Oxygen-electrode System (산소전극 시스템에 사용되는 고분자막에 관한 연구)

  • 박희영;김현준;정용섭;홍석인
    • Proceedings of the Membrane Society of Korea Conference
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    • 1995.04a
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    • pp.52-53
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    • 1995
  • 현재 상용화 되어있는 산소/질소 분리용 고분자 분리막은 비교적 낮은 선택도를 가지고 있다. 즉, 이점은 확산도와 용해도를 조절함으로써 분리막의 투과선택도를 높일 수 있는 가능성을 보여주고 있으며 보다 높은 투과도와 투과선택도를 갖는 새로운 고분자 재료의 선택이 분리막을 통한 기체 분리나 그 상업적 이용에 절실히 요구되고 있다. PSf는 상용성, 화학적 내구력, 강도, 높은 유리전이온도와 우수한 기체투과성질을 가진 고분자로 분리막에 많이 응용되고 있다. Erb 등은 용매로 DMF(dimethylformamide)와 THF(tetrahydrofuran)를 사용하여 막을 제조하였다. 상부 흐름압력이 5atm일때 각 기체의 투과도 계수는, 헬륨이 11, 이산화탄소가 5.5, 메탄이 0.5, 질소가 0.2였으며, PSf막에 대한 각 기체의 투과는 Henry mode보다 Langmuir mode에서 더욱 우세하게 일어난다고 생각하였다. 또한 Ghosal 등은 PSf에 nitro기를 도입한 nitrated PSf의 투과특성을 조사하였다. 실험결과 nitro group이 치환된 PSf막이 nitro group이 없는 막에 비해 투과도는 낮았지만 선택도는 증가하였다. 구조가 다른 여러가지의 PSf막을 통한 기체 투과성질은 Ghem 등에 의해 밝혀졌다. Membrane-covered probes를 이용한 폴라로그램(polarogram) 방법은 산소를 측정하는데 가장 보편적인 방업ㅂ으로, 산소 탐침(oxygen probe)의 원리는 소위 효소 전극을 발전시키는데 이용되어 왔다. 효소전극은 산소와 실험하고자 하는 물질간의 특정한 효소반응에 기초를 둔 다양한 물질의 선택적 측정을 위한 것이다. 이때 센서에 응용되는 합성막은 산소에 대해 선택적인 투과를 해야하며, 상대적으로 높은 산소확산계수와 물에 대해서는 낮은 투과도를 가져야 한다. 높은 산소확산계수는 반응을 빠르게 하는 잇점이 있으며 물에 대한 낮은 투과도는 센서내의 전해질 물질을 유지보호하는 역할을 한다. 분리막이 산소전극에 이용될 경우 높은 산소 확산계수 이외에도 적절한 기계적 강도, 열적 안정성 등이 요구된다.

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Distribution of Periodontal Status and Treatment Need between Smoker and Nonsmoker (흡연자와 비흡연자의 치주상태 및 치주치료요구도 - 일부 대학생 흡연자 중심 -)

  • Cho, Myung-Sook;Kim, Young-Sun;Jeong, Hyun-Ja
    • Journal of Korean society of Dental Hygiene
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    • v.1 no.1
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    • pp.111-123
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    • 2001
  • Objectives : The purpose of this study was to investigate distribution of periodontal status and treatment need between smokers and nonsmokers. Methods : Interview and measurement was completed by 82 smoker students and 59 nonsmoker students in Taegu Health College from April 1 to 31, 2001. The community periodontal index of treatment needs(CPITN) was analyzed by percentage. Results : In distribution of CPITN by age, almost all subjects had periodontal diseases except for aged 20~24 years nonsmokers(4%). Smoking 5 cigarettes per a day, up to 10, and above 10 increased 5.3%. 7.1%. and 9.5% in 4 score of CPITN, respectively. In years of smoking, smokers who had above 5 years(13.5%) were higher than below those(6.7%), 20% for smoker who take tooth brushing once per a day had higher than 8.3%(or three in depth of pocket above 6mm. In treatment need, all subjects should take education(or oral health except for aged 20~24 years nonsmokers(4%), 96% of smokers and nonsmokers were need scaling. Conclusion : This study indicated that treatment needs for periodontal diseases and scaling in smoker were higher than nonsmoker those.

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