The paleogenetic analysis has become an increasingly important subject of archaeological, anthropological, biological as well as public interest. Recently, scientific research for human skeletal remains was more activated because of increasing awareness of the valuable archaeological information by the ancient DNA analysis. State of preservation of organic remains vary in different soil and burying environmental condition. Almost all available tissue disappear to analysis ancient DNA of bone in acidic soil caused by climate and geological features in Korea. Many preserved human remains excavated in the 'Heogwakmyo'(limelayered tomb of Chosun Dynasty Period) is able to explain through the relationship between burial conditions and bone survival form the burial method and ceremony. Ancient DNA analysis of excavated human bone form ancient tomb requires to remove contaminants such as microorganism's DNA and soil components that affect authentic results. Particularly, contamination control of contemporary human DNA is major serious problem and should verified by criteria of authenticity. In order to understand migration and culture of ancient population, when possible, ancient DNA studies needs to go abreast both radiocarbon and stable isotope studies because the dietary inferences will suggest ancient subsistence and settlement patterns. Also when the paleogenetic research supported with the arts and humanities research such as physical anthropology and archaeology, more valuable ancient genetic information is providing a unique results about evolutionary and population genetics studies to reconstruct the past.
In this study molecular genetic analysis was carried out on 4 human skeletal remains from Osuri, Buyeo. We showed that real-time PCR is the method of the choice to assess the initial number of genuine ancient DNA molecules. Human mitochondrial DNA quantification was accomplished by the real-time PCR for the cytochrome b gene of the mitochondria. Histological results proved to be a good potentiality for biochemical analysis using biomolecule. The level of specimen's preservation state was proved that level of quantitative result was BO-04, BO-01, BO-03, BO-02. Continually, we showed that biochemical and biomolecule results for the level of preservation state were similar. This study will be useful to important material for predicting biochemistry and biology analysis of the ancient bone.
Seo, Min-Seok;Lee, Kyu-Shik;Chung, Yong-Jae;Lee, Myeong-Hui
보존과학연구
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s.22
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pp.27-40
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2001
DNA typing is often used to determine identity from human remains. Recently, the molecular biological analysis of ancient deposits has become possible since methods for the recovery of DNA conserved in bones or teeth from archaeological remains have been developed. In the field of archaeology, one of the most promising approaches is to identify the individuals present in a mass burial site. We performed nuclear DNA typing and mitochondrial DNA sequencing analysis based on PCR from a Korea ancient human remain excavated from Sa-chon Nuk-island and civilian access controlline(CACL). A femur bone were collected and successfully subjected to DNA extraction, quantification, PCR amplification, and subsequently typed for several shot tandem repeat(STR)loci. 4 types of STR systems used in this study were CTT multiplex(CSF1PO, TPOX, TH01), FFv multiplex(F13A01, FESFPS, vWA), Silver STRⅢ multiplex(D16S539, D7S820, D13S317), and amelogenin for sex determination. This studies are primarily concerned with the extraction, amplification, and DNA typing of ancient human bone DNA samples. Also, it is suggestive of importance about closely relationship between both fields of archaeology and molecular biology.
Seo, Min Seok;Cho, Eun Min;Kim, Yun Ji;Kim, Sue Hoon;Kang, So Yeong
Journal of Conservation Science
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v.30
no.4
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pp.409-416
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2014
Most human bones of Joseon Dynasty period are so good condition that we can do research in physical anthropology, genetics and chemistry with them. In this study, we analyzed DNA typing using 6 human bones of Joseon dynasty period excavated at Janggi-dong, Gimpo. The DNA typing was mitochondrial DNA haplotype, Y-chromosome haplotype and sex determination. Prior to DNA analysis, we distinguished histological index of 6 human bones. As the result of mitochondrial DNA analysis, most of bones were confirmed as haplogroup G, R11, M7, A5, etc. As the result of sex determination, 4 human bones were female and 2 human bones were male. The male haplogroup was confirmed as haplogroup O by the single nucleotide polymorphism analysis of Y chromosome. For extensive ancient human bone analysis, researchers need to apply a histological index to select ancient human bones and explain a relationship among ancient human bones with various analyses of mitochondrial and nuclear DNA.
KIM, Mijeong;LEE, Yunseop;CHO, Eunmin;PARK, Sujin;MOON, Minseong
Korean Journal of Heritage: History & Science
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v.55
no.1
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pp.305-321
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2022
The stone chamber tomb in Eungpyeong-ri, Buyeo, is a joint tomb that contains the bodies of two individuals. This paper investigates the relationship between the buried persons and the characteristics of the stone chamber tomb. Based on the geographical location, relics, and the excavated human bones, it was determined that the tomb was built during the Sabi Period of the Baekje Dynasty and that the buried individuals were most probably residents of high stature or government officials. To study the excavated bones, the remains were carefully collected and conservation was carried out. Before collecting samples from the human bones for the analytical research, the results of near-infrared analysis were used to collect the samples for the isotope analysis and DNA analysis. The most important issue when handling the excavation site was the reinforcing agent and the concentration of the agent used. In situations like this, Paraloid B-72 is the most suitable agent. When the shape of human bones was difficult to distinguish from the soil, conservation was performed using X-ray and CT imaging data. The same chemical used for the reinforcement of the site was used to complete a minimum level of conservation to the surface areas where the conservation treatment of removing foreign substances, the reinforcement areas, and bonded areas were carried out. The collagen yield from the sample obtained at selected position was 3.8% to 6.1%. The results of analyzing the stable isotopes of carbon and nitrogen found in the extracted collagen showed that the stable isotope ratios came out to δ13C -18.3‰±0.1‰, -19.0‰±0.1‰ for EBW and δ15N 10.7‰±0.5‰, 10.6‰±0.1‰ for EBE. It is believed the two individuals consumed small amounts of minor cereals, mainly from C3 plants, and protein was obtained from eating terrestrial animals. What's more, the deviations in data obtained from the two individuals were so small that it could be inferred that the individuals ate similar foods. Considering the preservation state of the sample, amplifying DNA for the DNA analysis would have been very difficult since the amount of surviving DNA was so deficient. For DNA analysis, it is anticipated that the results could be derived by applying improved extraction methods that will be developed in the future. In this research, any association between scientific analysis(DNA and stable isotope ratio) and near-infrared spectroscopy was difficult to establish. Further research is needed on the utilization of near-infrared analysis for gathering samples from human bones.
Kang, Soyeong;Kim, Yun-Ji;Cho, Eun Min;Kim, Sue Hoon
Korean Journal of Heritage: History & Science
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v.49
no.4
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pp.38-51
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2016
This study reports on human dietary reconstruction of Joseon Dynasty using stable isotope analysis. The stable carbon and nitrogen isotope values were measured of bone collagen extracted from 25 human bones from archaeological site in Myeongam-ri, Asan. Average values of ${\delta}^{13}C$ and ${\delta}^{15}N$ are $-19.7{\pm}0.5$‰(n=23) and $9.6{\pm}1.1$‰(n=23), respectively. The isotopic data indicates that Myeongam-ri individuals consumed $C_3$ plants mainly and assumed of dietary resourced from a terrestrial animal protein. Previous isotopic studies of the Joseon era suggested that dietary composition of Joseon population was not influenced by region and burial type. Also comparison of the isotopic results of male and female from double burials showed sex-dependent dietary patterns among individuals living in the same circumstances.
Kim, Yun-Ji;Kim, Sue-Hoon;Cho, Eun-Min;Lee, Jeong-won
보존과학연구
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s.36
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pp.33-48
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2015
In this study, ancient DNA analyses were carried out on the human skeletal remains from a historical cemetery site in Myeongam-ri, Asan, Korea. Human remains of 27 individuals out of tombs from the Goryeo to Joseon Dynasty were selected for the analysis of this study. In order to identify the genealogy of the population and traditional burial pattern of the cemetery, we conducted comparative analyses of the hyper variable regions (HVRs) in mitochondrial DNA (mtDNA) of each sample. We sequenced 9 segmental amplicons of HVRs and assigned relevant haplogroups according to the sequence polymorphism on the basis of the known mtDNA database. As a result, we were analyses 18 human remains of 27 individuals and result of amelogenin analysis were only 4 samples.
Shin, Ji Young;Kang, Da Young;Kim, Sang Hyun;Jung, Eui Do
Analytical Science and Technology
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v.26
no.6
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pp.387-394
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2013
We aim to unveil dietary history recorded in Neolithic human bone from Janghang site at Gadeok Island, Busan. Excavation of Janghang site at Gadeok Island from 2010 to 2011 is an outstanding discovery in Korean Neolithic archaeology. A large number of human bones (48 individuals) were found at Janghang site, which is the largest-scale Neolithic cemetery in Korea. We extracted human bone collagen from 10 individuals and stable carbon and nitrogen isotope analysis were carried out using carbon and nitrogen analyzer connected to a continuous-flow isotope-ratio-monitoring mass-spectrometer. Although bone histological analysis shows poor preservation state, stable isotope results correspond well with bone collagen quality indicator, which implies that bone collagen reflects lifetime signature. Stable carbon and nitrogen isotope result indicates highly marinebased diet(${\delta}^{13}$C=$-14.5{\pm}1.3$‰, ${\delta}^{15}$N=$-17.4{\pm}1.7$‰, n=10), however the possible input of terrestrial animal and wild plant cannot be excluded. Our isotopic findings provide an invaluable information on Neolithic subsistence economy in this coastal area. In addition, Janghang site shows specific features in burial methods and burial goods. Two different burial methods of arranging bodies are found with extended burial type and particularly high ratio of flexed burial type. There are also burial goods such as pottery. However, there are no significant isotopic differences according to burial methods and burial goods. Although this is a preliminary study on this site, our research will provide important clues in understanding isotopic dietary history of Korean Neolithic people.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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