• Title/Summary/Keyword: 제한단편

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동위효소 분석과 제한효소 단편 다형화현상을 이용한 보리 품종의 분류 (Varietal Classification of Barley by Isozymes and Restriction Fragment Length Polymorphisms (RFLPs))

  • 진병순;박노동;은무영;이은섭
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제36권3호
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    • pp.139-145
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    • 1993
  • 등전점 전기영동법에 의한 동위효소 분석과 제한효소 단편 다형화현상(RFLP) 분석기법을 이용하여 보리 품종 19종의 품종형을 구분하고 근연관계를 검토하였다. 보리 19품종은 동위효소 형태특성 에 따라 esterase는 7가지형으로, phosphoglucose isomerase는 3가지형으로, peroxidase는 4가지형으로, alcohol dehydrogenase는 2가지 형으로 각각 분류되었으며, 그 핵 DNA를 제한효소 EcoRV로 절단하여 DNA probe pMSU 71로 RFLP를 분석한 결과 2가지 품종형으로 구분되었다. 이 4가지 동위효소의 형태특성 및 핵 DNA의 RFLP 특성을 종합하면 보리 19품종을 13가지 품종형으로 구분할 수 있었다. 이렇게 구분된 13가지 품종형들은 Nei's F-statistics의 계산식으로 그 근연관계를 분석하였더니 $97.4{\sim}66.5%$ 범위의 근연관계를 보였다.

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반복배열된 토마토 phenylalanine ammonia-Iyase(p AL X1, PAL X2) 유전자의 구조해석 (Structural Analysis of Repeated Tomato Phenylalanine Ammonia-Lyase Gene (PAL X1, PAL X2))

  • 이신우;여윤수
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제42권1호
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    • pp.34-38
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    • 1999
  • 토마토의 genome내에는 적어도 5개 이상의 PAL유전자 좌가 존재한다는 사실을 이 등(1992)이 이미 genomic Southern blot hybridization으로 확인하여 보고하였다. 그러나 본 연구에서 제작한 genomic DNA libraries를 대상으로 검색한 결과 기존에 보고된 PAL유전자 이외에 약 15 kb 와 10 kb에 해당하는 큰 EcoRI 단편을 확보 할 수 있었다. 이들 단편을 BamHI, HindIII등 9종의 제한효소를 사용하여 Southern blot hybridization을 행한 결과 PAL X1의 경우는 모든 효소에 대하여 2개의 단편이 hybridization 되었으며, 특히 BamHI으로 절단하여 얻은 3개의 단편중 두 개는 PAL5 유전자의 exon 2 부위에서 취한 oligomer(18 mer)와 primer extension 반응이 진행되어서 약 200 bp의 PAL유전자와 아주 높은 상동성을 갖는 염기서열이 확인되었다. 따라서 PAL X1유전자는 2 copy의 유전자가 나란히 존재하거나 아니면 염색체 재배열이 진행된 것으로 추정된다. 이러한 결과는 적어도 7개 이상의 PAL유전자 좌가 토마토 염색체내에 존재하는 것으로 사료된다.

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토양으로부터 분리한 Klebsiella pneumoniae 의 pullulanase 유전자의 cloning 및 발현

  • 유주현;공인수;정용준;이정기
    • 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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    • 한국미생물생명공학회 1986년도 추계학술대회
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    • pp.518.2-519
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    • 1986
  • 토양으로부터 분리한 질소고정균인 Klebsiella pneumoniae NFB320의 chromosomal DNA를 BamHI으로 절단하여 동일한 제한효소로 절단한 pBR322에 ligation시켜 E. coli HB101에 형질전환을 행하여 pullulanase activity를 나타내는 clone을 얻어내었다. 이 형질 전환체로부터 분리한 pullulanase 유전자가 재조합된 plasmid DNA는 약 10kb의 DNA단편을 가지고 있었으며, 재조합된 plasmid로부터 생산되는 pullulanase의 특성은 최적 활성 pH가 6.0이며, 효소의 pH안정성은 5-10이었다. 또한 형질 전환체로부터 생산되는 pullulanase의 localization,효소활성에 영향을 미치는 온도안정성 둥을 조사하였다.

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정보시스템 감리방법 개선을 통한 소프트웨어 프로젝트관리 (The Software Project Management by Improvement of Audit Method)

  • 고찬;송경열
    • 한국디지털정책학회:학술대회논문집
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    • 한국디지털정책학회 2005년도 추계학술대회
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    • pp.27-43
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    • 2005
  • 정보시스템 감리 시 시간적인 제한과 제한적인 검토로 인하여 문제점 도출에 한계가 있다. 이로 인하여 정보화계획 수립, 분석, 설계, 구현단계 산출물과 시스템에 대한 지적사항이 단편적으로 된다. 본 연구에서는, 정보시스템 감리 보고서에서 지적되었던 프로젝트관리에 대한 검토사항 및 지적사항을 유형별로 분석 하여, 체크리스트를 개선하였고, 이를 적용하여 프로젝트 관리를 효과적으로 하도록 제안하였다. 개선된 체크리스트를 이용하여 정보화 사업관리자가 관리의 포인트로 활용할 수 있고, 감리 시 생산성을 높이며 정보시스템 감리의 품질이 향상 될 것이다. 본 연구에서 제안한 개선된 체크리스트는 향후 자료를 보완하고 유형별 사례를 보완하면 프로젝트 관리 성과 측정 툴로서도 활용될 수 있을 것으로 기대한다.

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공간 제약적인 센서 운영체제를 위한 효율적인 메모리 할당 기법 (An Efficient Memory Allocation Scheme for Space Constrained Sensor Operating Systems)

  • 이상호;민홍;허준영;조유근;홍지만
    • 한국정보과학회논문지:시스템및이론
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    • 제33권9호
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    • pp.626-633
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    • 2006
  • 무선 센서 네트워크는 자연 환경의 정보를 수집하고, 수집된 정보를 가공하고, 가공된 정보를 무선 통신을 통하여 사용자에게 실시간으로 전달하는 기능을 가진 설비이다. 이러한 무선 센서 네트워크는 수백 혹은 수천 개의 무선 센서 노드들로 이루어지고, 센서 노드의 플랫폼은 비용 효율성 때문에 매우 제한적인 메모리 공간을 지니며 제한적인 배터리로 동작한다. 따라서 이것들을 동작시키는 센서 운영체제는 공간 제약성을 감내할 수 있어야 하고, 에너지 효율적으로 동작해야 전체 센서 네트워크를 효율적으로 동작시킬 수 있게 된다. 본 논문에서는 공간 제약적인 센서 운영체제를 위한 효율적인 메모리 할당 기법을 제안한다. 제안한 기법을 사용하면, 기존 센서 운영체제들에서 사용되었던 메모리 할당 기법들을 사용하는 것보다 메모리 단편화 문제를 감소시킴과 동시에 공간의 효율성을 증진시킬 수 있다. 본 논문의 비교 실험 결과를 통하여 제안한 기법을 사용하는 것이 기존의 방법보다 메모리 단편화를 상당히 줄일 수 있고, 또한 수행 시간도 나빠지지 않음을 보인다.

DNA microarray를 이용한 항진균 활성세균 Bacillus lentimorbus WJ5의 유전자 발현 분석 (DNA Microarray Analysis of Gene Expression in Antifungal Bacterium of Bacillus lentimorbus WJ5)

  • 이영근;김재성;장유신;조규성;장화형
    • 미생물학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.141-147
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    • 2003
  • 여러 항진균 활성 관련 유전자들의 발현 수준을 동시에 연구하기 위하여 DNA microarray를 이용하여 유전자들의 발현 패턴을 비교 분석하였다. 본 연구에서는 항진균활성을 가지는Bacillus lentimorbus WJ5의 genomic DNA를 무작위 하게 제한효소로 절단하여 2,000개의 DNA단편을 microarray하였으며, 감마선($^{60}Co$)조사로 유도된 7종의 항진균 활성 결핍 돌연변이체와 발현양상을 정량적으로 비교하였다. Gene Cluster (Michael Risen, Stanford Uniy.)를 이용한 DNA microarray의 분석 결과, 총 408개의 DNA 단편이 발현되는 것을 확인할 수 있었으며, 이들 중 20개의 DNA단편이 항진균 활성 결핍 돌연변이체에서 발현이 억제되는 것으로 나타났다. 특히,pbuX (xanthine permease, K222), ywbA (phosphotransferase system enzyme II, K393), ptsG (PTS glucose specific enzyme II ABC component, K877), yufO (ABC transporter(ATP-binding protein), K1301), 그리고 ftsY (signal recognition particle (docking protein), K868)는 모든 돌연변이체에서 동시에 발현되는 down-regulation된 유전자들로서 물질 이동과 관련된 것으로 보고되어 있으며, 항진균 활성 관련 신호 및 물질의 이동에 관여할 것으로 사료되어진다.

Neisseria lactamica 2118의 $\beta$-galactosidase 유전자의 대장균으로의 클로닝 (Molecular Cloning of $\beta$-Galactosidase Gene from Neisseria lactamica 2118 into Escherichia coli MC 1061)

  • 이종수
    • 자연과학논문집
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    • 제5권1호
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    • pp.37-45
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    • 1992
  • Neisseria lactamica 2118 의 $\beta$-galactosidase 유전자를 Southern Hybridization 과 colony hybridization을 통하여 Escherichia coli MC 1061에 클로닝 시켰다. $\beta$-Galactosidase 유전자를 함유하는 6.5 Kb EcoR I 단편과 7.2 Kb BamH I 단편들을 pMC 1871의 lac Z 유전자를 probe로 한 Southern hybridization으로 얻고 이들을 pBR 322에 삽입한후 Escherichia coli MC 1061에 형질전환 시키고 이들 형질전환체들을 동일 probe로 colony hybridization 시켜 최종적으로 3주의 $\beta$-galactosidase positive clone들을 얻었다. 이들의 재조합 plasmid에는 Neisseria lactomica 2118 염색체 DNA의 약 7.2Kb BamH I 단편이 삽입되어 있음을 확인 하였고 probe와 상동성이 가장 강한것으로 추정되는 pNL 24에 대한 제한효소지도를 작성 하였다.

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퍼지 그래프 기반의 수직 분할 알고리즘 (A Vertical Partitioning Algorithm based on Fuzzy Graph)

  • 손진현;최경훈;김명호
    • 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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    • 제28권3호
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    • pp.315-323
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    • 2001
  • 사용자의 질의 요청을 보다 빨리 지원하고 시스템 전체 처리량을 증가시키기 위한 하나의 방법으로 데이터 스키마의 수직 분할 문제가 많이 연구되어 왔다. 수직 분할의 대표적인 응 용 예로는 중앙 집중 시스템에서의 파일 분할, 분산 데이터베이스에서의 데이터 분산, 메모 리 계층사이의 데이터 분할 등이 있다. 일반적으로 수직 분할 알고리즘은 모든 유용한 단편 들의 생성과 임의 분할 지원 등의 두가지 기능을 효율적으로 지원할 수 있어야 한다. 그러 나, 기존의 제안된 방법들은 대부분 첫 번째 기능에 중점을 두고 있어 임의 분할 기능을 지 원하는데 많은 제한이 있다. 그리고 수직 분할 알고리즘에서 데이터 속성들이 포함될 단편 을 결정할 때 기본적으로 모호성 문제를 가지고 있기 때문에 이에 대한 효과적인 처리가 필 요하다. 본 논문에서는 퍼지 이론에 기반한 효율적인 수직 $\alpha$-분할 알고리즘을 제안한다. 이 방법은 퍼지 그래프 이론을 바탕으로 수직 분할에서의 모호성 문제를 해결하여 복잡한 수학적 계산 없이 모든 유용한 단편들을 생성할 수 있다. 또한, 범용 임의 분할 기능도 효과 적으로 지원할 수 있다.

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시나리오 기반 이미지 개발을 통한 파일 카빙 도구 검증 방안 연구 (A Study of Verification Methods for File Carving Tools by Scenario-Based Image Creation)

  • 김해니;김재욱;권태경
    • 정보보호학회논문지
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    • 제29권4호
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    • pp.835-845
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    • 2019
  • 파일 카빙(File Carving)은 저장 매체가 포맷되거나 파일시스템이 손상되어 메타데이터가 없는 파일 복구를 시도하는 기법으로 일반적으로 파일의 특정 헤더/푸터 시그니처 및 데이터 구조를 찾는다. 그러나 파일 카빙은 오랫동안 단편화 (Fragmentation) 된 파일을 복구해내는 문제점에 직면하고 있으며, 디지털포렌식에서 중요한 대상의 파일(doc, hwp, xls 등)은 비교적 단편화되기 쉬우므로 이에 대한 해결방안 제시는 매우 중요하다. 이와 같은 한계점을 극복하기 위하여 다양한 카빙 기법 및 도구들이 지속적으로 개발되고 있으며, 기능 검증을 위하여 다양한 연구 및 기관에서 데이터셋을 제공한다. 그러나, 기존에 제공된 데이터셋은 환경적인 조건이 상당히 제한되어 도구를 검증하는데 있어 비효율적이다. 본 논문에서는 단편화된 파일 카빙의 중요성을 언급하고, 카빙 도구 검증을 위한 시나리오 기반의 16가지의 이미지를 개발한다. 개발된 이미지는 상용 카빙 도구로 잘 알려진 Foremost를 통하여 매체 별로 카빙률 및 정확도를 계산하여 나타낸다.

Rhodospirillum rubrum Plasmid pKY1의 유전정보 분석과 그의 활용에 관한 연구 (Genetic Analysis and its Application of Rhodosprillum rubrum PKY1 Plasmid)

  • 김복환;김정목
    • 미생물학회지
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    • 제40권2호
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    • pp.172-177
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    • 2004
  • 광합성 박테리아 Rhodospirillum rubrum은 광원의 조건에 따라 균주 내의 신진대사 양상이 변화된다고 보고 되어 왔다. 이러한 광조건에 의한 신진대사 변환 과정을 담당하는 유전자에 대한 연구는 광합성 박테리아에 관한 주된 과제 중 하나이다. 근래 이러한 광조건에 의한 균주내 변화 과정이 균주가 지니는 extrachromosomal plasmid와 관련이 있음이 보고되었다. 본 연구는 광합성 박테리아 R. rubrum의 extrachromosomal plamid pKYl 을 분리 정제하고 이를 제한효소 HindIII로 단편화 하여 이들 단편의 일부에 대한 염기서열을 분석하고 이들의 기능을 추론하였다. 본 연구를 통하여 plasmid pKY1에 박테리아의 유전적 재조합 (genetic recombination)에 관여하는 단백질에 대한 정보가 위치하고 있음을 유전자 및 아미노산 상동성 조사를 통하여 알 수 있었다.