• Title/Summary/Keyword: 유전체 분석

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The Korea Academia-Industrial cooperation Society (양극산화공정을 사용한 LED 패키지)

  • Kim, Moon-Jung
    • Proceedings of the KAIS Fall Conference
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    • 2012.05b
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    • pp.690-692
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    • 2012
  • 전도도가 우수한 알루미늄 및 알루미나 소재를 사용하여 LED 패키지를 제작하였다. 선택적 양극산화 공정을 적용하여 알루미늄 기판 상에 알루미나를 형성하고 이를 유전체로 사용하였다. 패키지 기판에 따른 열저항 및 광량 분석을 위해 알루미늄 기판과 알루미나 기판을 제작하여 성능 비교분석을 진행하였다. 알루미늄 기판이 알루미나 기판보다 우수한 열저항 및 발광효율 특성을 보여주었으며, 이러한 결과는 선택적 양극산화 공정을 사용한 알루미늄 기판이 고출력 LED 패키지용 기판으로 활용할 수 있음을 보여준다.

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Bioinformatics for constructing bio-pathways (바이오 네트워크 구축을 위한 바이오인포매틱스 기반 기술)

  • 박선희
    • Proceedings of the Optical Society of Korea Conference
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    • 2003.02a
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    • pp.124-125
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    • 2003
  • 바이오인포매틱스 기술이란 정보통신 인프라와 IT기술을 기반으로 분산되어 있는 대용량의 바이오 데이터 및 문헌 정보를 통합적으로 관리, 분석 및 처리하여 각종 바이오 정보 활용 분야(신약개발, 의료진단, 농산물 개량 등)에 효율적으로 응용 서비스하기 위한 IT-BT융합 핵심 기반 요소 기술을 의미한다. 2000. 6. 인간 유전체 초안 완성 후 대량 획득되는 바이오 데이터의 최대 부가가치 창출을 위해 대용량 바이오 데이터로부터 유용한 지식정보를 자동적으로 추출해내기 위한 효율적인 통합분석 기술이 필요하고 이는 바이오인포매틱스 기본 개념이 된다. (중략)

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Analysis of Phase Noise Characteristics of Voltage-Control Microwave Oscillator (전압제어 마이크로파 발진기의 위상잡음 특성 분석)

  • 강진래;이승욱;김영진;이영철
    • Proceedings of the Korean Institute of Information and Commucation Sciences Conference
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    • 2001.10a
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    • pp.242-245
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    • 2001
  • 본 논문은 디지털 위성용 하향변환기에 적용되는 고안정 전압제어 마이크로파 발진기의 위상잡음 특성을 분석하였다. 전압제어 마이크로파 발진기는 능동소자의 비선형 등가모델과 궤환회로의 영향을 고려하여 유전체 공진 마이크로파 발진기를 위상잡음과 출력 전력에 절충(trade-off)하여 설계하였고, 13.25GHz의 발진주파수에서 출력이득은 12dBm이고, 위상잡음은 옵셋 주파수 100KHz 에서 -107.91dBc를 보였다. 바렉터 다이오드 동작에 의한 튜닝 범위는 2MHz/V로 위상동기 발진기에 응용할 수 있음을 보였다.

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An Empirical Study on the Economical Competition Factors of Internet Retailers (인터넷 소매상의 경제적 경쟁요인에 관한 실증연구)

  • 이수정;남순해;고석하
    • Proceedings of the Korea Society for Industrial Systems Conference
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    • 2002.11a
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    • pp.3-13
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    • 2002
  • 고석하 등(2002)은 인터넷 소매상이 상품 품목의 명목 가격과 배송료를 이용해서 고객의 일회 총 구매 비용을 조절한다는 것을 밝혔다. 고석하 등(2002)은 같은 내용의 상품 조합을 인터넷 시장에서 구매하기 위한 비용과 전통 시장에서 구매하기 위한 비용을 비교하였다. 분석 결과, 그 교호작용과 함께, 상품 종류와 일회 구매액/가격의 크기의 두 요소가 인터넷 시장의 전통 시장에 대한 총 구매비용 할인율의 변동의 약 60%내지 80%를 설명할 수 있다는 것을 보여주었다. 한편, 구매액/가격은 인터넷 시장에서의 해당 산포도(전통 시장의 그것에 대비한)에는 거의 영향을 미치지 못하며, 상품의 종류도 산포도에는 할인율에서와 같이 큰 영향을 미치지 않았다. 인터넷 시장의 가격이나 구매비용 산포도는 상품 특성이나 구매액 크기 이외의 다른 요인에 의해서 주로 영향을 받는 것으로 나타났다. 따라서, 본 논문에서는 가격 요인 이외의 경제적 경쟁요인에 관한 실증연구로서, 2002년 6월 17일부터 20일까지, 소프트웨어, PC와 주변기기, 휴대폰, 가전제품, CD, 화장품, 그리고 책의 7가지 산업 전문 쇼핑몰과 종합 쇼핑몰을 대상으로, 인터넷 시장에서 수행되고 있는 경제적인 비 가격 경쟁요인에 관한 실증 조사를 실시하였다. 조사 결과, 인터넷 시장에서 수행되고 있는 경제적인 비 가격 경쟁요인은 매우 다양하며, 상품별로도 다른 특성을 보이고 있는 것으로 밝혀졌다. 인터넷 소매상의 경제적인 비 가격 경쟁요인은 크게 배송료 면제와 배송료 외 인센티브 제도로 구분된다 본 논문에서는 경제적인 비 가격 경쟁요인의 모든 경우의 수를 고려할 수 있도록, 코드표를 작성하여 정리하고 분석하였다.전체 분석정보의 공유가 필수적으로 발생하게 됨으로, 유전체 정보와 임상정보의 통합은 미래 의료환경에 필수기능이 될 것이다. 3) 각 생명공학 연구소에서 사용하는 첨단 분석 장비와 생명공학 정보시스템의 자동 연계가 필요하다. 현재 국내에는 전국적인 초고속정보망이 가동되어 웹을 기반으로 하는 생명정보의 공유는 기술적으로 문제가 될 수 없으나 임상정보의 유전체연구에 그리고 유전체연구정보의 임상활용은 다양한 문제를 내포하고 있다. 이에 영상을 포함한 환자정보의 유전체연구센터와 병원정보시스템과의 효율적인 연계통합 운영을 위해 국내에서는 초기 도입단계에 있는 국제적인 보건의료정보의 표준인 Health Level 7 (textural information 공유), DICOM (image 및 wave 공유), 관련 ISO표준, WHO의 ICD9/10 (질병분류), LOINC (검사 및 관련용어), SNOMED International (의학용어) 등을 활용하여야 한다.matrix. The prediction system gives about 50% of sensitivity and 98% of specificity, Based on the PID matrix, we develop a system providing several interaction information-finding services in the Internet. The system, named PreDIN (Prediction-oriented Database of Interaction Network) provides interacting domain finding services and interacting protein

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Discovering Sequence Association Rules for Protein Structure Prediction (단백질 구조 예측을 위한 서열 연관 규칙 탐사)

  • Kim, Jeong-Ja;Lee, Do-Heon;Baek, Yun-Ju
    • The KIPS Transactions:PartD
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    • v.8D no.5
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    • pp.553-560
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    • 2001
  • Bioinformatics is a discipline to support biological experiment projects by storing, managing data arising from genome research. In can also lead the experimental design for genome function prediction and regulation. Among various approaches of the genome research, the proteomics have been drawing increasing attention since it deals with the final product of genomes, i.e., proteins, directly. This paper proposes a data mining technique to predict the structural characteristics of a given protein group, one of dominant factors of the functions of them. After explains associations among amino acid subsequences in the primary structures of proteins, which can provide important clues for determining secondary or tertiary structures of them, it defines a sequence association rule to represent the inter-subsequences. It also provides support and confidence measures, newly designed to evaluate the usefulness of sequence association rules, After is proposes a method to discover useful sequence association rules from a given protein group, it evaluates the performance of the proposed method with protein sequence data from the SWISS-PROT protein database.

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Draft genome sequence of lytic bacteriophage KP1 infecting bacterial pathogen Klebsiella pneumoniae (병원균 Klebsiella pneumoniae를 감염시키는 용균 박테리오파지 KP1의 유전체 염기서열 초안)

  • Kim, Youngju;Bang, Ina;Yeon, Young Eun;Park, Joon Young;Han, Beom Ku;Kim, Hyunil;Kim, Donghyuk
    • Korean Journal of Microbiology
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    • v.54 no.2
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    • pp.152-154
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    • 2018
  • Klebsiella pneumoniae is a Gram-negative, rod-shape bacterium causing disease in human and animal lungs. K. pneumoniae has been often found to gain antimicrobial resistance, thus it has been difficult to treat K. pneumoniae infection with antibiotics. For such infection, bacteriophage can provide an alternative approach for pathogenic bacterial infection with antimicrobial resistance, because of its sensitivity and specificity to the host bacteria. Bacteriophage KP1 was isolated in sewage and showed specific infectivity to K. pneumoniae. Here, we report the draft genome sequence of Klebsiella pneumoniae phage KP1. The draft genome of KP1 is 167,989 bp long, and the G + C content is 39.6%. The genome has 295 predicted ORFs and 14 tRNA genes. In addition, it encodes various enzymes which involve in lysis of the host cell such as lysozyme and holin.

Diffraction-efficiency Correction of Polarization-independent Multilayer Dielectric Gratings (무편광 유전체 다층박막 회절격자의 효율 보정)

  • Cho, Hyun-Ju;Kim, Gwan-Ha;Kim, Dong Hwan;Lee, Yong-Soo;Kim, Sang-In;Cho, Joonyoung;Kim, Hyun Tae
    • Korean Journal of Optics and Photonics
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    • v.33 no.1
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    • pp.22-27
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    • 2022
  • We fabricate a polarization-independent dielectric multilayer thin-film diffraction grating for a spectral-beam-combining (SBC) system with a simple grating structure and low aspect ratio. Due to the refractive index and thickness error of the manufactured thin films, the diffraction efficiency of the fabricated diffraction grating was lower than that of the design. The causes of the errors were analyzed, and it was confirmed through simulation that diffraction efficiency could be compensated through an additional coating on the manufactured diffraction grating. As a result of sputtering an additional Ta2O5 layer on a fabricated diffraction grating, the diffraction efficiency was corrected and a maximum 91.7% of polarization-independent diffraction efficiency was obtained.

Distribution Pattern of cpSSR Variants in Korean Populations of Japanese Red Pine (국내 소나무 집단에 있어서 cpSSR 표지자 변이체의 분포양상)

  • Hong, Yong-Pyo;Kwon, Hae-Yun;Kim, Yong-Yul
    • Journal of Korean Society of Forest Science
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    • v.95 no.4
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    • pp.435-442
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    • 2006
  • A total of 167 peculiar haplotypes confirmed from 28 cpSR variants that were observed in 19 populations of Japanese red pine in Korea through cpSSR marker analysis. Thirteen individuals that showed identical haplotype dispersed evenly in 10 populations, and the average number of effective haplotype within population was 13.37. Estimate of genetic diversity (He) was 0.987 on the basis of cpSSR haplotype variants that was equivalent to or higher than the estimates reported in other studies on some forest tree species. Estimation of genetic diversity (S.I.) on the basis of cpSSR variants composing each haplotype revealed the highest estimate of 1.109 for the population of Gangwon-Yeongwol and the lowest estimate of 0.411 for the population of Gyeongbuk Mungyeong with the average of 0.887. Most of observed cpSSR variants appeared to exist commonly in 19 populations (97.62%), and genetic differentiation of cpSSR variants among populations was turned out to be weak (${\Phi}_{ST}=0.024$). Relatively fast rate of mutation of cpSSR marker might be a major cause for such weak population differentiation. There was no identical haplotype shared between 39 population pairs of 173 pair-wise population pairs. Estimation of genetic distance among 19 populations on the basis of population pairs was also impossible, that might be resulted from restricted migration among 19 populations. Considering the observed distribution patterns of cpSSR variants in addition to the previous studies on I-SSR variants, informations on the present geographic location and genetic status of populations should be considered together for effective sustainable management of the genetic resources of Japanese red pine in Korea.

Correlation between Strain and Dielectric properties in Paraelectic $ZrTiO_4$ Thin Films ($ZrTiO_4$상유전 박막의 Strain과 유전 특성 상관성 고찰)

  • 김태석;오정민;김용조;박병우;홍국선
    • Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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    • 2000.02a
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    • pp.108-108
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    • 2000
  • 급증하는 무선통신 정보수요는 특히, 고주파대역 (300NHz-300GHz)에서 사용되는 공진기, 필터, 발진기 등과 같은 소자의 품질향상을 요구하고 있다. 고주파용 유전체 중 ZrTiO4 는 $\alpha$-PbO2 계열의 사방정구조를 갖고 있는 유전체로서 높은 유전율 ($\varepsilon$=40)과 높은 품질계수 (Q=1/tan$\delta$=4700 at 7GHz)를 갖고 있고, Sn 첨가시 0ppm/$^{\circ}C$의 공진주파수 온도계수를 얻을 수 있다고 보고되어 있다. 본 연구에서는 약 110$0^{\circ}C$ 이상에서 안정한 상으로 존재하는 ZrTiO4를 저온에서 증착하여 준안정한 상태로 결정화되게 한후, 유전손실 (tan$\delta$)과 유전율($\varepsilon$)을 측정하였다. 또한 증착온도와 열처리과정에 따른 박막의 us형 (Strain) 정도의 변화를 X-선 회절결과로부터 분석하였으며 이를 측정된 유전특성 값과 비교하였다. ZrTiO4 박막은 DC magnetron reactive sputter로 Zr과 Ti 타겟으로부터 high phosphorous doped Si (100) 기판위에 증착하였다. 압력은 4mTorr로 유지하고 박막의 화학양론적 조성비를 맞추기 위해 각 타겟에 가해지는 power는 Zr/Ti=500W/650W로 고정하고, 반응가스의 비율을 Ar/O2=17sccm/3.5sccm으로 유지하여 박막내에 인입되는 산소량을 제어하였다. 증착 직후와 열처리 후의 박막특성을 비교하기 위해 증착온도를 상온에서부터 $600^{\circ}C$까지 변호시키고 증착후 각각의 시편을 80$0^{\circ}C$ 산소분위기에서 2시간동안 열처리하여 시편을 준비하였다. 박막의 상형성 여부와 결정성변화는 $ heta$-2$\theta$X-선 회절법을 사용하여 조사하였고, EPMA를 이용하여 박막의 조성을 확인하였다. 유전특성의 측정을 위해 백금 상부전극을 증착한 후, impedance analyzer를 이용하여 100kHz 영역에서의 유전손실을 측정하고, 측정된 정전용량과 박막의 두께로부터 유전율을 계산하였다. ZrTiO4 박막은 증착온도 20$0^{\circ}C$ 이상에서 결정성을 보이기 시작했으며, 열처리 이후에는 상온에서 비정질이었던 시편이 $650^{\circ}C$ 이상의 온도에서 결정화되기 시작하였다. 증착온도에 따라 유전손실은 0.038에서 0.017 정도로 감소하는 경향을 나타냈으며, 각각 열처리에 의해서 0.034, 0.005 정도로 다시 감소하였다. 박막의 유전율은 약 35 정도의 값을 나타내었으며 X-선 회절 data로부터 분석한 박막의 변형은 증온도에 따라 7.2%에서 0.04%로 감소하였고 이 이경향은 유전손실은 감소경향과 일치하였다.

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Effective Analysis Of SNP Related Chronic Hepatitis Using SNP (SVM을 이용한 만성간염 환자 예측진단을 위한 SNP 정보분석)

  • Kim Dong-Hoi;Ham Ki-Baek;Kim Jin
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2006.06a
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    • pp.19-21
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    • 2006
  • Single Nucleotide Polymorphism(SNP)는 인간 유전자 서열의 0.1%에 해당하는 부분으로 이는 각 개인의 체질 및 각종 유전질환과 밀접한 관련이 있다고 알려져 있다. 최근 이 SNP정보의 패턴을 이용 질병의 진단 및 치료에 연관지으려는 노력이 시도되고 있다. 그러나 아직 SNP를 이용한 효율적인 분석방법에 대한 전산학적 연구는 많지 않다. 본 논문에서는 대표적인 패턴인식기 중 하나인 Support Vector Machine(SVM)을 이용 한국인의 대표적인 유전질환으로 알려진 만성간염에 대해서 관련된 SNP에 대한 패턴 인식율 측정을 실험하였다. 실험 데이터는 간 및 소화기 질환 유전체 센터에서 얻어진 만성간염 환자와 관련 SNP정보를 사용하였으며, 실험 결과 전체 SNP 정보를 모두 가지는 환자그룹에 대한 학습인식율이 66.46%로 나타났으며, 부분그룹에서는 72.91%로 높은 인식율을 보였다. 이 결과는 SNP 정보를 이용한 만성간염의 초기진단예측에 SVM을 효율적으로 사용할 수 있음을 보인다.

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