• Journal of Yeungnam Medical Science
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• 제22권2호
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• pp.221-240
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• 2005

사람의 악성 골종양 세포주 Saos-2 를 이용하여 doxorubicin에 의해 발현이 증가 또는 감소하는 유전자들의 변화를 cDNA microarray를 이용하여 확인하였다. 그 결과 대조군에 비하여 2배 이상 증가 또는 감소하는 유전자 264개, 3배 이상 증가 또는 감소하는 유전자 35개를 선별할 수 있었다. Doxorubicin 처리 후 시간대 별로 발현변화가 비슷한 유전자들을 k-mean clustering으로 분석하여 5가지의 군으로 분류할 수 있었다. A군은 24시간 까지 계속 발현이 증가하는 67개 유전자, B군은 6시간까지는 변화가 없다가 24시간에는 감소하는 108개 유전자, C군은 6시간에 발현의 감소하고 24시간까지 지속되는 33개 유전자, D군은 6시간에 발현의 감소하였으나 24시간에는 다시 발현이 회복되는 5개 유전자, 그리고 E군은 6시간까지는 발현의 변화가 없다가 24시간에 발현이 증가하는 경향을 보이는 51개 유전자로 구분하였다. cDNA microarry 결과 발현차이가 현저한 22개의 유전자들을 대상으로 RT-PCR을 시행하여 발현정도를 비교하였다. cDNA microarry에서 발현증가를 보이는 13개 유전자 중에서, RT-PCR 결과 11개가 그 발현이 증가하였으며, cDNA microarry의 결과에서 발현감소를 보이는 9개 유전자 중에서 RT-PCR 결과에서 2개 유전자만 감소하였다. 이상의 결과 Saos-2 세포에서 doxorubicin에 의해 세포사멸과 세포성장, 세포신호전달, 세포골격, 세포주기, 운반, 대사 등에 관여하는 많은 유전자들의 발현이 변함을 확인할 수 있었다.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• 제15권1호
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• pp.47-54
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• 1998

본 실험은 Brewer thioglycollate 배양액으로 자극시킨 뒤 분리된 마우스 복강내 대식세포를 LPS로 자극하여 이들로 부터 발현되는 케모카인 KC에 대한 IL-10의 KC 유전자 발현 억제효과에 대한 실험을 실시하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. LPS에 의해 유도되는 KC 유전자 발현은 IL-10에 의하여 현저히 억제되며 IL-10의 억제작용은 반응 2시간대에 나타나는 지연성 반응을 보였다. 2. Nuclear run-on 실험의 결과 IL-10의 KC 유전자 발현 억제작용은 KC 유전자의 전사단계와는 무관함을 확인하였다. 따라서, IL-10의 KC 유전자 발현 억제기전을 명확히 이해하기 위하여 KC mRNA decay 실험과 반응시간에 따른 KC 단백질 생성 수준에 대한 실험이 진행되어야 할 것으로 생각된다.

• 한국측량학회:학술대회논문집
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• 한국측량학회 2004년도 추계학술발표회 논문집
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• pp.335-341
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• 2004

소축척지도제작을 위한 자동화 처리 과정에서는 기하학적 및 논리적 오류가 발생하고, 기하학적 오류는 많은 부분에서 자동화 처리가 가능하나 논리적 오류는 여러 가지 경우에 대하여 자동 판단이 곤란한 경우가 많기 때문에 대부분 수작업으로 이루어지고 있는 실정이다. 따라서, 본 연구는 수치지도를 이용한 일반화 처리 후의 지형도 제작시에서 나타나는 여러 가지 문제 중 도로과장화로 인한 오류문제를 해결하기 위하여 도로와 건물 폴리곤간의 겹침위치를 자동 탐색하고, 이를 자동처리하기 위한 프로그램을 유전자 알고리즘을 이용하여 개발하였다. 그 결과 지도제작 과정에서 발생하는 오류를 해결할 수 있었고, 지도제작 자동화율을 향상시킬 수 있었다.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2006년도 한국컴퓨터종합학술대회 논문집 Vol.33 No.1 (A)
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• pp.31-33
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• 2006

활자유전학(typogenetics)은 인공생명(artificial life) 연구에 사용되는 형식 시스템으로서, 자가복제자와 하이퍼사이클의 출현에 관한 연구에 효과적인 모델이다. 본 연구에서는 하이퍼사이클에 추가될 복제자의 차이점과 유사점을 측정하기 위하여 편집거리(edit distance)를 사용하여, 기존의 연구에서 생성된 하이퍼사이클 보다 더 큰 크기의 다양한 하이퍼사이클들을 생성하였다.

• 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
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• 한국콘텐츠학회 2018년도 춘계 종합학술대회 논문집
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• pp.523-524
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• 2018

본 논문에서 구현한 시스템은 LMO를 생산하기 위하여 수행하는 실험과정 중 Protein coding을 변화시켜 인위적으로 변형된 생물체를 확보하기 위하여 수행하는 전처리 작업을 용이하게 수행 할 수 있도록 설계되고 구현되었다.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• 제12권2호
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• pp.237-245
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• 1995

Klebsiella pneumoniae 의 phoA 유전자를 함유하는 DNA를 plasmid pACYC184에 클로닝 하였다. 클로닝된 DNA의 크기는 4.0 kb이었으며 제한효소지도를 작성한 결과 3개의 PstI 절단부위와 4개의 PvuII 절단부위가 발견되었다. Klebsiella pneumoniae 의 phoA 유전자의 염기서열은 Escherichia coli와 매우 유사하여 80%의 유사성을 보였으며 이는 이 두 균종이 서로 유전적으로 매우 가까운 관계에 있음을 시사하였다.

• 한국환경농학회지
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• 제40권3호
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• pp.179-185
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• 2021

BACKGROUND: Tomato genome editing using CRISPR-Cas9 is being actively conducted in recent days, and lots of plant researches have been aiming to develop high valued crops by editing target genes without inserting foreign genes. Many researchers have been involved in the manipulation of the crop ripening process because fruit ripening is an important fruit phenotype for increasing fruit shelf life, taste, and texture of crops. This paper intends to evaluate target sgRNA to edit the two ripening-related genes encoding pectate lyase (PL) and phytoene synthase (Psy) with the CRISPR-Cas9 system. METHODS AND RESULTS: The CRISPR-Cas9 expression vector was cloned to target the PL (Solyc03g111690), Psy1 (Solyc03g031860), and Psy2 (Solyc02g081330) genes, which are the ripening genes of tomatoes. Tomatoes injected with Agrobacterium containing the CRISPR-Cas9 expression vector were further cultured for 5 days and used to check gene editing efficiency. As a result of the target gene sequence analysis by the next generation sequencing method, gene editing efficiency was calculated, and the efficient target location was selected for the PL and Psy genes. CONCLUSION: Therefore, this study was aimed to establish target sgRNA data that could have higher efficiency of the CRISPR-Cas9 system to obtain the delayed ripening phenotype of tomato. The developed method and sgRNA information is expected to be utilized in the development of various crops to manage its ripening processes.

• 한국환경생태학회지
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• 제35권5호
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• pp.503-524
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• 2021

배스(Micropterus salmoides)는 수생태계에서 최상위단계에 위치하는 생태계교란 어종으로 심각한 담수생태계의 불균형을 초래하고 있다. 배스의 퇴치 및 관리를 위한 다양한 시도를 하고 있지만 효과적인 방안은 없는 상황이므로 배스의 고유한 특성에 기반한 개체군 감소의 효율성을 극대화할 수 있는 방식을 모색하였다. 본 연구에서는 배스의 Transcriptom 분석으로 Unigene contigs는 182,887개, 그리고 정자-난자 인식 단백질인 IZUMO1과 Zona pellucida sperm-binding protein의 유전자에서 CRISPR/Cas9 system을 적용할 최종 Target sequence는 12종을 산출하였다. 각 Target sequence를 인식할 수 있는 12종의 sgRNA를 합성한 후 후속 연구에 사용할 12종의 Cas9-sgRNA ribonucleoprotein (RNP) complex를 제작하였다. 본 연구에서는 차세대염기서열 분석법으로 정자-난자 인식 단백질을 암호화하는 유전자를 탐색하였고, CRISPR/Cas9 system으로 유전자를 편집하여 번식행동은 하지만 수정란을 형성하지 못하는 생식세포를 생산하는 불임개체를 유도하기 위한 조성물 개발 과정을 확립하였다. 그리고 배스와 동일한 수계에 있는 고유 생물종의 서식에는 영향을 미치지 않는 생태교란종 관리 방안으로서의 유용성을 검증하기 위한 후속 연구의 귀중한 기초 자료를 확보하는데 기여했다고 판단된다.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• 제14권2호
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• pp.293-313
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• 1997

이상에서 고찰하였듯이 현재까지는 어느 하나로 결정할 만한 선별 검사 방법이 없지만, 그 중에서 경질 초음파 검사와 color-flow Doppler 초음파 검사가 시행하기가 쉬우면서 민감하고 비교적 특이도가 높은 방법이라고 할 수 있다. 그러나 역학적인 면에서 조기 진단 혹은 선별 검사의 효율은 검사의 시행과 그에 따른 처치에 의해 사망률이 실제로 감소되었을 때 유의하다고 할 수 있으며, 이런 면에서 아직까지 난소암으로 인한 사망률을 감소시킬 만한 결정적인 선별 검사 방법은 알려져 있지 않다. 사망률이 1/3 감소되었음을 확인하는데 100,000명의 선별 검사자와 100,000명의 대조군이 필요하므로 앞으로 보다 많은 인구를 대상으로 한 역학적인 연구가 필요하다. 앞으로의 선별 검사에는 보다 특이도가 높은 종양 표지 물질의 개발, 초음파를 비롯한 진단 기기의 혁신적인 발달이 필요하며 이는 현재까지의 발전 상황으로 보아 실제로 가능할 것으로 생각된다. 이와 더불어 돌연변이를 일으킨 난소 상피 세포가 수 차례의 분열만 일으키더라도 그 유전자 산물을 검색해 낼 수 있고, 나아가서는 DNA 진단까지 가능한 분자 생물학적 혹은 세포 유전학전 진단 방법의 개발과 이용도 기대된다.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• 제19권1호
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• pp.1-10
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• 2002

With the establishment of rapid sequence analysis of 16S rRNA and the recognition of its potential to determine the phylogenetic position of any prokaryotic organism, the role of 16S rRNA similarities in the present species definition in bacteriology need to be clarified. Comparative studies clearly reveal the limitations of the sequence analysis of this conserved gene and gene product in the determination of relationship at the pathogenic strain level for which DNA-DNA reassociation experiments still constitute the superior method. Since today the primary structure of 16S rRNA is easier to determine than hybridization between DNA strands, the strength of the sequence analysis is to recognize the level at which DNA pairing studies need to be performed, which certainly applies to similarities of 97% and higher.