• Korean Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
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• v.28 no.1
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• pp.114-122
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• 1995

Defining the mechanisms of B cell diversification which establish the immune repertoire is fundamental to understand how the immune response is regulated. In this report, B cell differentiation and diversification focused on the regulation of immunoglobulin $V_H$ gene expression during ontogeny were analyzed by in situ hybridization technique. Fetal liver B cells in .different gestational days from 16d to 20d showed the predominant expression of $V_H7183$ and $V_HQ52$ without transition of repertoire during the observed gestation days. The two subsets of fetal liver B cells separated according to different differentiation stages based on the presence of tell surface immunoglobulin also did not indicate apparent difference in expressed $V_H$ gene family profiles. B cells in fetal spleen as an another hematopoietic lymphoid tissue in fetus also expressed similar $V_H$ gene repertoire to that in fetal liver B cells. This distinct pattern of $V_H$ gene expression in fetal B cells from that of adult B cells were not changed even after four weeks contact with adult bone marrow microenvironment supplied by the established adult bone marrow stromal cell layers. Thus, the restricted $V_H$ gene repertoire of B cells in fetus which is distinct from that in adult appears to be associated more with the genetic potential of fetal B cell progenitors and less with environmental influences or differentiation stages or compartmentalization.

• Food Industry And Nutrition
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• v.11 no.3
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• pp.6-11
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• 2006

바이러스성 식중독은 장염을 일으키는 원인 병원체 중 노로바이러스에 의해 흔히 발생하며 이외에도 아스트로바이러스나 로타바이러스에 의한 집단 설사 사례가 국내에서 보고된 바 있다. 노로바이러스는 식중독과 관련하여 특히 오염된 식수와 굴 등 어패류의 생식을 통한 감염 사례가 많이 보고되어 있으나 사람 간 전파도 흔히 일어나는 전염력이 매우 높은 바이러스이다. 국내에서는 1999년 이후 보고가 되고 있으며 최근 집단 급식과 관련된 대형 식중독 사례들이 보고되면서 학교급식이 사회적인 이슈로 대두되고 있다. 2000년 이후 질병관리본부는 바이러스성 설사의 국내 발생현황을 파악하기 위하여 전국의 17개 시도보건환경 연구원과 노로바이러스를 포함한 4종의 바이러스성 장염원인 병원체에 대한 전국적인 실험실 감시체계를 운영한 결과 바이러스성 병원체가 확인된 사례의 약 18%에서 노로바이러스가 검출되었고, 집단설사 사례에서는 대부분 노로바이러스가 원인병원체로 확인되었다. 또한 노로바이러스의 조기 검출을 위해 질병관리본부는 2004년 중 노로바이러스 유전자 검출 kit를 자체적으로 제작하여 이를 전국의 시도 보건환경연구원을 연계한 감시체계에서 적극 활용함으로써 노로바이러스 집단설사사례의 조기 검출이 가능하게 되었고 지역내 노로바이러스 검출율을 높이는데 기여하였다. 국립보건연구원은 2003년과 2006년에 발생한 대규모 노로바이러스 식중독 사례 이외에도 산발적으로 지속적으로 발생하는 사례들을 조기에 탐지하고 국내에서 검출되는 설사바이러스 유전형 분포양상과 새로운 유전자형이나 변이주를 조기에 검출하고자 전국적인 노로바이러스 실험실 감시망을 강화하여 운영하고 있으며, 집단설사 발생시 각 사례의 연관성을 신속하게 분석할 수 있는 실시간 분자역학적 유전자 분석체계를 단계적으로 도입하고 있다. 실험실 감시체계 운영과 함께 집단 식중독 유발 병원체의 효율적인 관리를 위해 질병관리본부는 노로바이러스를 포함한 설사 유발 병원체를 신고대상 병원체로 지정(2006.06.12)하여 병원체 검출시 보고하도록 하고 관련 지침을 마련하였다. 노로바이러스가 지정전염병 병원체로 추가로 지정됨에 따라 집단 사례 및 실험실 감시사업을 통해 검출되는 병원체에 대한 보고가 강화되고 전파 방지와 2차 감염 사례 감소에도 기여할 수 있을 것으로 사료되며 전국의 실험실 감시망을 연결하는 국가 차원의 노로바이러스 실시간 분자역학적 분석체계 도입을 통해 노로바이러스 2차 감염을 줄이고 대규모 집단발병 및 유행의 조기 차단 효과를 가져올 수 있을 것이다.

• Journal of Life Science
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• v.19 no.6
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• pp.711-719
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• 2009

We determined a portion of mitochondrial 16S rRNA gene sequences (416 bp) to investigate the genetic structure of the octopus (Octopus minor Ssaki) population in Korea and China. Samples were obtained from Korea (Yeosu, Namhae, Jindo, Muan, Geomundo and Seosan) and China (Sandong) during the period of August 2006 to September 2007. Sequence analyses of 28 individual specimens collected from 7 localities revealed 11 haplotypes, ranging in a sequence divergence of 0.2% - 1.2%. Phylogenetic analyses using PHYLIP and networks subdivided the octopus into two clades (termed clade A and B) and the nucleotide divergence between them was 0.4%. This haplotype subdivision was in accordance with geographic separation: one at Yeosu, Namhae, Muan and Jindo, and the other at Seosan, Geomundo and Sandong. On the basis of hierarchial genetic analysis, genetic distance between localities in Korea and China were also found, but a significant population differentiation was not shown in this study (p>0.05). Consequently, most of the octopus populations in Korea had considerable distribution due to the mitochondrial gene flow that resulted in a formation of a genetically homogenous structure, whereas some of the Korean and Chinese populations had different genetic structures. Gene flow among populations may be restricted due to impassable geographic barriers that promote genetic differentiation.

• Korean Journal of Biological Psychiatry
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• v.15 no.1
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• pp.14-22
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• 2008

Objectives : The authors purposed to present data for explaining gene-environmental interaction causing depressive disorder by examining the effects of genetic factors related to the serotonin system and environmental factors such as stressful life events in early adulthood. Methods : The subjects were 150 young adults(mean age 25.0${\pm}$0.54), a part of 534 freshmen who had completed the previous study of genotyping of TPH1 gene. We assessed characteristics of life events, depression and anxiety scale and checked if they had a depressive disorder with DSM-IV SCID interview. Along with TPH1 A218C genotype confirmed in previous study, TPH2 -1463G/A and 5HTR2A -1438A/G genes were genotyped using the SNaPshot$^{TM}$ method. Results : In comparison with the group without C allele of TPH1 gene, the number of life events had a significant effect on the probability of depressive disorder in the group with C allele. Other alleles or genotypes did not have a significant effect on the causality of life events and depressive disorder. Conclusion : The results of this study suggest that TPH1 C allele is a significant predictor of onset of depressive disorder following environmental stress. It means that the TPH1 gene may affect the gene-environmental interaction of depressive disorder.

• Korean Journal of Plant Resources
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• v.21 no.1
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• pp.41-46
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• 2008

Molecular relationship and genetic diversity of 21 wild tea collections which grown natural region in Korea were investigated based on PCR-RFLP analysis using DFR genes. Approximately 1.4kb fragment of the DFR gene from wild tea samples were successfully amplified use DFR 4+5 primer pair. On the bases of restriction fragment length polymorphism(RFLP) analysis using Hpa II and Mse I enzymes, three different band patterns shown from Hpa II enzyme and showed genetic diversity between same region wild tea group. Six kind of restriction enzyme profiles obtained from digested with restriction endonuclease Mse I and shown two kind of restriction enzyme profiles collected from same region wild tea at Ungpo. The results of RFLP analysis indicated that wild tea showed genetic diversity among different regions of tea groups, but also between same region wild tea.

• Journal of Life Science
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• v.18 no.7
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• pp.1015-1018
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• 2008

To analyze the population genetic structure of the oyster Crassostrea gigas Thunberg, 34 specimens werecollected from Gamak bay in March, 2007. Total genomic DNA was extracted from each sample and PCR was performed to identify haplotypes of oyster by using HCO2918 and LCO1491 primers. Four kinds of haplotypes (CR1, CR2, CR3, and CR4) were identified. Among these group, CR3 showed the highest relative frequency at 73% than any other of haplotypes. On the basis of hierarchical genetic structure, the population of Gamak showed a higher genetic relationship with Namhae, but the genetic distance between southern and western coasts was negative and no statistical significance was found (p>0.05). Consequently, the oyster from Korea coast is determined to be both homogenous and large.

• Journal of Life Science
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• v.19 no.2
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• pp.169-173
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• 2009

To assist in selection schemes we estimate the genetic diversity of the horse breeds. Genetic diversity at 13 microsatellite loci was compared in six horse breeds : Jeju Native Horse, American Quarter, Jeju Racing Horse, Mongolian Horse, Japanese Horse and Thoroughbred. All of the equine microsatellite used in this study were amplified and were polymorphic. The expected total heterozygosity over all the populations varied between 0.669 and 0.869 and the expected heterozygosity within population range from 0.569 to 0.219 in this study. The low coefficient of gene differentiation value showed that only 0.118 of the diversity was between horses breeds. The constructed dendrogram from the genetic distance matrix showed little differentiation between horse breeds using DISPAN program. The genetic distance using 13 microsatellites ranged between 0.137 and 0.414 for the six horse breeds. These results confirm the potential use of equine microsatellite loci as a tool for genetic studies in horse populations. The genetic diversity of the six horse breeds to each other closed to their geographical distribution. Suggesting that the loci would be suitable for horse breeds parentage testing. Therefore, Microsatellite marker seems to be very useful for clarifying the evolutionary relationships of closely related populations.

• Proceedings of the Korean Operations and Management Science Society Conference
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• 2006.05a
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• pp.33-36
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• 2006

OR 기법이 현실에 성공적으로 적용된 분야 중 하나가 차량 경로 문제 풀이며 이 분야에 대한 연구는 꾸준히 진행되어 오고 있다. 시간대 제약이 있는 차량 수 배송 문제는 기존의 차량 배송 문제에서 더욱 진보된 형태의 문제이다. 많은 연구가 있어왔지만, 이러한 형태의 문제들은 NP-hard 형태의 문제이므로 meta-heuristic 기법들이 많이 사용되었다. 유전자 알고리즘에 비해 타부 서치 기법이 많이 사용되었는데, 이는 시간대 제약이 있는 차량 수 배송 문제의 경우 유전자 알고리즘의 근간인 염색체 형태로 표현하기가 쉽지 않기 때문이다. 이에 본 논문에서는 시간대 제약이 있는 차량 수 배송 문제를 다수의 차량을 사용하는 Grouping Genetic Algorithms을 적용하여 이러한 어려움을 해결하였다. 또한, 기존의 유전자 알고리즘들은 초기 해 집단을 임의 선택 방식으로 구성하였지만, 초기 해 집단 구성을 heuristic 기법을 사용하여 적합도 함수 값이 좋은 해들로 구성하여 기존에 사용된 알고리즘들과 성능을 비교 분석하고자 한다.

• Proceedings of the Korean Institute of Intelligent Systems Conference
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• 2002.12a
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• pp.263-266
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• 2002

데이터의 군집화를 수행할 때 최적 군집수 결정은 군집 결과의 성능에 많은 영향을 미친다. 특히 K-means 방법에서는 초기 군집수 K에 따라 군집결과의 성능 차이가 많이 나타난다. 하지만 대다수의 군집분석에서 초기 군집수의 결정은 경험을 바탕으로 하여 주관적으로 결정된다. 이때 개체수와 속성수가 증가하면 이러한 결정은 더욱 어려워지며 이때 결정된 군집수가 최적이 된다는 보장도 없다. 본 논문에서는 군집의 수를 자동으로 결정하고 그 결과의 유효성을 보장하기 위해 유전자 알고리즘에 기반한 최적 군집수 결정 방안을 제안한다. 데이터의 속성에 근거한 초기 해 집단이 생성되고, 해 집단 내에서 최적화된 군집수를 찾기 위해 교차 연산이 이루어진다. 적합도 값은 전체 군집화의 비 유사성의 합의 역으로 결정되어 전체적인 군집화 성능이 향상되는 방향으로 수렴된다. 또한 지역 국소값을 해결하기 위해 돌연변이 연산이 사용된다. 그리고 유전자 알고리즘의 학습 시간의 비용을 줄이기 위해 붓스트랩 기법이 적용된다.

• Korean Journal of Plant Taxonomy
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• v.43 no.4
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• pp.245-251
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• 2013

Paeonia lactiflora is a valuable natural resource for horticulture and traditional Chinese medicine. To propose conservation strategy and future utility of the wild Paeonia lactiflora populations recently found around the Gyeongju National Park, genetic diversity analysis using microsatellite markers were performed. Three populations in and near the Gyeongju N.P. and one population from Jilin, China were analyzed for five microsatellite markers, producing 61 alleles with mean observed heterozygosity($H_o$) of 0.452. $F_{ST}$ value (0.11642) suggested moderate level of genetic differentiation among the populations, and hierarchical AMOVA suggested most of the genetic variation resides within/among the individuals rather than among-population. While AMOVA with $F_{ST}$ suggested lack of genetic differentiation between the regional (Korean vs. Chinese) populations, AMOVA with $R_{ST}$, which incorporates the allele sizes, suggested considerable differentiation between them, but without significant statistical support. STRUCTURE analysis also suggested segregation of regional populations with presence of gene flow among the three Gyeongju N.P. populations. Considering small population size and scarcity of mature individuals, further protection and long-term monitoring are needed.