• Applied Biological Chemistry
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• v.40 no.1
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• pp.30-33
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• 1997

About 250 bp ura5 gene (Orotate phosphoribosyl transferase) fragment was cloned from genomic DNA of entomopathogenic fungus Metarhizium anisopliae by using PCR method. Entire nucleotide sequences of cloned DNA fragment were determined and analysed as compared with other fungus ura5 genes. The amino acid sequence deduced from the nucleotide sequence showed 85.5% homology to ura5 protein of Trichoderma reesei. Using this 250 bp PCR fragment we have isolated full ura5 gene of M. anisopliae by genomic Southern hybridization and the isolated 4.4 kb DNA fragments were mapped by restrictional enzyme.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
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• 2003.04a
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• pp.715-718
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• 2003

A COG (clusters of orthologous groups of proteins) algorithm, protein similarities among genomes, was used to detect conserved genes and to figure out their relationships within 42 procaryote, 33 Bacteria and 16 Proteobacteria All analyzed procaryotes shared 75 COGs. COG0195, COG0358 and COG0528 were only represented by the 42 procaryotes. Sixty-four COGs were added as conserved genes in 33 eubacteria. Each Proteobacteria group has a unique repertoire of COGs. Metabolic COGs were more diverse in the beta-Proteobacteria group than in the other groups. The possibilities of detecting new biological molecules is high in phylogenetically related organisms, hence the identification of useful proteins by using this algorithm is possible.

• Journal of the Korean Institute of Intelligent Systems
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• v.8 no.3
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• pp.1-8
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• 1998

This paper proposes a reinforcement genetic programming based on the reinforcement learning method for the performance improvement of genetic programming. Genetic programming which has tree structure program has much flexibility of problem expression because it has no limitation in the size of chromosome compared to the other evolutionary algorithms. But worse results on the point of convergence associated with mutation and crossover operations are often due to this characteristic. Therefore the sizes of population and maximum generation are typically larger than those of the other evolutionary algorithms. This paper proposes a new method that executes crossover and mutation operations based on reinforcement and inhibition mechanism of reinforcement learning. The validity of the proposed method is evaluated by appling it to the artificial ant problem.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2010.10a
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• pp.3-3
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• 2010

GM 들잔디의 환경위해성평가는 유전자변형생물체의 국가간이동등에 관한 법률 (2008년)에 안전관리 및 시험평가가 수행되었다. 일반적으로 GM 작물의 환경위해성평가는 도입 유전자의 안정적 발현여부, 일반적으로 사용되어온 식물과의 실질적 동등성, 화분비산에 의한 유전자이동성 검정, GM재배작물 주변 환경에 미치는 영향, GM작물 및 유전자의 인체 및 동물에 대한 안전성 평가, 위해성 관리 등이 있다. 본 발표에서는 제초제저항성 GM 들잔디를 실용화 하기위한 환경위해성평가의 내용을 소개하기 위하여 GM 들잔디의 안전성평가를 수행한 포장시험에 대해서 간략히 발표하고자 한다. GM 들잔디는 제초제저항성 유전자가 식물체내에 1개의 복제수를 갖으며, 후세대에서도 안정적으로 발현되었다. 또한 TAIL PCR을 통한 도입 유전자의 삽입 부위를 확인하였고, 주변염기서열을 이용한 JG21 들잔디 만의 특이적 염기서열을 얻었다. GM 들잔디의 실질적 동등성검정은 격리온실 수준과 격리포장 수준에 생물학적, 화학적 특성을 조사하였고, 일반 들잔디와 큰 차이가 없음을 확인하였다. GM 들잔디의 화분은 일광조건하에서 약 1시간 이내에 불활성 되었고, 실내의 실온조건에서는 3시간까지 활성이 유지되었다. GM 들잔디 재배포장 ($12m{\times}6m$ 크기)으로부터 화분비산 밀도는 3 m 이내에서 높게 나타났고, 9 m 이상의 거리에서는 낮은 빈도로 일정하게 나타났다. 화분비산에 의한 GM 들잔디 유전자이동성은 근접거리에서 약 15%가 관찰되었고, 반경 3 m 이내에서 거리에 따라서 2 ~ 0.12%의 유전자이동성이 관찰되었다. 각각의 시험모형에 따른 GM 들잔디와 일반들잔디 간의 교잡율을 조사한 결과 들잔디 교잡율은 GM 잔디의 면적과 거리에 의존적이었고, GM 들잔디 면적에 따라서 6-21%의 교잡율이 나타났다. GM들잔디의 인체위해성평가는 독성 및 알레르기 반응성을 검정하였고, 도입유전자 산물인 PAT 단백질은 독성 및 알레르기 반응성이 없음이 알려져 있다. 본 연구에서는 GM들잔디의 독성 및 알레르기 반응성을 검토한 결과 아플라톡신 등의 독성은 검출되지 않았으나, GM과 일반 들잔디 모두에서 화분 알레르기 반응성이 양성으로 나왔다. 그러나 GM들잔디에 도입된 유전자에 의한 알레르기 반응이 아닌 일반들잔디 화분에 가진 알레르겐에 의한 반응성이라 할 수 있다. GM들잔디의 비의도적 방출가능성을 조사하기위하여 시험포장외부의 자연환경에 대해서 환경모니터링을 수행한 결과 GM 들잔디의 유출 및 유전자이동 의한 제초제저항성 들잔디는 나타나지 않았다.

• Journal of the Korean Society of International Agriculture
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• v.30 no.4
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• pp.347-356
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• 2018

Genetically modified (GM) crops have been increased continuously over the world and concerns about the potential risks of GM crops have also been increasing. Even though GM crops have not been cultivated commercially in Korea, it should be necessary to develop the safety assesment technology for GM crops. In this study, we investigated the influence of heading date difference on gene flow from GM to non-GM rice. In the experimental plot design, The PAC GM rice was placed in the center as a pollen donor and non-GM rice were placed in eight directions as pollen receivers. Five pollen receiver rice cultivars were Unkawng, Daebo, Saegyejinmi, Nakdong-byeo, and Ilmi which had different flowering times. A total of 266,436, 300,237, 305,223, 273,373, and 290,759 seeds were collected from Unkawng, Daebo, Saegyejinmi, Nakdong, and Ilmi, respectively, which were planted around PAC GM rice. The GM${\times}$non-GM hybrids were detected by repeated spraying of herbicide and PAT immunostrip assay. Finally, the hybrids were confirmed by PCR analysis using PAC gene specific primer. The hybrids were found in Nakdong-byeo which had the same heading date with PAC GM rice. The hybridization rate was 0.0007% at Nakdong-byeo plot. All of GM${\times}$non-GM hybrids were located within 2 m distance from the PAC GM rice zone. The physiological elements including rice heading date were found to be important factors to determine GM?rice out crossing rate with GM rice. Consideration should be taken into for many factors like the physiological elements of field heading date of rice cultivars to set up the safety management guideline for prevention of GM rice gene flow.

• 대한핵의학회:학술대회논문집
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• 2002.11a
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• pp.29.2-29.2
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• 2002

• 대한핵의학회:학술대회논문집
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• 2003.11a
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• pp.15.1-15.1
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• 2003

• 대한핵의학회:학술대회논문집
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• 2005.11a
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• pp.318.2-318.2
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• 2005

• Journal of Ocean Engineering and Technology
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• v.11 no.4
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• pp.227-238
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• 1997

다목적함수 최적화를 효과적으로 수행하기 위하여 유전자 알고리즘과 직접탐색법을 결합하여 혼성형 최적화기법을 구현하였다. 이 방법은 유전자 알고리즘을 사용하여 최적점이 존재할 가능성이 높은 영역을 탐색한 후, 이 영역에서 직접탐색법을 사용하여 최종해를 찾는다. 따라서 탐색의 효율을 향상시키고 계산시간을 절약할 수 있는 장점이 있다. 그러나 최적화기법이 효율적이지만, 최적화기법을 사용하기 위해서는 전문가의 전문지식이 필요하다. 따라서 실제 최적화를 수행하기 위해서는 관련 분야의 전문지식과 최적화기법이 효율적으로 결합되는 것이 필요하다.

• Reproductive and Developmental Biology
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• v.29 no.1
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• pp.15-18
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• 2005

This study was carried out to analyze the structure of the gene related to porcine stress syndrome (PSS) through cloning from PSS heterozygous pigs and to examine hereditary type associated with PSS. The results obtained from the study were summarized as follows: Amino acid arginine and cysteine exist in dominant gene, N and harmfully recessive gene, n, respectively. It was confirmed that such genes exists as alleles in the sixth chromosome related to PSS. These allelic genes might be inherited according to Mendelian law.