• 제목/요약/키워드: 역전사 중합효소연쇄반응

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위암에서 정량적 역전사 중합효소연쇄반응을 이용한 다중 표지자 분석 (Multiple Genetic Marker Analysis with Using Quantitative RT-PCR in Gastric Cancer)

  • 유문원;이혁준;최수민;유지은;허근;김영국;양한광
    • Journal of Gastric Cancer
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    • 제7권2호
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    • pp.59-66
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    • 2007
  • 목적: 위암 세포주 및 조직에서 다중 표지자 mRNA 발현을 정량적 RT-PCR 검사를 통해 확인함으로써 이들 표지자를 이용하여 위암의 복강내 미세전이 진단이 가능한가를 평가하고자 본 연구를 시행하였다. 대상 및 방법: 12개의 인체 위암 세포주와 10개의 위암 조직을 대상으로 Carcinoembryonic antigen (CEA), Cytokeratin 20 (CK20), Dopa decarboxylase (DDC), L-3-phosphoserine phosphatase (L3PP)의 네 가지 mRNA를 이용한 정량적 RT-PCR 다중 표지자 분석을 시행하였다. 결과: 12개의 인체 위암 세포주 중 CEA는 4개(33%), CK-20는 1개(8%), DDC는 6개(50%), L3PP는 12개 세포주 모두(100%)에서 과발현되었다. 10개의 위암 조직 중 CEA는 9개, CK20은 3개, DDC는 9개, L3PP는 10개 조직 모두에서 과발현되었다. L3PP는 모든 위암 세포주와 조직에서 과발현을 나타내었으나 과발현 정도는 비교적 낮게 측정된 반면, CEA와 DDC는 일부 위암 세포주 및 조직에서만 과발현을 나타내었지만 파발현 시 충분한 발현도를 나타내었다. 결론: 위암 환자에서 하나 이상의 암 특이적 유전자를 이용한 다중 표지자 분석은 단일 표지자 분석이 가지는 단점을 보완할 수 있을 것으로 예상되며, CEA, DDC, 및 L3PP의 세 가지 mRNA가 후보 유전자로 사용될 수 있을 것으로 생각한다.

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상업용 유전자 변형작물 이벤트 선발을 위한 도입유전자 확인, 발현 및 세대간 안정성 평가 : 오이모자이크바이러스 저항성 GM 고추 (Identification of Introduced Gene and Its Expression and Gene Stability Assessment for Event Selection of Genetically Modified Plant toward Approval: Cucumber Mosaic Virus Resistant Hot Pepper)

  • 강승원;한밝음;이태호;김은지;이긍표
    • 원예과학기술지
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    • 제30권2호
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    • pp.192-200
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    • 2012
  • 형질전환 작물 개발시, 위해성 평가에 영향을 미치게 될 요인들을 파악하고, 이에 대한 과학적 근거의 마련을 위한 실험 자료 생산계획의 확립과 실험을 진행하는 것이 매우 중요하다. 또한 유전자변형작물을 개발한 후 정부의 승인을 위한 과학적이고 신뢰할 만한 자료를 축적하기 위해서는 오랜 기간과 많은 자본이 투입된다. 이에 따라, 본 연구에서는 CMV 저항성 유전자변형 고추에 대한 평가분석 연구를 통해 유전자변형작물의 환경위해성 평가를 수행하는데 있어 도입유전자 확인을 위한 평가서 작성을 위해 요구되는 서던 분석을 위한 탐침 포화, 도입유전자의 발현 해석을 위한 RT-PCR, ELISA 실험에 관한 사례를 제시하고자 하였다. 서던 분석을 위해 삽입 유전자 전체 서열의 확인이 가능한 10개의 부분적으로 겹치는 탐침을 제작하였다. 서던 분석 결과, 고추에 도입된 외래유전자가 단일사본으로 존재하여, 게놈전체에서 도입된 위치 이외에 상동성을 갖는 다른 조각 부위가 없음을 확인하였으며, 도입유전자 전체의 안정성을 확실히 입증할 수 있었다. 그와 더불어, 역전사 중합효소 연쇄반응 및 효소면역법 실험을 통하여, CMV 저항성 고추의 잎, 과실 등과 같은 주요 기관에서의 삽입 유전자에 대한 안정적인 발현을 확인 할 수 있었다.

2005년 하절기에 충남지역 소아에서의 장바이러스 감염원인 (Cause of enteroviral infection in children in chungnam area summer, 2005)

  • 전세윤;최석주;김용배;남해선;박귀성;백경아;박준수
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제49권11호
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    • pp.1186-1193
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    • 2006
  • 목 적 : 장바이러스 감염은 하절기에 소아에서 비교적 흔하게 일어나는 바이러스 감염이다. 임상증상으로 비특이적인 열, 무균성 뇌수막염, 위장관 질환, 피부 발진, 수족구병 등을 일으키며 드물게 심근염, 심외막염, 횡단성 척수염, 사지마비 등 치명적으로도 나타날 수 있다. 장바이러스 유행에 대한 보고는 있었으나, 충남지역에서 장바이러스 감염에 대한 조사 및 연구 보고는 이루어지지 않고 있었다. 이에 저자들은 2005년 5월부터 8월까지 장바이러스 감염으로 의심되어 순천향대학교 천안병원에 입원한 소아를 대상으로 역전사 중합효소연쇄반응을 이용하여 원인 바이러스를 파악하고자 본 연구를 시행하였다. 방 법 : 같은 기간 순천향대학교 천안병원 소아과에 입원한 환자 중 임상적으로 장바이러스 감염이 의심되었던 환아 157명을 대상으로 입원 후 급성기에 뇌척수액 또는 분변을 채취하여 장바이러스 세포병변효과 관찰 및 역전사 중합효소연쇄반응검사를 시행하였다. 결 과 : 연구 기간동안 장바이러스 감염이 의심되어 입원하였던 환아는 157명이었고 역전사 중합효소연쇄반응 검사에서 양성을 보인 환아는 32명(20.4%)이었다. 양성 환아 중 남자가 20명, 여자가 12명으로 남녀비는 1.67:1 이었다. 이들의 임상증상은 발열이 93.7%로 가장 많았으며 두통(90.0%), 뇌막자극증상(65.0%), 복통(30.0%) 순이었다. 분리된 장바이러스는 Echovirus 18형 17례, Coxsackievirus B5형 6례 였으며, 그 외 Echovirus 9형 2례, Coxsackievirus A6형 1례, Coxsackievirus B3형 1례 분리되었으며 유전자형이 결정되지 않은 Enterovirus가 5례였다. 결 론 : 이번 연구로 Echovirus 18형을 국내 최초로 분리하였으며, 2005년 하절기에 충남지역에서 Echovirus 18형을 포함한 여러 장바이러스 감염 원인을 알 수 있었다. 향후 장바이러스 감염 환아의 진단 및 치료를 위한 지속적인 역학적 연구가 필요할 것으로 생각된다.

세포배양법과 PCR 방법에 의한 물에서의 폴리오 바이러스 검출 (Detection of Poliovirus in Water by Cell Culture and PCR Methods)

  • 조연희;이찬희
    • 미생물학회지
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    • 제38권3호
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    • pp.198-204
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    • 2002
  • 폴리오 바이러스는 전형적인 장관계 바이러스로 마비, 무균성 수막염, 뇌염 등을 유발한다. 폴리오 바이러스는 분변-구강 경로를 통해 전파되며, 오염된 물을 음용수로 사용할 시 공중 보건에 문제가 될 수 있으므로 먹는 물에서 폴리오 바이러스를 검출하는 것은 중요하다. 감염성이 있는 바이 러스와 불활성화(열처리와 자외선 처리)시킨 바이러스를 세포배양법, 역전사 중합효소 연쇄반응법(reverse transcription-polymerase chain reaction: RT-PCR)그리고 세포배양-중합효소 연쇄반응 통합법(integrated cell culture-PCR: ICC-PCR)으로 검출 실험을 했다. 감염성이 있는 폴리오 바이러스는 세 가지 방법으로 모두 검출이 되었으며, 이 중에서 바이러스를 검출하는데 ICC-PCR 방법이 가장 민감했다. 세포배양법은 적은 수의 바이러스를 검출하는데 약 2주의 긴 시간이 걸렸다. 열처리나 자외선 처리로 불활성화된 바이 러스는 세포배양과 ICC-PCR방법으로는 검출이 되지 않았다. 자외선 처리한 바이러스는 RT-PCR 방법으로 검출되지 않았으나 열처리한 바이러스는 검출되었다. RT-PCR 방법은 감염성 바이러스뿐 아니라 불활성화된 바이러스도 검출할 수 있으므로 감염성이 있는지 없는지를 구분할 수 없는 단점이 있다. 이와 같은 결과는 감염성 있는 바이러스를 가장 민감하고 효과적으로 검출하는 방법이 ICC-PCR 방법이라는 것을 제시하여 준다.

배추에서 분리한 순무 모자이크 바이러스의 특성 및 역전사 중합효소 연쇄반응법(RT-PCR)을 이용한 검정 (Characterization and RT-PCR Detection of Turnip Mosaic Virus Isolated from Chinese Cabbage in Korea)

  • 박원목;최설란;김수중;최승국;류기현
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권3호
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    • pp.223-228
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    • 1998
  • Turnip mosaic virus)TuMV-Ca) was isolated from a Chinese cabbage showing severe mosaic and black necrotic spots symptoms in Korea. The virus was identified as a strain of TuMV by its host range test, particle morphology, serology, double stranded RNA analysis. For detection of the virus, reverse transcription and polymerase chain reaction(RT-PCR) was performed with a set of 18-mer TuMV-specific primers to amplify a 876 bp DNA fragment The virus was rapidly detected from total nucleic acids of virus infected tissues as well as native viral RNA of purified virion particles by RT-PCR. Detection limit of the viral RNA by RT-PCR was 10 fg.

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간이 조즙액 추출법을 이용한 RT-PCR 방법에 의한 오이 모자이크 바이러스의 검정 (Detection of Cucumber Mosaic Virus by RT-PCR Using a Simple and Rapid Crude Sap Extraction Method)

  • 이상용;홍진성;이진상;최장경
    • 한국식물병리학회지
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    • 제12권4호
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    • pp.432-436
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    • 1996
  • 역전사 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)을 이용하여 담배(Nicotiana glutinosa)에 증식시킨 7종의 오이 모자이크 바이러스(CMV)를 검정하였다. RT-PCR을 위한 간단하고 신속한 바이러스 핵산의 조즙액 추출법이 개발되었으며, CMV 외피단백질 유전자 부위를 기초로 하여 제작한 20개의 염기로 구성된 primer를 사용하여 RT-PCR을 실시한 결과, 약 490 염기쌍의 DNA 단편들이 이병식물의 조즙액으로부터 증폭되었다. EcoRI 및 MspI을 이용한 RT-PCR 산물의 분석에 의하여, 공시한 7종의 바이러스는 모두 CMV subgroup I으로 동정되었다. Ouchterlony 한천젤 이중 확산법을 이용한 항혈청 검정에서도 7종의 바이러스 모두 CMV-Y의 항혈청과 단일의 침강선을 형성하였다.

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한우송아지에서 소 바이러스성 설사병 바이러스 발생 (Outbreak of Bovine Viral Diarrhea Virus in Korean Indigenous Calf)

  • 송무찬;최경성
    • 한국임상수의학회지
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    • 제26권6호
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    • pp.578-581
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    • 2009
  • 25일령의 한우송아지가 10일 간의 호흡기질환과 출혈성 설사의 병역을 나타내다가 폐사하였다. 이 송아지는 다른 송아지들과 비교해보았을 때 극도로 위축되어 있었다. 꼬리와 회음부의 분변 흔적은 만성설사가 지속되었음을 말해주었다. 부검시 다양한 기관(조직)에서 반상출혈이 관찰되었다. 역전사 중합효소연쇄반응에 의하여 소 바이러스성 설사병 바이러스가 진단되었다. 이 증례는 계통발생분석에서 BVDV-2a 그룹에 속하는데, 이것은 고병원성인 미국 균주890 (U18059)과 유사하다. 본 증례는 BVDV-2가 한국에서 유행하고 있다는 증거를 제공한다. 이를 통해 우리는 BVDV-2의 발생을 재확인하였다.

DNA 중합효소 연쇄반응을 이용한 한국형 젖소 면역 결핍 바이러스의 검출 (Molecular Detection of Korean-type Bovine Immunodeficiency Virus by Polymerase Chain Reaction)

  • 권오식
    • 대한의생명과학회지
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    • 제5권1호
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    • pp.101-107
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    • 1999
  • 젖소 면역결핍 바이러스 (BIV)는 젖소에게 여러 가지 면역결핍증후군을 야기하는 렌티 바이러스 (역전사효소 바이러스의 아군)로서 국내에서는 이에 대한 연구나 보고가 진행된 바 없다. 본 연구에서는 BIV가 다른 젖소의 역전사효소 바이러스인 젖소 백혈병바이러스 (BLV)와 동시 감염되고 (50%정도)있는 점을 착안해 우선 대구.경북지역의 소의 BLV감염실태를 조사해 BLV가 감염된 젖소를 대상으로 BIV 감염상태를 알아보았다. 먼저 10회에 걸쳐 젖소와 황소 248마리의 혈액을 채취 해 BLV와 BIV의 숙주세포가 되는 말초혈액 단핵구 (peripheral blood monocytes, PBMC)를 분리하고, 이를 이용해 DNA중합효소 연쇄반응 (PCR)과 Southern blot분석법을 통해 BLV와 BIV의 존재여부를 조사하였다. 그 결과 조사대상 젖소의 66.9% (81/121) 이상이 BLV에 감염되어 있음을 PCR 검사를 통해 알 수 있었으며, 이는 Southern blot법으로 재차 확인되었다. 이 결과는 종래에 보고된 대구경북지역에서의 BLV 감염율인 27~30%보다 2배 이상 높은 수치로서, (1) 우리가 사용한 방법들 (PCR & Southern blot법)이 분자생물학적 연구방법인 관계로 고도의 특이성 (specificity)을 지녔기 때문이며 (2) 지난 10년간 조사 대상지역인 대구 경북지역 내에서 젖소들에게 지속적으로 BLV감염이 증가하였기 때문으로 본다. 한편 이들 BLV positive PBMC의 chromosomal DNA를 사용해 BIV의 검출을 시도한 바, lot 3C샘플은 BLV에 100%감염되어 있음과 동시에 그 일부가 BIV에 감염되어 있음을 PCR 방법을 통하여 확인할 수 있었다.

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재조합 인간 인터페론 알파와 Pentoxifylline을 이용한 고양이 전염성 복막염의 치료 증례 (Successful Management of Feline Infectious Peritonitis with Human Recombinant Interferon-alpha and Pentoxifylline in a Cat)

  • 강민희;박희명
    • 한국임상수의학회지
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    • 제28권4호
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    • pp.427-430
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    • 2011
  • 6개월령의 잡종 수컷 고양이가 갑작스런 호흡곤란과 식욕부진 증상으로 내원 하였다. 신체검사상 심음의 감소와 함께 확연한 호흡곤란이 확인 되었다. 혈액학적 검사에서 고글로블린 혈증을 동반한 고단백혈증이 관찰되었으며, 다클론성 감마글로블린병증이 확인 되었다. 환축은 흉부 방사선 검사에서 흉수가 확인 되었으며, 흉수는 비감염성 삼출물로, 흉수 역시 다클론성 감마글로블린병증을 동반한 고글로블린증과 감소한 알브민 대 글로블린 비율이 관찰되었다. 또한 흉강 삼출물을 통한 역전사 중합효소연쇄반응에서 고양이 코로나바이러스에 양성반응을 확인하였다. 따라서, 환축은 고양이 전염성 복막염이 강하게 의심되었으며, 재조합 인간 인터페론 알파, pentoxifylline 과 스테로이드제를 이용한 적극적인 치료가 시작 되었다. 환축은 초기 치료에 반응이 좋았으며, 치료 이후 5개월간 재발 증상이 관찰되지 않았다. 결론적으로 본 증례는 재조합 인간 인터페론 알파와 pentoxifylline을 이용한 고양이 전염성 복막염의 치료 반응에 대한 국내 첫 증례보고이다.

코로나바이러스감염증 2019에서 흉부X선사진 및 CT의 역할과 인공지능의 적용 (Role of Chest Radiographs and CT Scans and the Application of Artificial Intelligence in Coronavirus Disease 2019)

  • 유승진;구진모;윤순호
    • 대한영상의학회지
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    • 제81권6호
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    • pp.1334-1347
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    • 2020
  • 코로나바이러스감염증-19 (coronavirus disease 2019; 이하 COVID-19)는 전 세계적 대유행 질환으로 인류 보건을 위협하고 있다. 흉부 CT 및 흉부X선사진은 COVID-19의 표준 진단검사인 역전사 중합효소 연쇄반응에 더하여 COVID-19 진단 및 중증도 평가에서 중요한 역할을 하고 있다. 본 종설에서는 흉부 CT 및 흉부X선사진의 COVID-19 폐렴에 대한 현재 역할에 대하여 살펴보고 인공지능을 적용한 대표적 초기 연구들과 저자들의 경험을 소개함으로써 향후 활용가치에 대해 살펴보고자 한다.