• Journal of KIISE:Databases
• /
• v.30 no.6
• /
• pp.573-584
• /
• 2003

Recent massive data generation by genomics and proteomics requires bioinformatic tools to extract the biological meaning from the massive results. Here we introduce ROSPath, a database system to deal with information on reactive oxygen species (ROS)-mediated cell signaling pathways. It provides a structured repository for handling pathway related data and tools for querying, displaying, and analyzing pathways. ROSPath data model provides the extensibility for representing incomplete knowledge and the accessibility for linking the existing biochemical databases via the Internet. For flexibility and efficient retrieval, hierarchically structured data model is defined by using the object-oriented model. There are two major data types in ROSPath data model: ‘bio entity’ and ‘interaction’. Bio entity represents a single biochemical entity: a protein or protein state involved in ROS cell-signaling pathways. Interaction, characterized by a list of inputs and outputs, describes various types of relationship among bio entities. Typical interactions are protein state transitions, chemical reactions, and protein-protein interactions. A complex network can be constructed from ROSPath data model and thus provides a foundation for describing and analyzing various biochemical processes.

• Proceedings of the Korea Society of Poultry Science Conference
• /
• 2002.11a
• /
• pp.46-58
• /
• 2002

포도당 대사에서 중심적인 역할을 담당하고 있는 호르몬인 인슐린의 작용기전은 이전에 알려진 것보다 매우 다양하고 복잡한 세포내 신호전달 체계에 의해서 수행된다. 지난 10여년간 이러한 세포 신호전달 흐름내 중간물질인 여러 가지 단백질의 역할에 대해서 많은 연구가 진행되어 적지 않은 성과를 거두고 있다. 근래에는 해당 유전자에 대해 분자생물학적인 조작을 가하여 실험동물 체내에서 이러한 중간 단백질이 발현되지 못하도록 한 후, 각 조직에서의 인슐린 신호전달 체계를 더욱 심도 있게 연구하고 있다. 여러 연구방법 가운데서, 특히 조직 특이적으로 특정 유전자를 제거하여 태어난 개체를 이용하고, 또한 이들을 서로 교배시켜 나타나는 현상을 연구하여 비정상적인 포도당대사를 이해하는데 많은 도움을 받고 있다. 동물종에 따른 대사상의 차이점 등으로 인해 적지 않은 한계를 갖고 있지만, 동물 질환모델은 포도당 대사와 같은 생체 내에서 중요한 작용을 깊게 이해하고 더 나아가서는 비정상적인 대사를 밝히는데 핵심적인 역할을 수행하고 있다. 기초분야의 성과를 활용하는 응용학문인 축산분야에서도 이러한 접근방법과 연구 결과는 시사하는 바가 있을 것이다.

• The Journal of the Acoustical Society of Korea
• /
• v.17 no.4
• /
• pp.82-87
• /
• 1998

여러 음원들에 의해 형성된 파동장내에서 각 신호음의 주파수 특성과 시간 지연 (time delay)을 추정할 수 있는 알고리즘을 개발하였다. 이 알고리즘의 관련 수식은 두 개의 상호 간섭하는 신호가 입사하고 여기에 주변 환경에 의한 랜덤 잡음이 첨가된다고 가정하여 유도되었으며 두 개 이상의 신호음이 있는 상황에 대해 확장이 가능하다. 본 논문에서 시간 지연이 일정한 수신 신호 영역에 등간격으로 놓여진 수신기로부터 각 센서에 수신된 신호의 스펙트럼은 M개의 센서에 대해 K개의 음원 스펙트럼과 K개의 조정 벡터(steering vector) 의 선형 조합(linear combination)으로 주파수에서 모델된다. 각 음원의 주파수 특성과 음원 으로 들어오는 신호의 입사각을 결정하기 위하여 본 알고리즘은 전달 행렬(transfer matrix) 을 계산하고 그 전달 행렬의 고유값(eigenvalue)과 고유벡터(eigenvector)를 분석한다. 이 고 유값들은 복소수이며 그 크기는 진폭 변환 계수를 결정한다. 위상은 수신기의 간격으로부터 시간 지연을 결정하는 기울기를 갖는 주파수의 선형 함수이다. 전달 행렬에의 입력 자료들 은 동일 간격 소자간의 cross-power spectra이다.

• Journal of the Korean Wood Science and Technology
• /
• v.28 no.2
• /
• pp.19-24
• /
• 2000

Effects of the cross-sectional dimension and moisture profile of wood specimens on the ultrasonic sound velocities of radiata pine heartwood and sapwood. Each moisture profile model specimen was made by composing five wood pieces with various moisture contents. As the cross-sectional dimensions decreased the ultrasonic velocities of both heartwood and sapwood decreased by 4~8%. In the ultrasonic signals transmitted through the specimens low frequency components more dominated than high frequency components as the dimension of cross section increased. The specimens with the same average MCs and different moisture profiles showed different ultrasonic velocities. By plotting the ultrasonic velocities against the average moisture contents of the inner three pieces of the moisture profile model specimens it was revealed that three distinct plot patterns existed.

• The Journal of the Acoustical Society of Korea
• /
• v.11 no.6
• /
• pp.15-22
• /
• 1992

i.i.d 신호의고차 모멘트와 스펙트럼의 성질에 대하여 4차까지 고찰하였으며 이의 결과를 이용하 여 2차 Volterra 급수로 표시되고, i.i.d. 입력 신호를 갖는 시불변 비선형 시스테므이 파라메타들을 추정 하는 알고리즘을 시간 영역과 주파수 영역에서 각각 제안하였다. 비록 2차 Volterra 급수가 i.i.d. 입력 신호에 대하여 orthogonal 모델이 아닐지라도 입력 신호의 각종 시간지연에 대한 모멘트나 역행렬의 계 산등이 요구되지 않으며 선형 전달함수와 2차 전달함수를 추정할 수 있는 알고리즘이 존재하는 것을 보 았다.

• Proceedings of the Korea Contents Association Conference
• /
• 2015.05a
• /
• pp.337-338
• /
• 2015

알츠하이머병은 뇌에 비이상적으로 베타아밀로이드 단백질의 축적으로 인해 신경세포가 손상되는 질병으로 아직까지 명확한 질병의 메커니즘이 밝혀지지 않고 있다. 새로운 알츠하이머병의 생물학적 모델을 제시하기 위해, KEGG의 알츠하이머병의 신호전달패스웨이와 문헌정보를 기반으로 구축된 신호전달 네트워크를 병합함으로써 새로운 질병의 모델을 생성하였다. 분석결과 로바스타틴하부경로를 포함하는 새로운 알츠하이머 생물학적 경로 모델을 제시하고자 한다. 향후 메디컬 페스웨이의 병합기술을 통해 보다 다양한 질병의 원인 기작을 연구하는데 활용하고자 한다.

• The Journal of the Acoustical Society of Korea
• /
• v.21 no.8
• /
• pp.679-685
• /
• 2002

Low-frequency mono-static reverberation model for shallow-water environment is presented. It is necessary to develop the transmission loss model to calculate the sub-bottom interaction because the ray-based transmission loss model is difficult to compute the pressure accurately which penetrates the bottom medium. In this paper reverberation level is calculated using the RAM (Range dependent Acoustic Model) to augment the multi-path expansion model because it does not estimate transmission loss accurately in shallow water. The signals generated by the L-HYREV and the GSM are compared with the observed signals and it is showed that the L-HYREV model provides a closer fit to the observed signals than those obtained using the GSM.

• Proceedings of the Acoustical Society of Korea Conference
• /
• spring
• /
• pp.429-432
• /
• 2002

천해에서의 저주파 단상태 잔향음 모델(L-HYREV)을 개발하였다. 음선이론에 기초한 전파모델은 해저 내로 투과되는 음파에 대한 효과를 적절하게 고려 할 수 없으므로, 해저 내 상호작용을 계산할 수 있는 전파모델이 필요하다. 따라서 본 논문에서는 RAM을 이용해서 전달손실을 계산 후, 다중경로 확장모델을 이용해서 산출한 전달손실을 보정하였다. 모델의 검증을 위하여 GSM(generic sonar model) 잔향음 모의 신호 및 실측잔향음 신호와 비교하였으며, 비교 결과 GSM 보다 L-HYREV 모델이 저주파 잔향음 예측에 적합함을 확인할 수 있다.

• Journal of Biomedical Engineering Research
• /
• v.23 no.3
• /
• pp.227-233
• /
• 2002

The IME(implantable middle ear) system is Promising due to its ability to free from sound feedback and Produce a good sound quality and intelligibility with low distortion even if it is operated with high gain for severe hearing impaired. The differential electromagnetic vibration transducer. which was developed for using in IME system and has two small magnets attached the same Pole facing in the coil. is not influenced by environmental external magnetic field. Besides, it has high vibration efficiency and good frequency response characteristics. In this Paper, using acoustic model of the transducer and ear model of normal Person. the signal transfer characteristics of the IME system are analyzed and investigated From the differences of the characteristics between normal ear and the IME system, it is Possible that design of the IME system that have the signal transfer characteristics similar to normal person's ear.

• The Journal of the Korea Contents Association
• /
• v.18 no.11
• /
• pp.655-664
• /
• 2018

Retina transforms the external light into electrical signal that stimulates visual cortex of the brain. Electrical modeling of the retina is useful to understand its structure and action that is a prerequisite to implement the retina as a hardware device. This paper introduces a 2-D electrical network model of vertebrate's retina considering signal pathway of retinal cells and synapses. We implemented a simulator of the retina based on the electrical network model to analyze its operation under various circumstances. Compared to the prior studies, It might contribute designing of artificial retina device in terms of that this study specifically observed input and output reactions of each cell and synapse node under various light intensity on the retina.