• Title/Summary/Keyword: 서열체계

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Phylogenetic Relationships of Genera Coprinus and Psathyrella on the Basis of ITS Region Sequences (먹물버섯속(Coprinus)과 눈물버섯속(Psathyrella)의 ITS 영역 염기서열에 의한 계통학적 유연관계 분석)

  • Park, Dong-Suk;Go, Seung-Joo;Kim, Yang-Sup;Seok, Soon-Ja;Ryu, Jin-Chang;Sung, Jae-Mo
    • The Korean Journal of Mycology
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    • v.27 no.4 s.91
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    • pp.274-279
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    • 1999
  • The internal transcribed spacer regions(ITS) of the ribosomal DNA gene repeat from Coprinus and Psathyrella spp. were amplified using polymerase chain reaction (PCR) and sequenced. Sequences from 11 species including Coprinus comatus, C. atramentarius, C. micaceus, C. cinereus, C. rhizophorus, C. radians, C. echinosporus, C. disseminatus, Psathyrella candolleana, P. spadiceogrisea and Stropharia rugosoannulata were compared. The spacer region I and II were $258{\sim}301\;bp\;and\;253{\sim}275\;bp$ in length respectively and partially contained 17S, 5.8S and 25S. The reciprocal homologies of ITS sequences among these strains were in the range of $43.9{\sim}96.0%$. According to the analysis of ITS sequences, Coprinus and Psathyrella spp. were classified into three clusters. Cluster I consisted of Coprinus lagopus, C. cinereus, C. echinosporus, C. rhizophorus, and C. atramentarius. Cluster II comprised C. micaceus, C. radians, C. disseminatus, Psathyrella candolleana, and P. spadiceogrisea. On the other hand C. comatus is in Cluster III with Stropharia rugosoannulata even though this species is belonging to the section Coprinus in morphological aspect. These results suggest that taxonomic position of Psathyrella would better be inculded in genus Coprinus. Coprinus comatus, the type species of Coprinus, gives a doubt on monophyletic evolution and is assumed to be paraphyletic or polyphyletic.

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Change in patient safety, quality of medical care, organization culture and hospital management performance after healthcare accreditation system for convalescent hospital (요양병원 의료기관인증제 시행 후 환자안전, 의료의 질, 조직문화 및 병원경영성과의 변화)

  • Seo, Young-Ho;Kim, Keon-Yeop;Kim, Myeong-Seon
    • Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
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    • v.19 no.9
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    • pp.391-401
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    • 2018
  • This study was conducted to investigate the effects of implementation of the healthcare accreditation system on patient safety, quality of medical care, organization culture and management performance of convalescent hospitals. Ten hospitals were selected at random from among 36 convalescent hospitals in Daegu that had obtained accreditation until September 2015. To accomplish this, hospital staff were surveyed from 15 February to 25 March, 2016 using a questionnaire with 253 objects. We investigated how the healthcare accreditation system has influenced patient safety, service quality, organization culture and performance of hospital management. The change in the treatment support system showed the highest score of 3.93 among quality change and medical service items, while that of personnel source culture showed the highest score of 3.78 points among organization culture items, and that of internal process view, study and growth view showed the highest score of 3.71 among management performance items. Multiple regression analysis revealed that factors positively changing hospital management performance were nurses, employees and managers, basic value systems, organization culture, personnel source culture, open system culture, hierarchical culture, and production oriented culture. The quality of patient safety and medical care was positively influenced by changes in the quality of convalescent hospitals after implementation of the healthcare accreditation system. However, among the four types of organizational culture, the financial perspective was relatively low compared to other perspectives.

Vegetation Structure and Dynamics on Bars in Streams with Different Stream Bed Substrates (하상재료가 다른 하천의 하중도 환경에서 식생의 구조 및 동태)

  • Lee, Chang-Seok;Cho, Yong-Chan;Oh, Woo-Seok;Park, Sung-Ae;Seol, Eun-Sil
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2007.05a
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    • pp.1140-1144
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    • 2007
  • 모래하천과 자갈하천의 하중도에 성립한 식생을 분석하여 하천복원과 복원된 하천의 사후 관리에서 요구되는 생태정보를 구축하였다. 모래하천의 하중도에는 버드나무군락, 물억새군락, 산조풀군락, 속속이풀군락, 큰개여뀌군락, 밭뚝외풀군락 등이 성립하였다. 이러한 식생자료를 서열법으로 처리한 결과, 식물의 배열은 천이경향을 반영하였고, 하중도의 미지형에 의해 결정된 지하수위 높이가 천이단계를 지배하는 것으로 판단되었다. 모래하천인 용수천의 하중도에서 상류로부터 하류를 향해 식생의 분포는 버드나무군락-물억새군락-산조풀군락-속속이풀군락의 순서를 보였다. 우점종의 생활형에 따라 이들을 구분하면, 이 순서는 목본 식물군락-다년생 식물군락-1년생 식물군락의 순서를 보였다. 이러한 식생의 배열로부터 하중도는 하류 방향으로 새로 생성되고 있음을 알 수 있었다. 자갈하천의 하중도에는 발달단계가 다른 세 개의 소나무군락과 초지가 성립하였다. 소나무군락은 유령림, 성숙목과 유령목이 혼합된 복층림, 그리고 성숙림으로 이루어졌다. 초지는 쑥, 달뿌리풀, 환삼덩굴, 소나무 실생, 황철나무 등이 산재하는 밀도가 낮은 식생으로 이루어졌다. 이러한 식생자료를 서열법으로 처리한 결과 여기에서도 식생의 배열은 천이경향을 반영하였다. 천이단계를 지배하는 요인은 홍수에 밀려온 자갈의 피복율로 나타났다. 상류로부터 하류를 향해 식생의 분포는 초지, 소나무 유령림, 소나무 복층림 및 소나무 성숙림의 순서를 보였다. 이러한 식생의 배열로부터 하중도는 상류방향으로 새로 성립하고 있음을 알 수 있었다.변지역에 거주하는 주민의 역할이 중요하며, 이에 따라 보 철거 선정 체계는 보 철거를 위해서 보 주변 지역 거주민을 설득하며, 하천의 환경 개선을 위한 합리적인 대안 제시를 목적으로 하고 있다. 선정 체계를 바탕으로 주민 협의 및 대안 제시를 통해 결정된 대상 보는 선정 체계 안에서 보 철거 영향 판단 절차에 따라서 보 철거로 인한 수문, 수리, 지형, 수질, 생태 영향을 판단하게 되며, 이와 더불어 사회 경제적인 영향을 평가하게 된다. 평가결과에 따라서 보를 완전히 철거하거나 다른 대안을 고려하여 보를 부분적으로 철거하거나 개량하게 된다.곳으로 1/3의 자기 생산을 담당하고 있었다. $\ulcorner$경상도지리지$\lrcorner$(慶尙道地理志)에는 $\ulcorner$세종실록$\lrcorner$(世宗實錄) $\ulcorner$지리지$\lrcorner$(地理志)와 동년대에 동일한 목적으로 찬술되었음을 알 수 있다. $\ulcorner$경상도실록지리지$\lrcorner$(慶尙道實錄地理志)에는 $\ulcorner$세종실록$\lrcorner$(世宗實錄) $\ulcorner$지리지$\lrcorner$(地理志)와의 비교를 해보면 상 중 하품의 통합 9개소가 삭제되어 있고, $\ulcorner$동국여지승람$

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Analytic study on Rhizome by Gilles Deleuze : Focusing on the Film (들뢰즈의 리좀 모델 분석 : 영화 <엘리펀트>를 중심으로)

  • Lim, Taewoo
    • The Journal of the Korea Contents Association
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    • v.14 no.1
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    • pp.66-75
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    • 2014
  • The purpose of this study is to analyze and illustrate 'Rhizome', a postmodern speculation system based on de-subjectivity and decentralization, presented by Gilles Deleuze. He borrowed the word rhizome, an originally botanical term meaning a horizontal stem under the surface of the earth, to counteract the dominating system grounded on binary, root-tree structure. The study then criticizes the early movements of de-subjectivity with molecular-biological and evolutionary evidences, and proves that these evidences can only be characterized by chance and nomadism, which are the key elements that constitute Rhizome. As a practical example of Rhizome, the study analyzes the film by Gus Van Sant, and demonstrates that both his various cinematic experiments and the result bear the same characteristics as Rhizome.

Designing of Comparison System for Protein Tertiary Substructure Database (단백질 3차 하위구조 비교 시스템 설계)

  • Yu, Nam Hee;Jung, Kwang Su;Sohn, Gyo Yong;Chung, Yong Je;Ryu, Keun Ho
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2009.04a
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    • pp.369-371
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    • 2009
  • 생명체 내에서 기능 수행 시 각종 물질들이나 단백질들끼리 상호결합을 해야 한다. 이런 결합성을 결정짓는 것들이 단백질의 3차원 구조이기 때문에 단백질 구조연구는 중요하다. 이 논문에서는 단백질 구조데이터 및 관련된 구조정보의 통합된 데이터베이스를 구축하고 웹 환경에서 질의된 단백질과 유사성 비교를 진행하여 그 결과 및 연관된 정보를 검색하여 체계적으로 정보를 제공하는 단백질 구조 비교시스템을 제안한다. 제안 시스템을 구축하기 위하여 공개용 단백질 구조데이터 저장소인 Protein Data Bank의 플랫파일에서 필수적인 구조데이터정보만을 추출하여 여기에서 단백질의 하위구조 생성 알고리즘을 적용하여 데이터베이스를 구축한다. 사용자가 인터넷을 통하여 진행한 질의는 하위구조처리 모듈을 통하여 하위구조를 생성하고 구조유사부분에 대해 RMSD값이 계산되고 이와 연관된 구조정보의 검색이 진행 된 후 체계적으로 출력화면에 보여준다. 제안 시스템은 단백질의 전체적인 서열과 구조 정보를 이용하지 않고서, 단백질 기능을 결정하는 핵심영역을 포함하는 표면을 효과적으로 비교함으로써 기존의 구조비교 시스템보다 빠른 검색과 상세한 분석을 지원한다.

The Brassica rapa Tissue-specific EST Database (배추의 조직 특이적 발현유전자 데이터베이스)

  • Yu, Hee-Ju;Park, Sin-Gi;Oh, Mi-Jin;Hwang, Hyun-Ju;Kim, Nam-Shin;Chung, Hee;Sohn, Seong-Han;Park, Beom-Seok;Mun, Jeong-Hwan
    • Horticultural Science & Technology
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    • v.29 no.6
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    • pp.633-640
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    • 2011
  • Brassica rapa is an A genome model species for Brassica crop genetics, genomics, and breeding. With the completion of sequencing the B. rapa genome, functional analysis of the genome is forthcoming issue. The expressed sequence tags are fundamental resources supporting annotation and functional analysis of the genome including identification of tissue-specific genes and promoters. As of July 2011, 147,217 ESTs from 39 cDNA libraries of B. rapa are reported in the public database. However, little information can be retrieved from the sequences due to lack of organized databases. To leverage the sequence information and to maximize the use of publicly-available EST collections, the Brassica rapa tissue-specific EST database (BrTED) is developed. BrTED includes sequence information of 23,962 unigenes assembled by StackPack program. The unigene set is used as a query unit for various analyses such as BLAST against TAIR gene model, functional annotation using MIPS and UniProt, gene ontology analysis, and prediction of tissue-specific unigene sets based on statistics test. The database is composed of two main units, EST sequence processing and information retrieving unit and tissue-specific expression profile analysis unit. Information and data in both units are tightly inter-connected to each other using a web based browsing system. RT-PCR evaluation of 29 selected unigene sets successfully amplified amplicons from the target tissues of B. rapa. BrTED provided here allows the user to identify and analyze the expression of genes of interest and aid efforts to interpret the B. rapa genome through functional genomics. In addition, it can be used as a public resource in providing reference information to study the genus Brassica and other closely related crop crucifer plants.

Expression Comparison of the GFP Gene under the Controls of Several Internal Promoters in the Retrovirus Vectors with or without WPRE Sequence (여러 표적세포에서 Retrovirus Vector의 내부 Promoter의 종류와 WPRE의 유무에 따른 GFP 유전자의 발현 효율성 비교)

  • Kim Y. H.;Koo B. C.;Kwon M. S.;Kim T. O.
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • v.28 no.3
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    • pp.191-196
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    • 2004
  • In this study, to construct more effective retrovirus system, we compared four internal promoters (RSV: Rous sarcoma virus, UbC: Ubiquitin C, β-actin, CMV: human cytomegalovirus) in the retrovirus vector by measuring GFP (green fluorescent protein) expression. The effect of WPRE (woodchuck hepatitis virus posttrans-criptional regulatory element) sequence on transgene expression was also investigated. Experiments were conducted with cells derived from three different species (human, pig and chicken) and evaluated the activity of each promoter and the effect of WPRE sequence by fluorometry and Western blotting. In all cells tested, RSV and CMV promoters were superior to UbC and β-actin promoters, and RSV promoter was the best one in chicken cells. The boosting effect of WPRE sequence on GFP expression was evident in human and porcine cells but not in chicken cells.

Features of Students Moving for University Education (대학교육을 위해 다른 지역으로 이동하는 학생의 특성)

  • Han, Song-Ie;Bae, Sang-Hoon
    • Journal of Digital Convergence
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    • v.18 no.2
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    • pp.95-101
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    • 2020
  • The purpose of this study is to examine the features of students moving to other areas for university education in entrance stage. 2018 K-NSSE data were analyzed, and Chi-square test and binary logistic regression analysis were performed. As a result, many students in Seoul area moved to various areas, but students from local areas moved to Seoul area universities with low percentage. In addition, it was confirmed that there was a difference in socioeconomic background, high school type and academic achievement level, career maturity, and university commitment level among the students group moving from Seoul to the local and from the local to Seoul area. This study suggests that the government needs to provide systematic support to overcome the stratification structure of the university centered on Seoul and to secure diversity of student composition to improve the quality of education and contribute to regional development.

Molecular cloning, sequences analysis and in vitro expression of the dihydroflavonol 4-reductase gene from Gypsophila paniculata L. (안개초(Gypsophila paniculata L.)로부터 dihydroflavonol 4-reductase 유전자의 분리 및 분석)

  • Min, Byung-Whan;Cheong, Dong-Chun
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • v.37 no.1
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    • pp.89-95
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    • 2010
  • Dihydroflavonol 4-reductase (DFR) is a key enzyme of the flavonoid biosynthesis pathway which catalyses the NADPH-dependent reduction of 2R,3R-trans-dihydroflavonols to leucoanthocyanidins. In this study we describe cloning and expression of the genes encoding the flavonoid-biosynthetic enzyme DFR in Gypsophila paniculata L. Inspection of the 1279 bp long sequence revealed an open reading frame 1063 bp, including a 36 bp 5' leader region and 181 bp 3' untranslated region. Comparison of the coding region of this DFR cDNA sequence including the sequences of Arabidopsis thaliana, Citrus sinensis, Dianthus caryophyllus, Ipomoea batatas, Matthiola incana, Nierembergia sp, Petunia hybrida, Solanum tuberosum, Vitis vinifera reveals an identity higher than 69% at the nucleotide level. The function of this nucleotide sequences was verified by comparison with amino acid sequences of the amino-terminus and tryptic peptides from purified plant enzyme, by northern blotting with mRNA from wild type and mutant plants, by in vitro expression yielding and enzymatically active reductase, as indicated by the small leucopelargonidin peak. Genomic southern blot analysis showed the presence of only one gene for DFR in Gypsophila paniculata.

Molecular Phylogenetic and Dendrological Study of Paper-mulberry (B. kazinoki) in Gyeongsang-do Region (경상도지역 닥나무의 수목학 및 분자계통학적 연구)

  • Go, In Hee;Jo, Ah Hyeon;Jang, Kyung Ju;Park, Kyu Tae;Park, Sun Mi;Park, Seon Joo;Jeong, Seon Hwa
    • Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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    • 2019.04a
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    • pp.68-68
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    • 2019
  • 닥나무(Paper mulberry)는 뽕나무과(Moraceae) 닥나무속(Broussonetia)에 속하는 낙엽 활엽 관목으로 중국, 일본, 한국 등에 자생하며 Hutchinson(1967)에 의하면 닥나무 속은 열대, 아열대, 난대지방에서 자라는 낙엽성 관목으로 세계적으로 약 6종이 있다고 보고되었다. 일반적으로 닥나무의 품종을 구분하는 것은 수목학적 관점으로 잎의 성상, 줄기의 색과 무늬 유무로 구분한다. 그러나 상기의 수목학적 특징은 닥나무(Broussonetia kazinoki Siebold)와 꾸지나무[Broussonetia papyrifera (L.) L'Her. ex Vent.]가 유사하여 오동정의 사례가 발생하기도 한다. 경상도지역에서는 닥나무를 참닥나무, 머구닥나무, 개닥나무 3가지의 향명으로 구분하고 있다. 본 연구에서는 경상도지역 9개체 닥나무를 대상으로 수목학적 특징을 확인하였다. 나아가 식물종의 기준을 명확히 규명하기 위하여 엽록체 속의 matK, trnL-F, ndhF, 3개 마커와 핵에 존재하는 ITS, 총 4개 마커의 염기서열을 생산하였고 상기 구간에서 얻어진 염기서열 비교분석 및 계통학적 분류를 통해 유연관계를 파악하였다. 수목학적 관점으로는 품종을 명확하게 구분하기가 어려웠으며 분자계통학적 연구로 모든 시료는 닥나무와 꾸지나무의 교잡종으로 확인되었다. 본 연구 결과는 우리나라 전통한지의 원재료로 사용되는 닥나무류 식물자원의 분류체계의 확립을 위한 기초자료로 활용 될 것이다.

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