• Korean Journal of Breeding Science
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• v.42 no.4
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• pp.397-406
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• 2010

Field screening method has been commonly used for purity test of $F_1$ hybrid seeds in melon and oriental melon. However, as this method takes a lot of time and cost, molecular marker-based purity test is necessary. To develop molecular markers for purity test, thirty pairs of SNP (single nucleotide polymorphism) primers were obtained from melon EST sequences, and 10 polymorphic markers showing HRM (high resolution melting) polymorphisms between parents of two melon cultivars and one oriental melon cultivar were selected. Blind tests were performed to validate usefulness of the selected markers for purity test. Blind test results showed that HRM genotypes were matched with the expected identity of individual sample, $F_1$ hybrid, male or female parents. Three HRM-based SNP markers were converted to CAPS markers for general use which is favor to breeders. We expect that SNP markers developed in this study will be useful for purity test of $F_1$ hybrid seeds in melon and oriental melon.

• Korean Journal of Plant Taxonomy
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• v.48 no.4
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• pp.249-259
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• 2018

$Iso{\ddot{e}}tes$ L. ($Iso{\ddot{e}}taceae$) is a cosmopolitan genus of heterosporous lycopods containing ca. 200 species being found in lakes, streams, and wetlands of terrestrial habitats. Despite its ancient origin, worldwide distribution, and adaptation to diverse environment, species in $Iso{\ddot{e}}tes$ show remarkable morphological simplicity and convergence. Allopolyploidy appears to be a significant speciation process in the genus. These characteristics have made it difficult to assess the phylogenetic relationships and biogeographic history of $Iso{\ddot{e}}tes$ species. In recent years, these difficulties have somewhat been reduced by employing multiple molecular markers. Here, we reconstruct the phylogenetic relationships in East Asian $Iso{\ddot{e}}tes$ species. We also provide their divergence time and biogeographic origin using a fossil calibrated chronogram. East Asian $Iso{\ddot{e}}tes$ species are divided into two clades: I. asiatica and the remaining species. $Iso{\ddot{e}}tes$ asiatica from Hokkaido forms a clade with northeastern Russian and western North American $Iso{\ddot{e}}tes$ species. In clade I, western North America is the source area for the dispersal of $Iso{\ddot{e}}tes$ to Hokkaido and northeastern Russia via the Bering land bridge during the late Miocene. The remaining $Iso{\ddot{e}}tes$ species (I. sinensis, I. yunguiensis, I. hypsophila, I. orientalis, I. japonica, I. coreana, I. taiwanensis, I. jejuensis, I. hallasanensis) from East Asia form a sister group to Papua New Guinean and Australian species. The biogeographic reconstruction suggests an Australian origin for the East Asian species that arose through long-distance dispersal during the late Oligocene.

• Proceedings of the Korean Society for Food Science of Animal Resources Conference
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• 2006.05a
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• pp.112-116
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• 2006

본 연구는 인간과 동물의 식욕조절, 에너지 대사, 체지방 축적 및 지방 대사에 핵심적인 역할을 담당하는 비만 유전자 leptin의 SNP를 검색하고, 이들 SNP 마커와 한우의 도체 및 육질형질들과의 연관성을 구명하여 고급육 생산 한우 조기 선발 및 육질 진단을 위한 분자 표지 마커로 활용하기 위하여 수행하였다. 한우 leptin 유전자의 exon 2 및 3번 영역을 포함한 염기서열 분석결과 총 3개의 SNP를 검출하였고, PCR-RFLP및 SSCP기법을 이용하여 SNP유전자형을 분석한 결과 exon 2 영역 내 C1180T SNP부위가 한우의 근내 지방도 및 등지방 두께와 유의적인 연관성(p<0.05)이 있는 것으로 나타났다. 따라서, 본 연구를 통해 개발된 한우 leptin 유전자의 특정한 SNP marker는 근내 지방도가 우수한 고급육을 생산하는 한우의 조기식별 및 마블링 등 육질진단에 매우 유용한 DNA 표지인자로 활용할 수 있을 기대된다.

• Proceedings of the Korean Society for Food Science of Animal Resources Conference
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• 2005.10a
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• pp.119-122
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• 2005

본 연구는 한우 근내 지방 축적 기작을 구명하고 고급육과 저급육에서 차등 발현되는 유전자를 발굴 동정하여 한우 육질 진단을 위한 분자 표지 마커로 활용하기 위해 GeneFishing PCR 기법을 이용하여 한우 육질등급에 따른 등심조직에서 차등적으로 발현되는 유전자를 분석하였다. 한우 육질 등급($1^+$ 등급 vs 3 등급)간에 총 10개의 차등 발현 유전자가 확인되었고 이 가운데 고급육 한우 등심에서 발현량이 높은 유전자가 4개 그리고 저급육 등심에서 발현량이 높은 유전자 6개가 각각 검출되었다. 발현량 차이 유전자를 cloning하여 염기서열을 분석하고 상동성 검색을 실시한 결과 고급육에서 발현량이 높은 DEG는 주로 EST(expressed sequence tag) 유전자들로 밝혀졌고 저급육에서 발현량이 높은 DEG는 malate dehydrogenase 2(MDH2), myosin heavy chain 2a, triosephosphate isomerase 1(TPI 1), actin, alpha 1, skeletal muscle(ACTA1 ) 유전자들로 동정 되었다. 본 연구를 통해 한우 육질간 차등 발현되는 유전자들은 한우 육질 및 등급판정을 위한 표지인자(marker)로 활용할 수 있어 유전자 마커를 이용한 고급육 생산 한우의 육질 조기진단이 가능할 것이다.

• Korean journal of applied entomology
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• v.48 no.2
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• pp.211-219
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• 2009

Local and seasonal populations of the oriental fruit moth, Grapholita molesta, were monitored with sex pheromone trapping and RAPD (random amplified polymorphic DNA) molecular marker to analyze their movement in apple orchards. To detect their movements among farms, pheromone traps were placed at regions between apple farms ('outside-farms') as well as within-farms ('inside-farms'). Four seasonal adult peaks were evident in apple-cultivating fields from April to October in both trappings of inside- or outside-farms. After overwintering generation, populations of inside-farms were significantly reduced with frequent insecticide applications, compared to populations of outside-farms. Within apple farms, G. molesta tended to be unevenly distributed because of significant sublocal preference. Active movements of local and seasonal populations of G. molesta were supported by gene flow analysis using RAPD marker. Monitoring data using sex pheromone and seasonal reduction in initial genetic differentiation detected in the overwintering populations suggest that there must be significant movement of G. molesta among different orchards in apple-cultivating areas.

• Journal of the korean veterinary medical association
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• v.25 no.10
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• pp.595-606
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• 1989

항원제시세포(APC)와 보조T세포 간의 협력작용에 의하여 활성화된 작동세포(NK세포, CTL, K세포, 대식세포, 과립구 등)의 종양세포, 이식장기 및 세포내기생세균에 감염된 각종 세포에 대한 세포독성작용은 생체방어를 위한 중요한 세포성면역기전이다. 지난 몇 년간 세포성면역기전에 관한 많은 연구에도 불구하고 T림파구매개성 세포독성작용의 면역생물학적기전은 확실히 밝혀있지 않다. 지금까지 알려진 중요한 연구내용을 요약하면 다음과 같다. 1. 세포독성작용을 나타내는 작동세포로는 NK세포, CTL, K세포, 대식세포/단핵구 및 과립구가 있다. 2. T세포의 세포표면항원분자군(CD)으로는 $CD_{2},\;CD_{3},\;CD_{4}[Ly_{3}T_{4}],\;CD_{5}[=Ly_{1}],\;CD_{7},\;CD_{8}[Ly_{2,3}]$가 있으며 $CD_{4}$는 보조Ttpvhdml 특이마커이고 $CD_{8}$는 세포독성 T세포 및 억압T세포의 특이마커이다. 주요 T세포수용체(TCR)는 $CD_{4}$ 또는 $CD_{8}$ 분자와 가까이 연합된 이향체($TCR-{\alpha}{\beta}/TCR-{\gamma}{\delta}$이며 보조 T세포 $CD_{4}$(마우스 $L_{3}T_{4}$)는 수용체와 연합되어 있는반면 억압 T세포 $CD_{8}(Ly+_{2,3})$는 항원수용체와 연합되어 있다. 3. T세포는 Ti-$CD_{3}$(항원/MHC) 복합체를 통한 '항원가교'에 의한 자극(항원인식)과 $CD_{2}$를 통한 비특이경로에 의하여 활성화(분화증식)된다. 비특이경로를 통한 활성경로에서 T세포($CD_{4}$ 및 $CD_{8}$)가 활성화되기 위하여는 보조T세포가 생산하는 IL-2을 요구하며 IL-2의 자극으로 분화증식된 $CD_{8}$는 세포독성능을 나타내지만 $CD_{4}^{+}$는 여전히 세포독성능을 나타내지 못한다. 4. 보조T세포는 class II MHC분자와 연합된 항원을 식별하는 반면 세포독성T세포는 class I MHC 분자와 연합된 항원을 식별한다. 5. 림파구 매개성 세포독성은 접촉(conjugati-on), 탈분극(depolarization), 용해계획(progra-mming), 용해(lysis) 및 재순환(recycling)의 단계를 거쳐 진행된다. 6. 표적세포살해매체로는 perforin / PFP / cy-tolysin, lymphopores, lymphotoxins, protone, cytolytic enzymes가 알려졌으며 세포독성작용은 이들 이외에도 여러 가지 매체를 통한 복합작용으로 추정된다. 7. CTL 매개성 표적세포의 주요 대사변화는 actomyocin ATPase의 증가, phosphocreatine과 ATPase의 소모, ATP 의존성 $Na^{+}/K^{+}$ 펌프작용의 중지, ATP 의존성 $Ca^{2+}$ 유출감소 및 세포내 축적이 관찰된다. 8. $Ca^{2+}$의 축적으로 세포막 교질 침투손상을 주어 수분의 유입을 증가시킴으로써 수포형성, 핵붕괴, 사립체팽화 및 정상세포 구조상실(Zeiosis)이 있다. 결론적으로 CTL 매개성 세포독성작용은 PFP, LT, TNF, 유사 TNF / LT 및 기타 매체를 통한 복합작용이며 세포살해기전은 지속적 대사소모와 정형적 세포구조(핵 및 세포질)의 파괴에 의한 것이다.

• Korean Journal of Environmental Biology
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• v.36 no.3
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• pp.352-358
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• 2018

This study aimed to develop a species identification method for the egg and fry of the three Korean bitterling fishes (Pisces: Acheilognathinae), including Acheilognathus signifer, Acheilognathus yamatsutae and Rhodeus uyekii based on the PCR-based Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) markers. We conducted a field survey on the Deokchicheon River from the North Han River basin, where the three Acheilognathinae species co-occur, and also analyzed the existing sequence dataset available from the GenBank. We found coexistence of the three species at the study site. The egg and fry were obtained from the host mussels (Unio douglasiae sinuolatus) by hand from May to June 2015 and in May 2017. To develop PCR-based RFLP markers for species identification of the three Acheilognathinae fish species, restriction enzymes pinpointing species-specific single nucleotide variation (SNV) sites in mitochondrial DNA COI (cytochrome oxidase I) and cyt b (cytochrome b) genes were determined. Genomic DNA was extracted from the egg and fry and RFLP experiments were carried out using restriction enzymes Apal I, Stu I and EcoR V for A. signifer, A. yamatsutae and R. uyekii, respectively. Consequently, unambiguous discrimination of the three species was possible, as could be seen in DNA band patterns from gel electrophoresis. Our developed PCR-based RFLP markers will be useful for the determination of the three species for the young and would assist in studying the spawning patterns and reproductive ecology of Acheilognathinae fishes. Furthermore, we believe the obtained information will be of importance for future maintenance, management and conservation of these natural and endangered species.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• v.28 no.5
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• pp.1043-1053
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• 2017

In this study, genotyping was executed by using 13 microsatellite markers for genetic diversity of 224 Gorals (Saanen(88), Laoshan(67), Toggenburg(32), Alpine(12), Anglonubian(9), Jamnapari(7) and Black Bengal(4)). The number of alleles was observed 4 (INRA005) to 18 (SRCRSP23) each markers. Observed heterozygostiy ($H_{obs}$), expected heterozygosity ($H_{\exp}$) and polymorphism information content (PIC) were observed 0.482 to 0.786, 0.476 to 0.923, and 0.392 to 0.915, respectively. Principal Components Analysis(PCoA) results were similar to the results of FCA. NE-I(on-exclusion probability for identity of two unrelated individuals) was estimated at $2.47{\times}10^{-15}$. In conclusion, this study shows the useful data that be utilized as a basic data of Gorals breeding and development.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2019.10a
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• pp.97-97
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• 2019

사삼(沙蔘, Adenophorae Radix)은 "대한민국약전외한약(생약)규격집(KHP)"에 잔대 Adenophora triphylla var. japonica Hara 또는 사삼(당잔대, A. stricta Miq.)의 뿌리로 수재되어 있으나, 형태학적으로 유사한 제니(모시대, A. remotiflorus Miquel), 층층잔대(윤엽사삼, A. tetraphylla (Thunb.) Fisch), 더덕 Codonopsis lanceolata (Sieb. et Zucc.)과 오 혼용 우려가 있어 이들을 구별하기 위한 종 감별법이 필요하다. 본 연구에서는 '사삼'과 오 혼용 우려가 있는 종들을 구별할 수 있는 유전자 마커 개발을 위하여 DNA 바코드로 활용되고 있는 유전자 부위를 분석하여 ITS (25%), atpB-rbcL (15%), atpF-atpH (14%), rpl16 (13%), trnL-F (10%), matK (9%), rpoC1 (7%)에서 변이율(percent of variable sites)을 확인하였다. 또한, 분석한 유전자 부위 중 종간 차이를 확인하기 용이한 matK 구간을 활용해 기원종인 잔대, 당잔대와 형태적으로 유사하여 오 혼용될 우려가 있는 층층잔대, 모시대 및 더덕을 감별 할 수 있는 유전자 마커를 개발하였다. 본 연구를 통해 얻어진 염기서열과 분자 마커는 '사삼'의 품질관리에 유용하게 활용 가능할 것으로 사료된다.

• Journal of Digital Convergence
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• v.17 no.5
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• pp.399-405
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• 2019

This study was investigated the effect of aerobic exercise and chrysin supplementation on macrophage infiltration and lipolysis in high-fat diet mice. To accomplish the purpose of this study, C57BL/6 mice were fed high fat diet(60% fat diet) during experimental period. The animals were divided into 4 groups; NC (normal diet control, n=5), HC (high fat diet control, n=5), Hch(high fat diet with chrysin, n=5), and HME (high fat diet with aerobic exercise training, n=5). Exercise training was performed for 16 weeks on a treadmill running. As a result, macrophage marker, F480 and CD11c were significantly decreased in HME comparison with HD and Hch. Also, M2 macrophage marker CD11c, and lipolysis marker PRDM were significantly increased in HME compared with HC and Hch These findings suggest that regular aerobic exercise has beneficial effects to inhibit macrophage infiltration in high fat diet mice.