일차 담수어류의 잉어과(Cyprinidae)에 속하는 Zacco속 어류 4종과 이와 근인관계가 가까운 Candid유속 어류 1종에 대한 유전적 변이를 조사하기 위하여, 한국, 일본 및 대만에서 채집된 개체를 대상으로 전기영동을 실시하여 24-28개의 유전자를 검출 분석하였다. 각 종의 유전적 변이 정도를 조사한 결과 Zaccoplotypus는 전 집단 평균 h: 1.22, p= 17. 52%, HD = 0.053 및 HD= 0.056으로서 조사한 전종중에서일근 변이가 가장 높았다. Z. pachycepholus의 유전적 변이 정도는 A= 1.17, p= 14.8%, HD: 0.026, HG=0.027로서 Z. ploDpus보다 변이 정도가 낮았고, Z. temminck와 Candidia barbata는 각기 A= 1.07, p =7.95%, HD = 0.011, HG = 0.013 및 A= 1.05, P= 3.7%, Hd: 0.013, HG = 0.011로서 변이 정도가 가장 낮았다. Z. Platypus의 경우 한국집단이 변이가 가장 높았으며 대만집단이 가장 낮았다. Zacco속과 Candid지속 어류의 평균 유전적 변이정도는 타어류의 유전적 변이보다 낮았으며 이는 한국산 담수어류중 잉어과 어류의 일반적인 특징이라 사료된다.
한국산 송사리 (Oryzias)속의 송사리 (O. latipes)와 대륙송사리(O. sinensis)의 집단 내 유전적 변이 및 종간 유연관계를 밝히고자 남한의 16개집단과 일본산 송사리(O. latipes) 1개 집단 등 총 17개 집단에 대한 isozyme 분석을 실시하였다. Isozyme 분석 결과 17개의 효소 및 비효소단백질에서 총 32개의 유전자를 검출한 결과, 전체 유전자중 Est-1과 Est-3 는 종 특유의 유전적 표식인자(genetic marker)였다. 송사리집단 중 진도집단의 유전적 변이 가 가장 낮았으며(Ho=0.011, He=0.043), 대륙송사리 서천집단의 유전적 변이가 가장 높았 다.(Ho=0.114, He=0.124). 한국산 송사리 11개 집단의 평균 유전적 변이 정도는 P=12.7%, Ho=0.029, He=0.042, 대륙송사리 5개 집단의 평균 유전적 변이정도는 P=26.3%, Ho=0.082, He=0.097로 각각 나타나 대륙송사리집단의 유전적 변이 정도가 송사리집단에 비해 약 2.5배 정도 높았고 일본산 송사리의 유전적 변이 정도는 P=15.6%, Ho=0.073, He=0.068로 나타났 다. 한국산 송사리와 일본산 송사리와의 유연관계는 S=0.761(D=0.243)로 나타나 유전적으로 뚜렷한 별개의 분류군으로 생각되며, 대륙송사리와 송사리간의 종간 유전적 근연치는 S=0.648(D=0.389)로 일반적인 척추동물의 종간 유전적 분화 수준을 나타냈다.
Journal of the Korea Society of Computer and Information
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v.17
no.11
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pp.141-148
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2012
The advance of technologies for human genome makes it possible that the analysis of association between genetic variants and diseases and the application of the results to predict risk or susceptibility to them. Many of those studies carried out in case-control study. For quantitative traits, statistical analysis methods are applied to find single nucleotide polymorphisms (SNP) relevant to the diseases and consider them one by one. In this study, we presented methods to select informative single nucleotide polymorphisms and predict risk for quantitative traits and compared their performance. We adopted two SNP selection methods: one considering single SNP only and the other of all possible pairs of SNPs.
Proceedings of the Korean Institute of Navigation and Port Research Conference
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2016.05a
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pp.159-160
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2016
본 연구는 우리나라 수출입 컨테이너화물의 5대 내륙기종점 권역별로 항만집중도 및 변이효과를 분석함으로써, 항만간 경쟁 구도 및 효율적인 컨테이너부두 개발 및 운영에 대한 시사점을 도출하고자 한다. 2011년, 2006년, 2011년의 항만별 내륙기종점 조사자료를 바탕으로 허쉬만-허펜달지수 및 변이할당법을 활용하여 분석하였다.
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2000.10b
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pp.473-475
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2000
폐암의 변이 형태는 크게 침륜형과 팽창형의 두 가지로 나눌 수 있는데, 팽창형은 암의 크기가 크고 성장속도는 느린 특징을 가지고 있으며, 침륜형은 암의 크기가 작고 성장 속도는 빠르며 괴사 부분이 많고 경계선이 불규칙적인 특성을 가지고 있다. 본 논문은 병리 전문가의 이와 같은 시각적인 진단요소를 폐암 변이 분석을 위한 영상의 특성으로 추출하여, 형태학적 특성과 절감특성으로 분석한 후 의료 영상에 대한 진단을 전문가의 진단 견해와 비교해 보았다. 의료 영상에 대한 진단은 영상의 특성과 함께 전문가의 진단 기준에 대한 특성을 최대한 반영하는 특성에 의한 것이어야 할 것이다.
This study distinguished thinking related to statistical variability into six components - the noticing of variability, the explanation of variability, the control of variability, the modeling of variability, the understanding of samples, and the understanding of sampling distribution and investigated the relationships among the thinking components. This study found that this distinction of thinking components related to statistical variability is reasonable. The results showed that each correlation coefficient of the modeling of variability, the understanding of samples, and the understanding of sampling distribution with regard to the noticing of variability, the explanation of variability, and the control of variability is similar. Based on this results, new variable, the understanding of sampling, has been drawn. The results also showed that while the noticing of variability and the control of variability influence the understanding of sampling, the explanation of variability does not influence it.
Korean Journal of Construction Engineering and Management
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v.2
no.4
s.8
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pp.117-126
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2001
The purpose of this study is to present a way of Variation Control in building construction process. The study suggest a way of the application method of shielding, decoupling concept and also Poka-yoke device to control variation that occurs from uncertainty in construction industry with lots of waste factors. The main contents of the study are as follows; (1) It's suggested strategy to apply shielding, decoupling as variation control technique. (2) Current Poka-yoke devices are investigated and analyzed. As a future research, it is required to study continuously on the more effective application method of Poka-yoke device and on existing examples in domestic construction sites for the process improvement.
This study investigated the pathogenicity of different genotypes of infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV) strains isolated from infected rainbow trout in Gangwon Province. RtPc0314c and RtPc0314g strains belonging to the JRt-Shizuoka lineage and RtPc0816g strain belonging to the JRt-Nagano lineage showed 100% cumulative mortality when inoculated at a high titer. In addition, more rapid necrosis was observed in rainbow trout infected with RtPc0314c and RtPc0314g mutations. When inoculated at a low titer, 100% mortality was not observed until the end of the experiment, but the mortality was higher in rainbow trout infected with a mutant strain belonging to the JRt-Shizuoka linage than a mutant strain belonging to the JRt-Nagano lineage. A histopathological analysis showed a clear signature of infection in kidney and spleen tissues upon infection with RtPc0314c and RtPc0314g but no signature of infection associated with the Rt03186 strain. Based on the results in this study, it seems that strains belonging to the JRt-Shizuoka lineage in Gangwon Province IHNV are more pathogenic.
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2012.06c
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pp.19-21
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2012
모든 암 세포는 체세포 변이를 동반한다. 따라서 암 유전체 변이 분석에 의하여 암을 발생시키는 유전자 및 진단/치료법을 찾아낼 수 있다. 본 연구에서는 차세대 시퀀싱 데이터를 이용하여 암 특이적 단이 반복 변이(copy number variation, CNV) 유형을 밝히는 새로운 알고리즘을 제안한다. 제안하는 방식은 암 환자의 정상 세포와 암세포로부터 얻어진 정상 유전체와 암 유전체를 동시 분석하여 각각 CNV 후보 영역을 추출하며, 통계적 유의성 분석을 통하여 암 특이적 CNV 후보 영역을 선별하고, 다음 후처리 과정에서 참조 표준 서열(reference sequence)에 존재하는 오류 영역 보정 작업을 수행하여 정확한 암 특이적 CNV 영역을 추출해 낸다. 또한 다수의 대용량 유전체 데이터 동시 분석을 위하여 맵리듀스(MapReduce) 기법을 기반으로 하는 병렬 수행 알고리즘을 제안한다.
Park, JaeSoon;Kwon, Seong Gyu;Oh, Ji Won;Lee, JongHyuk
Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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2020.11a
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pp.663-664
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2020
차세대 염기서열 분석 기술은 성능과 비용 면에서 매우 향상되어 한 개체 내 여러 세포의 유전자 분석이 가능한 수준이다. 한 개체 내 여러 조직 세포의 유전자는 모두 동일하지 않기 때문에 여러 조직 세포의 Lineage 를 계층적으로 표현하고 이를 조직 세포 간 변이 정도를 파악하는 데 활용한다면 암 돌연변이 발생 등을 미리 예측할 수 있다. 본 논문은 한 개체 내 여러 조직 간 변이를 관찰하기 위해 변이 검출 데이터를 계층적 군집 방법을 이용해 분석하고 이를 시각화 하는 방법을 제안한다. 실제의 8 개 조직 세포의 유전자를 분석하고 변이를 검출하여 Dendrogram 그래프로 시각화 하였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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