호흡기 유두종(recurrent respiratory papillomatosis, RRP)은 호흡기의 편평상피에 발생하는 바이러스성 질환으로 잦은 재발과 증식을 특징으로 한다. 다발성으로 발생하는 경우 소아에서는 생명을 위협하기도 하는 치명적인 질환이다. 호흡기 유두종의 발생에 가장 중요한 원인은 유두종 바이러스(human papilloma virus : HPV)의 감염으로 생각된다. HPV는 Papovaviridae군에 속하는 이중쇄 구조의 DNA virus로서 피부 사마귀, 항문성기기관 및 호흡소화기관의 양성 또는 악성 편평상피 유두종을 유발하는 원인 인자로 알려져 있다. 최근까지의 발표에 의하면 HPV 6, 11형이 호흡기 유두종증의 주원인이라고 알려져 있다. 원인 바이러스의 검출방법에 대하여 최근 DNA chip을 이용하는 방법이 개발되었고, 자궁경부암과 암 전구병변에서 인 유두종 바이러스의 아형에 대한 연구가 발표된 바 있다. (중략)
중합효소 연쇄반응은 분자 생물학적 연구에 여러 목적으로 이용되고 있으며 그 진단적 가치는 교잡반응등에 의한 것보다 더욱 정확한 것으로 알려져 있다. 최근 두경부암의 발생원인중의 하나로 유두종 바이러스가 중요 역할을 하는 것이 알려지면서 여러 방법으로 두경부암 조직내에서 유두종 바이러스 DNA의 검출이 많이 시도되고 있다. 저자들은 54명의 두경부암 환자의 파라핀 절편조직에서 중합효소 연쇄반응을 이용한 유두종 바이러스 DNA의 검출을 시도하여 11명(30%)에서 양성반응을 얻어 그 임상적 특성을 비교분석 하였다.
Viral coat protein (CP) encoding cDNA with artificial start and stop codons was synthesized by reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) from the Korean isolate of potato virus Y-vein nectrosis strain (pVY-VN). To make PVY CP cDNA to untranslatable form, three stop codons were inserted near the start codon by "megaprimer-PCR" method. The untranslatable CP cDNA was subcloned to plant expression vector and transferred to N. tabacum cv. NC82 by Agrobacterium-mediated transformation. Highly resistant plants to PVY infection were screened, based on symptom development after mechanical virus inoculation. By genomic PCR and Southern blot analysis, one or more copies of the untranslatable CP gene were found in all transformants. From northern blot analysis, highly resistant transgenic lines had very low level of CP transcript but susceptible lines had high level, suggesting resistance to PVY infection should be related to RNA-mediated mechanism.mechanism.
배추흰나비 P. rapae와 P. brassicae GV의 DNA성상과 이를 기초로한 상동성을 검정한 결과 Tm값에서는 P. rapae GV DNA는 $83.7^{\circ}C$이고, P. brassicae GV DNA의 경우는 $84.0^{\circ}C$로 G+C 함량은 전자가 35.5%, 후자가 35.9%였다. 그리고 제한산소처리에 의한 DNA의 분석에서는 P. Rapae GV의 genome의 크기는 103 kb, P. brassicae GV DNA는 108kb로 나타났으며, 두바이러스 간의 상동성은 97.0%였다.
유전자치료W터의 주입시 생식세포를 통한 다음 세대로의 전달 가능성은 안전성 측면에서 관심을 중대시키고 있다. 특히 전립선암이나 난소암의 치료시 바이러스를 생식기관에 인접한 부위에 주입하여야 하므로 그 가능성이 높다. 따라서 본 연구에서는 유전자치료에 많이 이용되는 아데노바이러스를 매개로하여 tumor suppressor 유전자인 p53을 발현하는 아데노바이러스 벡터를 제조하여 이를 투여시 생식장기를 포함한 주요장기조직에의 분포와 germ cell을 통한 차세대로의 전달 가능성 등의 생식독성을 조사하였다. In vivo biodistribution study를 위하여 $Ad-CMV-{\beta}-gal$흑은 Ad-CMV-p53를 마우스 암 수의 복강에 주사한 후 생식장기를 포함한 주요 장기에서 아데노바이러스 유래 DNA검출 및 RNA발현 여부를PCR과 RT-PCR로 각각 확인하였다. 그 결과 간 및 비장과 같은 일반 장기에서도 주입한 외부유전자의 DNA가 검출되거나RNA가 발현되었을 뿐만 아니라, 정낭, 전립선, 부고환, 난소 및 자궁 등의 생식장기에서도 주입한 외부유전자가 검출되거나 발현되는 것으로 나타났다. Real-time PCR을 이용하여 각 장기에서의 투여된 아데노바이러스 벡터는 시간 의존적으로 감소되는 것을 정량하였다. Ad-CMV-p53를 암 수 마우스의 난소와 고환에 각각 직접 주사하여 교배시킨 후 그 후세대의 DNA를 분리하여 주입한 아데노바이러스 유래의 DNA를 검색한 결과, 어떠한 차세대에서도 주입한 아데노바이러스 유래의 DNA가 검출되지 않았다. 한편 생식장기에서의 PCR및 RT-PCR signal유래 vector의 위치를 확인하기 위해 매우 감도가 높은 in-situ PCR로 조사한 결과 고환의 경우 간질조직으로의 전달은 일어나나 정세관 내에는 아데노바이러스 벡터가 전달되지 않으며, 난소에서도 아데노바이러스벡터는 난포내의 난자에 전달되지 않고 기질조직에 존재하는 것으로 확인되었다. 결론적으로 복제 능력 이 결여된 아데노바이러스를 매개로 한 유전자치료제는 생식 장기에서 검출되더라도 다음 세대로 전달될 가능성은 대단히 낮음을 제시한다.
돼지의 주요 장염 유발 바이러스인 돼지 전염성 위장염 바이러스 (transmissible gastroenteritis virus; TGEV), 돼지 유행성 설사증 바이러스 (porcine epidemic diarrhea virus; PEDV), 돼지 칼리시 바이러스 (porcine enteric calicivirus; PECV), 돼지 로타바이러스 A 형과 C 형 (porcine rotavirus; PRY, group A and C)을 동시에 감별 진단 할 수 있는 신속하고 정확한 oligonucleotide microarray 진단법을 개발하였다. 이 진단법은 유리슬라이드에 각각의 바이러스에 특이적인 부위에서 제작된 oligonucleotide probe를 찍은 DNA chip을 제작하여 여기에 각각의 바이러스를 역전사하고 cy5-dCTP를 포함한 multiplex PCR을 수행한 다음 hybridization 하였다. 이후 hybridization 결과는 fluorescence scanner를 이용하여 확인하였다. 이 새로운 microarray system은 RT-PCR과 같은 기존의 진단방법보다 소량의 바이러스를 민감하게 검사할 수 있을 뿐 아니라 hybridization을 통해 검사결과의 정확성을 확인할 수 있었다. 따라서 본 연구에서 개발한 microarray system은 돼지의 설사 유발 바이러스를 진단하는데 매우 유용한 진단 방법임을 확인하였다.
바이러스는 RNA나 DNA의 유전물질과 그것을 둘러싸고 있는 최소한의 단백질들만으로 구성되어 있기 때문에 바이러스가 증식하기 위해서는 숙주세포에 침투하여 전적으로 숙주의 복제 기구를 이용해야만 한다. 하지만 아직까지 뎅기 바이러스의 감염 및 복제 기전은 명확하게 밝혀지지 않았다. 이에 본 연구에서는 바이러스의 감염 및 복제기전에 대한 유용한 정보를 도출하기 위하여 사람 단백질과 뎅기 바이러스 단백질의 상호작용(Hu-DV PPI) 네트워크를 분석하였다. 우선 문헌조사를 통하여 실험적으로 검증된 뎅기 바이러스 단백질(9개)과 상호작용하는 사람 단백질(149개)을 추출하였으며, 이 정보를 이용하여 사람-뎅기 바이러스 단백질 상호작용 네트워크를 구축하였다. 이 네트워크를 기반으로 바이러스 감염 전/후의 네트워크 구조 및 특성을 분석하였으며, 이 정보를 바탕으로 감염경로를 탐색하였다.
본 연구는 유효한 분변오염의 지표 미생물로서 제안되고 있는 E.coli와, 병원성 바이러스에 대한 지표 미생물로 추천되는 $Q{\ss}$ 파지의 UV 및 UV/$H_2O_2$에 대한 내성을 비교하였다. 이 결과에 의거, 병원성 바이러스 관리를 위한 E.coli 규제의 유효성을 고찰하였다. 또한, 병원성 바이러스에 대한 대체 지표 미생물로써, $Q{\ss}$ 파지, T4 및 lambda 파지의 실제 하수 2차 처리 수중에서의 UV 불활성화를 비교하였다. 실험결과, $Q{\ss}$ 파지와 E.coli는 UV에 대해 거의 동등한 내성을 보였으나, UV/$H_2O_2$ 공정에 대해서는 E.coli보다 $Q{\ss}$ 파지가 더 높은 내성을 보였다. 이로부터, $Q{\ss}$ 파지가 모든 병원성 바이러스의 UV 또는 UV/$H_2O_2$에 대한 내성을 대표한다고 할 수는 없을지라도, 지표 미생물로써 E.coli의 불활성화 효과에만 의존하는 것은, 소독공정에 따라서는 바이러스류에 대해 충분한 소독효과를 얻지 못할 수도 있음을 알 수 있었다. 한편, T4 및 lambda 등 DNA 파지와 불활성화를 비교하였을 경우, $Q{\ss}$ 파지가 UV에 대해 더 낮은 내성을 보였다. 따라서, 불활성화에 대한 지표 바이러스로써 $Q{\ss}$ 파지의 이용은 낮은 UV 조사량의 도입에 의해 결과적으로 불충분한 소독효과를 초래할 수도 있을 것 같다. 이 결과는, 병원성 바이러스류에 대해 보다 충분한 불활성화를 달성하기 위해서는 RNA 파지인 $Q{\ss}$보다 T4 및 lambda 등 DNA 파지가 지표 바이러스로써 보다 유효할 수 있음을 보여준다.
인유두종 바이러스는 표피세포에 감염되는 DNA 바이러스로 자궁경부암을 일으키는 가장 큰 요인이다. 현재까지 100 여개의 종류가 알려져 있고 악성종양 유발 가능성에 따라 위험군을 나누는데. 여기서 중요한 것은 고위험군을 저위험군으로 잘못 분류하는 것을 최소화하는 것이다. 본 논문에서는 분류를 위한 데이터로 인유두종 바이러스에 관한 문서 자료들을, 기계 학습 방법으로 분류 비용을 고려해 줄 수 있는 비용 의존 학습을 이용하였다. 실험결과. 비용을 고려해 주는 것이 고려하지 않았을 때보다 더 종은 성능을 나타내었다.
우리나라와 같이 B형 간염 바이러스의 유병율이 높은 지역에서는 B형 간염 바이러스뿐만 아니라 HCV에 대한 항 바이러스 효과도 동시에 시행함이 유용할 것으로 사료되었다. 본 연구에서는 인진청간탕(菌蔯淸肝湯)을 이용하여 B형 간염 바이러스에 대한 항(抗) 바이러스 효과를 PCR을 이용하여 HBV의 DNA를 검색하였다. 인진청간탕(菌蔯淸肝湯)이 처리된 처리군의 경우 대조군에 비하여 농도 의존적으로 B형 간염 바이러스의 표면항원 생산을 억제하였고, PCR을 이용하여 증폭한 경우에도 증폭된 DNA의 양은 감소하였다. 또한 C형 간염 바이러스에 대한 항(抗) 바이러스 효과를 검색하기 위하여 복제에 필수적인 단백질인 HCV helicase의 ATPase에 대한 활성 억제 효과를 조사하였다. 인진청간탕(菌蔯淸肝湯)이 HCV helicase의 ATPase 활성을 억제하는 효과가 있음을 확인한 후 dose-respond에 따른 실험을 수행하여 HCV helicase의 ATPase 활성을 억제함으로써 탈인산화 되지 않은 ATP의 양을 이용하여 PSL로 분석한 결과 인진청간탕(菌蔯淸肝湯)이 HCV helicase의 ATPase 기능에 대한 억제효과가 우수함이 확인되었다. 이상의 결과로 보아 인진청간탕(菌蔯淸肝湯)이 B형 및 C형 간염치료에 동시에 응용될 수 있을 것으로 사료된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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