• Title/Summary/Keyword: 단백질 특성 분석

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Expression of Fusion Protein with Autographa californica Nuclear Polyhedrosis Virus Polyhedrin and Bacillus thuringiensis cryIA(c) Crystal Protein in Insect Cells (곤충세포주에서 Autographa californica 핵다각체병 바이러스의 다각체 단백질과 Bacillus thuringiensis cryIA(c) 내독소 단백질의 융합 단백질 발현)

  • 제연호;진병래;박현우;노종열;장진희;우수동;강석권
    • Korean journal of applied entomology
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    • v.36 no.4
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    • pp.341-350
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    • 1997
  • We have now constructed a novel recombinant baculovirus producing fusion protein with Autographa californica nuclear polyhedrosis virus (AcNPV) polyhedrin and Bacillus thuringiensis(Bt) cryIA(c) crystal protein. The fusion protein expressed by the recombinant baculovirus in insect cells was characterized. The N-terminal of cryIA(c) gene of Bt subsp. kurstaki HD-73 was introduced under the control of polyhedrin gene promoter of AcNPV, by fusion in the front of intact polyhedrin gene or by insertion into the HindIII site in polyhedrin gene. The recombinant baculoviruses were named as BtrusI or BtrusII, respectively. Although single transcript from the fusion protein gene was apparently observed. BtrusI was produced the two proteins, 92 kDa fusion protein and only polyhedrin. In addition, fusion protein produced by BtrusI did not form polyhedra. Interestingly, however, the cells infected with BtrusII did not show a 33 kDa polyhedrin band as a cells infected with BtrusI. Cells infected with BtrusII were only produced fusion protein, but the polyhedra formed by fusion protein was not observed. To determine the insecticidal toxicity of fusion protein, therefore, Sf9 cells infected with BtrusI were inoculated to Bombyx mori larvae. Sf9 cells infected with BtrusI that expressed the fusion protein caused larval mortality although the insecticidal toxicity was low. In conclusion, our results clearly demonstrated that the fusion protein with polyhedrin and Bt cryIA(c) crystal protein have a insecticida toxicity.

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Solubility and Electrophoretic pattern of Korea Ginseng Protein (한국산 인삼 단백질의 용해성 및 전기영동 패턴)

  • Choi, Cheong;Yoon, Sang-Hong;Bae, Man-Jong;An, Bong-Jeon
    • Applied Biological Chemistry
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    • v.28 no.2
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    • pp.88-91
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    • 1985
  • For the systematic investigation of biochemical characteristics of Korean ginseng protein, protein fractions were analyzed by the techniques of sodium dodecyl sulfate (SDS) polyacrylamide gel electrophoresis. The effect of pH and various salts on extractibility of ginseng protein were determined while the amino acid composition was studied by amino acid autoanalyzer. The protein was consisted of 66.08% of albumin and 20.51% of glutelin. Extractability of ginseng protein was the lowest in pH 3.0 and the highest in $pH\;6.0{\sim}8.0$. Among the neutral salts solution, $0.4M\;Na_2CO_3$ showed maximum extractability while $1.0M\;MgSO_4$ solution showed the least extractability. Resonable precipitation was obtained by 40% of acetone and ammonium sulfate. It has been shown by SDS polyacrylamide gel electrophoresis that the soluble protein had 11 bands. The molecular weight for the main protein of the soluble protein wasestimated to be 43,000. In amino acid composition of water extracted protein, arginine content was the highest 47.17% while on the contray, proline and cystine contents were very low.

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대두단백질 가수분해물의 쓴맛 펩타이드 구조와 특징

  • Lee, Cheol-Ho
    • Proceedings of the Korean Society of Life Science Conference
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    • 2001.06a
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    • pp.3-41
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    • 2001
  • 단백질의 부분 가수분해는 산성 음료에서의 용해도 증가, 환자들의 소화력과 알러지 내성의 개선, 다른 기능적 특성의 개발 등을 위하여 식품산업에 널리 이용되고 있다. 그러나 우유 단백질이나 대두 단백질과 같은 몇 가지 단백질들은 가수분해에 의하여 강한 쓴맛을 형성한다, 단백질 가수분해물의 쓴맛에 관한 연구는 1950년대 초에 시작되었으며, 여러 가지 원료로부터 쓴맛물질이 분리되었다. 이들 단백질 가수분해물의 쓴맛 물질은 올리고펩타이드로 알려져 있으며, 펩타이드 분자를 구성하는 소수성 아미노산의 존재와 밀접한 관계가 있는 것으로 보고되고 있다. 본 연구에서는 최근에 발달된 분석기술과 생명공학적 기법으로 E. coli에서 생산한 콩 단백질 단일 subunit를 이용하여 효소적 가수분해물의 분자구조를 확인하고자 하였다. 탈지대두박으로부터 115 glycinin와 E.coli떼서 발현된 proglycinin을 각각 90%, 97%의 정제도로 분리하여 이들 단백질을 trypsin으로 각각 가수분해하였다. 115 glycinin은 효소/기질 비 3%에서 4시간 가수분해에 의해 $14.0{\times}10^{-5}$ M quinine-HCI equivalent의 강한 쓴맛을 나타내었으며, 12%의 가수분해도(DH)를 나타내었다. 대두 단백질의 쓴맛 성분을 확인 위하여 이미 아미노산 서열이 밝혀진 11S glycinin과 proglycinin 가수분해물에서 GP-HPLC, $C_{18}$ RP-HPLC 등을 통하여 쓴맛 peptide들을 분리하였다. 각각의 분획은 다시 21개의 peptide로 분리되어 그 서열이 결정되었으며 이중 RP와 GI는 이미 알려진 쓴맛 dipeptide였고, LAGNQEQE, SAEFG, NALPE, KLHENIAR, GMIYPG 등이 주된 쓴맛 Peptide로 확인되었다. 이들은 11S glycinin의 5개의 subunit 중에서 그 위치가 확인되었다. Proglycinin 가수분해물에서도 11S glycinin과 같은 방법으로 7개의 쓴맛 peptide가 분리되었다. 이들은 $A_{1a}B_{1b}$의 아미노산 서열 중에서 37-42, 103-110, 164-167, 323-327, 367-373의 위치에 분포하고 있었으며, NALKPD, IYPGCPST, SlDT, HNIGQT, NAMFVPH의 서열을 나타내었다. 분리된 쓴맛 peptide 중에서 가장 쓴 두 분회의 peptide를 합성하여 관능 검사한 결과, NALPE는 매우 쓴맛을 내는 peptide로 확인되었다.

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Relation of Correlation about Rice quality related Characters in Condition storage of Unhulled rice (정조 저장조건에서 식미관련특성에 대한 상관성 정도)

  • Hwang, Pil-Seong;Lee, Jeom-Sig;Kim, Kee-Jong;Son, Jong-Rok;Chung, Won-Bok;Oh, Ju-Seong
    • Journal of Life Science
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    • v.17 no.4 s.84
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    • pp.510-514
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    • 2007
  • This study was carried on cool and RT(room temperature) storage of unhulled rice. In RT storage of an analysis of coefficient relation, high significant positive coefficients were observed in toyo index and breakdown, setback and protein content. high significant negative coefficients were showed setback and breakdown, breakdown and protein content. In cool storage of an analysis of coefficient relation, high significant positive coefficients were observed in toyo index and amylose content and gelatinization start temperature and protein content and high significant negative coefficients were showed toyo index and whiteness, toyo index and gelatinization start temperature, gelatinization start temperature and amylose content. In RT storage of a path coefficient analysis, a highest positive direct influence was observed in amylose content and a highest negative direct influence was protein content. Positive indirect influence was high revealed breakdown and protein content and negative indirect influence was gelatinization start temperature and Mg/K ratio. In cool storage of a path coefficient analysis, a highest positive direct influence was whiteness and a highest positive indirect influence was gelatinization start temperature. Positive indirect influence was high revealed gelatinization start temperature and amylose content, negative indirect influence was whiteness and gelatinization start temperature. In RT storage of Multiple regression equation of Toyo index based on physicochemical properties of unhulled rice, a highest coefficient of determination was revealed among five facters of whiteness, protein content, Mg/K ratio, amylose content and gelatinization start temperature. In cool storage of Multiple regression equation of toyo index based on physicochemical properties of unhulled rice, highest coefficient of determination was revealed among five facters of moisture content, amylose content, gelatinization start temperature, breakdown and setback.

Protein of Major Germplasms for High-Protein Wheat Breeding (밀 주요 교배모본의 단백질 특성)

  • Ha, Yong-Woong;Song, Hyeon-Suk;Lee, Choon-Ki;Cho, Chang-Hwan
    • KOREAN JOURNAL OF CROP SCIENCE
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    • v.35 no.5
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    • pp.393-402
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    • 1990
  • Studies to obtain a fundamental data to improve the quantity and quality of wheat protein and to select the excellent breeding materials suitable for various uses of it were performed on the focuses of protein content, amino acid composition, and its related quality. The range of seed protein content of crossing block consisted with 319 varieties or lines was from 9.9% to 17.6% with the average of 13.2%. The minimum protein content was showed by Wonkwang, and the maximum by Chungnamjaerae and Suwon 210. Among the Korean native varieties or breeding lines of crossing block, at least twelve lines or varieties were selected as the high-protein wheats. In the effects of environmental conditions, the variations of protein content by cultivating locations and year were showed out to be up to 3.6%, and 3.3%, respectively. But the varietal characteristics of wheat protein were seemed to remain constantly. In the results of amino acid analysis, those related with bread quality, except proline were improved with the increase of seed protein. But the improvement of nutritional quality did not agree with the protein content increase of seed. The total content of amino acid essential to adults was very low with 266.6-273.3mg per one gram of protein compare to the 350mg (free from the amino acid of tryptophan) recommended by FAO/WHO. Especially the limiting amino acid such as methionine, lysine and threonine were critically deficient. The correlation between protein contents and sedimentation values was obtained r=0.656$\^$**/ of average notwithstanding widly different environmental conditions, and in some condition the value was obained about to r=0.956$\^$**/.

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Viscogram Pattern of Korean Rice Flours (우리나라 쌀의 점도 특성)

  • Kim, Sung-Kon;Kim, Sang-Soon
    • Applied Biological Chemistry
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    • v.28 no.3
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    • pp.142-148
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    • 1985
  • Pasting properties of 35 traditional (Japonica) and 23 high-yielding (J/Indica) rice varieties having various hydration rates at $23^{\circ}C$ were investigated. Amylograms showed that high-yielding rice varieties had higher values for peak (P), hot-paste (H) and cold-paste (C) viscosities than those for traditional rice varieties. P had a highly negative correlation with H/P, C/P and C/H. P of traditional rice varieties was positively and negatively correlated with protein amylose contents, respectively. However, H and C showed no correlation with protein or amylose content. No correlation was observed between amylograph indices and hydration rate of rice grain.

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Feature Extraction for Protein Pattern Using Fuzzy Integral (퍼지적분을 이용한 단백질패턴에 관한 특징추출)

  • Song, Young-Jun;Kwon, Heak-Bong;Kim, Mi-Hye
    • The Journal of the Korea Contents Association
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    • v.7 no.1
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    • pp.40-47
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    • 2007
  • In the protein macro array image, it is important to find out the feature of the each protein chip. A decision error by the personal sense of sight occurred from long time observation while making an experiment in many protein chip image. So the feature extraction is needed by a simulator. In the case of feature analysis for macro array scan image the efficiency is maximized. In the fluorescence scan image, the response for each cell have been depend on R, G, B distribution of color image. But it is difficult to be classified as one color feature in the case of mixed color image. In this paper, the response color of a protein chip is classified according to the fuzzy integral value with respect to fuzzy measure as the user desired color. The result of the experiment for the macro array fluorescence image with the Scan Array 5000 shows that the proposed method using the fuzzy integral is important fact to be make decision for the ambiguous color.

Identification of Equine Heat Shock Proteins Gene and Their mRNA Expression Analysis after Exercise (말의 열충격 단백질(heat shock proteins)의 특성 구명과 운동 후 유전자의 발현 분석)

  • Cho, Hyun-Woo;Park, Jeong-Woong;Choi, Jae-Young;Sivakumar, S.;Kim, Nam-Young;Shin, Teak-Soon;Cho, Seong-Keun;Kim, Byeong-Woo;Cho, Byung-Wook
    • Journal of Life Science
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    • v.24 no.2
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    • pp.105-111
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    • 2014
  • The purpose of this study was to characterize equine heat-shock protein (Hsp) genes and analyze their expression pattern in various horse tissues and blood leukocytes after exercise. In a previous study, RNA sequencing of blood and skeletal muscles of thoroughbreds before and after exercise was performed using differently expressed gene (DEG) analysis. Three Hsp genes (HspH1, Hsp90${\alpha}$ and Hsp70) were selected by DEG analysis and were found to be differentially expressed in either blood or muscle. To validate and extend previous observations on these genes, we performed RT-PCR analyses of horse tissue as well as real-time qPCR analyses of blood leukocytes after exercise. mRNA expression of these Hsp genes was found to be ubiquitous in the analyzed tissues (including thyroid, colon, skeletal muscle, cecum, kidney, spinal cord, heart, and lung). In addition, Hsp mRNA expression of these genes in extracted whole blood increased after 120 minutes of exercise compared to the baseline condition. These results are in agreement with the results of human and other experimental animals, suggesting that regulatory mechanisms that are responsible for upregulation of Hsp gene transcription may be conserved among species. Further investigations to correlate Hsp gene expression patterns with athletic performance or recovery processes after exercise are warranted.

Characterization of Umbilical Cord-derived Stem Cells during Expansion in Vitro (탯줄유래 줄기세포의 계대배양에 따른 특성 변화의 분석)

  • Park, Se-Ah;Kang, Hyun-Mi;Heo, Jin-Yeong;Yoon, Jin-Ah;Kim, Hae-Kwon
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • v.36 no.1
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    • pp.23-34
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    • 2009
  • Objectives: Mesenchymal stem cells (MSC) comprise a promising tool for cellular therapy. It is known that long-term in vitro culture of human bone marrow and adipose tissue derived-MSCs lead to a reduction of life span and a change of stem-like characters. The aim of our study was to examine whether stem cell properties of human umbilical cord-derived stem cells (HUC) could be affected by in vitro expansion. Methods: HUC were isolated from human umbilical cord and cultured for 10 passages in vitro. Morphology and population doubling time (PDT) were investigated, and changes of stem cell properties were examined using RT-PCR and immunocytochemistry during serial subcultures. Results: Morphology and PDT of HUC began to change slightly from the 7th passage (p7). Expression level of nestin and vimentin mRNAs increased along with the culture period from p4 until p10. In contrast, expression level of SCF mRNA decreased during the same culture period. Expression level of Oct-4 and HNF-4${\alpha}$ mRNAs was not significantly changed throughout the culture period until p10. Expression level of BMP-4, FGF-5, NCAM and HLA-ABC mRNAs appeared to increase as the culture continued, however, the difference was not significant. Immunocytochemical studies showed that HUC at p3, p6 and p9 positively were stained with antibodies against SSEA-3 and SSEA-4 proteins. Interestingly, staining intensity of HUC for ICAM-1 and HLA-ABC gradually increased throughout the culture period. Intensity against thy-1 and fibronectin antibodies increased at p9 while that against TRA-1-60 and VCAM-1 antibodies began to decrease at p6 until p9. Conclusions: These results suggest that HUC change some of their stem cell characteristics during in vitro culture. Development of culture system might be needed for the maintenance of characteristics.

식품과 알레르기: 유전자 재조합 식품의 알레르기 위험성

  • 손대열
    • Proceedings of the Korean Journal of Food and Nutrition Conference
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    • 2000.12a
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    • pp.29-34
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    • 2000
  • 산업 발달에 따라 날로 많은 식품들이 새롭게 개발되어지고 있다. 또한 이와 병행해서 식품으로 인한 알레르기 발생 빈도도 날로 증가하고 있으며 그 증상 또한 점차 심화되고 있는 것이 세계적인 추세이다. 우리나라도 예외는 아니어서 일반 알레르기 환자뿐 아니라 식품으로 인한 알레르기 환자들이 점차 증가됨이 보고되어지고 있다. 농산물 시장의 수입개방이후 우리나라에는 많은 해외 농산물이 수입되어지고 있으며 그 중 작년 한해의 경우 총 수입 농산물의 10%를 넘는 유전자 재조합 농산물이 우리나라에 수입되어진 것으로 통계 보고되어졌다. 이러한 관점에서 알레르기 환자의 증가와 새로운 식품 (특히 유전자 재조합 식품)의 증가에는 서로 관련성이 있을 것으로 추측되어지고 있어 (새로운) 식품에 대한 알레르기성의 예측과 관리가 필요한 실정이다. 이에 몇몇 발표된 유전자 재조합 식품에 관련된 알레르기성 검사 논문들과 실험실에서 이루어진 연구 결과들을 중심으로 유전자 재조합 식품의 알레르기 위험성에 대해 알아보고자 한다. 일반적으로 식품의 단백질이 알레르겐(allergen)으로 작용하기 위해서는 먼저 소화효소에 의해 분해되어지고 장에서 흡수되어져서 immunopotent cell에 의해 process 되어 immune system에 present 되어져야 한다. 따라서 단백질로 인한 알레르기 반응은 그 단백질의 자연적 형태 뿐만이 아니라 소화 효소에 분해된 단편들의 구조 또는 다른 알레르겐 단백질과의 유사 구조로 인한 교차 반응에 의해 발생함을 기억해야 한다. 식품 단백질 중 어떤 단백질이 알레르겐으로 작용하는가에 대한 특이성 조사에 많은 관심이 집중되어지고 있지만 아직까지는 대략 다섯 개 정도의 일반적인 특성으로서 요약되어질 수 있다. 그러나 이러한 대략의 특성에 적용되지 않는 식품 알레르겐도 많음을 잊어서는 안 될 것이다. 알레르겐으로 작용하는 식품 단백질의 일반적 특성 1. 좋은 수용성 2. 식품내에 많은 부분을 차지하는 주 단백질이 주 알레르겐으로 작용 3. 단백질내에 하나 이상의 IgE-binding site 존재 4. 위장액에 대한 저항성 5. 10~70 kDa 크기 유전자 재조합 기술이란 말 그대로 유전자를 인위적으로 새롭게 조합하는 기술로 이전의 기술로는 불가능했던 유전적 변형을 농작물과 동물에 가능하게 했으며 이로 인해 유전적으로 변형된 식용 동식물의 개발이 가능하게 되었다. 새로운 유전인자를 개체에 삽입함으로 새로운 단백질이 발현 될수 있고 그로 인해 1) 해충과 질병에 대한 저항성 증가, 2) 화학 제초제에 대한 새로운 저항성 부여, 3) 식품의 저장성 향상, 4) 식품의 영향적 보충/향상 등의 이점을 얻을 수 있다 (표 1). 세계적으로 유전자 재조합 된 새로운 농산물의 재배는 날로 증가추세에 있으며 그 중에서 가장 많은 부분을 차지하는 농산물로 soybean을 들 수 있으며 (표 2) soybean을 중심으로 그 알레르기성의 변화가 연구 조사된 몇 가지 예를 살펴보고자 한다. (표 3)에 요약된 soybean중 첫 번째 경우는 재초제에 대한 저항성을 높여주기 위해 Agrobacterium에 존재하는 EPSPS라는 단백질을 콩에서 발현하도록 찬 유전자 재조합 된 콩의 경우이다. 이 콩의 경우에는 첫째. 이전된 새로운 단백질 EPSPS가 다른 여러 식물에 이미 존재하고 있는 단백질로서 우리가 이미 이러한 식품을 섭취할 때 이 단백질도 같이 섭취해오고 있었다는 점, 둘째. 이 단백질이 소화액 분해 실험에서 짧은 시간내에 분해가 되었다는 점, 셋째. 재조합 된 콩과 자연 콩이 성분 분석에서 차이를 나타내지 않았다는 점, 네 번째. 쥐를 통한 다양섭취 실험에서 아무런 이상 반응이 없었다는 점등의 결과를 기준으로 알레르기에 대한 개별 검사 없이 안전한 콩으로 결론짓고 있다. 영양성을 높이기 위해 Brazil nut에서 methionine 함량이 풍부한 2s albumine을 콩에서 발현하도록 한 두 번째 유전자 재조합 콩의 경우 이전된 단백질 때문에 Brazil nut에 알레르기 반응을 일으키는 알레르기 환자들을 조사한 결과 역시 재조합 된 콩에도 알레르기 반응을 일으켰다는 보고이다. Brazil nut에서 콩으로 이전된 단백질이 Brazil nut에서의 알레르기성을 그대로 유지한 점을 볼 때 새로운 단백질이 어디에서 유래하는가가 중요함을 잘 보여준 연구이다 세 번째 콩의 경우 역시 영양성을 높여주기 위해 corn에서 10 kDa과 HSZ 단백질을 콩에서 발현하도록 유전자 재조합했는데 이 콩의 경우는 알레르기 환자들이 유전자 재조합 된 콩과 자연 콩에 반응의 차이를 나타내지 않았다는 결과 보고이다. 위의 세 실험 결과들을 종합해 볼 때 무엇보다도 새롭게 발현된 단백질이 원래 어떤 성질을 갖고 있으며 어디에서 유래했는지가 알레르기성 조사에 중요한 역할을 한다 할 수 있겠다. 또한 유전자 재조합된 식품들은 알레르기 환자들을 위해 표기되어져야 할 것인데 이를 위한 알레르기성 검사 실험은 공공단체를 통해 이루어져야 할 것이며 환자들마다 알레르겐으로 작용하는 단백질의 인식부위(epitope)가 다를 수 있기 때문에 적어도 10명 이상의 알레르기 환자들이 조사되어져서 검사가 이루어져야 할 것이다. 환자들의 혈청을 통한 in vitro 실험에서는 ELISA, RAST, immunoblotting과 같은 검사 방법들이 적용될 수 있고, 그 결과가 음성인 경우에 그 다음 단계로 in vivo 실험에서는 직접 환자의 피부반응검사 (skin prick test)나 DBPCFC (double-blind placebo-controlled food challenge) 검사 방법을 통해 확인되어져서 이 모든 경우가 음성인 경우와 하나라도 양성인 경우를 구별하여 식품에 표기함으로 알레르기 환자들의 유전자 재조합 식품에 대한 안전성이 보장되어져야 할 것이다.

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