• Journal of Korean Ophthalmic Optics Society
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• v.10 no.2
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• pp.91-97
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• 2005

We investigated the question whether protein removing activities of enzyme cleaner - protein remover for soft contact lens - are associated with the material of soft contact lens as well as action time, temperature and pH of enzyme solution. We used a subtilisin cleaner as protein remover and estimated the protein amount remained on soft contact lens after using the subtilisin cleaner under the different conditions. The remained protein in soft contact lens was greatly decreased until treatment for 60min, but no significant differences were found from 60min to 24hr. The cleaning effect of the enzymatic treatment in the range of $15{\sim}30^{\circ}C$ was constant. however, there was a significant decline of the protein removing effect at $10^{\circ}C$ and less. The pH of the solution was also important for the efficacy of the enzymatic treatment. The activity of the enzyme cleaner was highest in pH 8.0 and significantly decreased a pH below 7. The pH dependence was found to be related to the conformational change of subtilisin. Furthermore, significant differences in the protein deposit removing efficacy of the subtilisin cleaner were found among the soft contact lens materials.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.42 no.1
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• pp.1-6
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• 2006

Saccharomyces cerevisiae Dna2 helicase/endonuclease plays an essential role in removing DNA primers during Okazaki fragment processing in eukaryotic DNA replication. Genome-wide scale co-immunoprecipitation experiments predicted that Dna2 interacts with a novel protein YHR122W (1). In this study, we observed that overexpression of YHR122W gene suppressed the temperature-sensitive phenotype of $dna2\Delta405N$ mutation. To investigate direct interaction between these two proteins, a histidine-tagged recombinant YHR122W protein was expressed and purified from E. coli. Physical interaction between the purified YHR122W and Dna2 proteins was detected by enzyme-linked immunosorbent assays. Further more, the complex formation was most efficient at physiological salt concentration, 150 mM NaCl. The genetic and physical interactions between YHR122W and Dna2 shown in this study suggest that the biological functions of these two proteins may be closely related each other.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2005.11a
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• pp.513-516
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• 2005

단백질 2DE 이미지 분석의 주요작업은 스팟 매칭에 의한 동일한 종류의 단백질 그룹인 패어링 클래스를 구성하는 것으로서 단백질간의 상호 작용, 질병에 관련한 단백질의 변화 등을 관찰할 수 있다. 하지만 2DE 실험의 여러 가지 문제점으로 인하여 패어링 클래스는 먼지, 공기방울 등 에러를 포함하게 되며 이런 에러들은 왜곡된 분석결과를 초래한다. 따라서 본 논문에서는 동일한 조직에서 같은 종류의 단백질은 발현량이 비슷하다는 특성을 이용하여 패어링 클래스의 개개의 스팟을 참조 스팟 속성으로 나눈 값을 유사도로 정의하고, 스팟의 유사도가 사용자에 의하여 선택되는 필터링 배수에 의한 범위를 벗어날 때 에러 스팟으로 간주하여 제거되는 에러 필터링 기법을 제안한다. 실험에서는 정확도(Precision), 재현율(Recall) 및 조화평균(Harmonic-mean) 값을 사용하여 제안된 필터링 기법의 타당성을 보여준다.

• Journal of the Korean Chemical Society
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• v.58 no.6
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• pp.560-568
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• 2014

The contribution of electrostatic interactions to protein folding reaction was studied by using mutant ubiquitin with lysine to alanine mutation at residue position 29. Based on the three dimensional structure of ubiquitin, lysine 29 is located close to negatively charged glutamate 16 and aspartate 21 and considered to stabilize the native state of ubiquitin by electrostatic interactions between these residues. The equilibrium unfolding experiment showed that the native stability was decreased by about ~20% upon mutation. This observation indicates lysine 29 indeed forms electrostatic interactions with nearby residues. Folding kinetics measurements using stopped-flow device and quantitative analysis of kinetics data indicate that ubiquitin folds from unfolded state to native state via intermediate state as observed previously. This intermediate state was observed to form immediately after the initiation of folding reaction. The folding intermediate was shown to be destabilized considerably upon lysine to alanine mutation. These observations indicate that electrostatic interactions can form early stage of protein folding and hence lead the folding reaction.

• Current Research on Agriculture and Life Sciences
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• v.32 no.3
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• pp.149-154
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• 2014

It is already known that adzuki beans (Vigna angularis) are able to control appetite. Therefore, this study tested the proteins isolated from adzuki beans for their protease resistance and interaction with the intestinal mucosa. The major proteins from adzuki beans were found to be resistant to the digestive enzymes pepsin and pancreatin, and were identified using 2D-SDS-polyacrylamide gel electrophoresis and mass spectrometry. The major adzuki proteins were easily fractionated by treating the soluble protein extract with 10mM $CaCl_2$, and were found to contain lactotransferrin, a homologous protein to the dynein light chain domain, proteinase inhibitor, and proteins with unknown functions. From a tissue binding assay using mouse intestinal tissue sections, the major protein fraction showed weak, yet significant and specific binding to the mucosa layer of the small intestine. Thus, the current results suggest that adzuki proteins are resistant to digestive enzymes, which enables them to survive protease digestion in the intestinal tract, plus they may interact with the intestinal mucosa layer. Therefore, the molecules responsible for controlling appetite in adzuki beans are presumably protease-resistant proteins that interact with the intestinal mucosa or delay digestion in the digestive tract.

• Proceedings of the Korea Society of Poultry Science Conference
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• 2002.11a
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• pp.46-58
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• 2002

포도당 대사에서 중심적인 역할을 담당하고 있는 호르몬인 인슐린의 작용기전은 이전에 알려진 것보다 매우 다양하고 복잡한 세포내 신호전달 체계에 의해서 수행된다. 지난 10여년간 이러한 세포 신호전달 흐름내 중간물질인 여러 가지 단백질의 역할에 대해서 많은 연구가 진행되어 적지 않은 성과를 거두고 있다. 근래에는 해당 유전자에 대해 분자생물학적인 조작을 가하여 실험동물 체내에서 이러한 중간 단백질이 발현되지 못하도록 한 후, 각 조직에서의 인슐린 신호전달 체계를 더욱 심도 있게 연구하고 있다. 여러 연구방법 가운데서, 특히 조직 특이적으로 특정 유전자를 제거하여 태어난 개체를 이용하고, 또한 이들을 서로 교배시켜 나타나는 현상을 연구하여 비정상적인 포도당대사를 이해하는데 많은 도움을 받고 있다. 동물종에 따른 대사상의 차이점 등으로 인해 적지 않은 한계를 갖고 있지만, 동물 질환모델은 포도당 대사와 같은 생체 내에서 중요한 작용을 깊게 이해하고 더 나아가서는 비정상적인 대사를 밝히는데 핵심적인 역할을 수행하고 있다. 기초분야의 성과를 활용하는 응용학문인 축산분야에서도 이러한 접근방법과 연구 결과는 시사하는 바가 있을 것이다.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.40 no.4
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• pp.257-262
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• 2004

ErmSF is one of the ERM proteins which transfer the methyl group to A2058 in 23S rRNA to confer the resis­tance to MLS (macrolide-lincosamide-streptogramin B) antibiotics on microorganism. Unlike other ERM pro­teins, ErmSF contains long N-terminal end region (NTER), of which $25\%$ is composed of arginine that is known to interact with RNA well. Gradual deletion of NTER leaded us to the point where mutant protein lost much of activity in vivo. Overexpressed and purified mutant protein showed much reduced activity in vitro: $2\%$ activity relative to that of wild type protein. This fact suggests that this amino acid interact with RNA close to meth­ylatable adenine to locate it at an active site properly.

• Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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• 1994.04a
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• pp.213-213
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• 1994

배풍등, 등혹 및 ginsenoside Rh$_1$의 간암세포에 대한 세포독성작용, 인삼 Rh$_1$의 세포보호작용, 비파의 ursolic acid 생체방어기전 활성화 및 산화억제작용, ononin의 radical 제거능을 검토하였다. 그 결과 배풍등 CHCl$_3$분획 및 등혹 CHCl$_3$분획의 간암세포에 대한 강한 세포독성작용을 나타내었으며 배풍등 CHCl$_3$은 sarcoma 180 이식 종양조직의 성장을 유의성있게 억제하였다. Ursolic acid는 지질과산화, 단백질 산화억제와 catalase, GSH S-transferase를 활성화시켰다. 인삼 saponin은 SOD 및 nonprotein-SH를 증가시키고, 지질과산화를 억제시켰다. Ginsenoside Rh$_1$ 및 Rh$_2$는 각각 radical에 대한 세포보호작용과 간암세포 세포독작용을 나타내었다.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.42 no.3
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• pp.165-171
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• 2006

ERM proteins transfer the methyl group to $A_{2058}$ in 23S rRNA to confer the resistance to MLS (macrolide-lincosamide-streptogramin B) antibiotics on microorganism ranging from antibiotic producers to pathogens. To define the functional role of peptide segment encompassing amino acid residues 1 to 25 in NTER (N-terminal end region) of ErmSF, one of the ERM proteins, DNA fragment encoding mutant protein deprived of that peptide was cloned and overexpressed in E. coli to obtain a purified soluble form protein to the apparent homogeneity in the yield of 12.65 mg per liter of culture. The in vitro activity of mutant protein was found to be 85% compared to wild type ErmSF, suggesting that this peptide interact with substrate to affect the enzyme activity. This diminished activity of mutant protein caused the delayed expression of antibiotic resistance in vivo, that at fIrst cells expressing mutant protein showed the retarded growth due to the antibiotic action but with time cells inhibited by antibiotic gradually recovered the viability to exert the resistance to the same extent as those with wild type protein.

• Journal of the Society of Cosmetic Scientists of Korea
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• v.25 no.2
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• pp.77-127
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• 1999

활성 산소종은 노화, 특히 피부노화의 원인 물질로 작용하고 있다. 피부는 자외선에 노출되어 있어 활성 산소종을 만드는 광화학적 반응들이 계속해서 일어나고 있다. 이들 활성 산소종들은 피부 세포 및 조직 손상을 주도한다. 이들은 항산화 효소와 비효소적 항산화제들로 구성된 항산화 방어망을 파괴함으로써 산화제/항산화제 균형을 산화 상태 쪽으로 기울게 한다. 결과적으로 계속된 산화적 스트레스는 지질 과산화, 단백질 산화, 간질 성분을 파괴시키는 단백질분해효소의 활성화, 탄력 섬유인 콜라겐과 엘라스틴의 사슬절단 및 비정상적인 교차결합, 히아루론산 사슬의 절단, 멜라닌 생성반웅 촉진, DNA 산화와 같은 생체 구성 성분들의 손상을 야기시킨다. 결국에는 탄력감수 주름살 및 기미.주근깨 둥으로 특징 지워지는 피부노화가 가속화된다. 따라서 피부노화 방지를 위해서는, 과잉의 활성 산소종 생성을 억제하고 또한 생성된 활성산소를 효율적으로 제거할 수 있는 시스템이 화장품의 처방에 반드시 포함될 필요가 있다. 즉, 산화제/항산화제 밸런스가 유지되는 피부의 항산화 방어 시스템 구축이 필요하다. 피부노화 방지에 있어서 천연물의 역할로 (1) 자외선 흡수제로서의 역할, (2) 항산화제로서의 역할, (3) 주름 개선제로서의 역할, (4) 미백제로서의 역할, (5) 항균\ulcorner항염작용 및면역 조절제로서의 역할에 대하여 살펴 보았다. 21세기는 본격적으로 기능성 화장품 시대가 개막될 것으로 예측하고 있다. 이에 맞춰 천연물들은 피부노화를 방지하는데 주도적인 역할을 할 것으로 기대된다.