• 대한수의학회지
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• 제39권2호
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• pp.327-337
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• 1999

The transposon TnphoA was used to generate avirulent mutants from a type A Pasteurella multocida. A suicide vector plasmid pRT733 carrying TnphoA, having the kanamycin resistant gene and harbored in Escherichia coli K-12 strain SM10(${\lambda}pir$), was mated with streptomycin resistant P. multocida P-1059 strain as recipient. This resulted in the generation of two TnphoA insertion mutants (transconjugants, tc95-a and tc95-b) which were resistant both to kanamycin ($Km^{R}$) and streptomycin ($Sm^{R}$), secreted alkaline phosphatase, and were avirulent to turkeys. Southern blot hybridization using two probes derived from internal fragments of TnphoA, confirmed the insertion of TnphoA into 12.9kb or 13.7kb DNA fragment from the EcoRV digested genomic fragments of transconjugants. The two transconjugants, tc95-a and tc95-b, were distinguishable from their parent strains by differences in ribotypes, and outer membrane protein profiles. TnphoA insertion in both transconjugants also resulted in constitutive expression of a 33Kd iron regulated outer membrane protein (IROMP). The gene encoding $Sm^{R}$ was also located within the same 12.9kb EcoRV genomic fragment from both transconjugants. Furthermore, our finding that the recipient P. multocida P-1059 $Sm^{R}$ strain and both transconjugants were avirulent to turkeys suggest that the either 12.9kb or 13.7kb genomic DNA contains the virulence gene and speculate that the presence of $Sm^{R}$ gene or TnphoA insertion may be responsible for regulating and inactivating the gene(s) encoding virulence in P. multocida.

• 미생물학회지
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• 제22권4호
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• pp.265-269
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• 1984

E. coli $P^{RDI}$에서 DAP-영양요구성 변이주를 분리하였으며 이 변이주가 갖고 있는 plasmid의 안정성과 활성도를 확인하는 살험을 통하여 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. Mutagen인 NG를 처리 후 DAP-변이주를 보다 쉽게 분리하기 위하여 항생제처리를 하였다. 이때 사용균주가 갖고 있는 plasmid내의 내성인자들 중에 carbr인자로 인하여 같은 계열에 있는 penicillin유도체들에 대해서는 교차내성을 갖고 있음이 확인되었다. 그러냐 penicillin과 같은 기능을 갖고 있으나 그 구조가 다른 cephalexin, cycloserine에 대해서는 교차 내성을 잘 나타내지 않았으므로 항생제처리로서는 cephalexin을 사용하였다. 2. 세균 접합을 통하여 DAP-균주의 특성을 동정하였다. 즉 nif-gene의 안정성과 활성도는 DAP-균주로 부터 plasmid를 전이반은 전이체에서 6-cyanopurine첨가로 확인하였다.

• BMB Reports
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• 제42권3호
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• pp.172-177
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• 2009

Phosphoglucose isomerase (PGI) is involved in synthesizing extracellular polysaccharide (EPS). The gene encoding PGI in Sphingomonas chungbukensis DJ77 was cloned and expressed in E. coli, and the protein was characterized. The pgi gene from DJ77 is 1,503 nucleotides long with 62% GC content and the deduced amino acid sequence shows strong homology with PGIs from other sources. The molecular masses of PGI subunit and native form were estimated to be 50 kDa and 97 kDa, respectively. Four potentially important residues (H361, R245, E330 and K472) were identified by homology modeling. The mutations, H361A, R245A, E330A, R245K and E330D resulted in decrease in Vmax by hundreds fold, however no significant change in Km was observed. These data suggest that the three residues (H361, R245Aand E330) are likely located in the active site and the size as well as the spatial position of side chains of R245 and E330 are crucial for catalysis.

• 원예과학기술지
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• 제18권3호
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• pp.342-347
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• 2000

본 실험은 diphtheria 독성유전자의 수술조직 특이적인 발현을 이용하여 유기된 웅성불임 형질전환체들의 유전적 특성 및 표현형의 특징을 조사하고 후대로의 유전양상을 조사하여 전이유전자의 안정성을 검정하며 유전자의 조직특이적 발현 현상을 실제적으로 작물육종에 이용할 수 있는 가를 검토코자 수행하였다. 각 계통의 $BC_1$ 종자의kanamycin 저항성 검정을 수행한 바 조사된 13계통 중 $BC_{1}5-13,\;BC_{1}5-23,\;BC_{1}5-28$과 $BC_{1}5-32$의 4계통을 제외한 나머지 9계통의 kanamycin 저항성 개체($Kan^R$) 대 kanamycin 감수성 개체($Kan^S$)의 비율은 1 : 30-0 : 52로 나타났다. 그러나 이 결과는 화분 특이 BAN215 프로모터에 의한 형질전환체의 도입유전자 copy 수에서 예상되는 Mendel 법칙의 우성유전자의 유전비율에 모든 개체가 다 부합되지는 않았다. 형질전환된 웅성불임 개체에 존재하는 DTx-A 유전자가 후대로 안정적으로 전이되는지 또한 웅성불임 상태가 그대로 유지되는지를 확인하기 위하여 완전웅성불임개체중 전이유전자의 copy 수가 다른 5개체(5-13, 5-14, 5-23, 5-32, 5-33)를 선발하고 여교잡을 실시하여 $BC_2T_0$세대부터 $BC_4T_0$세대를 확보하였으며 각 계통의 후대로부터 428bp 크기의 DTx-A 유전자의 PCR 밴드를 확인할 수 있었다. 각 계통의 후대 개체들은 전이유전자를 후대 4대($BC_4T_0$)까지도 안정적으로 전달하고 전달받은 후대들은 웅성불임성을 그대로 유지하였으나 그 비율은 각 세대에 전이된 DTx-A 유전자의 copy수에 따라 차이를 나타냈다. 웅성불임개체들과 임성개체들을 여교잡하여 수확한 꼬투리의 크기와 종자결실은 정상적인 개체들의 교배때와는 달리 감소하였으며 이는 전이된 DTx-A 유전자의 copy수가 많은 개체들에서 더욱 많이 감소하였다. 따라서 이러한 종류의 유전자 전환체를 육종에 이용하기 위해서는 이론분리비에 부합되는 개체를 선발한 후 누대(累代)에 걸쳐 검정함으로써 안정성이 있는 개체를 이용하여야 할 것으로 생각된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제20권5호
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• pp.871-874
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• 2010

Many studies require expression analysis of the same gene/promoter across a range of bacterial genera. However, there is currently a lack of availability of reporters based on the broad-host-range IncQ replicon, which is compatible with a popular improved IncP transfer system that is self-transfer defective. We report IncQ lacZ reporter plasmids with features including (1) compatibility with IncP, IncW, and pBHR/pBBR replicons, (2) a variety of antibiotic markers (Sp-r, Sm-r, Km-r, Cm-r), (3) convenient mobilization via a novel self-transfer-defective IncP conjugation system, and (4) GenBank DNA sequences. Utility is demonstrated using three different promoters in different Gram-negative genera.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제17권5호
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• pp.454-460
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• 1989

자연계로부터 분리한 Gram 음성세균과 함께 유전자 조작기법으로 kanamycin (Km)과 chloramphenicol (Cm)에 대한 내성유전자를 재조합한 균주들에서 그 내성유전자의 전이율을 conjugation 방법으로 몇 가지 상이한 수질환경에서 비교 연구하였다. 자연계로부터 분리한 DK1 균주와 재조합한 DKC601이나 DKH103을 donor로 하고 recipient 및 기타 조건을 같게 했을 때, donor가 가지고 있던 Km$^{${\gamma}$}$ 유전자의 전이율은 자연환경의 하천수에서 보다 실험실 환경의 멸균한 하폐수에서 더 높았고, 실험실 환경에서는 멸균한 하폐수보다 Luria-Bertani (LB) 액체배지에서 휠씬 높았다. 온도를 2$0^{\circ}C$와 3$0^{\circ}C$로 했을 때에는 어느 종류의 균주를 donor로 사용하더라도 전이율에는 큰 차이가 없었으나, 전이가 일어나는 시간은 3$0^{\circ}C$에서 조금 빨랐다. 하천수의 자연환경에서나 실험실이 멸균하폐수에서는 항생제내성유전자의 전이율은 두 가지 종류의 균주 사이에 차이가 거의 없거나 재조합된 균주에서 $10^{-1}$ 정도로 낮다. 그러나 실험실 환경의 LB액체배지에서는 전이가 일어나는데 필요한 반응시간이 재조합된 균주에서 더 길 뿐만 아니라, 전이율에 있어서도 $10^{-3}$ - $10^{-4}$ 정도 낮았다. 그리고 MT1 균주를 recipient로 하고 재조합된 균주인 DKC601과 DKH103을 donor 로 했을 경우에는 donor에 따라 전이율의 차이가 없었으나, DKC601을 donor로 하고 MT1과 MT2을 각각 recipient로 했을 경우에는 recipient에 따라 전이율이 $10^{1}$ - $10^{2}$ 정도 차이가 났다.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제39권4호
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• pp.264-271
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• 2023

The edible jellyfish Rhopilema esculentum occurs in waters throughout northeastern Asia, including in Korea, China, and Japan. In Korean waters, R. esculentum has appeared in two regions (Gangwha and Muan). Based on the appearance of young medusae and coastal distribution records, these two regions may be key R. esculentum breeding sites. In the present study, we investigate and compare the genetic structure of R. esculentum in the two regions using mitochondrial sequences (16S ribosomal RNA and cytochrome c oxidase subunit I). The genetic diversity of the R. esculentum population at Ganghwa exceeded that of the population at Muan. Despite considerable geographic separation (400 km) between the two regions(Gangwha and Muan), our haplotype network suggests that the Gangwha and Muan populations of R. esculentum are related. The simple and monotonous genetic structure of the Muan population shows that R. esculentum emergence is relatively recent. In contrast, the Gangwha population shows evolution. Moreover, jellyfish of the Gangwha population are genetically diverse and remain constant despite environmental fluctuations in the Han River. The Gangwha area is considered to be the old origin of R. esculentum in Korea.

• 생명과학회지
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• 제8권2호
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• pp.216-225
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• 1998

Metal ion-induced and it’s regulatory genes were screened in virulent salmonella typhimurium UK1 and tested cross-regulation with various stresses. Using the techniqud of P22-MudJ(Km, lacZ)-directed lacZ operon fusion, LF40 cuiA::MudJ and Lf153 cuiD::MudJ which were induced by copper were selected. cuia and cuiD were determined anaerobic coper inducible and copper tolerance response gene, respectively. Also cuiA and cuiD locus were determined at 81 and 8min, respectively, on salmonella Genetic Map. The two regulators were identified as cuaR, and cudR, which controls cuiA and cuiD, respectively. cuaR, and cudR appeared as negative regulators because the expression of cuiA-lac-Z and cuiD-lacZ were increased. Copper adapted UK1 showed high resistance to H$_{2}$O$_{2}$, but cuiD did not. The product of the cudR locus was responsible for decreasing the tolerance to copper and H$_{2}$O$_{2}$. Furthemore cuiA and cuiD locus were found to be part of a regulon under the control of a trans-acting regulators, rpoS, oxyR and relA. Therefore, the results suggest CTR participate with oxidative stress on Salmonella.

• 미생물학회지
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• 제20권1호
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• pp.11-20
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• 1982

A study was undertaken to examine the effect of curing agents on the stability, curing and segregation of R plasmid pSL100. And also the stability, transfer frequency, and recombination of its segregants obtained from curing agent treatment were studied. Ethidium bromide, acridine orange, and mitomycin-C were used as curing agent. The results obtained were as follows ; 1. The curing agent ethidium bromide, acridine orange, and mitomycin-C were not effective for curing the multiple antibiotic resistant determinant of pSL100 in Salmonella typhimurium and Escherichia coli. However, they induced plasmid segregation with high frequency in S.typhimuruim LT-2strains. TcApSmCm, TcSmCmKm, TcApCm, TcAp, TcKm, Tc segregants were obtained. 2. The resistant markers of the segregents were transferred to S.typhimurium LT-2 strains with high frequencies whereas they were transferred to E.coli K-12 only with low frequencies. 3. The transconjugants obtained from conjugation between two different S.typhimurium segregants were similar to the phenotype of the original R factor pSL100 and the resistant markers were transferred to the S.typhimurium LT-2 or E.coli strain with equal frequencies, indicating that they are recombinants. 4. The transconjugants obtained from conjugation between pSL100 segrgants and pKM101, or pBR322 possessed the resistant markers of the two parental plasmids and they were transferred to both S.typhimurium and E.coli K-12 strains with the same frequencies and maintained stably, suggesting that they are also recombinants. 5. The recombinant pSL100 could be also obtained in rec A-strains of E.coli, suggesting that the gene function of rec A is required for the recombination of pSL100 segregants in E.coli.

• Applied Biological Chemistry
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• 제38권2호
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• pp.111-117
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• 1995

CRP (cAMP receptor protein)은 cAMP와 결합하여 cAMP-CRP 복합체를 형성하여 전사조절의 조절인자로서 작용한다. crp 유전자에 변이를 도입하여 cAMP의 비존재 상태에서 cAMP-CRP와 비슷한 기능을 가진 crp 유전자가 도입된 대장균 MK2001 (crp, cya::km)을 숙주로 사용하여 cAMP 혹은 cGMP의 비존재하에서도 mal 유전자의 발현을 촉진시키는 유전자 sfs (sugar fermentation stimulation) 수 종을 클로닝 하였다. 본 실험에서는 이미 밝혀진 nlp (Ner like protein) 유전자와 같이, sfs의 새로운 유전자를 탐색하여, 그 중 sfs4의 2126 bp 전 염기배열을 결정하고, 잠정적인 sfs4의 promoter 영역에는 CRP 단백질과의 결합 DNA 공통 염기배열(5' AAT TGTGA ACACCA TCACC CGT 3')이 존재함을 확인했다. lacZ 융합 유전자를 작성하여 TP2010R1 MK2001의 균주에서 cAMP를 첨가할 경우 각각 2.3배, 1.8배의 ${\beta}-galactosidase$ 활성이 증가하는 것으로 보아 sfs4는 cAMP-CRP에 의해 발현 조절을 받는 것으로 나타났다.