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Tilted beta regression and beta-binomial regression models: Mean and variance modeling

  • Edilberto Cepeda-Cuervo
    • Communications for Statistical Applications and Methods
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    • 제31권3호
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    • pp.263-277
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    • 2024
  • This paper proposes new parameterizations of the tilted beta binomial distribution, obtained from the combination of the binomial distribution and the tilted beta distribution, where the beta component of the mixture is parameterized as a function of their mean and variance. These new parameterized distributions include as particular cases the beta rectangular binomial and the beta binomial distributions. After that, we propose new linear regression models to deal with overdispersed binomial datasets. These new models are defined from the proposed new parameterization of the tilted beta binomial distribution, and assume regression structures for the mean and variance parameters. These new linear regression models are fitted by applying Bayesian methods and using the OpenBUGS software. The proposed regression models are fitted to a school absenteeism dataset and to the seeds germination rate according to the type seed and root.

한국인 분변으로부터 분리한 Bifidobacterium sp. Int-57의 효소 Pattern (The Enzymatic Pattern of Bifdobacterium sp. Int-57 Isolated from Korean Feces)

  • 박헌국;강동현;이계호;윤석환;이세경;지근억
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제20권6호
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    • pp.647-654
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    • 1992
  • 장내 세균의 생리적 연구를 목적으로 한국인의 장내 상재균을 분리하여 효소 pattern을 관찰하였다. 분리된 Bifidobacterium sp. Int-57은 다른 장내 균종에 비하여 $\alpha$-glucosidase, $\beta$-glucosidase, $\alpha$-galactosidase, $\beta$-galactosidase, $\beta$-xylosidase, $\alpha$-arabinofuranosidase역가가 높았다. Bifidobacterium sp. Int-57의 각 효소 생산에 미치는 탄소원의 영향을 조사하였다. $\alpha$-glucosidase는 maltose, $\beta$-glucosidase는 cellobiose, $\alpha$-galactosidase는 raffinose, 는 lactose, $\beta$-xylosidase와 $\alpha$-arabinofuranosidase는 xyloserk 각각 최적의 탄소원이었다. 또한 각 효소들의 최적 조건과 pH 안정성을 조사 하였다. $\alpha$-glucosidase는 pH 6.0 $40^{\circ}C$에서 $\beta$-glucosidasessm pH 7.0 50에서, $\beta$-galactosidase는 pH 7.0 50에서, $\beta$-xylosidase는 pH 6.0 $40^{\circ}C$에서, $\alpha$-arabinofurnaosidase는 pH 5.0 $50^{\circ}C$에서 각각 최적이었다. $\alpha$-glucosidase는 pH 4.0~9.0 $\beta$-glucosidase는 pH 4.0~7.0 $\beta$-galactosidase는 pH 4.0~9.0, $\beta$-xylosidase는 pH 4.0~6.0, $\alpha$-arabinofuranosidase는 pH 7.0~9.0에서 각각 안정하였다.

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Streptomyces sp. YB-9가 생산하는 균체외 ${\beta}-galactosidase$의 특성 (Characterization of the Extracellular ${\beta}-Galactosidase$ Produced from Streptomyces sp. YB-9)

  • 이경섭;김창진;윤기홍
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제46권4호
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    • pp.299-304
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    • 2003
  • 토양으로부터 lactose의 가수분해를 촉매하는 균체외 ${\beta}-galactosidase$를 생산하는 YB-9가 분리되었다. 분리균 YB-9는 분리균의 배양, 형태, 생리적 특성을 조사한 결과 Streptomyces속 균주로 동정되었다. 분리균의 배양상등액을 ammonium $sulfate(15{\sim}70%)$로 처리하고 투석하여 부분정제된 ${\beta}-galactosidase$$para-nitrophenyl-{\beta}-D-galactopyranoside(pNP-{\beta}Gal)$와 lactose를 기질로 하여 반응특성을 분석하기 위해 조효소액으로 사용하였다. ${\beta}-Galactosidase$는 pH $6.0{\sim}6.5$$60^{\circ}C$에서 최대활성을 보였다. $pNP-{\beta}Gal$과 lactose에 대한 ${\beta}$-galactosidase의 가수분해 활성은 galactose에 의해 감소되었다. Lactose에 대한 가수분해 활성은 glucose에 의해 미미하게 감소하였으나, glucose에 의해 $pNP-{\beta}Gal$에 대한 활성은 1.3배 증가하였다. 특히, xylose에 의한 lactose의 가수분해 활성에는 영향이 없었고, $pNP-{\beta}Gal$에 대한 활성은 1.6배 증가시켰다.

Effect of Soy Isoflavones on the Expression of $TGF-{\beta}1$ and Its Receptors in Cultured Human Breast Cancer Cell Lines

  • Kim Young-Hwa;Jin Kyong-Suk;Lee Yong-Woo
    • 대한의생명과학회지
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    • 제11권2호
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    • pp.175-183
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    • 2005
  • The two major isoflavones in soy, genistein and daidzein, are well known to prevent hormone-dependent cancers by their anti estrogenic activity. The exact molecular mechanisms for the protective action are, however, not provided yet. It has been reported that genistein and daidzein have a potential anticancer activity through their antiproliferative effect in many hormone-dependent cancer cell lines. Transforming growth $factor-\beta1(TGF-\beta1)$ has also been found to have cell growth inhibitory effect, especially in mammary epithelial cells. This knowledge led to a hypothetical mechanism that the soy isoflavones-induced growth inhibitory effect can be derived from the regulation of $TGF-\beta1$ and $TGF-\beta$ receptors. In order to test this hypothesis, the effects of the soy isoflavones at various concentrations and periods on the expression of $TGF-\beta1$and $TGF-\beta$ receptors were investigated by using Northern blot analysis in human breast carcinoma epithelial cell lines, an estrogen receptor positive cell line (MCF-7) and an estrogen receptor negative cell line (MDA-MB-231). As a result, only genistein has shown a profound dose-dependent effect on $TGF-\beta1$ expression in the $ER^+$ cell line within the range of doses tested, and the expression levels are correspondent to their inhibitory activities of cell growth. Moreover, daidzein showed down-regulated $TGF-\beta1$ expression at a low dose, the cell growth proliferation was promoted at the same condition. Therefore, antiproliferative activity of the soy isoflavones can be mediated by $TGF-\beta1$ expression, and the effects are mainly, if not all, occurred by ER dependent pathway. The expression of $TGF-\beta$ receptors was induced at a lower dose than the one for $TGF-{\beta}1$ induction regardless of the presence of ER, and the expression patterns are similar to those of the cell growth inhibition. These results indicated that the regulation of $TGF-\beta$ receptor expression as well, prior to $TGF-\beta1$ expression, may be involved in the antiproliferative activity of soy isoflavones. Little or no expression of $TGF-\beta$ receptors was found in the MCF-7 and MDA-MB-231 cells, suggesting refractory properties of the cells to growth inhibitory effect of the $TGF-\beta$. The soy isoflavones can seemingly restore the sensitivity of growth inhibitory responses to $TGF-\beta1$ by re-inducing $TGF-\beta$ receptors expression. In conclusions, our findings presented in this study show that the antitumorigenic activity of the soy isoflavones could be mediated by not only $TGF-\beta1$induction but $TGF-\beta$ receptor restoration. Thus, soy isoflavones could be good model molecules to develop new nonsteroidal antiestrogenic chemopreventive agents, associated with, regulation of $TGF-\beta$ and its receptors.

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방울비짜루(Asparagus oligoclonos)로부터 분리한 스테로이드 사포닌의 항균활성 (Steroidal Saponins from the Rhizomes of Asparagus oligoclonos and their Antibacterial Activity)

  • 성재덕;박승용;오세량;곽용호;김금숙
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제43권2호
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    • pp.136-140
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    • 2000
  • 방울비짜루의 MeOH 추출물 및 수포화 BuOH추출물로부터 항균활성을 확인하고 그 원인물질을 구명하던 중 두 종의 steroid saponin을 분리하였다. 이들의 구조확인을 위해 $^1H,\;^{13}C$ NMR 및 2D NMR 등 분광학적 방법을 사용하였으며 최종 이들의 구조가 25S-spirostane계의 steroid saponin인$3-O-[{\beta}-D-glucopyranosyl-(1{\rightarrow}2)-{\beta}-D-glucopyranosyl]-(25S)-spirostan-3{\beta}-ol$$3-O-{{\beta}-D-glucopyranosyl-(1{\rightarrow}2)-[{\beta}-D-xylopyranosyl-(1{\rightarrow}4)]-{\beta}-D-glucopyranosyl}-(25S)-spirostan-3{\beta}-ol$인 것으로 동정되었다. 이 두 화합물은 방울비짜루로부터는 처음으로 분리되었다. 이들 saponin의 항균활성 및 항균 스펙트럼을 검사하기 위하여 20개 균주에 대한 MIC를 실시하였다. 이들은 그중 10개 균주에 대해 $100\;{\mu}g/ml$의 농도에서 세균의 성장을 저지하는 항균력이 있었으며 광범위한 항균 스펙트럼을 나타내었다.

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생쥐 초기배아에서 Interleukin-$1\beta$ 유전자의 발현에 미치는 수란관과 자궁내막세포의 영향 (The Effects of Oviduct and Uterine Epithelial Cells on the Expression of Interleukin-$1\beta$ Gene in Preimplantation Mouse Embryos)

  • 홍석호;계명찬;김종월;이정복;오은정;조동제;최규완;김문규
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제3권1호
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    • pp.59-67
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    • 1999
  • 초기배아의 발생과정동안 배아와 모체에서 발현되는 여러 cytokine은 착상을 위한 신호물질로 중요한 역할을 한다. 그 중 interleukin-1$\beta$ (IL-1$\beta$)는 배아와 모체간의 상호 신호전달체로서 성공적인 착상을 위한 필수적인 요소로 작용한다고 알려져 있다. 따라서 본 연구에서는 초기배아의 발생과정에 있어서 IL-1$\beta$ 유전자의 역할을 규명하기 위해 생쥐 초기배아에서의 IL-l$\beta$ 유전자의 발현양상을 역전사중합효소연쇄반응을 통해 조사하였고, IL-l$\beta$ 유전자의 발현에 미치는 수란관과 자궁내막세포의 영향을 밝혀보기 위해 공배양방법을 이용하였다. 그 결과 IL-l$\beta$ in vivo 에서는 4-세포기부터 포배기까지, in vitro에서는 상실배부터 부화중 포배기까지 발현하는 양상을 보였다. 또한 수란관과 자궁내막세포와의 공배양시 대조군과 비교하였을 때 실험군에서 IL-l$\beta$ 유전자의 발현이 촉진되었다. 이러한 결과는 IL-l$\beta$ 의 존재가 착상전 초기배아의 발생에 중요한 역할을 한다는 것을 의미한다. 또한 수란관과 자궁내막세포와의 공배양을 통해 IL-1$\beta$ 유전자의 발현이 수란관과 자궁요소에 의해 조절됨을 확인하였다.

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BCD를 섭취한 돼지의 부위별 콜레스테롤 함량 (Cholesterol Contents of Pork Fed Dietary β-Cyclodextrin)

  • 강환구;박병성
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제36권2호
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    • pp.180-185
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    • 2007
  • 본 연구는 비육말기 돼지에서 베타사이클로덱스트린$\beta$-cyclodextrin의 급여가 돈육의 콜레스테롤 수준을 낮춘다는 것을 나타내고 있다. 120마리의 돼지에게 0, 5, 7, 10%의 $\beta$-cyclodextrin를 함유하는 사료를 35일 간 급여하였다. 혈액 총지질, 중성지방 및 총 콜레스테롤 함량은 $\beta$-cyclodextrin첨가구가 대조구에 비해서 낮게 나타났으며 처리구간 통계적인 유의차가 나타났다(p<0.05). 혈액 100 mL 당 지질은 대조구와 비교할 때 $\beta$-cyclodextrin 5.0%, $\beta$-cyclodextrin 7.0% 및 $\beta$-cyclodextrin 10.0% 첨가구에서 각각 63.22 mg, 73.98 mg, 82.12 mg의 유의적인 감소를 나타냈으며, 중성지방 56.24 mg, 55.48 mg, 60.02 mg, 총콜레스테롤 25.05 mg, 27.17 mg, 30.19 mg의 유의성 있는 감소경향을 보였다(p<0.05). 총스테로이드의 배설은 $\beta$-cyclodextrin 첨가수준이 증가할수록 대조구에 비해서 유의적으로 높게 나타났다(p<0.05). 돼지고기의 부위별, 등지방, 삼겹살, 등심 및 햄의 콜레스테롤 함량은 대조구에 비해서 $\beta$-cyclodextrin 첨가수준이 높아질수록 유의적인 감소경향을 나타냈다(p<0.05). 돼지고기의 콜레스테롤 함량 감소율은 $\beta$-cyclodextrin 첨가구가 대조구와 비교할 때 15.31% 이상의 높은 감소율을 나타냈다(p<0.05). 본 연구 결과는 비육말기 돼지사료 내 $\beta$-cyclodextrin를 혼합 급여하여서 콜레스테롤 함량이 낮아진 새로운 기능성 돈육을 생산할 수 있음을 시사해준다.

FRC에서 Lymphotoxin β receptor의 자극은 MLCK와 ROCK의 이중 신호전달 경로를 통해 stress fiber 변화에 관여 (Signals of MLCK and ROCK Pathways Triggered via Lymphotoxin β Receptor are Involved in Stress Fiber Change of Fibroblastic Reticular Cells)

  • 김대식;이종환
    • 생명과학회지
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    • 제29권2호
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    • pp.256-264
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    • 2019
  • Lymphotoxin ${\beta}$ receptor ($LT{\beta}R$)는 TNF 계열로 림프조직의 미세구조와 기관형성에 중요한 역할을 한다. MLCK와 ROCK는 세포의 stress fiber 형성조절에 관여하는 주요 신호전달자이다. Fibroblastic reticular cell (FRC)에서 $LT{\beta}R$ 자극을 통한 이런 신호전달자들의 관련성을 알아보기 위해 ML-7 (MLCK 저해제)이 사용되었다. ML7 처리된 FRC에서 SF가 완전히 파괴되었고 anti-$LT{\beta}R$ antibody 처리 세포와 유사하게 ML7 처리 FRC에서 응축된 세포형태를 관찰 할 수 있었다. Y27632로 ROCK를 저해 했을 때 FRC의 액틴 세포골격과 세포형태 변화가 유도 되었다. FRC에서 p-MLC가 액틴과 함께 SF 구성성분을 이루었다. FRC세포 추출물로 Rho-guanosine diphosphate (GDP)/guanosine triphosphate (GTP) 교환활성을 확인했다. Agonistic anti-$LT{\beta}R$ antibody로 $LT{\beta}R$을 자극 했을 때 Rho-GDP/GTP 교환활성이 크게 감소했다. MLCK 저해처럼 $LT{\beta}R$ 자극은 MLC의 인산화를 감소시켰다. Agonistic anti-$LT{\beta}R$ antibody-treated FRC에서 세포골격 구성요소인 세포막과 세포골격 링커 역할을 하는 p-ezrin의 인산화는 감소 되었고 b- actin, 그리고 tubulin 발현도 줄었다. 이런 결과는 FRC의 $LT{\beta}R$ 신호전달을 통한 SF 조절에는 MLCK와 ROCK가 관여하고 있다는 것을 알 수 있었다.

Growth and $\beta$-Glucosidase Activity of Bifidobacterium

  • CHOI, YUN-JUNG;CHUL-JAI KIM;SO-YOUNG PARK;YOUNG-TAE KO;HOO-KIL JEONG;GEUN-EOG JI
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제6권4호
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    • pp.255-259
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    • 1996
  • $\beta$-Glucosidase was known to be involved in the mutagenic activation of $\beta$-glucosides. The level of $\beta$-glucosidase in the feces of adults was 2.7 times higher than that of infants. There was no difference in the percentage of $\beta$-glucosidase positive strains among Bifidobacterium isolates between adults and infants, corresponding to 90 and 92$%$, respectively. However, the strains from adults showed 1.9 times higher enzyme activity than those from infants when grown in Brain Heart Infusion medium. $\beta$-Glucosidase negative strains could not ferment $\beta$-glucosidase substrates, such as cellobiose, salicin, naringin, esculin and arbutin. Presence of $\beta$-glucosidase in Bifidobacterium did not alter the degree of growth in reconstituted skim milk. The $\beta$-glucosidase level was much lower in milk and vegetable medium, although cells grew above $10^8$cfu/ml, than in BHI medium. This study suggests that metabolic activation of the $\beta$-glucosides by Bifidobacterium $\beta$-glucosidase varies significantly depending on types of growth medium.

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Thiol의 친핵성 첨가물의 합성 (제VIII보) ${\beta}$-Acetyl-${\beta}$-benzoylstyrene 유도체에 대한 thioglycolic acid, benzenethiol 및 benzylmercaptan 첨가 생성물의 합성 (Synthesis of Nucleophilic Adducts of thiols (VIII). Addition of Thioglycolic acid, Benzenethiol and Benzylmercaptan to ${\beta}$-Acetyl-${\beta}$-benzoylstyrene Derivatives)

  • 허태성;백인숙;서기림;김태린
    • 대한화학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.364-368
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    • 1987
  • ${\beta}-Acetyl-{\beta}-benzoylstyrene$ 유도체에 대한 thioglycolic acid, benzenethiol 및 benzylmercaptan의 첨가반응에 관하여 연구하였다. ${\beta}-acetyl-{\beta}-benzoylstyrene$ 유도체는 쉽게 thioglycolic acid, benzenethiol, benzylmercaptan과 반응하여 다섯가지 (2-acetyl-2-benzoyl-1-phenylethyl) thioglycolic acid 유도체 (IIa-IIe), 다섯가지의 (2-acetyl-2-benzoyl-1-phenylethyl)benzenethiol 유도체 (IIIa-IIIe) 및 다섯가지의 (2-acetyl-2-benzoylphenylethyl)benzylmercaptan 유도체 (IVa-IVe)를 합성한다.

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