Kwon, Sun Jae;Choi, Eun Young;Seo, Jong Bok;Park, Ohkmae K.
Molecules and Cells
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제24권2호
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pp.268-275
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2007
Protein phosphorylation plays a key role in signal transduction in cells. Since phosphoproteins are present in low abundance, enrichment methods are required for their purification and analysis. Chemical derivatization strategies have been devised for enriching phosphoproteins and phosphopeptides. In this report, we employed a strategy that replaces the phosphate moieties on serine and threonine residues with a biotin-containing tag via a series of chemical reactions. Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (RUBISCO)-depleted protein extracts prepared from Arabidopsis seedlings were chemically modified for 'biotin-tagging'. The biotinylated (previously phosphorylated) proteins were then selectively isolated by avidin-biotin affinity chromatography, followed by two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) and matrix-assisted laser-desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). This led to the identification of 31 protein spots, representing 18 different proteins, which are implicated in a variety of cellular processes. Despite its current technical limitations, with further improvements in tools and techniques this strategy may be developed into a useful approach.
Mature embryo and developing seedlings of Ginkgo biloba L. were embedded in a paraplast and serially sectioned at 10${\mu}{\textrm}{m}$ to examine vascular differentiation and vascular transition. Procambium and protophloem formed a continuous system along the epicotylhypocotyl root axis and cotyledons in mature embryo, whereas protoxylem was differentiated discontinuously in the cotyledons and rarely in the upper hypocotyl. The traces of the first and second leaf primordia apeared almost at the same time oppositely to each otehr at the epicotyl and alternately with the cotyledon traces in the upper hypocotyl. The trace differentiated bidirectionally toward the epicotyl and root tips. the young root initially formed a diarch xylem. Then, as the traces of the first and second leaves were superimposed, the diarch xylem. Then, as the traces of the first and second leaves were superimposed, the diarch xylem of the root was changed totriarch and tetrarch xylem, respectively. On the formation of primary vascular system of Ginkgo biloba, it is suggested that the primary phloem forms a continuous system throughout the seedling, whereas the primary xylem of the epicotyl is formed independently from that of the root-hypocotyl cotyledon system.
This study was conducted to investigate colonization of ectomycorrhizal fungi(ECM) in roots of Abies koreana which is an endemic and endangered species in Korea. Roots of A. koreana were collected at Mt. Halla. ECM root tips were classified using morphotyping and identified using sequences of internal transcribed spacer (ITS) region of the fungal rDNA. Total 8 species of ECM fungi were identified from roots of 11 seedlings of A. koreana : Cenococum geophilum, Russula brevipes, 2 species of Russula, 2 species of Thelephora, Cortinarius camphorates and 2 species of Helotiales. These species were known to be typical ectomycorrhizal fungi found in coniferous mature forests.
The growth of digitaria adscendens and eleusine indica, annual weeds common in japan, was experimentally analyzed under varying untrient conditions. compared with e. indica, d. adscendensshowed a higher the two under high nitrogen availability. Higher net assimilation rate(nar) in d. adscendens than e. india was responsible for high RGR in D. adscendens under the low nitrogen availability. The different of NAR in the two species was induced not by leaf nitrogen content but by nitrogen use efficiency. Under unfertilized conditions nitrogen uptake rate(nur) was greater in d. adscendens than e. indica. Specific absorption rate in two species was similar, but root mass was greater in d. adscendens than e. indica.d. adscendens allocated more dry matter to roots than e. india earlier stage of seedlings. The contributed to higher rot mass and in turn resulted in higher nur in d. adscendens than that in e. india. It is concluuded that the larger allocation of dry matter to roots at early seedling stage in d. adscendens plays an important role in obtaining nitrogen for the continuation of growth under low nitrogen availability.
Pseudomonas chlororaphis O6 induces systemic tolerance in plants against drought stress. A volatile, 2R, 3R-butanediol, produced by the bacterium causes partial stomatal closure, thus, limiting water loss from the plant. In this study, we report that applications of extracellular polymeric substances (EPS) from P. chlororaphis O6 to epidermal peels of leaves of Arabidopsis thaliana also reduce the size of stomatal openings. Growth of A. thaliana seedlings with applications of the EPS from P. chlororaphis O6 reduced the extent of wilting when water was withheld from the plants. Fluorescence measurements showed photosystem II was protected in the A. thaliana leaves in the water stressed EPS-exposed plants. These findings indicate that P. chlororaphis O6 has redundancy in traits associated with induction of mechanisms to limit water stress in plants.
과실의 연화는 주로 조직의 세포벽의 구조적 붕괴에 기인하며 이 중 Pectin의 분해와 밀접한 관련이 있다고 한다. 과실의 세포벽에는 다량의 $Ca^{2+}$이 존재하면서 세포벽의 구조를 지지하는데 중요한 역할을 하고있다. 양액 재배시에는 배양액의 농도가 높을수록 $Ca^{2+}$ 흡수이동이 억제되어 토마토식물체의 $Ca^{2+}$ 함량은 감소하는 것으로 보고되었다. 본 실험은 $Ca^{2+}$을 이용한 토마토과실의 품질향상을 위한 연구의 기초자료를 얻고자 토마토 유식물체에 $Ca^{2+}$ 농도별, 종류별 처리를 통하여 토마토 육묘중 $Ca^{2+}$ 및 다른 양이온의 흡수 유형을 알아보고자 하였다. (중략)
An efficient regeneration system was established by using in vitro plantlets of germinated seedlings from different cultivars of lettuce (Lactuca sativa cv. Chongchima, Chongchuckmyun, Jeokchima, Jeokchuckmyun). Shoot formation were observed from all cultivars on MS medium supplemented with 0.1 mg/L NAA and 0.5 mg/L BA. In all cultivars, when cotyledon was cultured, the number of shoot per explant was more greater than that hypocotyl and leaf disc were cultured. Shoot formation rate (91.7%) was high in a cotyledon culture of cultivar, Chongchukmyun. The growth of multiple shoots derived from the cultivar, Chongchukmyun, was most effective on medium containing 0.5 mg/L BA and 1.0 mg/L GA$_3$. When shoots were transferred on MS medium without plant growth regulators, roots were effectively differentiated. Rooted plantlets were acclimated on pots for further propagation.
Kim, Juyun;Kim, Namgyu;Mannaa, Mohamed;Lee, Hyun-Hee;Jeon, Jong-Seong;Seo, Young-Su
The Plant Pathology Journal
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제35권3호
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pp.280-286
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2019
In this study, PVF11 was selected among 20 candidate pathogenesis-related genes in Burkholderia glumae based on its effect on virulence to rice. PVF11 was found to interact with several plant defense-related WRKY proteins as evidenced through yeast-two hybrid analysis (Y2H). Moreover, PVF11 showed interactions with abiotic and biotic stress response-related rice proteins, as shown by genome-wide Y2H screening employing PVF11 and a cDNA library from B. glumae-infected rice. To confirm the effect of PVF11 on B. glumae virulence, in planta assays were conducted at different stages of rice growth. As a result, a PVF11-defective mutant showed reduced virulence in rice seedlings and stems but not in rice panicles, indicating that PVF11 involvement in B. glumae virulence in rice is stage-dependent.
Min, Young Ju;Park, Myung Soo;Fong, Jonathan J.;Seok, Soon Ja;Han, Sang-Kuk;Lim, Young Woon
Mycobiology
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제42권3호
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pp.221-228
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2014
The fungal genus Suillus Micheli ex S. F. Gray plays important roles in the survival and growth of plant seedlings. Humans have utilized these ectomycorrhizal fungi to enhance the nutrient uptake and defense systems of plants, particularly in the reforestation of coniferous forests. The genus Suillus is easily distinguishable by its distinctive morphological features, although the morphology of the fruiting body does not facilitate reliable interspecies discrimination. On the basis of micro-morphological features and internal transcribed spacer sequence analysis, we found that 51 of 117 Korean Suillus specimens had initially been misidentified. The list of the 12 Suillus species previously recorded in Korea was re-evaluated and revised to only eight distinct species: S. americanus, S. bovinus, S. granulatus, S. grevillei, S. luteus, S. pictus, S. placidus, and S. viscidus. We provide taxonomical descriptions for six of these species from the sample specimens.
Lee Sang-Bok;Ku Yeon Chung;Seong Ki Young;Song Duck Young;Seo Kyung In;Shin Jin Chul
한국작물학회지
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제50권2호
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pp.79-83
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2005
Rice and weed interference in the paddy field caused by resource competition and allelopathy. Evaluation method of active weed suppressive behavior of rice to weed was developed by eliminating light competition at soil condition. Twenty eight days old rice seedlings (6-7 leaf stage) which was grown at saturated, no drainage pot were clipped above $3\~4cm$ from the soil surface. Weeds seeded around clipped rice stem, named ratoon seeding screening method, showed varietal suppressive difference to Echinochloa crus-galli, Echinochloa crusgalli var. praticola and Monochoria vaginalis. Potential allelopathic rice varieties, Sathi, AC1423 and PI312777 showed better suppressive activity to weed seedling growth than Nonganbyeo and Keumobyeo. Weed suppression of one plant of rice cultivars could be evaluated by the cell size of $2.5\times2.5cm$ at rice clipping of seedling 29 days after rice seeding.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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