• 제목/요약/키워드: yeast two-hybrid system

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Yeast Two-hybrid System을 이용한 cTPx II 결합단백질 탐색 및 분석 (Screening and Analysis for cTPx II-Interacting Protein Using Yeast Wo-hybrid System)

  • 김일한;오영미;차미경
    • 자연과학논문집
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    • 제15권1호
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    • pp.79-88
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    • 2005
  • 효모에는 여러 가지 종류의 thiol peroxid se 동위 효소들인 cytoplasmic TPx I, cTPx II, cTPx III, mitochodrial TPx (mTPx), 및 nuclear TPx (nTPx)가 존재하고 있다. 특히 cTPx II는 다른 효모TPx와 비교해 볼 때 매우 낮은 peroxidase 활성을 보이나, cTPx II를 제거한 cTPx II mutant균주는 심하게 성장이 저해되는 특징을 보인다. 본 연구에서는 효모에서의 cTPx II의 생리학적 기능을 밝히는 연구의 첫 과정으로 cTPx II와 상호 작용하는 단백질을 탐색하였다. Sacchromyces cerevisiae genomic DNA library에서 yeast two-hybrid system을 이용하여 cTPx II와 상호 결합하는 단백질을 탐색하여 그 단백질들의 기능을 연구하여, 궁극적으로 cTPx II의 생리기능을 밝히는데 이 연구의 목적을 두었다.

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Use of the Yeast 1.5-Hybrid System to Detect DNA-Protein-Protein Interaction

  • Kim, Sook-Kyung;Han, Jin-Hee
    • Journal of Microbiology
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    • 제38권2호
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    • pp.113-116
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    • 2000
  • Escherichia coli F plasmid partition apparatus is composed of two trans-acting proteins (SopA and SopB) and one cis-acting DNA sequence (sopC). The SopB-sopC complex has been suggested to serve a centromere-like function through its interaction with chromosomally encoded proteins which remain to be identified. In this paper, we are introducing a new yeast 1.5-hybrid system which assembles the two-hybrid and one-hybrid system as a mean to find and additional component of the F plasmid partition system, interacting with DNA (sopC)-bound SopB protein. The results indicates that this system is a promising one, capable of selecting an interacting component.

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HIV gp41의 세포내 부분과 상호작용하는 단백질 유전자의 분리 (Isolation of the Gene for HIV-1 gp41 Interacting Protein)

  • 김은미;김정우
    • 자연과학논문집
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    • 제10권1호
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    • pp.27-32
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    • 1998
  • HIV-1 gp41의 세포내 부분과 상호작용하는 단백질 유전자를 분리할 목적으로 yeast two hybrid system을 사용하여 검색하였다. 전체 $1.4 \times 10^6 colony를 검색하여 최종적으로 20개의 colony를 얻었다. 이들 colony로부터 분리된 유전자의 염기배열을 결정하여 본 결과, acidic ribosomal protein P0, beta tubulin, alpha catenin등의 세가지 종류임을 밝혔다. 이들은 yeast system 내에서 매우 특이적으로 gp41과 상호작용하고 있음을 알았다.

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Yeast two-hybrid system을 이용한 Ref-1 (redox factor-1) 결합 단백질의 분리 및 동정 (Detection of Ref-1 (Redox factor-1) Interacting Protein Using the Yeast Two-hybrid System)

  • 이수복;김규원;배문경;배명호;정주원;안미영;김영진
    • 생명과학회지
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    • 제14권1호
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    • pp.26-31
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    • 2004
  • 본 연구는 redox regulator로 알려 진 Ref-1 (Redox factor-1)과 결합하는 새로운 단백질을protein-protein interaction의 원리를 이용한 방법인 yeast two-hybrid assay로 검색, 동정하고, 검색된 단백질의 in vitro, in vivo 기능을 규명하는 데 그 목적을 두고, mouse 11-day Embryo cNA library를 prey로, full length REF-1을 bait로 하여 yeast strain 인 HF7C에 cotransformatiom시킨 후 histidine, leucine, tryptophan이 결핍된 SD plate에서 키워 자란 yeast transformants를 $\beta$-galactosidaseassay하여 screening하여 분리한 세 개의 clone중 한 clone이 DNA sequencing으로 확인한 결과 mouse thioredoxin임을 확인하였다.

이스트 two-hybrid 시스템을 이용한 hnRNP E1 cDNA의 클로닝과 hnRNP E1-hnRNP K 상호결합에 대한 연구 (Cloning of hnRNP E1 cDNA via yeast two-hybrid system and a study on protein-protein interaction between hnRNP E1 and hnRNP K)

  • 최미영
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제9권6호
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    • pp.1795-1799
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    • 2008
  • hnRNP K 단백질은 hnRNP 복합체를 구성하는 핵단백질들 중의 하나이며 시토신이 많은 RNA/DNA sequence에 잘 결합한다. 이 단백질은 핵 내에서만 머무르지 않고 핵과 세포질을 왕복하는 특징을 지니고 있다. hnRNP K의 기능을 조사하기 위하여 우선 hnRNP K와 상호 결합하는 세포내 단백질을 찾아내고자 하였다. 이를 위하여 본 연구에서는 이스트 two-hybrid 시스템을 사용하여 HeLa CDNA librar를 탐색하였다. 그 결과 얻은 클론들 중에는 사람의 hnRNP E1 (poly(rC) binding protein 1) cDNA (GenBank accession number XM_031585) 클론이 포함되어 있었다. 본 논문에서는 이스트 two-hybrid 시스템과 in vitro에서의 생화학적 실험을 통하여 hnRNP E1은 hnRNP K와 특이적으로 상호 결합한다는 것을 밝혔다.

Activated Phenoloxidase Interacts with A Novel Glycine-rich Protein on the Yeast Two-hybrid System

  • Lee, Sun-Woo;Lee, Hyun-Seong;Kim, Eun-Jun;Yoo, Mi-Ae;Lee, Bok-Luel
    • BMB Reports
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    • 제34권1호
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    • pp.15-20
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    • 2001
  • One of the innate immune reactions in invertebrates is the pro-phenoloxidase (pro-PO) activation system that is involved in the generation of superoxide, melanin synthesis, and the subsequent sequestration of foreign matter entering the hemocoel of the invertebrates. However, the molecular mechanism of this biological reaction is still obscure. To expand our understanding of the biological roles of the pro-PO activation system in invertebrates, we performed a yeast two-hybrid screening by using three regions of pro-PO as bait and a yeast two-hybrid cDNA library from Tenebrio molitor larvae as prey We isolated a novel partial cDNA clone that encodes a glycine-rich protein that interacted with the active phenoloxidase (termed phenoloxidase interacting protein, POIP). POIP consists of two domains: One is an N-terminal unique domain and the other is a C-terminal glycine-rich domain. The C-terminal glycine-rich domain showed sequential homology with those of insect antifungal proteins. Also, the yeast two-hybrid screen in a reverse orientation (using POIP as bait) yielded PO, suggesting that the PO-POIP interaction is specific. By using a 315 bP PCR fragment of the N-terminal unique region of POIP, we cloned the full-length cDNA of POIP from the Tenebruo cDNA library constructed by using E. coli injected larvae. The interaction analysis between PO, and a truncated fragment lacking the N-terminal unique region of POIP, indicated that the N-terminal unique region is necessary for interaction between PO and POIP. The expression level of the POIP mRNA is increased by bacterial injection into T. molitor larvae. This suggests that POIP might be engaged in the humoral defense reaction.

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Identification of a Domain in Yeast Chitin Synthase 3 Interacting with Chitin Synthase 4 by Two-Hybrid Analysis

  • Park, Hyun-Sook;Shin-Jung-Choi;Nok-Hyun-Park;Chi-Hwa-Kim;Sung-Uk-Kim
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제12권6호
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    • pp.943-949
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    • 2002
  • It has been proposed that chitin synthase 3 (CHS3)-nediated chitin synthesis during the vegetative cell cycle is regulated by chitin synthase 4 (CHS4) of Saccharomyces cerevisiae. To investigate direct protein-protein interaction between the coding products of these two genes, a domain of Chs3p that is responsible for interaction with Chs4p was identified, using the yeast two-hybrid system. This domain of 54 amino acids, termed MIRC3-4 (Maximum Interacting Region of Chs3p with Chs4p), is well conserved among CHS3 homologs of various fungi. Some mutations in MIRC3-4 resulted in a decrease in the enzymatic activity and chitin contents. Chs3p carrying those mutations exhibited weak interactions with Chs4p, when assayed by the yeast two-hybrid system. Surprisingly, all the mutants were sensitive to Calcofluor regardless of changes in enzymatic activities or chitin contents. This report deals with a core region in MIRC3-4 that affects the interaction with Chs4p.

IGF결합 단백질-4(IGFBP-4)와 이질 핵 리보핵산단백질 L (hnRNP L)의 상호결합의 식별 (Identification of the Interaction between Insulin-like Growth Factor Binding Protein-4 (IGFBP-4) and Heterogeneous Nuclear Ribonucleoprotein L (hnRNP L))

  • 최미영
    • 생명과학회지
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    • 제23권11호
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    • pp.1311-1316
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    • 2013
  • hnRNP L은 pre-mRNA에 결합하는 단백질들 중에서 핵심이 되는 단백질이다. hnRNP L은 양이 아주 많은 핵 단백질로서 핵과 세포질을 왕복하는 특성을 지니고 있다. 이 단백질은 염색질 변형(chromatin modification), pre-mRNA 스플라이싱, 인트론이 없는 유전자들에서 유래한 mRNA들의 세포질로의 반출(export), IRES-매개성 번역, mRNA의 안정성 조절, 정자형성과정 등, 세포 내의 여러 가지 과정에 관여하고 있는 것으로 알려져 있다. 이 논문에서는 hnRNP L과 결합하는 세포 내 단백질을 찾아내기 위하여 사람의 간세포 cDNA library를 사용하여 이스트 two-hybrid 탐색 실험을 수행하였다. 그 결과 사람의 간세포에서 IGFBP-4가 hnRNP L과 상호결합하는 새로운 파트너라는 것을 발견하였다. 본 연구를 통하여 hnRNP L이 이스트 two-hybrid 시스템에서 IGFBP-4와 특이적으로 상호 결합한다는 것을 처음으로 발견하였다. 본 연구에서는 또한 이스트 two-hybrid 시스템에서 hnRNP L이 IGFBP-4와 상호결합한다는 점을 in vitro pull-down 실험을 통하여 재확인하였다.

Interaction of a Kinesin Superfamily Protein 1A (KIF1A) with Calmodulin

  • Seog, Dae-Hyun
    • Journal of Life Science
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    • 제12권2호
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    • pp.43-46
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    • 2002
  • Kinesin Superfamily Protein 1A (KIF1A) is an anterograde monomeric motor transporting a subset of synaptic vesicle precursors and plays an important role in neuronal function and survival. Here, f have used the yeast two-hybrid system to identify the proteins that interacts with the tail region of KIF1A. Calmodulin was found to interact specifically with the tail region of KIF1A. Calmodulin regulates many diverse cellular functions by modulating the activity of the proteins that interact with it. KIF1A interacts with calmodulin in the yeast two-hybrid assay, which is proved by immunoprecipitation with calmodulin in brain fraction. These results indicate that KIF1A is associated with calmodulin, suggesting that calmodulin may be a key role in the regulation of anterograde transport of synaptic 1 vesicle precursors.

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