• 식물병연구
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• 제29권3호
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• pp.321-329
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• 2023

The bacterium Neobacillus endophyticus BRMEA1^T, isolated from the medicinal plant Selaginella involvens, known as its thermotolerant can grow at 50℃. To explore the genetic basis for its heat tolerance response and its potential for producing valuable natural compounds, the genomes of two thermotolerant and four mesophilic strains in the genus Neobacillus were analyzed using a bioinformatic software platform. The whole genome was annotated using RAST SEED and OrthVenn2, with a focus on identifying potential heattolerance-related genes. N. endophyticus BRMEA1^T was found to possess more stress response genes compared to other mesophilic members of the genus, and it was the only strain that had genes for the synthesis of osmoregulated periplasmic glucans. This study sheds light on the potential value of N. endophyticus BRMEA1^T, as it reveals the mechanism of heat resistance and the application of secondary metabolites produced by this bacterium through whole-genome sequencing and comparative analysis.

• Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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• 제50권3호
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• pp.206-212
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• 2023

Objective: The aim of the present study was to evaluate the associations between hematologic parameters related to systemic inflammation and insulin resistance-associated metabolic parameters in women with polycystic ovary syndrome (PCOS). Methods: Eighty-two women between the ages of 18 and 35 years who were diagnosed with PCOS were included in this study. A 2-hour 75-g oral glucose tolerance test (OGTT) was administered to all study participants; fasting and postprandial glucose and insulin levels were measured simultaneously during the 2-hour OGTT. Hematologic parameters were derived from a standard complete blood count and a differential count of fasting-state blood samples. The correlations between hematologic parameters and insulin resistance-associated clinical and metabolic parameters were evaluated using the Spearman rank correlation and partial correlation coefficients. Hematologic parameters related to systemic inflammation were compared between the two groups, categorized by the presence or absence of insulin resistance. Results: Significant differences in the absolute neutrophil count, absolute monocyte count, platelet count, and neutrophil-lymphocyte ratio were found between the insulin-resistant group and insulin-nonresistant group. Correlation analysis found that all hematological parameters, except for the platelet-lymphocyte ratio, were associated with at least one insulin resistance-associated metabolic parameter. However, these significant correlations between hematological and metabolic parameters were attenuated after controlling for the effects of other covariates using partial correlation analysis. Conclusion: The association between hematologic parameters indicative of systemic inflammation and insulin resistance-associated metabolic parameters seems to be strongly influenced by other anthropometric covariates in women with PCOS.

• 한국수정란이식학회:학술대회논문집
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• 한국수정란이식학회 2002년도 국제심포지엄
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• pp.99-99
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• 2002

The hormone resistin is associated with typeII diabetes mellitus in rodent model. Resistin impairs glucose tolerance and insulin action. A new class of anti-diabetic drugs were called thiazolidinediones (TZDs) downregulates a resistin which is induced during adipocyte differentiation. But the connection between increased adiposity and resistin remains unknown. The objectives of this study was to clone a mouse resistin cDNA and to generate transgenic mice overexpressing mouse resistin gene. The 555 bp of mouse resistin was amplified from mob cDNAS by polymerase chain reaction (PCR) and cloned into pCR$\^$(R)/ 2.1 TOPO T-vector. Mouse resistin mRNA on the basis of Genbank sequence (acession no. AF323080). Then, the PCR product was cloned into pTargeT$\^$TM/ mammalian expression vector that has pCMV promoter and chimeric intron. Restriction enzyme analysis with BamH I and Not I was carried out to determine an orientation of the insert in the vector. The pCMV-mus/resistin gene was prepared from previous recombinant pTargeT$\^$TM/-mus/resistin by digestion of Bgl II, and has used for microinjection into pronuclei of one cell embryos. The microinjected embryos were transfered to pseudopregnant foster-mother. Mouse resistin expression was detected in transgenic F1 mice by Reverse Transcriptase- Polymerase Chain Reaction (RT-PCR). Resistin gene expression mouse has heavier body weight which was measured higher level of plasma glucose than that of normal mouse. And in diet-induced experiments, the abdominal fat pads were isolated from each 24h starvation and re-feeding after fasting group mice that were assessed by RT-PCR analysis. In fasting group mice, resistin expression was higher than that of re-feeding group mice. This result suggests that the resistin gene overexpressing mice may be became to obesity and be useful as an animal disease model to be diabetes mellitus caused by insulin resistance of resistin.

• 한국초지조사료학회지
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• 제43권3호
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• pp.168-176
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• 2023

Silicon (Si) has the potential to improve plant growth and stress tolerance. The study aimed to explore Si-involving plant responses and molecular characterization of different Si-responsive genes in alfalfa. In this study, the exogenous supplementation of Si enhanced plant growth, and biomass yield. Si-acquisition in alfalfa root and shoot was higher in Si-supplemented compared to silicon deficient (-Si) plants, implying Si-acquisition has beneficial on alfalfa plants. As a consequence, the quantum efficiency of photosystem II (Fv/Fm) was significantly increased in silicon-sufficient (+Si) plants. The quantitative gene expression analysis exhibited a significant upregulation of the Lsi1, Lsi2, Lsi3, NIP5;1, and NIP6;1 genes in alfalfa roots, while BOR1, BOR4, NIP2, and NIP3 showed no significant variation in their expression. The MEME results further noticed the association of four motifs related to the major intrinsic protein (MIP). The interaction analysis revealed that NIP5;1 and Lsi1 showed a shared gene network with NIP2, BOR1, and BOR4, and Lsi2, Lsi3 and NIP3-1, respectively. These results suggest that members of the major intrinsic proteins (MIPs) family especially Lsi1, Lsi2, Lsi3, NIP5;1, and NIP6;1 genes helped to pass water and other neutral solutes through the cell membrane and those played significant roles in Si uptake and transport in plants. Together, these insights might be useful for alfalfa breeding and genome editing approaches for alfalfa improvement.

• Mycobiology
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• 제51권6호
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• pp.379-387
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• 2023

In this study, twenty-five yeast strains were isolated from soil samples collected in the gold mining ore in Gia Lai, Vietnam. Among them, one isolate named GL1^T could highly tolerate Cu²⁺ up to 10 mM, and the isolates could also grow in a wide range of pH (3-7), and temperature (10-40 ℃). Dried biomass of GL1 was able to remove Cu²⁺ effectively up to 90.49% with a maximal biosorption capacity of 18.1 mg/g at pH 6, temperature 30 ℃, and incubation time 60 min. Sequence analysis of rDNA indicated this strain was closely related to Rhodotorula mucilaginosa but with 1.53 and 3.46% nucleotide differences in the D1/D2 domain of the 28S rRNA gene and the ITS1-5.8S rRNA gene-ITS2 region sequence, respectively. Based on phylogenetic tree analysis and the biochemical characteristics, the strain appears to be a novel Rhodotorula species, and the name Rhodotorula aurum sp. nov. is proposed. This study provides us with more information about heavy metal-tolerant yeasts and it may produce a new tool for environmental control and metal recovery operations.

• 대한임상검사과학회지
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• 제37권2호
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• pp.65-70
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• 2005

Those specifications of the CLIA analytical tolerance limits are consistent with the performance goals in Six Sigma Quality Management. Six sigma analysis determines performance quality from bias and precision statistics. It also shows if the method meets the criteria for the six sigma performance. Performance standards calculates allowable total error from several different criteria. Six sigma means six standard deviations from the target value or mean value and about 3.4 failures per million opportunities for failure. Sigma Quality Level is an indicator of process centering and process variation total error allowable. Tolerance specification is replaced by a Total Error specification, which is a common form of a quality specification for a laboratory test. The CLIA criteria for acceptable performance in proficiency testing events are given in the form of an allowable total error, TEa. Thus there is a published list of TEa specifications for regulated analytes. In terms of TEa, Six Sigma Quality Management sets a precision goal of TEa/6 and an accuracy goal of 1.5 (TEa/6). This concept is based on the proficiency testing specification of target value +/-3s, TEa from reference intervals, biological variation, and peer group median mean surveys. We have found rules to calculate as a fraction of a reference interval and peer group median mean surveys. We studied to develop total error allowable from peer group survey results and CLIA 88 rules in US on 19 items TP, ALB, T.B, ALP, AST, ALT, CL, LD, K, Na, CRE, BUN, T.C, GLU, GGT, CA, phosphorus, UA, TG tests in chematology were follows. Sigma level versus TEa from peer group median mean CV of each item by group mean were assessed by process performance, fitting within six sigma tolerance limits were TP ($6.1{\delta}$/9.3%), ALB ($6.9{\delta}$/11.3%), T.B ($3.4{\delta}$/25.6%), ALP ($6.8{\delta}$/31.5%), AST ($4.5{\delta}$/16.8%), ALT ($1.6{\delta}$/19.3%), CL ($4.6{\delta}$/8.4%), LD ($11.5{\delta}$/20.07%), K ($2.5{\delta}$/0.39mmol/L), Na ($3.6{\delta}$/6.87mmol/L), CRE ($9.9{\delta}$/21.8%), BUN ($4.3{\delta}$/13.3%), UA ($5.9{\delta}$/11.5%), T.C ($2.2{\delta}$/10.7%), GLU ($4.8{\delta}$/10.2%), GGT ($7.5{\delta}$/27.3%), CA ($5.5{\delta}$/0.87mmol/L), IP ($8.5{\delta}$/13.17%), TG ($9.6{\delta}$/17.7%). Peer group survey median CV in Korean External Assessment greater than CLIA criteria were CL (8.45%/5%), BUN (13.3%/9%), CRE (21.8%/15%), T.B (25.6%/20%), and Na (6.87mmol/L/4mmol/L). Peer group survey median CV less than it were as TP (9.3%/10%), AST (16.8%/20%), ALT (19.3%/20%), K (0.39mmol/L/0.5mmol/L), UA (11.5%/17%), Ca (0.87mg/dL1mg/L), TG (17.7%/25%). TEa in 17 items were same one in 14 items with 82.35%. We found out the truth on increasing sigma level due to increased total error allowable, and were sure that the goal of setting total error allowable would affect the evaluation of sigma metrics in the process, if sustaining the same process.

• 한국안광학회지
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• 제11권3호
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• pp.217-223
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• 2006

본 연구를 하게 된 목적은 전국의 약 7681개의 안경업소와 안과병 의원 그리고 콘택트렌즈 전문점에서 타각적 굴절 검사를 한 후 자각적 굴절 검사를 하기 위해 사용하는 검안렌즈세트(Trial lens set)가 표준화 된 규격이 미흡하고 안광학적 허용 오차도 규정되어 있지 않고 표기된 굴절력과 실제 렌즈 도수가 상의한 것이 많아 이를 개선하고 검안렌즈 규격에 표준화를 만들고자 이 연구를 하게 되었다. 연구방법으로는 검안렌즈 세트를 사용하는 안경사들을 대상으로 보수교육을 통해 설문조사를 실시하고 국내에서 사용하는 제품과 수입 제품을 사용하는 안경원을 설정하여 이들이 사용하는 김안렌즈 세트를 사용하기에 따라 5년 미만, 5~10년, 10년 이상 각 5곳씩 검안렌즈를 선정하였으며, 표기된 굴절력과 실제렌즈를 측정하여 일본공업규격(JIS T4402)과 비교 분석하여 보았다. 분석결과를 살펴보면 검안렌즈를 사용하는 사람들이 사용 중인 접안렌즈의 굴절력에 대한 신뢰성이 응답자의 80% 이상을 차지하고 구입후 한 번도 표기된 굴절력과 실제도수를 측정해보지 않았다. 또한 한국산업규격(KS P4402)은 1979년도에 제정되어서 현재 사용하는 렌즈세트에서 빠지는 도수가 많다. 응답자의 95% 이상이 시력검사시 불편함을 느끼고 있다. 또한 굴절력에 대한 오차는 사용기간이 오래된 검안렌즈 일수록 오차가 큰 것을 알 수 있었다. 결론은 우리나라도 검안렌즈 규격을 표준화시키고 한국산업규격(KS P4402)에서 규정된 렌즈 세트에서 빠지는 도수에 대한 렌즈 세트를 추가시켜야 된다고 생각한다. 그리고 표준화된 검안렌즈를 검사 및 관리 감독하는 기관도 만들어야 한다고 생각한다. 국내에서 생산하는 제품이나 외국에서 수입되는 제품도 독일이나 일본처럼 안광학적 허용오차를 규정히여 이를 검사하고 규격에 맞는 검안렌즈 세트가 유통되기를 바란다. 국민의 안보건 향상과 시기능 관리를 위해서 정확한 시력검사를 해야 하고 누구나 똑같은 표준화된 검안렌즈 세트를 사용하고 규격과 허용오차 범위를 벗어나지 않는 검안렌즈 세트가 규정되길 바란다.

• 한국작물학회지
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• 제65권3호
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• pp.161-171
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• 2020

본 연구에서는 국내 벼 직파재배 활성화 및 재배면적 확대를 위하여 담수발아 관련 QTLs 단편이 이입된 자포니카형 우량 계통을 육성하였다. 더불어 담수 중 혐기발아 내성과 관련 분자표지를 개발하였으며, 이를 우량계통 선발에 직접 활용하였다. 인공교배를 통해 국내 자포니카 잡초벼인 PBR을 수여친으로 남평을 반복친으로 여교잡을 수행하였으며, 이 조합으로부터 담수 혐기 발아성이 개선된 자포니카 형 우량계통을 육성하였다. 그리고 혐기 발아 내성 관련 QTL 판별을 위한 CAPS 분자표지(NP01.014, NP03.077, NP11.091)를 개발하였다. 여교잡 집단을 육성하고, 작물학적 특성, 담수저항성 검정 등의 표현형 선발과 분자표지 선발을 통해 주요 농업형질, 담수 혐기 발아성이 양호한 5계통이 최종 선발되었으며, 이들 계통은 모두 QC1 혹은 QC2 조합으로 남평에 비해 온실에서 평균 2.3배, 포장에서 2.6배 가량 유묘 생존율이 개선된 것으로 나타났다. 선발된 5계통에 대한 생산력 검정 예비시험(PYT), 주요 작물학적 특성 및 담수 혐기 발아성 등의 검정을 통해 28708을 담수직파 우량계통으로 최종 선발하고 '전주643호'로 계통명을 부여하였다.

• 한국작물학회지
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• 제65권4호
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• pp.406-415
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• 2020

본 연구는 간척지 내 재배 가능한 내염성 사료용 옥수수를 선발하기 위해 EMS를 이용하여 돌연변이 집단을 구축하고 기내 선발 방법을 통해 내염성 증진 계통을 선발하였고, 연구결과는 다음과 같다. 1. 사료용 옥수수 모본인 KS140에 다양한 조건으로 EMS를 처리하여 발아율 및 식물의 생육 상태를 조사하였고, 발아율에는 영향을 미치지 않으면서 생육에 큰 영향을 주지않는 0.5% EMS를 돌연변이 유도 적정 농도로 선정하였다. 2. 기내 선발 방법을 통해 선발된 내염성 증진 계통 140ES91 계통을 이용하여 0.5% 염분 스트레스 처리 후 표현형을 조사한 결과, 대조군인 KS140 대비 식물의 초장 및 근장의 생육이 양호하였으며, 높은 proline 함량과 기공전도도를 보였다. 따라서 염분 스트레스 시 높은 proline 함량과 기공전도도가 140ES91 계통의 증가된 내염성과 관련이 있을 것으로 판단된다. 3. 내염성 증진 140ES91 계통의 유전변이 분석을 통해 유전자 기능에 영향을 미칠 수 있는 아미노산 변이를 유발하는 39개의 변이 유전자를 확인하였고, 변이 유전자와 내염성의 관계를 증명하기 위한 유전자 기능 분석이 요구된다. 4. 기 보고된 내염성 관련 유전자들의 발현 양상을 조사한 결과 ABP9과 CIPK31 유전자는 대조군 대비 염분 스트레스 처리 전후 140ES91 계통에서 높은 발현율을 보였으며, CIPK21 유전자는 염분 스트레스 처리 후 대조군에는 발현이 감소하나 140ES91 계통에서는 발현이 유지됨을 확인하였다. 따라서 140ES91 계통에서 보이는 내염성 관련 유전자들의 높은 발현율이 140ES91 계통의 내염성에 관여할 것으로 판단된다. 5. 이상의 결과 기내 선발 방법을 통해 선발한 내염성 증진 계통은 간척지와 같은 염류집적 토양에서 작물의 안정적인 재배와 생산이 가능한 내염성 증진 품종 개발의 육종소재로 활용될 수 있을 것으로 판단된다.

• 한국작물학회지
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• 제63권1호
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• pp.8-17
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• 2018

본 연구는 2013~2017년에 벼의 출수 후 적산온도에 따른 수발아 발생 양상의 품종간 차이와 연차간 변이를 조사하고, 품종간 수발아성에 관여하는 생리적 요인을 구명하고자 수행하였으며, 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 벼 품종별 수발아율은 품종 간에 크게 차이가 났으며, 다산벼, 조운벼, 남평벼가 내수발아성이 강하였고, 고품벼와 조평벼는 수발아성이 높게 나타났다. 2. 벼 품종별 수발아성은 연도에 따라 발생정도가 다르게 나타났으며, 특히 2015년과 2016년에는 대부분의 품종이 높은 수발아율을 보였다. 등숙기 기상 조건에 따라 품종간 수발아의 발생 양상이 다르게 나타났는데, 유전적인 특성과 환경 조건의 상호작용이 컸기 때문으로 보인다. 3. 출수 후 적산온도가 $800^{\circ}C$ 에서 $1200^{\circ}C$로 증가할수록 수발아성은 높아졌다. 수발아 검정 시기를 출수 후 일수로 고정하는 것보다 등숙적산온도를 기준으로 하는 것이 기상 조건에 따른 종자의 생리적 발달 단계를 적절하게 반영할 수 있으며, 적산온도 $1000^{\circ}C$에서 종자가 발아력을 충분히 갖추면서 품종간 변이계수가 큰 것으로 나타났다. 4. 출수 후 적산온도 $800^{\circ}C$ 이후 적산온도가 증가함에 따라 ABA 함량이 점차 감소하는 경향을 보였다. 그러나 ABA 함량과 벼 품종의 수발아성은 유의한 상관관계를 보이지 않았다.