Purpose: This study was conducted to analyze specific RNA expression profiles in gingival tissue and saliva samples in periodontitis patients and healthy individuals, and to determine their correlations in light of the potential use of microarray-based analyses of saliva samples as a periodontal monitoring tool. Methods: Gingival tissue biopsies and saliva samples from 22 patients (12 with severe periodontitis and 10 with a healthy periodontium) were analyzed using transcriptomic microarray analysis. Differential gene expression was assessed, and pathway and clustering analyses were conducted for the samples. The correlations between the results for the gingival tissue and saliva samples were analyzed at both the gene and pathway levels. Results: There were 621 differentially expressed genes (DEGs; 320 upregulated and 301 downregulated) in the gingival tissue samples of the periodontitis group, and 154 DEGs (44 upregulated and 110 downregulated) in the saliva samples. Nine of these genes overlapped between the sample types. The periodontitis patients formed a distinct cluster group based on gene expression profiles for both the tissue and saliva samples. Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery analysis revealed 159 enriched pathways from the tissue samples of the periodontitis patients, as well as 110 enriched pathways In the saliva samples. Thirty-four pathways overlapped between the sample types. Conclusions: The present results indicate the possibility of using the salivary transcriptome to distinguish periodontitis patients from healthy individuals. Further work is required to enhance the extraction of available RNA from saliva samples.
Robust identification of genetic alterations is important for the diagnosis and subsequent treatment of tumors. Screening for genetic alterations using tumor tissue samples may lead to biased interpretations because of the heterogeneous nature of the tumor mass. Liquid biopsy has been suggested as an attractive tool for the non-invasive follow-up of cancer treatment outcomes. In this study, we aimed to verify whether the mutations identified in primary tumor tissue samples could be consistently detected in plasma cell-free DNA (cfDNA) by digital polymerase chain reaction (dPCR). We first examined the genetic alteration profiles of three colorectal cancer (CRC) tissue samples by targeted next-generation sequencing (NGS) and identified 11 non-silent amino acid changes across six cancer-related genes (APC, KRAS, TP53, TERT, ARIDIA, and BRCA1). All three samples had KRAS mutations (G12V, G12C, and G13D), which were well-known driver events. Therefore, we examined the KRAS mutations by dPCR. When we examined the three KRAS mutations by dPCR using tumor tissue samples, all of them were consistently detected and the variant allele frequencies (VAFs) of the mutations were almost identical between targeted NGS and dPCR. When we examined the KRAS mutations using the plasma cfDNA of the three CRC patients by dPCR, all three mutations were consistently identified. However, the VAFs were lower (range, 0.166% to 2.638%) than those obtained using the CRC tissue samples. In conclusion, we confirmed that the KRAS mutations identified from CRC tumor tissue samples were consistently detected in the plasma cfDNA of the three CRC patients by dPCR.
Background: Lung cancer is the leading cause of cancer death in Brunei Darussalam, accounting for almost 20% of the total. The epidermal growth factor receptor (EGFR) is a member of the erbB family of tyrosine kinase receptor proteins, which includes c-erbb2(HER2/neu), erb-B3, and erb-B4. EGFR overexpression is found in a third of all epithelial cancers, often associated with a poor prognosis. Materials and Methods: Protein expression of EGFR in 27 cases of lung cancer tissue samples and 9 cases of normal lung tissue samples was evaluated using an immunohistochemical approach. Results: The results demonstrated significant increase and overexpression of EGFR in Bruneian lung cancer tissue samples in comparison to normal lung tissue. However, there was no significant relationship between clinicopathologic variables (age and sex) of patients and EGFR protein expression. Conclusions: EGFR is overexpressed in Bruneian lung cancer patient tissue samples in comparison to normal lung tissue samples. This may indicate that EGFR protein over expression plays an important role in the genesis of this type of cancer in Brunei Darussalam.
The aim of this series of experiments was to examine the opportunity for application of X-ray computer tomography (CT) in cattle production. Firstly, tissue composition of M. longissimus dorsi (LD) cuts between the $11-13^{th}$ ribs (in Exp 1. between the $9-11^{th}$ ribs), was determined by CT and correlated with tissue composition of intact half carcasses prior to dissection and tissue separation. Altogether, 207 animals of different breeds and genders were used in the study. In Exp. 2 and 3, samples were taken from LD cuts, dissected and chemical composition of muscle homogenates was analysed by conventional procedures. Correlation coefficients were calculated among slaughter records, tissues in whole carcasses and tissue composition of rib samples. Results indicated that tissue composition of rib samples determined by CT closely correlated with tissue composition results by dissection of whole carcasses. The findings revealed that figures obtained by CT correlate well with the dissection results of entire carcasses (meat, bone, fat). Close three-way coefficients of correlation (r = 0.80-0.97) were calculated among rib eye area, volume of cut, pixel-sum of adipose tissue determined by CT and intramuscular fat or adipose tissue in entire carcasses. Estimation of tissue composition of carcasses using equations including only CT-data as independent variables proved to be less reliable in prediction of lean meat and bone in carcass ($R^2 = 0.51-0.86$) than for fat (($R^2 = 0.83-0.89$). However, when cold half carcass weight was also included in the equation, the coefficient of determination exceeded $R^2 = 0.90$. In Exp. 3 tissue composition of rib samples by CT were compared to the results of EUROP carcass classification. Findings revealed that CT analysis has higher predictive value in estimation of actual tissue composition of cattle carcasses than EUROP carcass classification.
This study is concerned with the temperature dependence characteristics of ultrasound parameters in biological tissues, which are basic on the noninvasive deep body temperature estimation. Used parameters are ultrasonic attenuation coefficient and sound velocity In order to accomplishment our purpose, several signal processing methods were used. Attenua4iorl coefficient was estimated by spectral difference method and sound velocity was estimated by P-P method. And we also examined these methods through a series of IN VITRO experi mentis that used tissue-mimicking phantom samples and biological tissue samples. In order to imitate the biological soft tissue two kinds of phantom samples are used, one is agar phantom sample which is composed of agar, graphite, N-propyl alcohol and distilled water, and the other is fat phantom sample which is composed of pure animal fat. And the ultrasound transmission mode and reflection mode experiments are performed on the pig's spleen, kidney and fat. As a result, it is found that the temperature characteristics are uniform in case of phan- tom samples but not in biological tissues because of complicate wave propagation within them. Consequently, the possibility of temperature measurement using ultrasound on biological tissue is confirmed and its results may contribute to the establishment of reference values of internal temperature measurement of biological tissues.
Background Diabetes is characterized by chronic hyperglycemia, which can increase reactive oxygen species (ROS) production by the mitochondrial electron transport chain. The formation of ROS induces oxidative stress and activates oxidative damage-inducing genes in cells. No research has been published on oxidative damage-related extracellular superoxide dismutase (EC-SOD) protein levels in human diabetic skin. We investigated the expression of EC-SOD in diabetic skin compared with normal skin tissue in vivo. Methods The expression of EC-SOD protein was evaluated by western blotting in 6 diabetic skin tissue samples and 6 normal skin samples. Immunohistochemical staining was also carried out to confirm the EC-SOD expression level in the 6 diabetic skin tissue samples. Results The western blotting showed significantly lower EC-SOD protein expression in the diabetic skin tissue than in the normal tissue. Immunohistochemical examination of EC-SOD protein expression supported the western blotting analysis. Conclusions Diabetic skin tissues express a relatively small amount of EC-SOD protein and may not be protected against oxidative stress. We believe that EC-SOD is related to the altered metabolic state in diabetic skin, which elevates ROS production.
Li, S.X.;Chai, L.;Cai, Z.G.;Jin, L.J.;Chen, Y.;Wu, H.R.;Sun, Z.
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
제13권10호
/
pp.5027-5031
/
2012
This study was conducted to investigate the expression of survivin and caspase 3 in oral squamous cell carcinoma and peritumoral tissue, and possible pathogenesis mechanisms. We used ELISA and western blotting to detect the protein expression levels of survivin and caspase 3 in tissue. In situ hybridization and real-time PCR were applied to assess mRNA expression levels. In this study, 13 tumor samples and 13 peritumoral tissue samples were collected from oral squamous cell carcinoma patients and 10 normal tissue samples obtained from patients without tumor. The result showed that the protein and mRNA expression of survivin in carcinoma was the highest among three types of tissue; following was that in peritumoral tissue. No difference in caspase 3 zymogen between peritumoral tissue and normal tissue could be found, while it was evidently decreased in carcinoma tissue. Activated caspase 3 was detected in normal tissue but could not be identified in peritumoral or carcinoma tissue. Our results indicate that the expression of survivin is apparently elevated in tumoral and peritumoral tissue. Expression of activated caspase 3 was not detected in tumoral tissue and the expression of caspase 3 zymogen was decreased in tumoral tissue. Our findings suggest that survivin may inhibit both synthesis and activation of caspase 3, hence inhibiting cell apoptosis and facililitating eventual development of oral squamous cell carcinoma.
Purpose: The purpose of this study was to quantify and compare the expressions of CRP and M-CSF in the gingival tissues of the patients with chronic periodontitis associated to hypertension. Methods: Gingival tissue samples were obtained during periodontal surgery or tooth extraction. Clinically healthy gingival tissue samples from systemically healthy 12 patients were categorized as group 1 (n=12). Inflammatory gingival tissue samples from patients with chronic periodontitis were categorized as group 2 (n=12). Inflammatory gingival tissue samples from patients with chronic periodontitis associated with hypertension were categorized as group 3 (n=12). Tissue samples were prepared and analyzed by Western blotting. The quantification of CRP and M-CSF were performed using a densitometer and statistically analyzed by one-way ANOVA followed by Tukey test. Results: There were significant differences between group 1 and group 2 and between group 1 and group 3 in both CRP and M-CSF. The differences between group 2 and group 3 were not statistically significant in both proteins. However, the expression levels of CRP and M-CSF in hypertensive inflammatory gingiva showed increased tendency compared to non-hypertensive inflammatory gingiva. Conclusions: It is suggested that CRP and M-CSF might be used as inflammatory and bone resorption markers in periodontal diseased tissue. It is assumed that hypertension may be associated with the progression of periodontal inflammation and alveolar bone resorption.
A total of 782 blood and 465 tissue samples from 1,039 wild animals and 127 dairy goats were collected from January 2011 to December 2013 in 10 provinces of South Korea and tested for the presence of brucellosis. The Rose Bengal test revealed that 8.0% (52/650) of the serum samples were seropositive, while 4.2% (33/782) of the serum samples were positive for Brucella antibodies by competitive enzyme-linked immunosorbent assay. Of the 650 sera examined, only 16 (2.5%) were positive by both serological tests. Direct polymerase chain reaction (PCR) assay using B4/B5 primers for Brucella abortus (BCSP31) revealed the prevalence of Brucella to be 26.5% (129/487) in blood samples and 21% (98/465) in tissue samples while, 16S rRNA PCR detected Brucella DNA in 6.8% (33/487) and 2.6% (12/465) in blood and tissue samples, respectively. Of PCR-positive samples, only 6.2% (30/487) of blood samples and 2.4% (11/465) of tissue samples were found to be positive by both BCSP31 and 16S rRNA PCRs. However, Brucella strains were isolated by blood culture from only two out of 487 blood samples (0.4%). This characterization and identification of pathogenic Brucella isolates is the first to clearly indicate that the organisms were Brucella abortus biovar 1.
To control the maximum residue level (MRL) for sulfamethazine (SMZ) residues in pork tissue, a microbial inhibition method is a regulatory screening assay method in Korea. Microwell plate-based competitive enzyme immunoassay (ELISA) kit is avalable for routine screening of SMZ residues in pork tissue. One ELISA kit is evaluated. Phosphate buffer extracts of samples fortified with SMZ at 0, 1, 5, and 10 ng/g were used in a recovery test of the kit. Market pork samples were assayed by the kit. Recovery of sulfamethazine was 104% at 10 ng/g. Intraassay variations and interassay variations for the kit were 7.70% and 5.76%, respectively. Concentration causing 50% inhibition of color development compared with blanks was 16.4ng. The violative pork samples with over MRL (0.1 $\mu\textrm{g}$/g) was 4 of 32 cases (12.5%) by used ELISA kit. This result indicates a possibility of the ELISA kit for screening test of SMZ residues in pork tissue, and still needs a comfirmatory assay for mandatory purposes.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.