• 생명과학회지
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• 제26권8호
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• pp.963-969
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• 2016

Kinesin superfamily proteins (KIFs)은 세포 내 소기관이나 단백질복합체를 미세소관을 따라 운반하는 모터단백질이다. Kinesin 1은 경쇄단위체(light chain subunit)를 통하여 결합함으로써 세포 내 소기관, 신경소포, 신경전달물질수용체, 신호전달단백질, mRNA 등 다양한 운반체를 운반하는 KIFs의 한 종류이다. Kinesin light chains (KLCs)은 모터기능이 없는 단위체로서 kinesin heavy chains (KHCs) 이량체와 결합하여 kinesin 1을 구성한다. KLCs은 여러 단백질과 결합하지만 아직 결합단백질이 충분히 밝혀지지 않았다. 본 연구에서 KLC1의 tetratricopeptide repeat (TPR) 영역과 결합하는 단백질을 분리하기 위하여 효모 two-hybrid 탐색을 수행한 결과 Wiskott-Aldrich syndrome의 원인단백질이며 액틴 세포골격 조절단백질인 WASP/WAVE family의 하나인 WAVE1을 분리하였다. WAVE1은 KLC1의 TPR 영역을 포함한 부위와 결합하지만 KHCs인 KIF5A, KIF5B, KIF5C와는 결합하지 않았다. 또한 KLC1은 WAVE1의 C-말단에 존재하는 verprolin/cofilin/acidic (VCA) 도메인과 결합하였으며, 다른 WAVE isoform인 WAVE2와 WAVE3과도 결합하였다. HEK-293T 세포에 WAVE1과 KLC1을 동시에 발현시켰을 때 두 단백질이 세포 내에서 같은 부위에 존재하며, WAVE1을 면역침강한 결과 KLC1뿐만 아니라 KIF5B가 같이 침강함을 확인하였다. 이러한 결과들은 kinesin 1이 WAVE 단백질복합체 혹은 WAVE로 덮여있는 운반체를 운반함을 시사한다.

• 생명과학회지
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• 제22권12호
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• pp.1608-1613
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• 2012

KIF5/Kinesin-I는 경쇄(light chain)를 통하여 결합함으로써 다양한 운반체들을 미세소관을 따라 운반한다. Kinesin light chains (KLCs)은 tetratricopeptide repeat (TPR) 영역을 매개로 운반체와 결합한다. 현재까지 KLCs와 결합하는 많은 운반체들이 확인되었으나 KLCs가 어떻게 특정운반체를 인식하여 결합하는지는 아직 확실히 밝혀지지 않았다. 본 연구에서 KLC1의 TPR 영역과 결합하는 단백질을 분리하기 위하여 효모 two-hybrid system을 이용하여 탐색한 결과 amyloid precursor protein (APP)과 결합하는 것으로 보고된 protein interacting with APP tail 1 (PAT1)을 분리하였다. KLC1은 PAT1의 C-말단 부위와 결합하며, PAT1은 KLC1의 TPR 영역을 포함한 부위와 결합함을 효모 two-hybrid assay로 확인하였다. 또한 PAT1는 KLC2와도 결합하였지만 kinesin heavy chains (KHCs)인 KIF5A, KIF5B, KIF5C와는 결합하지 않았다. 단백질간 결합은 glutathione S-transferase (GST) pull-down assay와 공동면역침강으로도 확인하였다. 생쥐의 뇌 파쇄액을 PAT1 항체와 APP 항체로 면역침강을 행한 결과 KLC와 KHCs가 같이 침강하였다. 이러한 결과들은 PAT1이 Kinesin-I와 APP 포함 소포간의 상호작용을 매개한다는 것을 시사한다.

• 미생물학회지
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• 제41권4호
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• pp.246-254
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• 2005

Neurospora crassa의 게놈 분석을 통하며 tetratricopeptide repeat (TPR) 부위를 보유할 것으로 추정되는 19중의 단배질을 찾아냈다. 이중에서 한 단백질은 Saccharomyces cerevisiae에서 다양한 유전자들의 공통 전사 억제인자로 알려진 Ssn6 단백질에 $60\%$ 이상의 유사도를 보였다. N. crassa의 RIP (repeat-induced point mutation) 과정을 통하여 생산된 돌연변이 균주들은 도두 느리게 성장하였는데, 4가지로 구분되는 돌연변이 표현형을 나타냈다. 첫 번째 돌연변이 표현형은 균사가 ropy돌연변이와 유사한 균사 모양으로 성장하고 밀도가 높아 보였고, 대분생포자는 yellow와 csp 표현형을 보였다. 두 번째 돌연변이형은 늦은 성장을 보였지만 대분생포자를 생산하였다. 세 번째는 매우 느린 균사 성장을 보였고 acon 표현형을 나타냈다. 마지막 돌연변이형은 거의 공기 중으로 균사를 뻗지 못하였으며 acon 표현형을 보였는데, rco-1 RIP 돌연변이체와 유사하였다. 돌연변이체들은 모두 male로서는 수정능을 보였지만 female로서는 교배가 불가능했으며 자낭각을 생산하지 못하였다. 이 결과들은 이 유전자가 N. crassa의 성장은 물론 무성생식 및 유성생식의 여러 과정에 관여함을 나타낸다. 염색체와 cDNA의 서열을 분식한 결과에 따르면, 유전자가 6개의 인트론을 보유하고 있고, 총917개의 아미노산으로 구성된 102kDa의 단백질을 암호화할 것으로 예상되었다. 이 유전자를 rcm-1 (regulation of conidiation and morphology)으로 명명하였다.

• 한국미생물학회:학술대회논문집
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• 한국미생물학회 2003년도 International Meeting of the Microbiological Society of Korea
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• pp.51-54
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• 2003

Analysis of the Neurospora crassa genome data reveals at least 14 proteins that contain tetratricopeptide repeat (TPR) motifs. One of them shows over $60\%$ homology with SSN6 of Saccharomyces cerevisiae, a global repressor that mediates repression of genes involved in various cellular processes. Sequence analysis of its cDNA shows that it encodes a putative 102kDa protein. Mutant strains generated by RIP (repeat induced point mutation) process show four distinctive patterns of vegetative growth at various rates. They are male-fertile, yet all female-sterile and produced little or no perithecium. These results indicate that this gene is pleiotropic and involved in several cellular processes of vegetative growth, conidiation and sexual cycle. It is designated rcm-1(regulation of conidiation and morphology).

• 생명과학회지
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• 제30권1호
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• pp.10-17
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• 2020

Kinesin 1은 미세소관을 따라 plus말단으로 이동하는 모터단백질로 세포내 물질 수송에 관여한다. Kinesin 1은 경쇄단위체(light chain subunit)를 통하여 운반체들인, 세포내 소기관, 다양한 소포체, 신경전달물질 수용체 단백질, 세포신호전달 단백질과 여러 단백질 복합체들과 결합하여 운반하는 kinesin superfamily protein (KIFs)의 한 종류이다. Kinesin light chains 1 (KLC1)은 모터 기능이 없는 단위체로서 kinesin heavy chain (KHC)과 결합한다. KLC1은 다양한 매개단백질들과 결합하지만 아직 결합하는 매개단백질이 충분히 밝혀지지 않았다. 본 연구에서는 KLC1의 tetratricopeptide repeat (TPR) 영역과 결합하는 단백질을 분리하기 위하여 효모 two-hybrid 탐색한 결과 EH domain-binding protein 1-like 1 (EHBP1L1) 을 분리하였다. EHBP1L1은 KLC1의 TPR 영역을 포함한 부위와 결합하지만 KIF5B (kinesin 1의 모터 단백질)과 KIF3A (kinesin 2의 모터 단백질)와는 결합하지 않았다. 또한 KLC1은 EHBP1L1의 C-말단에 존재하는 coiled-coil 도메인과 결합하였으며, 다른 EHBP1L1의 isoform인 EHBP1과는 결합하지 않았다. KLC1은 GST와는 결합하지 않지만 GST-EHBP1L1과 GST-EHBP1L1-coiled-coil domain과는 결합하였다. HEK-293T세포에 EHBP1L1과 KLC1을 동시에 발현시켰을 때 두 단백질은 세포 내에서 같은 부위에 존재하며, EHBP1L1을 면역침강한 결과 KLC1뿐만 아니라 KIF5B와도 같이 침강함을 확인하였다. 이러한 결과들은 kinesin 1은 EHBP1L1이 결합한 운반체를 수송함을 시사한다.

• International Journal of Advanced Culture Technology
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• 제7권4호
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• pp.156-162
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• 2019

Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic autoimmune disorder characterized by progressive joint deterioration; Furthermore, RA can also affect body tissues, including the skin, eyes, lungs, heart and blood vessels. The early stages of RA can be difficult to diagnose because the signs and symptoms mimic those of many other diseases. It is not known exactly what triggers the onset of RA and how to cure the disease. But recent discoveries indicate that remission of symptoms is more likely when treatment begins early with strong medications known as disease-modifying anti-rheumatic drugs (DMARDs). Tumor necrosis factor (TNF) inhibitors are typical examples of biotherapies that have been developed for RA. The substances may occur naturally in the body or may be made in the laboratory. Other biological therapies care biological response modifiers (BRMs)such as monoclonal antibodies, interferon, interleukin-2 (IL-2) and a protein binder using repeat units. These substances play significant anti-inflammatory roles. Proteins with recurrent, conserved amino acid stretches mediate interactions among proteins for essential biological functions; for example, ankyrin (ANK), Heat repeat protein (HEAT), armadillo repeat protein (ARM) and tetratricopeptide repeats (TPR). Here, we describe Leucine rich repeats (LRR) that ideally fold together to form a solenoid protein domain and is more applicable to our current study than the previously mentioned examples. Although BRMs have limitations in terms of immunogenicity and effector functions, among other factors, in the context therapeutic use and for proteomics research, We has become clear that repeat-unit-derived binding proteins will increasingly be used in biotechnology and medicine.

• Molecules and Cells
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• 제24권1호
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• pp.27-36
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• 2007

The hypothetical protein TTC0263 of Thermus thermophilus HB27 is a thermophilic tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein. In the present study, the TPR region (residues 26-230) was resolved at $2.5{\AA}$ with R-factors of $R/R_{free}$ = 23.6%/28.6% $R/R_{free}=23.6%/28.6%$. TTC0263 consists of 11 helices that form five TPR units. Uniquely, it contains one atypical "extended" TPR (eTPR) unit. This comprises extended helical residues near the loop region of TTC0263, such that the helical length of eTPR is longer than that of the canonical TPR sequence. In addition, the hybrid TPR domain of TTC0263 possesses oligomer-forming characteristics. TPR domains are generally involved in forming multi-subunit complexes by interacting with each other or with other subunit proteins. The dynamic structure of TTC0263 described here goes some way to explaining how TPR domains mediate the formation of multi-subunit complexes.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제19권2호
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• pp.121-127
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• 2009

Sequencing analysis of a 5-kb DNA fragment from Streptomyces venezuelae ATCC 15439 revealed the presence of one 3.1-kb open reading frame(ORF), designated as afsR-sv. The deduced product of afsR-sv(1,056 aa) was found to have high homology with the global regulatory protein AfsR. Homology-based analysis showed that aftR-sv represents a transcriptional activator belonging to the Streptomyces antibiotic regulatory protein(SARP) family that includes an N-terminal SARP domain containing a bacterial transcriptional activation domain(BTAD), an NB-ARC domain, and a C-terminal tetratricopeptide repeat domain. Gene expression analysis by reverse transcriptase PCR(RT-PCR) demonstrated the activation of transcription of genes belonging to pikromycin production, when aftR-sv was overexpressed in S. venezuelae. Heterologous expression of the aftR-sv in different Streptomyces strains resulted in increased production of the respective antibiotics, suggesting that afsR-sv is a positive regulator of antibiotics biosynthesis.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제17권4호
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• pp.257-262
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• 2014

Severe combined immunodeficiency (SCID) is a life-threatening syndrome of recurrent infections and gastro-intestinal alterations due to severe compromise of T cells and B cells. Clinically, most patients present symptoms before the age of 3 months and without intervention SCID usually results in severe infections and death by the age of 2 years. Its association with intestinal anomalies as multiple intestinal atresias (MIA) is rare and worsens the prognosis, resulting lethal. We describe the case of a four year-old boy with SCID-MIA. He presented at birth with meconium peritonitis, multiple ileal atresias and underwent several intestinal resections. A targeted Sanger sequencing revealed a homozygous 4-bp deletion ($c.313{\Delta}TATC$; p.Y105fs) in tetratricopeptide repeat domain 7A (TTC7A). He experienced surgical procedures including resection and stricturoplasty. Despite parenteral nutrition-associated liver disease, the patient is surviving at the time of writing the report. Precocious immune system assessment, scrutiny of TTC7A mutations and prompt surgical procedures are crucial in the management.