• 미생물학회지
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• 제54권4호
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• pp.480-482
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• 2018

이 연구에서는 Illumina Hiseq platform을 사용하여 동해 심층 해양수로부터 분리된 Zhongshania marina $DSW25-10^T$의 유전체 염기서열 해독을 수행하였다. 그 결과, 유전체는 대략 4.08 Mbp의 길이 및 49.0%의 G + C 함량으로 구성되었고, 전체 3,702개의 단백질 암호 유전자, 3개의 rRNA 유전자, 39개의 tRNA 유전자, 4개의 non-coding RNA 유전자 및 36개의 위 유전자(pseudogenes)가 확인되었다. 또한, 지방족 및 방향족 화합물의 대사 경로가 확인되었다. 이러한 대사 경로들로 비추어 Zhongshania marina $DSW25-10^T$는 유용한 생물 정화 자원으로 사용될 수 있을 것으로 기대된다.

• 한국식품영양과학회지
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• 제21권6호
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• pp.681-685
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• 1992

돼지고기에서 분리한 bacteriocin 생성능이 우수한 젖산균을 동정하기 위하여 이미 알려진 몇가지 젖산균을 참고균으로 하여 10% denaturing polyacrylamide gel에 전기영동으로 전개한 5S rRNA 와 tRNA 등 150개 이하의 핵산으로 구성된 저분자량 RNA(Low Molecular Weight RNA : LMW RNA) profiles에 나타난 15~25개의 밴드 양상이 균에 따라 차이점을 보여 동정에 효과적으로 이용할 수 있었다. 새로 분리한 젖산균은 참고균과는 다른 균종이었다. APT, TSB, MRS의 3종류 다른 배지에서 배양하여도 LMW RNA profiles에는 차이가 없었으며, 겔상의 밴드 전개거리를 3개의 표준 분자량 물질을 이용하여 만든 표준곡선을 사용하여 상대핵산단위(relative nucleotide units : RNU)로 나타낸 밴드의 양상을 도표화 하는 것이 profiles를 서로 비교 하는데 편리하였다.

• 미생물과산업
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• 제14권1호
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• pp.7-11
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• 1988

Efficient in vitro RNA synthesis can be easily accomplished from cloned DNA using bactrio-phage SP6, T7 or T3 RNA polymerase. Despite its popularity as in vitro transcription system, molecular mechanisms of bacteriophage transcription has not been studied, although physical and catalytic properties of several phage RNA polymerases have well been documented (1). Only recently the T7 promoter has been physically mapped by footprinting of the T7 RNA polymerase (2,3). These simple phage systems, however, could be useful for detailed molecular studies of transcription.

• 한국생물물리학회:학술대회논문집
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• 한국생물물리학회 1998년도 학술발표회
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• pp.20-20
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• 1998

In mammalian cells, nine aminoacyl-tRNA synthetase, including aspartyl-tRNA synthetase, are associated within a multienzyme complex. Human aspartyl-tRNA synthetase contains a unique N-terminal polypeptide that is thought to be responsible for the complex formation.(omitted)

• 미생물학회지
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• 제24권4호
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• pp.400-405
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• 1986

이미 발표된 각 시료들의 tRNAAn 염기 서열을 이용하여 세통학적 연구플 하였나. archaebacterium안 H. volcano가 진핵생물과 연계된 결과는 진핵생물이 eubacteria와의 공통척 조상에셔 분화되지 않았음을 세시하며 Phage $T_{4}$와 $T_{s}$,의 연계 순서는 그들이 각각 독럽적으로 숙주로부터 분화되였음을 내타낸다. tRNA의 염기 순서의 상관관계를 이용한 연구 결과가 기존의 다른 연구 결고 및 고생물학적 기록들과도 일치함을 알 수 있었다.

• 한국잠사곤충학회지
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• 제42권1호
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• pp.14-23
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• 2000

The mitochondrial genome of domesticated silkworm (Bombyx mori) was mapped with five restriction endonucleases (BamHI, EcoRI, HindIII, PstI and XbaI), the entire genome was cloned with HindIII and EcoRI. From the end sequencing results of 5$^1$and 3$^1$region for full genome set of eleven mitochondrial clones, the seven mitochondrial genes (NADH dehydrogenase 6, ATPase 6, ATPase 8, tRN $A^{Lys}$, tRN $A^{Asp}$, tRN $A^{Thr}$ and tRN $A^{Phe}$ of mori were identified on the basis of their nucleotide sequence homology. The nucleotide composition of NADH dehydrogenase 6 was heavily biased towards adenine and thymine, which accounted for 87.76%. On basis of the sequence similarity with published tRNA genes from six insect species, the tRN $A^{Lys}$, tRN $A^{Asp}$ and tRN $A^{Thr}$ were showed stable canonical clover-leaf tRNA structures with acceptible anticodons. However, both the DHU and T$\psi$C arms of tRN $A^{Phe}$ could not form any stable stem-loop structure. The two overlapping gene pairs (tRN $A^{Lys}$ -tRN $A^{ASP}$ and ATPase8-ATPase6) were found from our sequencing results. The genes are encoded on the same strad. ATPase8 and ATPase6 overlaps (ATGATAA) which are a single example of overlapping events between abutted protein-coding genes are common, and there is evidence that the two proteins are transcribed from a single bicistronic message by initiation at 5$^1$terminal start site for ATPase8 and at an internal start site for ATPase6. Ultimately, this result will provide assistance in designing oligo-nucleotides for PCR amplification, and sequencing the specific mitochondrial genes for phylogenetics of geographic races, genetically improved silkworm strains and wild silkworm (mandarina) which is estimated as ancestal of domesticated silkworm.sticated silkworm.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제13권2호
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• pp.287-291
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• 2003

Botulinum neurotoxin type A (BONT/A) is an extremely potent toxin, which is produced by Clostridium botulinum. The light chain of this protein (BONT/A LC), which is known as a zinc endopeptidase, cleaves SNAP-25 involved in the exocytosis process. In this work, the expression of recombinant BoNT/A LC in E. coli is described. The BONT/A LC gene of C. botulinum contains a high frequency of the arginine AGA and isoleucine ATA codons that are rarely used in genes of E. coli, hampering the translation of recombinant protein. The argD and ilex tRNA genes were cloned into pACYC184 vector, resulting in pAAD131X plasmid. The translational stress of the toxin gene related to codon bias was reversed by fupplernentation of the AGA arginyl tRNA of T4 phage and AUA isoleucyl tRNA of E. coli. This system may be applicable for the expression of a variety of AT-rich heterologous genes in E. coli.

• Molecules and Cells
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• 제23권2호
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• pp.182-191
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• 2007

The complete mitochondrial genome of a troglobite millipede Antrokoreana gracilipes (Verhoeff, 1938) (Dipolopoda, Juliformia, Julida) was sequenced and characterized. The genome (14,747 bp) contains 37 genes (2 ribosomal RNA genes, 22 transfer RNA genes and 13 protein-encoding genes) and two large non-coding regions (225 bp and 31 bp), as previously reported for two diplopods, Narceus annularus (order Spirobolida) and Thyropygus sp. (order Spirostreptida). The A + T content of the genome is 62.1%, and four tRNAs ($tRNA^{Ser(AGN)}$, $tRNA^{Cys}$, $tRNA^{Ile}$ and $tRNA^{Met}$) have unusual and unstable secondary structures. Whereas Narceus and Thyropygus have identical gene arrangements, the $tRNA^{Thr}$ and $tRNA^{Trp}$ of Antrokoreana differ from them in their orientations and/or positions. This suggests that the Spirobolida and Spirostreptida are more closely related to each other than to the Dipolopoda. Three scenarios are proposed to account for the unique gene arrangement of Antrokoreana. The data also imply that the Duplication and Nonrandom Loss (DNL) model is applicable to the order Julida. Bayesian inference (BI) and maximum likelihood (ML) analyses using amino acid sequences deduced from the 12 mitochondrial protein-encoding genes (excluding ATP8) support the view that the three juliformian members are monophyletic (BI 100%; ML 100%), that Thyropygus (Spirostreptida) and Narceus (Spirobolida) are clustered together (BI 100%; ML 83%), and that Antrokoreana (Julida) is a sister of the two. However, due to conflict with previous reports using cladistic approaches based on morphological characteristics, further studies are needed to confirm the close relationship between Spirostreptida and Spirobolida.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제32권10호
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• pp.3779-3782
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• 2011

• Journal of Oral Medicine and Pain
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• 제34권4호
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• pp.363-369
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• 2009

미란형 구강편평태선과 재발성 아프타성 구내염은 T림프구에 의해 매개되는 염증성 면역질환이다. T림프구에 영향을 주는 다양한 조절 인자들 중 CD28, CD45, CD152, CD154, CD279등의 mRNA가 미란형 구강편평태선 및 재발성 아프타성 구내염 환자들의 비자극성 전타액내에서 어떻게 발현되는지를 살펴보고, 이것의 진단학적 가치를 평가하고자 한다. 미란형 구강편평태선으로 진단받은 환자군 18명, 재발성 아프타성 구내염으로 진단받은 환자군 12명, 정상군 8명에게서 비자극성 전타액을 10분간 채득한 후, 상피세포를 분리하여 mRNA를 추출하였다. Real time PCR을 이용하여 각 군의 T림프구 조절 인자들의 mRNA 발현 양상을 비교분석하였다. 미란형 구강편평태선의 T림프구 조절인자들의 mRNA 발현 양상은 정상인과 비교 결과, CD45, CD279는 높게 측정되었고, CD154는 낮게 측정되었다. 재발성 아프타성 구내염 환자들의 T림프구 조절인자들의 mRNA 발현 양상은 정상인과 비교 결과, CD45, CD279는 높게 발현되었고, CD28, CD154는 낮게 발현되었다. 부가적으로 미란형 구강편평태선 환자군의 타액내 CD152의 발현 양상은 재발성 아프타성 구내염 환자군보다 높게 발현되었다. 미란형 구강편평태선과 재발성 아프타성 구내염 환자들의 비자극성 전타액내 T림프구 조절인자들의 mRNA 발현 양상은 각 질환의 진단에 기여할 수 있을 것으로 사료된다.