• 미생물학회지
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• 제44권1호
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• pp.29-36
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• 2008

질소는 하수처리과정에서 제거되어야 하는 주요 오염물질 중의 하나이며, 세균 군집을 이용한 고도처리 시스템에서 생물학적 질소제거는 중요한 기술이다. 질산화반응은 생물학적 질소제거 시스템의 첫 단계로 미생물에 의해 진행된다. 암모니아는 암모니아산화세균에 의해 아질산염으로 산화되며, 그 후에 아질산염은 아질산염 산화세균에 의해 질산염으로 산화된다. 실험실 규모의 생물학적 질소제거 시스템인 변형된 eBAF 시스템, Nutrient removal laboratory 시스템과 반추기법을 적용한 rSBR 시스템의 질산화반응조 시료에서 16S rRNA 유전자를 이용한 terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) 방법으로 아질산염 산화세균군집을 분석하였다. 제한효소로 형성된 단편의 클러스터분석에서 Nitrobacter 군집은 각각의 폐수처리 시스템에 따라 군집의 차이가 있음이 나타났다. 그러나 Nitrospira 군집의 클러스터분석에서는 액체와 담체의 서식지 환경 차이에 의해 군집이 구분되었다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제52권1호
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• pp.79-83
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• 2014

Human taeniases had been not uncommon in the Republic of Korea (=Korea) until the 1980s. The prevalence decreased and a national survey in 2004 revealed no Taenia egg positive cases. However, a subsequent national survey in 2012 showed 0.04% (10 cases) prevalence of Taenia spp. eggs suggesting its resurgence in Korea. We recently encountered 4 cases of Taenia saginata infection who had symptoms of taeniasis that included discharge of proglottids. We obtained several proglottids from each case. Because the morphological features of T. saginata are almost indistinguishable from those of Taenia asiatica, molecular analyses using the PCR-RFLP and DNA sequencing of the cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) were performed to identify the species. The PCR-RFLP patterns of all of the 4 specimens were consistent with T. saginata, and the cox1 gene sequence showed 99.8-100% identity with that of T. saginata reported previously from Korea, Japan, China, and Cambodia. All of the 4 patients had the history of travel abroad but its relation with contracting taeniasis was unclear. Our findings may suggest resurgence of T. saginata infection among people in Korea.

• 한국산림과학회지
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• 제96권2호
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• pp.131-137
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• 2007

The first evidence has been provided about the variation within trnL-trnV and trnF-trnT spacer regions of cpDNAs in Korean fir and Manchurian fir, revealed by PCR-RFLP analysis. Four cpDNA haplotypes have accordingly been recognized by being analyzed using the trnL-trnV/Tru11 primer-enzyme combination and 3 haplotypes using the trnF-trnT/TagI combination, which exhibited inter and intraspecific variation. A total of 6 cpDNA haplotypes were recognized by pooling the PCR-RFLP variants observed in both combinations. Haplotypes 2 and 3 were common for both species investigated, whereas haplotypes 1, 4, and 5 were detected only in Korean fir and haplotype 6 was detected only in Manchurian fir. Although haplotypes 2 and 3 were common in both species, haplotype 2 was major haplotype for Korean fir and haplotype 3 was one of the 2 major haplotypes for Manchurian fir. Restricted occurrence of haplotype 4 in Mt. Halla and haplotype 5 in Mt. Jiri of the Korean fir may represent the existence of geographic isolation by the sea between them. Diagnostic potential of individual haplotypes in discriminating between the two species as well as between their populations is discussed.

• 한국양봉학회지
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• 제33권4호
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• pp.227-237
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• 2018

The majority parasitic bee mites of Thailand in genus Tropilaelaps are infesting colonies of native bees (Apis dorsata) and introduced bees (A. mellifera). The investigation aims to study morphological and genetic variation of Tropilaelaps mites infected different hosts. Adult mites were collected from honey bee brood throughout Thailand. Traditional and geometrical morphometrics were measured on photograph by using TPS program. Additional, COI gene variations were examined by PCR-RFLP and nucleotides sequencing. Tree of mites relationships were constructed by NJ and MP assumptions. Morphometric results indicated T. mercedesae were major species infesting on A. dorsata and A. mellifera. Mophological variation represented at anal and epigynial plate, which the shape of the anal plate apex margin has been key character to identify between T. mercedesae (bell to blunt shape) and T. koenigerum (pear shape). However, the discriminant analysis suggested that geometric results were potential to classify Thai Tropilaelaps populations from different hosts better than traditional morphometric. Otherwise, PCR-RFLP clearly detected the site of Dra I and Xba I digestion of Thai Tropilaelaps morphotypes. The COI sequences of T. koenigerum were founded infesting only A. dorsata in Thailand and four sequences that related to the Thai T. mercedesae morphotypes. The NJ and MP tree were clearly classified Thai Tropilaelaps species which were suggested both from morphological and molecular analysis. This information might be basically of taxonomic status, but this should have implication for controlling these mites in Thailand and other countries.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제46권6호
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• pp.917-924
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• 2004

미토콘드리아 ND2 유전자와 세 가지 tRNA (tRNA-M앙, tRNA-Trp, tRNA-Ala)들이 포함}는 mtDNA 절펀의 PCR-RFLP haplotyping 기법으로 제주도에서 사육하는 한국 재래돼지를 포함하는 5개 품종에 대한 유전적 다양성을 조사하였다. 몇몇 돼지 품종에서 mtDNA 상의 제한절편 길이의 다형성이 관찰되었다. HaeIll-와 Hinf1RFLP에서는 두 가지 제한절편 유형, Tsp509IRFLP에서는 네 가지 유형으로 각각 구분되었다. 발견된 제한절편 유형들을 조협하여 mtDNA haplotype으로 구분했을 때, 모두 네 가지 haplotype들이 발견되었고 집단에 따라 각기 다른빈도를 나타내였다. 하나의 동일한 haplotype mtWB가 한반도 야생멧돼지와 Large White 집단에서 관찰되었다. Duroc과 Landrace 품종들은 여러 모계 선조에서 유래되었을 것으로 추정되는 두 가지의 haplotype들을 가지고 있었다. 제주도에서 사육되고 있는 한국재래돼지 집단에서는 muD와 mtJN haplonpe들이 관찰되었는데, 이 중 mtJN은 빈도가 높고 집단 특이적이었다. 본 연구의 결과는 제주 돼지 집단의 형성에 적어도 둘 이상의 모계 선조가 참여했으며, 이후 동아시아 언근 돼지 품종들과의 인위적인 교잡아 이루어졌을 것으로 추정된다. 연구진의 예상과는 달리 한반도 야생멧돼지가 제주 재래돼지 집단의 모계 선조라는 증거는 확인되지 않았다. MtDNA haplotype과 돼지 계통간의 관계 에서의 특이성은 돼지 육종에 있어 모계 확인과 계보 구성에 매우 유용한 정보를 제공할 것으로 사료된다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제48권1호
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• pp.1-8
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• 2006

포유동물에서 KIT 유전자는 우성 백색의 모색발현에 관여하는 후보유전자로서 mast/stem cell growth factor receptor를 암호화하는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 한반도에서 서식하고 있는 야생멧돼지의 모색발현에 있어서 KIT 유전자의 유전적 변이를 확인하기 위하여 PCR- RFLP와 염기서열 분석을 수행하여 유전적 변이를 관찰하였다. 멧돼지 KIT 유전자의 exon17- intron 17 경계부위에 대한 NlaⅢ-RFLP 결과 splicing mutation이 없고, exon 19 상에서의 SNP C2678T에 대한 AciⅠ-RFLP 결과 역시 백색 품종들의 유전자형과는 다르게 나타났다. 이상의 결과는 멧돼지 집단 내 교잡에 의해 백모색의 자손이 출현하지 않음을 의미한다. 또한 exon 19과 exon 20에서 새로운 SNP들이 확인되었으며 이들 중 exon 20에서의 SNP A2760G는 아미노산의 변화(iso-leucine→valine)를 초래할 수 있으나 모색 발현과의 연관은 확인할 수 없었다. 돼지 KIT 유전자의 exon 19, 20과 intron 19 상에서의 새로 발견된 SNP와 splicing mutation의 존재 여부 등은 품종특이적인 양상으로 확인되었고, 이 같은 결과는 돼지에서 백색 모색 발현을 설명할 수 있는 좋은 자료가 될 것으로 사료된다.

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
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• 한국자원식물학회 2018년도 추계학술대회
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• pp.126-126
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• 2018

Many of researches have revealed that human intestinal microbiota is related to health. Several diseases like obesity, diabetes, and hypertension are affected by the microbiota directly and indirectly. So, interventions with food and drug have been tried to change a composition of the microbiota to better condition. However, few natural medicines have elucidated to date. To understand an influence on microbiota by plant materials including Glycyrrhizae Radix, the extract of medicines were administered to mice and the feces were collected before and after the administration. The feces were analyzed by terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP). The changes in composition of mice gut microbiota were detected and analyzed. The data could be utilized to further study about biological activities of the plant medicines.

• 약학회지
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• 제48권1호
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• pp.75-81
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• 2004

Bone mineral density (BMD) is influenced by genetic and environmental factors. Among genetic study; calcitonin receptor (CTR) gene is a good candidate influencing the inter-individual difference in BMD because CTR is involved in calcium and bone metabolism. Thus, we investigated the distribution of C1377T polymorphism in the CTR gene among male Korean elite athletic and control groups, respectively and also an association with BMD in lumbar spine and femoral neck. Our results suggested that this polymorphism of CTR gene was not significantly associated with lumbar spine or femoral neck BMDs in the both groups, respectively. However, we found that there was the racial difference in genotype distribution of this polymorphism between Caucasian and Asian populations. Though we could not detect the significant association between C1377T polymorphism of CTR gene and lumbar spine or femoral neck BMDs, further studies using other ethnic groups are necessary to clarify the precise role in BMD of CTR gene.

• 한국가금학회지
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• 제32권4호
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• pp.239-244
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• 2005

Uncoupling protein(UCP)은 갈색 지방세포에서 특이적으로 발현하고 있으며 복잡한 세포의 열 생산 작용에 관여한다고 알려져 있다. 본 연구는 한국 재래 닭 집단의 UCP 유전자 내에 존재하는 SNP를 검출하였다. 한국 재래 닭 집단의 UCP유전자 exon 3지역의 염기서열 분석 결과 1316 bp에서 T염기가 C염기로 치환되어짐을 확인하였다. T+11316C 지역의 PCR-RFLP 분석을 위해 제한효소 Afl III를 사용하였다. 한국 재래닭 집단내 유전자형 빈도는 TT가 0.7875, TC가 0.1875 그리고 CC가 0.025로 검출되었으며 대립유전자의 빈도는 T가 0.881 그리고 C가 0.119로 나타났다. 또한 검출된 SNP가 경제형질에 미치는 영향을 분석한 결과 한국 재래 닭 집단의 T/T 유전자형과 C/C유전자형에서 일당 산란율에서 통계적으로 유의한 차이가 있음을 확인하였다. 본 연구의 결과는 향후 더 많은 UCP 유전자와 관련된 연구와 한국 재래 닭의 육종 전략에 도움이 될 것으로 사료된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제19권11호
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• pp.1281-1287
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• 2009

The distribution pattern of the phylum Acidobacteria, a previously uncultured bacterial group, was investigated by molecular ecological analyses of global soil samples collected from pristine ecosystems across five continents. Acidobacterial 16S rDNAs were observed in almost all soil samples, and members of acidobacterial primer group A were detected in all samples that harbored the phylum Acidobacteria. Other primer groups, Y, G, and O, showed limited distribution patterns. We further divided the primer groups into acidobacterial subdivisions (class-level). Subdivisional distribution patterns were determined by comparing the observed T-RFs with theoretical T-RFs predicted by in silico digestion of acidobacterial 16S rDNAs. Consistent with the PCR results obtained with subgroup-specific primers, T-RFLP analyses showed that acidobacterial subdivision 1 belonging to primer group A was present in the majority of the soil samples. This study revealed that the phylum Acidobacteria could be globally distributed. At the subdivisional level, acidobacterial subdivision 1 might be the most widely distributed group in this phylum, indicating that members of subdivision 1 might be adapted to various soil environments, and members belonging to other subdivisions might be restricted to certain geographic regions or habitats.