• 생명과학회지
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• 제13권3호
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• pp.298-307
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• 2003

고세균 (Archaea)의 보존적 유전자를 파악하고 각 분류 단계별로 추가되는 보존적 유전자를 밝히기 위해 그리고 해양성 Euryarchaeota와 육지성 Euryarchaeota의 유전자 조성을 비교하기위해 COG (clusters of orthologous groups of proteins) 알고리즘을 이용하였다. 총 9종의 고세균이 공통적으로 보유하는 보존적 유전자는 340개로 나타났고 8종의 Euryarchaeota는 388개의 유전자가 보존적이었다. Euryarchaeota 각 종이 보유하는 orthologous에 대한 보존적 유전자의 비율은 20.73∼31.54%로 나타났다. 세균과 S.cerevisiae에는 없고 고세균 수준에서만 공통적인 265개 COG의 조성은 유전정보의 보존과 처리에 관여하는 COG가 94개 (35.5%)이고 대사에 관여하는 COG가 82개 (30.9%)로 유전정보와 물질대사와 관여하는 COG의 보존성이 높은 것으로 나타나 고세균이 독특한 생명체계를 이루고 있는 것으로 사료되었다. Euryarchaeota를 Crenarchaeota와 비교하면 핵산대사에서는 상당한 차이를 보이며 유전정보의 저장과 처리에서는 큰 차이가 없는 것으로 판단되었다. 해양성 Euryarchaeota의 보존적 COG는 기능분류별 종류가 육지성 Euryarchaeota와 달랐고 물질대사 관련 COG의 경우 육지성이 해양성보다 다양한 것을 알 수 있었다. 그리고 육지성과 해양성 Euryarchaeota는 탄수화물대사 등을 비롯한 생리적 측면에서 서로 차이가 있을 가능성이 높을 것으로 사료되었다. 본 연구는 해양 극한미생물인 해양성 Euryarchaeota의 기원과 분류단계에 따른 보존적 유전자를 파악하는데 도움을 줄뿐만 아니라 향후 해양미생물 등의 유용유전자 탐색 등에서도 Manco (Arch. Biochem. Biophy. 373, 182 (2000)) 등의 보고와 같이 충분한 연구가치가 있는 것으로 사료되었다.

• 농업생명과학연구
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• 제43권5호
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• pp.39-42
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• 2009

인간과 가축의 영양을 위한 식물성 단백질의 주요 공급원은 콩이며 콩 단백질은 영양 및 기능성면에서 우수하여 소비가 점차 증가하고 있다. 그러나 콩 단백질에는 알러지를 일으키고 영양가치를 떨어뜨리는 성분도 포함되어져 있다. 7S 및 11S 글로블린은 콩 저장단백질의 대부분을 차지하며 7S는 영양가치가 떨어지고 7S의 함량을 줄어든 콩 계통 육성에 대한 관심이 높아지고 있다. 7S 성분중의 하나인 ${\alpha}^{\prime}$-subunit의 유전양상을 파악하기 위하여 진품콩2호와 PI506876의 교배로부터 98개의 F2 종자가 얻어졌다. SDS-PAGE로 각각의 종자를 분석한 결과 ${\alpha}^{\prime}$-subunit을 가진 종자가 70개였고 결핍된 종자가 28개였다. 이러한 유전양상은 단인자 유전원칙 (${\chi}^2=0.667$, P=0.414)과 일치하여 콩 종자에서 7S의 ${\alpha}^{\prime}$-subunit 단백질은 한 개의 유전자에 의 해서 좌우되었다. 이 결과는 7S 단백질 함량이 줄어든 콩 계통 선발에 유용하게 활용될 것으로 기대된다.

• 한국응용약물학회:학술대회논문집
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• 한국응용약물학회 1998년도 Proceedings of UNESCO-internetwork Cooperative Regional Seminar and Workshop on Bioassay Guided Isolation of Bioactive Substances from Natural Products and Microbial Products
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• pp.136-136
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• 1998

L-asparaginyl and L- aspartyl residues in proteins are subject to spontaneous degradation reactions generating isomerized and racemized aspartyl derivatives. Proteins containing L-isoaspartyl and D-aspartyl residues usually have altered structures and diminished biological activities. These residues can be recognized and be repaired to normal L-aspartyl residues by protein L-isoaspartyl methyltransferase(PIMT), which is present at high levels in testis. Although testicular PIMT have been shown to be involved in either sperm motility or sperm maturation, it may play an important role in the repair of damaged sperm proteins during the prolonged period of epididymal transport and storage. In the present study, as a initial step toward elucidating the function of protein carboxylmethylation in testis, we purified PIMT from porcine testicular cytosol as a momeric 27,000 Da species by ammonium sulfate precipitation, DEAE-sephacel chromatography, SAH-liganded affinity chromatography, and gel filtration chromatography. The optimum pH for the reaction was 6.0. $K_{m}$ values of the enzyme for the S-adenosyl-L-methionine (SAM), synthetic oligopeptide(VYP-L-isoD-HA) and histone type II-As were 1.0 ${\mu}$M, 33.2 ${\mu}$M and 276 ${\mu}$M respectively. Consequently, properties of the porcine testicular PIMT is similar to that of other mammalian PIMTs.

• 한국축산식품학회지
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• 제35권5호
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• pp.692-702
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• 2015

Lactobacillus mucosae is a natural resident of the gastrointestinal tract of humans and animals and a potential probiotic bacterium. To understand the global protein expression profile and metabolic features of L. mucosae LM1 in the early stationary phase, the QExactive^TM Hybrid Quadrupole-Orbitrap Mass Spectrometer was used. Characterization of the intracellular proteome identified 842 proteins, accounting for approximately 35% of the 2,404 protein-coding sequences in the complete genome of L. mucosae LM1. Proteome quantification using QExactive^TM Orbitrap MS detected 19 highly abundant proteins (> 1.0% of the intracellular proteome), including CysK (cysteine synthase, 5.41%) and EF-Tu (elongation factor Tu, 4.91%), which are involved in cell survival against environmental stresses. Metabolic pathway annotation of LM1 proteome using the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) database showed that half of the proteins expressed are important for basic metabolic and biosynthetic processes, and the other half might be structurally important or involved in basic cellular processes. In addition, glycogen biosynthesis was activated in the early stationary phase, which is important for energy storage and maintenance. The proteogenomic data presented in this study provide a suitable reference to understand the protein expression pattern of lactobacilli in standard conditions

• 한국축산식품학회지
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• 제39권6호
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• pp.1008-1014
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• 2019

This study investigated the effects of pressure-mediated protein changes on the ice nucleation temperature of pork loins. To variate chemical state of meat proteins, pork loin was pressurized at varying pressure levels (100-500 MPa) for 3 min, and moisture content, expressible moisture (EM) and differential scanning calorimetry (DSC) were analyzed. Although, all treatments showed similar moisture content, EM and degree of protein unfolding of pork loin showed different features as of 300 MPa. At moderate pressure treatments (100-200 MPa), all protein fractions were detected in DSC experiments, and pork loin had lower EM than control (p<0.05). Meanwhile, myosin and actin of pork loin treated at greater than 300 MPa were completely unfolded, and the treatments showed high EM compared to control (p<0.05). Unfolding of meat proteins was a factor suppressing ice nucleation, and the ice nucleation temperature tended to decrease with increasing applied pressure level. The ice nucleation characteristics of pressurized pork loin exhibited a potential application in freezing storage of pressurized meat with less tissue damage comparing to freeze fresh meat, and further exploration regarding the quality change after freezing of fresh and pressurized meat was warranted.

• 한국식품영양과학회지
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• 제21권6호
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• pp.712-718
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• 1992

산 강직근과 알카리 강직근의 사후 자장중 물리, 화학적 변화를 비교 검토하였다. 근섬유의 소편화도는 산강직근이 알카리 강직근에 비하여 저장 3일째부터 월등히 높았다. $Mg^{2+}$-ATPase 활성은 알카리 강직근이 저장 전기간 동안 산 강직근 보다 높았으며, 산 강직근은 저장 1일째, 알카리 강직근은 저장 3일째에 가장 높았다. $Ca^{2+}$-ATPase 활성에 있어서 산 강직근과 알카리 강직근 모두 전 저장기간 동안 약간 증가하는 경향이었으나 산 강직근은 알카리 강직근 보다 전기간 동안 활성도가 낮았다. Actomyosin의 용해성이나 myofibril의 전기영동상은 강직 형태에 따른 유의한 차이가 없었다.

• 생명과학회지
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• 제26권6호
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• pp.698-704
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• 2016

세포내소기관과 단백질 복합체의 운반은 kinesin superfamily proteins (KIFs)에 의해 매개된다. 처음으로 밝혀진 kinesin인 kinesin 1은 motor단백질로서 세포 내에서 미세소관을 따라 이동하며, 다양한 세포내 소기관이나 단백질복합체를 운반한다. Kinesin 1은 장쇄(KHC, 또한 KIF5s로도 통칭) 2분자와 단쇄(KLCs) 2분자로 구성된 4합체(tetramer) 구조를 가진다. KIF5s의 운반체 결합영역을 포함하는 말단영역은 다수의 운반체와 결합하지만, 결합운반체에 관하여 아직 충분히 밝혀지지 않았다. 본 연구에서 KIF5A의 결합 단백질을 동정하기 위하여 효모 two-hybrid screening을 수행하였고 철 저장 및 해독 기능을 하는 단백질인 ferritin heavy chain (Frt-h)을 찾아내었다. Frt-h은 KIF5A의 아미노산 800번과 940번 사이의 부위와 결합하며, 다른 KIF5s와도 결합함을 효모 two-hybrid assay로 확인하였다. 또한 Frt-h의 coiled-coil 도메인이 KIF5A와의 결합에 필수영역임을 밝혔다. 한편, ferritin light chain (Frt-l) 또한 KIF5s와 결합함을 효모 two-hybrid assay로 확인하였다. 이러한 단백질간의 결합을 glutathione S-transferase (GST) pull-down assay를 통하여 검증하였다. 추가적으로 생쥐의 뇌 파쇄액을 항 KHC 항체로 면역침강을 행한 결과, KLC1뿐만 아니라 Frt-h와 Frt-l도 같이 침강하였다. 이러한 결과들은 세포 내에서 kinesin 1이 ferritin 복합체를 운반함을 시사한다.

• 생명과학회지
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• 제8권3호
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• pp.318-325
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• 1998

To investigate changes in protein and total lipid contents, seed storage protein pattern, and fatty acid composition of germination perilla(Perilla frutescens) seeds. Also, the corresponding value components in cotyledons, hypocotyles and roots were measured according to germination stage. The results were summarized as follows ; During germination, pertein and total lipid contents of Yepsilldalggae and Kwangyang cultivar were decreased continuously. In particular, protein contents rapidly decreased to the 3 days after germination(DAG), and then total lipid contents rapidly decreased between 3 DAG and 10 DAG. In changes of protein and total lipid contents of cotyledons, protein contents of Yeupsildalggae was increased during the germination, but Kwangyang cultivar was decreased during the same periods. The total lipids contents of Yeupsildalggae and Kwangyang cultivar were decreased during the germination. According to SDS-PAGE analysis, there was no detectible polypeptide bands on the gel before seed germination suggesting that this may be due to the rapid degradation of the storage proteins in the mature seed by hydrolyttic enzymes during the stage. During germinatation , the polypeptide band with 27$\sim$28KD of Yeupsildalggae and Kwangyang cultivar were accumulated gradually. In changes of fatty acid composition of total lipid of Yeupsildalggae and Kwangyang cultivar , saturated fatty acids such as palmitic acid and stearic acid increased during the germination. On the other hand, unsaturated fatty acid such as linoleic acid and linolenic acid decreased during the same periods. However, oleic acid increased to the 5 DAG, and then was repidly decreased.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제21권5호
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• pp.455-463
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• 2011

Metallothioneins are a class of small cysteine-rich proteins that have been associated with increased tolerance to metal and oxidative stresses in animals, plants, and fungi. We investigated a metallothionein-like (mt-like) gene shown previously to be upregulated in fruiting bodies of the fungus Agaricus bisporus in response to post-harvest storage. Analysis of an A. bisporus genomic DNA cosmid library identified two similar mt-like genes (met1 and met2) arranged as a bidirectional gene pair transcribed from the same promoter region. The promoter contained regulatory elements including 9 metal responsive elements and a CAAT box region 220 bp downstream of met1 that showed striking similarity to a feature in Coprinopsis cinerea mt-like gene promoters. Transcriptional analysis showed that both met genes are significantly and rapidly (within 3 hours) upregulated during post-harvest storage and expression is significantly greater in stipe and cap tissues compared with the gills. However, a strong directionality of the promoter was demonstrated, as transcript levels of met1 were at least two orders of magnitude greater than those of met2 in all samples tested.

• 한국식품저장유통학회지
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• 제10권2호
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• pp.206-212
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• 2003

인삼분말에 대한 전자선(electron beam)의 이용가능성을 연구하고자, 방사선 살균처리(2.5∼15 kGy)가 백삼 및 홍삼분말의 사포닌 함량 및 패턴, 페놀함량, 산성다당체 함량, amylase activity, 단백질 패턴 등에 미치는 영향을 감마선 조사와 비교하였다. 사포닌 함량과 패턴을 TLC 및 HPLC로 분석해 본 결과, 조사선량과 에너지원에 따른 변화는 확인되지 않았으며, 실온 저장 4개월 이후에도 안정된 경향을 보였다. 총페놀성분 및 산성다당체 함량은 홍삼이 백삼 보다 높은 함량을 보였으며, 산성다당체 함량은 조사선량의 증가로 높은 추출량을 보였다. 백삼분말의 amylase activity는 방사선조사 직후 증가하였으나, 4개월 이후에는 대조구 보다 낮은 간을 보였으며, 추출단백질의 전기영동 패턴은 15 kGy의 전자선 및 감마선구에서도 대조구와 차이가 없었다.