To elucidate the molecular genetical properties of the canine parvoviruses isolated from the diseased puppies in the regions of Kyunggi and Chungnam provinces, the replicative form (RF) DNA of four field isolates were compared with those of two attenuated vaccine strains and a reference strains of CPV by restriction endonuclease analysis (REA). REA by Hinf I showed that three CPV isolates except CPV-V15 had an identical banding pattern with two vaccine strains, one standard strain and feline panleukopenia virus (FPLV). In CPV-V15 strain the fourth fragment of DNA with 800 bp was deleted. REA by Bgl II and Pst I indicated that CPV-V15 and FPLV had a bigger second fragment than those of the other strains of CPV. Meanwhile REA by Bam HI revealed that all the field isolates and vaccine strains used in this experiment showed similar banding patterns.
Event-specific real-time polymerase chain reaction (PCR) detection method for genetically modified (GM) maize MIR604 was developed based on integration junction sequences between the host plant genome and the integrated transgene. In this study, 2 primer pairs and probes were designed for specific amplification of 100 and 111 bp DNA fragments from the zSSIIb gene (the maize endogenous reference gene) and MIR604. The quantitative method was validated using 3 certified reference materials (CRMs) with levels of 0.1, 1, and 10% MIR604. The method was also assayed with 14 different plants and other GM maize. No amplification signal was observed in real-time PCR assays with any of the species tested other than MIR604 maize. As a result, the bias from the true value and the relative deviation for MIR604 was within the range from 0 to 9%. Precision, expressed as relative standard deviation (RSD), varied from 2.7 to 10% for MIR604. Limits of detections (LODs) of qualitative and quantitative methods were all 0.1%. These results indicated that the event-specific quantitative PCR detection system for MIR604 is accurate and useful.
Purpose: This research is to find a solution for educational work on high blood pressure control in public health centers by analyzing their current status. Method: It analyzed data from 133 public health centers that had been doing educational work on high blood pressure, through a questionnaire. Also, it developed recommendations by converging opinions from an expert group made of 25 people with nominal group technique. Result: The educational methods of public health centers did not make any approach to get to the goal of the work. The mass media education and campaign activities for the general public had just temporary and passive propensities. In education for patients, it did not use appropriate methods to present management techniques for diagnosis process of patients, medication management, self monitoring BP, and risk factors. Pocket book for monitoring high blood pressure was not focused on self-recording for self-management. The expert group recommended that educational materials for adults should be developed focusing on treatments and observance of risk factors through daily living, and those for children should be focused on basic understanding about diseases, and life style. Conclusion: Presenting direction and strategy of fundamental education work is needed for public health centers by giving them standard educational guidelines of managing high blood pressure nationally, and it is desirable that fundamental frameworks of educational materials should be developed and distributed by professional groups nationally.
Objective: The present study is aimed at phenotypic characterization and mitochondrial d-loop analysis of indigenous "Diara" buffalo population, which are mostly confined to the villages on the South and North Gangetic marshy plains in the Bihar state of India. These buffaloes are well adapted and are best suited for ploughing and puddling the wet fields meant for paddy cultivation. Methods: Biometric data on 172 buffaloes were collected using a standard flexible tape measure. Animals are medium in size; the typical morphometric features are long head with a broad forehead and moderately long and erect ears. Genomic DNA was isolated from unrelated animals. The mtDNA d-loop 358-bp sequence data was generated and compared with 338 sequences belonging to riverine and swamp buffaloes. Results: Based on the mitochondrial d-loop analysis the Diara buffaloes were grouped along with the haplotypes reported for riverine buffalo. Sequence analysis revealed the presence of 7 mitochondrial D loop haplotypes with haplotype diversity of 0.9643. Five of the haplotypes were shared with established swamp breeds and with Buffalo population of Orissa in India. Conclusion: Morphometric analyses clearly shows distinguishing features like long and broad forehead which may be useful in identification. The germplasm of Diara buffalo is much adapted to the marshy banks of river Ganga and its tributaries. It constitutes a valuable genetic resource which needs to be conserved on priority basis.
Myoung, Se Hun;Woo, Min-Su;Min, Won Gi;Park, Joo Myun
Fisheries and Aquatic Sciences
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제25권9호
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pp.489-497
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2022
The first specimen (54.8 mm standard length) of Ernogrammus zhirmunskii Markevich & Kharin, 2011, belonging to the family Stichaeidae, was recorded in Dokdo, East Sea, Korea on July 26, 2021. This species was characterized by a single ventral lateral-line canal from the posterior margin of the pelvic-fin base extending to the anus and one or two rigid spines on the posterior part of the anal fin. This species is similar to Ernogrammus hexagrammus and Ernogrammus walkeri but differs in the number of ventral lateral-line canal present, with E. zhirmunskii consisting of one (unpaired) ventral lateral-line canal compared to other two Ernogrammus species, which have a pair of parallel ventral lateral-line canal. For further analysis of species identification, a partial gene sequence from the mitochondrial DNA cytochrome oxidase subunit I (554 bp) of E. zhirmunskii was obtained for the first time. This study documents the first record of E. zhirmunskii in Korean waters and proposes the new Korean name of 'Il-gob-julbe-do-la-chi' for the species.
Cho, Yoonjung;Lee, Min Ho;Kim, Su Jin;Park, Ji Hwan;Jung, Ju Yeon
대한의생명과학회지
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제28권3호
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pp.157-169
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2022
DNA typing is the typical technology in the forensic science and plays a significant role in the personal identification of victims and suspects. Short tandem repeat (STR) is the short tandemly repeated DNA sequence consisting of 2~7 bp DNA units in specific loci. It is disseminated across the human genome and represents polymorphism among individuals. Because polymorphism is a key feature of the application of DNA typing STR analysis, STR analysis becomes the standard technology in forensics. Therefore, the DNA database (DNA-DB) was first introduced with 4 essential STR markers for the application of forensic science; however, the number of STR markers was expanded from 4 to 13 and 13 to 20 later to counteract the continuously increased DNA profile and other needed situations. After applying expanded STR markers to the South Korean DNA-DB system, it positively affected to low copy number analysis that had a high possibility of partial DNA profiles, and especially contributed to the theft cases due to the high portion of touch DNA evidence in the theft case. Furthermore, STR marker expansion not only contributed to the resolution of cold cases but also increased kinship index indicating the potential for improved kinship test accuracy using extended STR markers. Collectively, the expansion of the STR locus was considered to be necessary to keep pace with the continuously increasing DNA profile, and to improve the data integrity of the DNA-DB.
황색포도상구균은 사람과 동물에서 화농성 질환과 위장관계 질환을 일으키는 세균으로 자연계에 널리 상재하며 식품으로의 감염이 일어날 수 있어 식중독의 원인이 된다. 이에 신속하고 정확한 황색포도상구균의 검출이 요구되는 실정이다. 본 연구에서는 상재균의 오염도가 다른 다양한 축산 가공식품과 비가공식품에서 황색포도상구균의 검출을 위해 표준 시험법인 배지법과 자체 개발한 real-time PCR법의 검출도를 비교하였고 황색포도상구균 coagulase 확인시험과 real-time PCR법을 활용한 colony PCR 확인 시험을 비교하여 균 동정 능력을 비교하였다. 상재균 수가 적은 식품인 우유와 소시지 그리고 상대적으로 상재균수가 많은 생 돼지고기와 야채 샐러드를 샘플로 선정하여 인위적으로 500 g 혹은 mL의 샘플을 25 g씩 20개의 시료샘플로 나누어 실험하였을 때에 최소한 한 개 이상 양성 결과가 나오도록 황색포도상구균을 접종하여 배지법과 realtime PCR법을 시행하여 검출능력을 비교하였다. 배지법에서 획득한 의심 집락의 확인 동정은 coagulase 시험과 realtime PCR법을 활용한 colony PCR 확인시험을 병행하여 비교하였으며 각각의 결과를 real-time PCR법으로 신속 검출한 결과와 비교하였다. 식품 내 상재균 수가 적은 축산 가공식품인 우유나 소시지 등에서 황색포도상구균을 검출할 경우에는 배지법의 coagulase 확인시험과 colony PCR 확인시험과의 유의차가 없었으며 colony PCR 확인시험을 이용한 확인동정 결과와 real-time PCR법을 사용한 24시간 신속 검출 결과 사이에도 역시 유의차가 없었다. 반면에 상대적으로 상재균수가 많은 비가공식품인 생 돼지고기나 야채 샘플에서는 coagulase 시험법을 사용한 황색포도상구균의 확인동정은 유효성이 매우 떨어졌으며 colony PCR 확인시험 결과와 유의적인 차이를 보였다. Real-time PCR법을 사용한 24시간 신속 검출법은 배지법의 coagulase 시험법의 양성 수보다 낮은 검출률을 보였으나 colony PCR 확인시험보다 높은 검출률을 보여 상재균 수가 높은 샘플에서도 배지법을 대체해서 사용할 수 있는 효율적인 방법임을 보여주었다. 이러한 결과를 종합해 볼 때 본 연구에서 개발한 realtime PCR법은 기존 배지법을 대체하여 24시간 이내에 신속하게 황색포도상구균을 검출할 수 있고 coagulase 확인 시험을 대체할 수 있는 방법으로 여겨진다.
목적: 임박사건(impending event)에 대한 인지는 보호자와의 보다 효과적인 의사소통을 위해 필요할 뿐 아니라, 임종실로 옮기는 시점을 결정하는데 있어서 매우 중요하다. 이 주제에 대한 지금까지의 연구는 대부분 임종 48시간을 전후한 시점에서 이미 '발생되어 있는' 증상의 나열에 불과하였다. 이에 '변화'의 시점에서 사망까지의 시간을 기준으로 하여 임박사건 간 48시간 이내 임종예측도를 비교하였다. 방법: 인천소재 완화의료병동에서 임종을 맞이한 160명의 환자 중 임종 전 일주일 동안의 의무기록이 있는 80명을 대상으로 하였다. 환자 및 보호자가 호소하는 주관적 증상 9가지와 의료인에 의해 관찰되는 객관적 징후 8가지를 선정하고 각 항목에 대한 '의미 있는 변화'의 기준을 사전에 정하였다. 결과: 증상에서는 수면량의 증가(53.8%), 징후에서는 혈압의 감소(87.5%)가 가장 높은 발생빈도를 보였다. 임종까지의 평균시간은 증상의 경우 안정 시 호흡곤란(46.8시간)이, 징후의 경우 산소포화도의 감소(13.6시간)와 혈압의 감소(36.9시간)가 48시간 이내였다. 48시간 임박사건으로서의 예측도는 증상의 경우, 양성예측도는 안정 시 호흡곤란이 가장 높았고(83%) 음성예측도는 안정 시 호흡곤란과 의식혼탁/섬망의 조합이 가장 높았으며(86%), 징후의 경우 양성 예측도는 모두 95% 이상이었고 음성예측도는 혈압의 감소와 산소포화도 감소의 조합에서 가장 높았다(60%). 증상과 징후의 발생양상은 유의한 차이를 보였다. 결론: 증상에서는 안정 시 호흡곤란과 의식혼탁/섬망이, 징후에서는 산소포화도나 혈압의 감소가 임종임박을 예측하는데 가장 유용한 임상지표로 생각된다.
파라벤은 화장품, 식품, 의약품 등에 첨가되는 살균성 보존제로 미생물의 성장을 억제한다. 그러나 체내에서 에스트로겐과 유사한 작용을 하는 내분비계 교란물질이며, 특히 독성물질에 민감한 영유아 및 태아에게 노출될 경우 생식기 기형, 고환암, 성조숙증 등 성장발달에 큰 영향을 미친다. 따라서 본 연구에서는 영아가 주로 섭취하는 모유에서의 파라벤 수준을 확인하기 위하여 모유 중 4가지 파라벤(methyl paraben, ethyl paraben, propyl parabne, butyl paraben)의 분석법을 확립하였다. 시료는 액체상추출(Liquid-liquid extraction, LLE)을 통하여 전처리 한 후, 액체크로마토그래피 텐덤 질량분석기(liquid chromatography tandem mass spectrometry, LC-MS/MS)를 사용하여 정량분석 하였다. 확립된 분석조건에서 얻어진 검량선의 직선성은 r2 > 0.999이고, 검출한계(LOD)는 0.019~0.044 ng/mL이었다. 또한 정확도는 85.3~105.9%, 정밀도는 10% 이하의 값을 나타내었다. 10개의 모유시료 중 파라벤류의 평균농도 ± 표준편차는 MP 0.660 ± 0.519 ng/mL, EP 1.631 ± 2.081 ng/mL, PP 0.326 ± 0.320 ng/mL이었고, BP는 불검출 되었다.
2011년 6월 28일에 파주시 조리읍 장곡리 인근 도로에서 두부쪽이 손상되고, 해당연도에 태어난 맹금류 어린새를 발견하였고, 이를 DNA 바코드 기법으로 동정하였다. Mitochondrial DNA(mtDNA) cytochrome c oxidase I(COI) 유전자의 695bp 절편을 중합효소연쇄반응(polymerase chain reaction, PCR)으로 증폭하고 염기서열을 결정하였다. 결정된 염기서열을 BOLD systems과 NCBI의 BLAST에서 유사도 분석을 수행한 결과 총 5개체의 왕새매가 검색되었고, 염기서열의 동일성은 100%로 조사되었다. 또한, DNA 분자성판별 결과는 해당 개체가 암컷임을 나타내었다. 이러한 결과는 경기도 파주에서 1968년 이후 43년만에 왕새매의 번식이 확인된 중요한 정보로, 향후 광역야생동물구조센터는 야생동물의 사체 수거 시 인근 기탁등록보존기관과 연계하여 DNA시료를 확보하고 보다 정확한 종동정과 성판별 정보를 기록하는 등의 체계적인 관리시스템이 필요할 것으로 사료된다. 또한 이렇게 확보한 왕새매의 DNA 시료와 DNA 바코드 COI 유전자 서열은 유사종 연구의 참조표본(reference standard)로 이용될 수 있을 것이다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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