Uddin, M. Salah;Tareque, A.M.M.;Howlider, M.A.R.;Khan, M. Jasimuddin
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
/
v.4
no.4
/
pp.399-405
/
1991
The interaction of 4 dietary crude protein (13, 16, 19 or 22%) and 4 metabolizable energy (2600, 2800, 3000 or 3100 kcal ME/kg) levels on egg quality performances of Starcross layers were assessed between 245 and 275 days of age. The egg weight increased significantly with the increasing dietary protein and energy levels. But egg shape index, albumen index, yolk index, yolk dry matter, yolk protein, yolk fat, albumen protein and shell tickness were similar at all dietary protein and/or energy levels. The egg specific gravity and albumen weight increased but the yolk, weight, Haugh unit and albumen drymatter decreased with the increase of dietary protein levels and showed irregular trend with energy levels. The albumen dry matter and egg shell weight, however, were not affected by energy and protein levels. Simultaneous increase of protein and energy increased specific gravity, albumen index and shell thickness at a greater rate than that increased by the increase of protein or energy alone.
Background: The mixed-cultivation of different Panax ginseng cultivars can cause adverse effects on stability of yield and quality. K-1 is a superior cultivar with good root shape and stronger disease resistance. DNA markers mined from functional genes are clearly desirable for K-1, as they may associate with major traits and can be used for marker-assisted selection to maintain the high quality of Korean ginseng. Methods: Five genes encoding pathogenesis-related (PR) proteins of P. ginseng were amplified and compared for polymorphism mining. Primary, secondary, and tertiary structures of PR5 protein were analyzed by ExPASy-ProtParam, PSSpred, and I-TASSER methods, respectively. A coding single nucleotide polymorphism (SNP)-based specific primer was designed for K-1 by introducing a destabilizing mismatch within the 3' end. Allele-specific polymerase chain reaction (PCR) and real-time allele-specific PCR assays were conducted for molecular discrimination of K-1 from other cultivars and landraces. Results: A coding SNP leading to the modification of amino acid residue from aspartic acid to asparagine was exploited in PR5 gene of K-1 cultivar. Bioinformatics analysis showed that the modification of amino acid residue changed the secondary and tertiary structures of the PR5 protein. Primer KSR was designed for specific discrimination of K-1 from other ginseng cultivars and landraces. The developed real-time allele-specific PCR assay enabled easier automation and accurate genotyping of K-1 from a large number of ginseng samples. Conclusion: The SNP marker and the developed real-time allele-specific PCR assay will be useful not only for marker-assisted selection of K-1 cultivar but also for quality control in breeding and seed programs of P. ginseng.
Wild-type and four mutant R100 merR genes were cloned and the proteins overproduced under tac promoter control of pKK223-3. His118Ala, Cys117Ser, Cys126Ser, and wild-type MerR were successfully overproduced although amino-terminal 14 amino acids deletion mutant MerR was not successful. The amount of overproduced wild-type MerR protein as well as other mutant MerR was between 15%-20% of the total protein. The protein was able to be purified up to 95% homogeneity. Specific DNA-protein blotting experiments showed that the 95 bp operator containing DNA fragment could bind to Cys126Ser, His118Ala, and wild- type MerR, but not to Cys117Ser. These results were consistent with the previously reported complementation experiment results that His118Ala, Cys126Ser, and wild-type MerR could repress the mer operon but Cys117Ser could not.
Successful control of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola, the causal agent of bacterial leaf streak, requires a specific and reliable diagnostic tool. A pathovar-specific PCR assay was developed for the rapid and accurate detection ofthe plant pathogenic bacterium Xanthomonas oryzae pv. oryzicola in diseased plant. Based on differences in a membrane fusion protein gene of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola and other microorganisms, which was generated from NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) and CMR (http://cmr.tigr.org/) BLAST searches, one pair of pathovar-specific primers, XOCMF/XOCMR, was synthesized. Primers XOCMF and XOCMR from a membrane fusion protein gene were used to amplity a 488-bp DNA fragment. The PCR product was only produced from 4 isolates of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola among 37 isolates of other pathovars and species of Xanthomonas, Pectobacterium, Pseudomonas, Burkholderia, Escherichia coli, and Fusarium oxysporum f.sp. dianthi. The results suggested that the assay detected the pathogen more rapidly and accurately than standard isolation methods.
Bacterial heat shock protein has been one of the components that are responsible to induce autoimmune disease mechanisms in the pathogenesis of atherosclerosis due to high level of homology in sequence with human counterpart. This mechanism may explain how bacterial infectious disease, such as periodontal disease, might contribute to the acceleration of the disease process of atherosclerosis. Porphyromonas gingivalis which is a major periodontal pathogenic bacterial species, has been implicated as one of the pathogenic bacteria playing the role in this context. The present study has been performed to evaluate the anti-atherosclerotic effect of adoptive transfer of Porphyromonas gingivalis heat shock protein epitope-specific T cell lines into severe combined immunodeficiency (SCID) mice. Peptide no. 15 with amino acid sequence VKEVASKTND-specific T cell line was selected for the transfer. When experimental atherosclerosis was induced in SCID mice adoptively transferred either by the T cell lines (experimental group) or by non-specific mouse T cells (control group), there was no significant difference in the severity and extent of the atherosclerosis induced by hypercholesterol diet.
Protein expression patterns in Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) strains with diverse phenotypes, such as phage type, antibiotic resistance pattern and plasmid profiles were examined. For detailed analysis of proteins expressed by different S. Typhimurium strains, protein fractions were divided into detergent-rich phase (DP) and aqueous phase (AP) using triton X-114 detergent. The two phases were subjected to two-dimensional gel electrophoresis (2-DE), followed by protein identification using peptide mass fingerprinting (PMF). In the results, PMF showed that DP fractions consisted mainly of outer membrane proteins, whereas the AP fractions included cytosolic proteins. Comparison of 2-DE profiles of DP did not show any distinct protein spots which could be correlated with phage type, antibiotic resistance pattern or plasmid profile. However, comparisons of 2-DE profiles of the AP revealed differences in the protein spots, which could be correlated with the plasmid profile and phage types. Among these protein spots, flagellin was specific for strains containing a 90 kb plasmid. Compared to DT193 phage type, three protein spots in the range of pI 5.0-5.5 and MW 8-15 kDa of AP 2-DE profiles were absent in the DT104 phage types. Additionally, a protein spot with PI in the range of 4.5-5.0 and molecular weight (MW) between 51-69 kDa was specific for phage type DT104, while a protein spot with pI in the range of 4.0-4.8 and MW between 18-20 kDa was specific for DT193 phage type. These protein spots may be useful for discriminating phage types of S. Typhimurium.
Park, Hyo-Sun;Hahn, Tae-Uook;Kim, Hyun-Soo;Choi, Kang-Seuk;Lee, Eun-Jeong;Kang, Shien-Young
Korean Journal of Veterinary Research
/
v.43
no.1
/
pp.129-137
/
2003
Porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) is characterized by reproductive failures in sows and respiratory problems in piglets. The nucleocapsid(N) protein, encoded by the open reading frame 7 (ORF7) gene, is known to be the most abundant and antigenic protein in PRRS virus. Therefore, it was suggested that the N protein could be a suitable candidate for the detection of PRRS virus-specific antibodies and diagnosis of PRRS. In the present study, the ORF7 gene encoding the N protein was cloned and expressed as a fusion protein with the glutathione S-transferase (GST) in Escherichia coli. The resulting GST-N recombinant protein was used as an antigen for an indirect sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (i-ELISA). Expressed GST-N recombinant protein was migrated at 41 kDa and reacted with ORF7-specific monoclonal antibody by Western blotting. In order to increase the specificity of the ELISA for the detection of PRRS virus-specific antibodes, an i-ELISA was developed using an anti-GST antibody as a capture antibody. The sensitivity and specificity of developed i-ELISA were 92% and 96%, respectively. Based on these results, it was suggested that the i-ELISA is a simple and rapid test for screening a large number of swine sera for the anti-PRRS virus antibodies.
Raf protein kinases and protein kinase C belong to serine/threonine-specific proteins in the cytoplasin, and are similar to each other in functional structure and the aspect of the distribution of celI. The distribution of raf protein kinase in the cerebrum of Geoclemys reevesfi as studied by using the antibodies against a-raf and c-raf protein kinase which induce the expression of raf fainily oncogenes. In general, raf protein kinases were distributed in such restricted regions as the general pallium, hippocampal formation, pdmordiuin hippocampi,nucleus of lateral olfactory tract, basal amygdaloid nucleus, and bed of stria terminalis. Immunological labeling of c-raf protein kinase was more widespread than that of a-raf. However, the intensity of the labeling of c-raf was lower than that of a-raf. The spherical cells of basal amygdaloid nucleus is a ring-like form, because only the cytoplasm was imunolabeled. Especially, c-raf protein kinase occurred in the cells which contained protein kinase C abundandy such as pyramidal cells and Purkinje cells. This suggests that a- and e-raf protein kinases may synegistically induce carclnoma with myc gene which is activated by protein kinase C.
Proceedings of the Microbiological Society of Korea Conference
/
2000.10a
/
pp.15-23
/
2000
The subcellular localization of the SopB protein, which is encoded by the Escherichia coli F plasmid and is involved in the partition of the single-copy plasmid, was directly visualized through the expression of the protein fused to the jellyfish green fluorescent protein (GFP). The fusion protein was found to localize to positions close but not at the poles of exponentially growing cells. Examination of derivatives of the fusion protein lacking various regions of SopB suggests that the signal for the cellular localization of SopB resides in a region close to its N terminus. Overexpression of SopB led to silencing of genes linked to, but well-separated from, a cluster of SopB-binding sites termed sopC. In this SopB-mediated repression of sopC-linked genes, all but the N-terminal 82 amino acids of SopB can be replaced by the DNA-binding domain of a sequence-specific DNA -binding protein, provided that the sopC locus is also replaced by the recognition sequence of the DNA-binding domain. These results suggest a mechanism of gene silencing: patches of closely packed DNA-binding protein is localized to specific cellular sites; such a patch can capture a DNA carrying the recognition site of the DNA -binding domain and sequestrate genes adjacent to the recognition site through nonspecific binding of DNA.
Leucine-rich repeat containing protein 10 (LRRC10) is characterized as a cardiac-specific gene, suggesting a role in heart development and disease. A severe cardiac morphogenic defect in zebrafish morphants was recently reported but a contradictory result was found in mice, suggesting a more complicated molecular mechanism exists during mouse embryonic development. To elucidate how LRRC10 is regulated, we analyzed the 5'enhancer region approximately 3 kilo bases (kb) upstream of the Lrrc10 start site using luciferase reporter gene assays. Our characterization of the Lrrc10 promoter indicates it possesses complicated cis-and trans-acting elements. We show that GATA4 and MEF2C could both increase transcriptional activity of Lrrc10 promoter individually but that they do not act synergistically, suggesting that there exists a more complex regulation pattern. Surprisingly, knockout of Gata4 and Mef2c binding sites in the 5’enhancer region (-2,894/-2,889) didn't change the transcriptional activity of the Lrrc10 promoter and the likely GATA4 binding site identified was located in a region only 100 base pair (bp) upstream of the promoter. Our data provides insight into the molecular regulation of Lrrc10 expression, which probably also contributes to its tissue-specific expression.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.