• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제17권9호
• /
• pp.1483-1490
• /
• 2007

A Gram-negative, motile by tuft flagella, obligately aerobic chemoorganoheterotrophic, sphere-form bacterium, designated $IMCC3135^T$, was isolated from the Antarctic surface seawater of King George Island, West Antarctica. The strain was mesophilic, neutrophilic, and requiring NaCl for growth, but neither halophilic nor halotolerant. The 16S rRNA gene sequence analysis indicated that the strain was most closely related to genera of the order Chromatiales in the class Gammaproteobacteria. The most closely related genera showed less than 90% 16S rRNA gene sequence similarity and included Thioalkalispira (89.9%), Thioalkalivibrio (88.0%-89.5%), Ectothiorhodospira (87.9%-89.3%), Chromatium (88.3%-88.9%), and Lamprocystis (87.7%-88.9%), which represent three different families of the order Chromatiales. Phylogenetic analyses showed that this Antarctic strain represented a distinct phylogenetic lineage in the order Chromatiales and could not be assigned to any of the defined families in the order. Phenotypic characteristics, including primarily non-phototrophic, non-alkaliphilic, non-halophilic, and obligately aerobic chemoheterotrophic properties, differentiated the strain from other related genera. The very low sequence similarities (<90%) and distant relationships between the strain and members of the order suggested that the strain merited classification as a novel genus within a novel family in the order Chromatiales. On the basis of these taxonomic traits, a novel genus and species is proposed, Granulosicoccus antarcticus gen. nov., sp. nov., in a new family Granulosicoccaceae fam. nov. Strain $IMCC3135^T\;(=KCCM42676^T=NBRC\;102684^T)$ is the type strain of Granulosicoccus antarcticus.

• The Plant Pathology Journal
• /
• 제23권4호
• /
• pp.272-280
• /
• 2007

Isolates of Cucumber mosaic virus (CMV) collected in Korea, were compared with their pathological features in tobacco and zucchini squash. Full-length cDNA clone of RNA3 was generated by using long-distance RT-PCR. Transcript RNA3 from the cDNA clone was inoculated onto host plants with transcripts RNA1 and RNA2 of Fny strain, generating RNA3-pseudorecombinant CMV. Timing and severity of systemic symptom was not significantly different among the pseudorecombinant CMVs in tobacco, compared with strains Fny-CMV and Pf-CMV. However, the pseudorecombinant CMVs induced two different systemic symptoms (mosaic vs. chlorotic spot) in zucchini squash. Based on symptom induction, the pseudorecombinant CMVs were categorized into two classes. The severity and timing of symptoms were correlated with viral RNA accumulations in systemic leaves of zucchini squash, suggesting that different kinetics of virus movement associated with CMV proteins are crucial for systemic infection and symptom development in zucchini squash. The analysis of movement proteins (MP) of CMV strains showed high sequence homology, but the differences of several amino acids were found in the C-terminal region between Class-I-CMV and Class-II-CMV. The analysis of coat proteins (CP) showed that the CMV isolates tested belonged to CMV subgroup I and the viruses shared overall 87-99% sequence identity in their genomes. Phylogenetic analysis of MP and CP suggested that biological properties of Korean CMV isolates have relationships associated with host species.

• Applied Microscopy
• /
• 제28권1호
• /
• pp.63-71
• /
• 1998

모샘치아과의 한국고유종인 긴몰개 (Squalidus gracilis majimae)의 정자는 구형의 두부와 짧은 중편 및 긴 편모를 가지고 있으며 그 길이는 $36.6{\mu}m$이었다. 두부에는 다른 경골어류에서와 같이 첨체를 가지고 있지 않으며 핵은 $1.9{\mu}m$의 직경을 가지고 핵막 주변부에는 전자밀도가 낮은 염색질 부위를 포함하고 있었다. 핵와는 다른 잉어류에서와 같이 핵막이 얕게 함입되어 기부중심립만을 포함하고 있어서, 메기류의 기부 및 말단부 중심립을 포함하는 긴 핵와와는 큰 차이를 보여주었다. 두 중심립은 서로 약 $140^{\circ}$의 각도로 배열되어 있었다. 미토콘드리아는 중편세포질에 3층으로 배열되어 있으나 축사를 둘러싸고 있지 않으며 축사와는 세포질관에 의해 분리되어 있었다. 정자의 꼬리에 대한 핵의 위치와 미토콘드리아의 비대칭적 배열은 잉어과 정자의 공통된 특징으로 나타나며, 미토콘드리아가 분포된 중편세포질은 다른 잉어류에서보다 훨씬 풍부하였다. 긴몰개의 정자는 현재까지 밝혀진 잉어과의 정자중에서 세포질관의 길이가 가장 길고, 미토콘드리아의 수도 가장 많이 나타났다. 편모에는 lateral fins가 관찰되지 않았다.

• 생명과학회지
• /
• 제21권7호
• /
• pp.939-946
• /
• 2011

미토콘드리아 산화효소(COI) 유전자의 서열을 이용하여 한국 내 육지플라나리아의 분류와 계통관계를 규명하였다. 유전자은행에서 Bipaliidae과의 종에 관한 기 발표된 서열을 계통분석을 위해 포함시켰다. 육지 플라나리아의 서열 배당은 387 bp에서 444 bp로 나타났으며 이런 차이는 염기 삽입에 기인하였다. COI 분석에 근거한 계통학적 분지도는 형태적 형질에 의한 결과와 일치하지 않았다. Bipalium nobile가 나머지 분류군(Bipalium adventitium, Bipalium venosum, Bipalium kewense, Bipalium multilineatum)을 포함하는 관계로 나타났다. 내부 가지의 분지군은 강하게 지지되었다(>91%). The phylogenic tree on COI 분석에 의한 계통도는 잘 분리되었다. 이들은 단계원을 형성하였다. 미토콘드리아 산화효소 유전자는 한국 내 육지 플라나리아 분류군을 동정하는데 유력한 도구가 될 수 있다.

• 생명과학회지
• /
• 제17권1호
• /
• pp.24-30
• /
• 2007

꽃치자(Gardenia jasminoides var. radicans)와 열매치자(C. jasminoides for. grandiflora)는 Gardenia속으로는 우리나라에 두 분류군밖에 없으며 열매치자는 약용, 식용, 꽃치자는 방향제로 쓰인다. 그런데 꽃이 지고 나면 형태적으로 구분이 거의 되지 않는다 ISSR분석으로 이들 종의 유전적 다양도와 집단구조를 실시하였다. 88개의 DNA 분절에서 한 분류군에만 나타나는 특이밴드가 탐지되었다. 한국의 세 야생 집단은 분리되어 있고 패치 분포를 보이지만 재배종에 비해 높은 유전적 다양성을 유지하친 있었다. 열매치자가 꽃치자보다 유전적 다양성이 높았으며 ISSR 마커로 이들 분류군이 잘 분리되었다. 또한 야생 집단이 재배 집단보다 다양성이 약간 높으나 유의성은 없었다. 이는 재배화과정에서 유전적 다양성의 일부 상실이 있었으나 인위적인 채취와 식재로 야생 집단과 재배 집단의 유전적 교류가 존재하였음을 시사한다.

• 한국수산과학회지
• /
• 제49권6호
• /
• pp.867-874
• /
• 2016

Although shrimps belonging to family Crangonidae are known to be genetically divergent and ecologically important among the various benthos, any of their mitochondrial genome has not been reported yet. We here determined the complete mitochondrial genome sequence of Crangon hakodatei (Rathbun, 1902), which was collected from East China Sea ($124^{\circ}E$ and $34.5^{\circ}N$). Total mitochondrial genome length of C. hakodatei was 16,060 bp, in which 13 proteins, 2 ribosomal RNAs, 22 transfer RNAs and a putative control region were encoded. Secondary structure prediction analysis showed that twenty tRNA genes exhibit the conserved structure but two genes, $tRNA^{Cys}$ and $tRNA^{Ser}$ (AGN), lack T and D arm, respectively. Based on the sequence similarity of the COI region from the currently reported five species belonging to genus Crangonidae, C. hakodatei was most closely related to Crangon crangon. Phylogenetic analysis of full COXI genes belonging to infraorder Caridea showed that only crangonid shrimps were clustered together with those of Dendrobranchiata. Gene order were well conserved from Penaeoidea to Caridea but $tRNA^{Pro}$ and $tRNA^{Thr}$ in Palaemonid shrimp were flipped each other by the recombination. Further study about mitochondrial genome sequences of shrimps belonging to Crangonidae should be made to know better about their evolutional relationships with other those in infraorder Caridea.

• 식물분류학회지
• /
• 제41권4호
• /
• pp.324-328
• /
• 2011

한국산 흰명아주(Chenopodium album var. album), 명아주(var. centrorubrum), 가는명아주(var. stenophyllum)를 대상으로 aceto-orcein에 의한 염색체 수와 모양을 조사하였고, 45S rDNA 유전자를 이용한 FISH (fluorescence in situ hybridization) 방법을 수행하여 세포유전학적 유연관계를 고찰하였다. 체세포 염색체 수는 흰명아주와 명아주는 모두 2n = 6x = 54개인 반면에 가는명아주는 2n = 4x = 36으로 뚜렷이 구별되었으며, 기본염색체수는 x = 9 개였다. 명아주속의 염색체에서 45S rDNA의 위치를 알아보기 위한 FISH 결과는 흰명아주의 경우 8개의 signal이, 가는명아주에서는 2개의 signal이 관찰되어 종간 차이를 보였으며, 모두 염색체 말단부위에서 관찰되었다. 염색체의 수와 형태, 45S rDNA를 이용한 FISH 결과는 명아주가 흰명아주에 통합되지만, 가는명아주와는 뚜렷이 구별됨을 지지해 주었다.

• 한국어류학회지
• /
• 제26권4호
• /
• pp.274-280
• /
• 2014

강도다리(Platichthys stellatus)의 정자는 대부분의 경골어류에서와 같이 첨체를 가지고 있지 않는 구형의 핵, 짧은 중편 및 꼬리를 가진 전형적인 수중형의 정자 형태를 하였다. 정자의 미세구조는 전자밀도가 높은 염색질 부위를 가지는 핵과 핵 기부에 위치한 깊이 함입된 핵와(nuclear fossa) 그리고 그 속에 기부 중심립과 말단부 중심립이 포함되어 있었다. 두 중심립은 90도의 각도로 배열되어 있었으며, 미토콘드리아는 중편 세포질에 배열되어 있으며 핵의 후반부와 꼬리의 기부를 둘러 싸고 있었다. 꼬리는 축사와 2개의 lateral ribbon로 구성되어 있었다. 이러한 특징들은 가자미류의 공유형질로 나타났다. 그러나 미토콘드리아의 수와 모양, 핵와의 모양과 크기에서는 종 특이적 특징을 나타내었다. 특히 강도다리 정자의 가장 큰 구조적 특징은 basal foot, rootlet 그리고 alar sheets로 구성된 기저체이었다. 이 구조의 형태적 특징은 다른 종들 사이에서 아주 다양하게 나타내었다. 이러한 구조는 가자미목의 계통적 관계를 연구하는데 매우 중요한 형질로 여겨진다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
• /
• 제29권9호
• /
• pp.1711-1716
• /
• 2008

The reaction of copper(II) chloride with phenyl-N-[(pyridine-2-yl)methylene]methaneamide (ppmma) leads to a new $\mu$ -chloro bridged dimeric [Cu(ppmma)$Cl_2$]$_2$ complex, whereas a reaction of copper(II) bromide with ppmma affords a monomeric Cu(ppmma)$Br_2$ complex. Both complexes have been characterized by X-ray crystallography and electronic absorption spectroscopy. The crystal structural analysis of [Cu(ppmma)$Cl_2$]$_2$ shows that the two Cu(II) atoms are bridged by two chloride ligands, forming a dimeric copper(II) complex and the copper ion has a distorted square-pyramidal geometry ($\tau$ = 0.2). The dimer units are held through a strong intermolecular $\pi-\pi$ interactions between the nearest benzyl rings. On the other hand, Cu(ppmma)Br2 displayed a distorted square planar geometry with two types of strong intermolecular π-π interaction. EPR spectrum of [Cu(ppmma)$Cl_2$]$_2$ in frozen glas s at 77 K revealed an equilibrium between the mononuclear and binuclear species. The magnetic susceptibilities data of [Cu(ppmma)$Cl_2$]$_2$ and Cu(ppmma)$Br_2$ follow the Curie-Weiss law. No significant intermolecular magnetic interactions were examined in both complexes, and magnetic exchange interactions are discussed on the basis of the structural features.

• 약학회지
• /
• 제39권6호
• /
• pp.636-644
• /
• 1995

Comparison of bioavailabflity (BA) of three brands of ranitidine (RT) tablets has been studied m rats. The purpose of this study was to characterize the pharniacolunetics of RT tablets in the rat and to coinpare phannacolunetic parameters of three brands of RT tablets. In addition, it was investigated whether plasma RT concentrations m humans can be predicted from pharmacokinetic parameters obtained in rats. RT was administered intravenously in dose of RT.HCI 10mg/kg and orally in dose of RT.HCI 50mg/kg as solution or crushed sample of thablets. Plasma RT concentrations were determned by HPLC. Plasma RT concentrations as a function of time were fitted to two compartment model. Plasma RT concentrations declined with a terminal half life ($t_{{1}/2{\betha}}$) of 40.9 min. The plasma RT concentration-time curve showed two peak plasma concentrations following an oral administration of solution or crushed sample in rats like humans. No significant difference among pharmacokinetic parameters was observed except $T_{max2}$ (p<0.05). The BA for crushed sample A, B and C were found to be 54.6 40.7 and 40.0%, respectively. Equivalence of $C_{max1}$ and $T_{max2}$ were guaranteed in this study. However, it was concluded that three brands of RT tablets are bioequivalent, taking the following characteristics of RT into consideration;(1) rapid onset of the effect is not required, (2) $C_{max1}$ and $T_{max2}$ do not seem to influence the effectiveness of the drug during a long-term treatment by the usual administration of twice a day. Results from this study were combined with plarmacokinetic data for RT in dogs and humans to develop a basis for interspecies scale-up of the disposition characteristics of the drug. there were similarities in the general disposition of the drug. Allometric relationships were sought between pharmacokinetic parameters nd species body weight. Significant interspecies correlations were found for total body clearance($Cl_{t}$) and steady state volume of distribution ($Bd_{ss}$). Thus, plasma RT concentrations in humans can be predicted from pharmacokinetic parameters obtained in rats.