미생물이 생산하는 생물 고분자의 기능성 당색 및 용도 재발 연구의 일환으로. Bacillus sp.의 알카리 발효에 의해 생합성된 점성의 생물 분자의 리올로지 특성을 다른 미생들 다당 및 식뮬 다당류와 비교하면서 검토하였다. 1% 정제 고분자 용액은 xanthan gum 및 guar gum과 마찬가지로 항복응럭을 갖는 의가소성 유체의 거동을 널었다. 유동지수(n)값은 0.41 - 0.75로 전단속도 의존성을 보였으며, 점조도지수(K)값은 0.87 Pa $s^n$으로 guar gum보다는 작고 xanthan gum 보다는 컸다. 그러나 항복응력 (${\tau}_y$)값은 2.28Pa로 xanthan gum이나 guar gum보다 크게 낮았다. 또 정제고분자의 점조도지수(K)값은 지수 함수식에 따르는 농도 및 온도 의존성을 나타내었다. 농도 의존성은 기울기가 서로 달라지는 두 개의 직선관계를 나타냈으며, 농도가 증가에 따라 의가소성은 강해졌다. 시료 용액은 온도 의존성이 매우 낮은 특징을 나타내었고, 유동의 활성화에너지지는 1.16kcal/g mol이었다. 겉보기 점도는 pH와 염의 변화에 매우 불안정함을 나타내었으나 유기용매에 대하여는 어느 정도 안정함을 보였고, 점증제를 첨가하였을 때 겉보기 점도의 상승효과는 관찰되지 않았다.
Organic solvent tolerant bacterium, designated as strain BCNU 106 is a gram negative, rod-shaped aerobe and grows on benzene, toluene, ethylbenzene, and xylenes (BTEX) as a sole carbon source. According to 16S rDNA analysis and fatty acid analysis, strain BCNU 106 showed highest similarity to Pseudomonas syringae var. savastanoi (Pseudomonas savastanoi). Strain BCNU 106 was able to utilize toluene, ethylbenzene, both o-, m-, p-xylene , m-cresol and o-cresol. The degradation of o-, m-, p-xylene by strain BCNU 106 is particularly important, since o-xylene is a compound of considerable environmental interest, owing to its recalcitrance; and very few microorganism have been reported to utilize both o-, m-, p-xylene as a sole carbon source.
Lewis-Lujan, Lidianys Maria;Rosas-Burgos, Ema Carina;Ezquerra-Brauer, Josafat Marina;Burboa-Zazueta, Maria Guadalupe;Assanga, Simon Bernard Iloki;del Castillo-Castro, Teresa;Penton, Giselle;Plascencia-Jatomea, Maribel
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제32권8호
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pp.989-1002
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2022
Cephalopods, in particular octopus (Octopus vulgaris), have the ability to alter their appearance or body pattern by showing a wide range of camouflage by virtue of their chromatophores, which contain nanostructured granules of ommochrome pigments. Recently, the antioxidant and antimicrobial activities of ommochromes have become of great interest; therefore, in this study, the pH-dependent redox effect of the extraction solvent on the antioxidant potential and the structural characterization of the pigments were evaluated. Cell viability was determined by the microdilution method in broth by turbidity, MTT, resazurin, as well as fluorescence microscopy kit assays. A Live/Dead Double Staining Kit and an ROS Kit were used to elucidate the possible inhibitory mechanisms of ommochromes against bacterial and fungal strains. The results obtained revealed that the redox state alters the color changes of the ommochromes and is dependent on the pH in the extraction solvent. Natural phenoxazinone (ommochromes) is moderately toxic to the pathogens Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Salmonella Typhimurium and Candida albicans, while the species Pseudomonas aeruginosa and Pseudomonas fluorescens, and the filamentous fungi Aspergillus parasiticus, Alternaria spp. and Fusarium verticillioides, were tolerant to these pigments. UV/visible spectral scanning and Fourier- transform infrared spectroscopy (FTIR) suggest the presence of reduced ommatin in methanol/ HCl extract with high intrinsic fluorescence.
Biodiesel is methyl and ethyl esters of long-chain fatty acids produced from vegetable oils or animal fats. Lipase enzymes have occasionally been used for the production of this biofuel. Recently, biodiesel production using immobilized lipase has received increased attention. Through enhanced stability and reusability, immobilized lipase can contribute to the reduction of the costs inherent to biodiesel production. In this study, methanol-tolerant lipase M37 from Photobacterium lipolyticum was immobilized using the cross-linked enzyme aggregate (CLEA) method. Lipase M37 has a high lysine content (9.7%) in its protein sequence. Most lysine residues are located evenly over the surface of the protein, except for the lid structure region, which makes the CLEA preparation yield quite high (~93%). CLEA M37 evidences an optimal temperature of $30^{\circ}C$, and an optimal pH of 9-10. It was stable up to $50^{\circ}C$ and in a pH range of 4.0-11.0. Both soluble M37 and CLEA M37 were stable in the presence of high concentrations of methanol, ethanol, 1-propanol, and n-butanol. That is, their activities were maintained at solvent concentrations above 10% (v/v). CLEA M37 could produce biodiesel from olive oil and alcohols such as methanol and ethanol. Additionally, CLEA M37 generated biodiesel via both 2-step methanol feeding procedures. Considering its physical stability and reusability, CLEA M37 may potentially be used as a catalyst in organic synthesis, including the biodiesel production reaction.
유기용매 내성 Pseudomonas sp. BCNU 106은 독성 용매에 의해 일부 생장이 제한되므로 다양한 생존전략이 필요하다. 이러한 한계를 극복하기 위한 하나의 전략으로 외인성 트레할로오스를 사용하는 것이다. Cyclohexane 존재하에 세포내 트레할로스 함량은 12시간 배양했을 때 181.88 mM로 가장 높게 측정되었고, 세포외 트레할로스 함량은 12시간에서 16시간 사이에 급격하게 감소하였다. 또한 1%(v/v) cyclohexane, hexane, propylbenzene 및 m-xylene 존재하에 0.1 M 트레할로스가 첨가된 LB 배지에서 Pseudomonas sp. BCNU 106 균주의 생장은 트레할로스가 첨가되지 않은 대조군에 비해 각각 89.94, 89.72, 91.25 및 118.9 배 증가하였으며, cyclohexane 및 hexane 존재하에서 0.05 M 트레할로스를 첨가했을 때 4시간 동안 각각 80과 90% 이상의 높은 생존율을 보였다. 이는 배지에 첨가된 트레할로스가 세포 내로 이동하면서 cyclohexane, hexane, propylbenzene 및 m-xylene 스트레스에 대해 방어작용을 한 것으로 보인다. 따라서 성장배지에 트레할로스를 첨가함에 따라 Pseudomonas sp. BCNU 106의 유기용매 내성이 향상되어 생물전환 및 생물분해에 대한 잠재적인 생물촉매로 사용 가능할 것이다.
유기용매 내성 세균인 Pseudomonas sp. BCNU 106을 10%(v/v) 톨루엔에 노출시킨 후 8시간 동안 random arbitrarily primed polymerase chain reaction (RAP-PCR)기법을 이용하여 메신져 RNA 발현 레벨을 조사하였다. 총 100개의 상향발현된 발현 산물 중에서 50개의 상보적인 단편들이 반복적으로 재현성있게 발현되는 것으로 확인되어, 이들을 클로닝을 하였으며 나아가 유전자 염기서열을 결정하였다. Blast analysis 결과, 톨루엔은 LysR family transcriptional regulator 그리고 RNA polymerase factor sigma-32같은 전사와 관련된 유전자들의 발현 레벨을 적응적으로 증가시키는 것으로 확인되었다. 그리고 톨루엔 스트레스 존재 하에서 inorganic ion 수송과 대사와 관련된 catalase와 Mn2+/Fe2+ transporter 유전자의 발현이 증가되었으며, 신호전달과 대사와 기능적으로 관련된 type IV pilus assembly PilZ와 multi-sensor signal transduction histidine kinase 유전자들의 발현 증가도 확인되었다. 한편 톨루엔 노출 후 탄수화물 수송과 대사와 관련된 beta-hexosaminidase 유전자발현 레벨이 증가하였다. 나아가 DNA polymerase III subunit epsilon, DNA-3-methyladenine glycosylase II와 DEAD/DEAH box helicase domain-containing 유전자들과 같은 DNA 복제, 재조합 그리고 수복에 관련성이 있는 유전자들의 발현 레벨 그리고 심지어는 ABC transporter 유전자와 같은 방어 메커니즘에 관련성이 있는 유전자들의 발현 레벨이 적응적으로 증가되는 것으로 밝혀졌다. 특히 10% 톨루엔 존재하에서 ABC transportor, Mn2+/Fe2+ transporter 및 β-hexosaminidase 유전자에 해당하는 RNA들이 괄목하게 유도되는 것이 확인되었다. 그러므로 유기용매 내성 세균 Pseudomonas sp. BCNU 106이 유기용매에 대하여 내성을 나타내는데 있어서 방어 메커니즘, 세포내 이온 항상성 그리고 바이오 필름 형성이 필수적인 것으로 확인되었다.
부탄올 용매에서 생존하는 부탄올 내성 미생물을 분리하였다. 분리된 미생물들의 세포성장은 부탄올 농도가 증가함에 따라 감소하였으며, 그 중에서 BRS02가 12.5 g/L에서 가장 높은 내성도를 나타내었다. 또한, UV를 이용하여 BRS02균의 변이를 유도하여 고농도 부탄올 내성균 BRS251을 개발하였다. 부탄올 생산 모델균주로 대장균과 함께 부탄올, 프로판올 및 펜탄올에 대한 내성도를 비교한 결과, 대장균은 7.5 g/L 부탄올과 20 g/L 프로판올, 2 g/L 펜탄올 농도까지 생육이 가능한 반편, BRS251은 더 고농도인 17.5 g/L 부탄올과 32.5 g/L 프로판올, 6 g/L 펜탄올 농도까지 생육이 가능하였다. 분리된 세균을 동정하기 위해서 그람염색 후 광학현미경으로 관찰한 결과 그람양성의 구균으로 확인이 되었으며, 6.5% NaCl에서 생육이 가능하였다. 생화학적 특성을 분석한 결과, arginine dihydrolase, ${\alpha}$-glucosidase, urease 효소활성을 가지고 있었으며, 호기적인 조건에서 D-galactose, Dmaltose, D-mannitol, D-mannose, methyl-${\beta}$-D-glucopyranoside, D-ribose, sucrose, D-trehalose를 탄소원으로 자화하여 산을 생성할 수 있었으며, bacitracin, vibriostatic agent O/129 및 optochin에 대한 항생제 내성을 나타내었다. 16S rRNA 유전자 서열을 결정하고 계통발생도 분석을 통해 BRS02는 최종적으로 Staphylococcus sp.임을 동정하였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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