• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제24권7호
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• pp.898-904
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• 2011

The PCR- restriction fragment length polymorphism (RFLP) in and around TM4 of SLC11A1 gene and its association with the incidences of brucellosis in Hariana breed (Bos indicus) and Holstein Friesian crossbred (Bos indicus${\times}$Bos taurus) cattle was examined. A fragment of 954 bp encoding the TM4 was amplified, and RFLP was identified by digestion of the amplicon independently with AluI and TaqI. The amplicon (GenBank Acc. No. AY338470 and AY338471) comprised of a part of exon V (<59 bp) and VII (62>), and entire intron 5 (423 bp), exon VI (71 bp) and intron 6 (339 bp). Digestion with AluI revealed the presence of two alleles viz, A (281, 255, 79 and 51 bp) and B (541, 255, 79 and 51 bp). The frequency of A allele was estimated as 0.80 and 0.73 in Hariana and crossbred cattle, respectively. Due to presence of a polymorphic TaqI site at intron 5, two alleles: T (552 and 402 bp) and Q (231, 321 and 402 bp) were identified. The frequency of T allele was estimated as 0.96 and 0.97, respectively. For association study, on the basis of serological tests and history of abortion, the animals were grouped into "affected" and "non-affected". However, no association could be established with the observed RFLPs.

• 생명과학회지
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• 제25권8호
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• pp.861-869
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• 2015

가축화된 동물종 중 하나인 개는, 다양한 목적을 위해 인간에 의하여 선택적으로 육종되었다. 개는 많은 품종을 갖고 있고, 특정한 행동과 형태를 갖도록 인공적으로 선택되어 왔다. 개들은 그들의 삶을 안내, 구조 혹은 탐지 등의 특수 목적에 대하여 인간에게 헌신하고 있다. 특수 목적견에게 요구되는 좋은 품성, 이를테면 온순함, 강건성, 그리고 인내심과 같은 특성은 그들의 특수 임무를 수행하는 데 필요하다. 많은 연구들이 우수한 특수 목적견의 선정을 위한 유전적 마커를 찾는 데 집중되었다. 본 연구에서는, 뇌에서 발현함으로써 기능하는 것으로 알려진 총 8개의 유전자(ABAT; 4-Aminobutyrate Aminotransferase, PLCB1; Phospholipase C, Beta 1, SLC10A4; Solute Carrier Family 10, Member 4, WNT1; Wingless-Type MMTV Integration Site Family, Member 1, BARX2; BarH-Like Homeobox 2, NEUROD6; Neuronal Differentiation 6, SEPT9; Septin 9 그리고 TBR1; T-Box, Brain, 1)들의 정량적인 발현 양상을 개의 네 품종의 뇌 조직에서 확인하였다. 특히, BARX2, SEPT9, SLC10A4, TBR1 그리고 WNT1 유전자들은 비글과 진돗개에서 많이 발현되는데 반하여, 삽살이와 세퍼드에서는 반대되는 발현 양상을 보여 주었다. 본 연구의 유전자들에 대한 Gene ontology (GO) 결정을 위하여 DAVID (Database for annotation, visualization and integrated discovery) 분석이 수행되었고, 이러한 유전자들이 뇌 발생과 개체의 지능에 중요한 기능을 제공할 것이라고 예상하였다. 결론적으로, 이러한 결과들을 통하여, 뇌에서의 기능과 관련된 인자들과 관련된 바이오마커를 발굴하는 데 중요한 단서를 제공해 줌과 동시에, 우수한 특수 목적견을 선발하는 데 도움을 줄 것이라 기대한다.

• 대한치매학회지
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• 제17권4호
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• pp.131-136
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• 2018

Alzheimer's disease (AD) related genes have been elucidated by advanced genetic techniques. Familial autosomal dominant AD genes founded by linkage analyses are APP, PSEN1, PSEN2, ABCA7, and SORL1. Genome-wide association studies have found risk genes such as ABCA7, BIN1, CASS4, CD33, CD2AP, CELF1, CLU, CR1, DSG2, EPHA1, FERMT2, HLA-DRB5-HLA-DRB1, INPP5D, MEF2C, MS4A6A/MS4A4E, NME8, PICALM, PTK2B, SLC24A4, SORL1, and ZCWPW1. ABCA7, SORL1, TREM2, and APOE are proved to have high odds ratio (>2) in risk of AD using next generation sequencing studies. Thanks to the promising genetic techniques such as CRISPR-CAS9 and single-cell RNA sequencing opened a new era in genetics. CRISPR-CAS9 can directly link genetic knowledge to future treatment. Single-cell RNA sequencing are providing useful information on cell biology and pathogenesis of diverse diseases.

• 대한한의학회지
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• 제35권4호
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• pp.36-51
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• 2014

Objectives: cDNA microarray is an effective method to snapshot gene expression. Functional clustering of gene expressions can identify herbal medicine mechanisms. Much microarray data is available for various herbal medicines. This study compares regulated genes with herbal medicines to evaluate the nature of the drugs. Methods: Published microarray data were collected. Total RNAs were prepared from dissociated hippocampal dissociate cultures which were given hypoxic shock in the presence of each herbal medicine. Up- or downregulated genes higher than Global M value 0.5 were selected, clustered in functional groups, and compared with various herbal treatments. Results: 1. Akt2 was upregulated by Acorus gramineus SOLAND, Arisaema amurense var. serratum $N_{AKAI}$ and Coptis chinensis $F_{RANCH}$, and they belong to Araceae herb. 2. Nf-${\kappa}b1$, Cd5, $Gn{\gamma}7$ and Sgne1 were upregulated by Arisaema amurense var. serratum $N_{AKAI}$, Coptis chinensis $F_{RANCH}$ and Rheum coreanum $N_{AKAI}$. 3. Woohwangcheongsim-won, Sohaphyang-won and Scutellaria baicalensis $G_{EORGI}$ downregulated Scp2 and upregulated Tsc2. Woohwangcheongsim-won and Sohaphyang-won upregulated Hba1 and downregulated Myf6. 4. Sohaphyang-won and Scutellaria baicalensis $G_{EORGI}$ downregulated Slc12a1. 5. Woohwangcheongsim-won and Arisaema amurense var. serratum $N_{AKAI}$ upregulated $Rar{\alpha}$, Woohwangcheongsim-won and Coptis chinensis $F_{RANCH}$ downregulated Rab5a and $Pdgfr{\alpha}$, and Woohwangcheongsim-won and Rheum coreanum $N_{AKAI}$ upregulated $Plc{\gamma}1$ and downregulated Pla2g1b and Slc10a1. Conclusions: By clustering microarray, genes are commonly identified to be either up- or downregulated. These results will provide new information to understand the efficacy of herbal medicines and to classify them at the molecular level.

• 생명과학회지
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• 제23권11호
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• pp.1325-1335
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• 2013

특수 목적견(구조견, 군견, 안내견 및 탐지견)은 집중력, 소유욕, 대담성 등을 기반으로 한 훈련시험을 통해 선별된다. 최근 특수견으로서의 특수한 능력 및 품성에 대해 유전적인 정보가 중요한 인자로 다뤄지고 있다. 본 연구에서는 특수견으로서의 개의 특수한 능력 및 품성과 관련된 유전자들의 분자적인 특징을 고찰하고자 하였다. 이전 연구에서 보고된 24개의 유전자(AR, BDNF, DAT, DBH, DGCR2, DRD4, MAOA, MAOB, SLC6A4, TH, TPH2, IFT88, KCNA3, TBR2, TRKB, ACE, GNB1, MSTN, PLCL1, SLC25A22, WFIKKN2, APOE, GRIN2B, PIK3CG)를 선택하여 품성, 후각, 운동 및 학습능력 관련 유전자, 네 가지 카테고리로 분류하였다. 본 연구에서는 생물학적인 기법을 이용하여 이 유전자들의 염색체상의 위치, 유전자들 간의 네트워크를 통한 상호관계를 조사하였으며, 어떤 생물학적 기능과 관련이 있는지 Gene Ontology 분석과 데이터베이스를 기반으로 in silico 발현 양상을 살펴보았다. 또한 이전 연구를 통하여 품성 관련 유전자들의 다양한 유전적 다형성에 대한 보고를 조사하였다. 본 연구는 특수 견으로서 주요하게 고려되는 개의 고유한 능력 및 품성 관련된 유전자에 대해 분자적 특징을 제시하고 있다. 이 후보 유전자들은 개의 특수한 표현형과의 관계를 밝힐 수 있는 연구의 기초자료로서 이용될 수 있을 뿐만 아니라 핵심적인 유전인자로 응용되어 신속하고 정확한 특수견 선발에 기여할 수 있을 것으로 전망된다.

• 한국어류학회지
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• 제32권3호
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• pp.117-129
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• 2020

생물의 종 구분에 이용하는 지표 중 체색은 특징이 뚜렷한 형태 지표로서, 어류의 종 동정에 유용한 형태형질이다. 개볼락은 한국 중부와 남부, 일본 홋카이도 남쪽 등지에 분포하는 상업적으로 중요한 어종으로, 피부에 반점의 유무 및 마킹이 있는 위치에 따라 4개의 아종으로 구분하는 복잡한 체색 특성을 갖는다. 그러나 개볼락의 다양한 체색 패턴과 관련된 유전자 탐색 및 유전자 변이 발굴 등 체색 형성에 관여하는 유전자 규명에 관한 연구는 없다. 이에 따라 본 연구에서는 개볼락의 체색 패턴 관련 유전자 발굴 및 유전자 발현 특성을 규명하기 위한 기초 연구로 체색 타입별 피부 전사체를 프로파일링하였다. 개볼락을 Wild type (반점과 marking 없음)과 Color type (반점과 마킹 모두 있음)으로 구분하였고, 피부 전사체를 RNA-seq 방법을 이용하여 분석하였다. 개볼락 피부 전사체의 발현량을 비교하여 체색 타입별 차등발현유전자 164개를 확보하였다. 이들 차등발현유전자의 기능을 Gene ontology(GO) 분석으로 확인한 결과, 2개는 molecular function, 46개는 biological process, 6개는 cellular component 기능그룹에 속하였다. 차등발현유전자 중 CTL (Galactose-specific lectin nattectin), CUL1 (Cullin-1), CMAS (N-acylneuraminate cytidylyltransferase), NMRK2 (Nicotinamide riboside kinase 2), ALOXE3 (Hydroperoxide isomerase ALOXE3), SLC4A7 (Sodium bicarbonate cotransporter 3) 등은 특정 체색 타입 특이적인 발현양상을 나타냈다. 이번 연구는 개볼락의 체색 패턴 형성에 관여하는 전사체를 탐색한 첫 번째 연구로, 체색 형성 관련 기능유전자 발굴을 위한 후보유전자로 개볼락의 체색 타입별 차등발현유전자를 확보한 것에 의의가 있다. 향후에는 이들 후보유전자의 발현양상 및 기능을 분석하여 개볼락의 복잡한 체색 패턴과 관련된 기능유전자의 특성을 밝히고자 한다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제52권12호
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• pp.1383-1387
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• 2009

저자들은 생후 18개월 여아에서 당원병 Ib 형을 경험하였기에 보고하는 바이다. 진단 시에는 호중구 감소증이 없었고, 이후 점차 중성구가 감소하여 3세에 절대적 호중구수가 $500/{\mu}L$ 미만을 보였다. 반복적인 세균 감염은 없었다. 유전자(SLC37A4) 검사에서 복합 이형접합체 과오돌연변이(Ala148Val/Gly273Asp)를 확인할 수 있었다.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제19권1호
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• pp.71-75
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• 2016

Esophageal candidiasis is commonly seen in immunocompromised patients; however, candida esophagitis induced stricture is a very rare complication. We report the first case of esophageal stricture secondary to candidiasis in a glycogen storage disease (GSD) 1b child. The patient was diagnosed with GSD type 1b by liver biopsy. No mutation was found in the G6PC gene, but SLC37A4 gene sequencing revealed a compound heterozygous mutation (p.R28H and p.W107X, which was a novel mutation). The patient's absolute neutrophil count was continuously under $1,000/{\mu}L$ when he was over 6 years of age. He was admitted frequently for recurrent fever and infection, and frequently received intravenous antibiotics, antifungal agents. He complained of persistent dysphagia beginning at age 7 years. Esophageal stricture and multiple whitish patches were observed by endoscopy and endoscopic biopsy revealed numerous fungal hyphae consistent with candida esophagitis. He received esophageal balloon dilatation four times, and his symptoms improved.

• 전자공학회논문지
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• 제52권9호
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• pp.54-62
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• 2015

낸드 플래시 기반의 SSD (Solid-State Drive)는 HDD (Hard Disk Drive) 대비 월등한 성능에도 불구하고 쓰기 회수 제한이라는 태생적 단점을 가지고 있다. 이로 인해 SSD의 수명은 워크로드에 의해 결정되어 SSD의 기술 변화 추세인 SLC (Single Level Cell) 에서 MLC (Multi Level Cell) 로의 전환, MLC에서 TLC (Triple Level Cell) 로의 전환에 있어 큰 도전이 될 수 있다. 기존 연구들은 주로 wear-leveling 또는 하드웨어 아키텍처 측면에서 SSD의 수명 개선을 다루었으나, 본 논문에서는 호스트가 요청한 쓰기에 대해 SSD가 낸드플래시 메모리를 통해 처리하는 수명관점의 효율성을 대변하는 WAF (Write Amplification Factor) 관점에서 Host I/O 스택 중 파일 시스템, I/O 스케줄러, 링크 전력에 대해 JEDEC 엔터프라이즈 워크로드를 이용해 I/O 스택 최적 구성에 대해 실험적 분석을 수행하였다. WAF는 SSD의 FTL의 효율성을 측정하는 지표로 수명관점에서 가장 객관적으로 사용한다. I/O 스택에 대한 수명 관점의 최적 구성은 MinPower-Dead-XFS로 최대 성능 조합인 MaxPower-Cfq-Ext4에 비해 성능은 13% 감소하였지만 수명은 2.6 배 연장됨을 확인하였다. 이는 I/O 스택의 최적화 구성에 있어, SSD 성능 관점뿐만 아니라 수명 관점의 고려에 대한 유의미를 입증한다.

• 대한유전성대사질환학회지
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• 제15권1호
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• pp.18-24
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• 2015

당원병 Ib형은 드문 유전 대사 질환 중 하나로 SLC37A4 유전자의 장애로 인해 발생한다. 특징적으로 간비대, 저혈당, 고젖산혈증, 고지혈증, 고뇨산증의 임상양상을 보인다. 총 3명(남자 1명, 여자 2명)이 포함되었고 의무기록을 후향적으로 분석하였다. 평균 진단시 나이는 각각 8개월, 26개월, 10세이다. 2명의 환자가 영유아기에 간비대, 저혈당 등으로 발견되었고, 다른 환자는 사춘기에 성장 발육 부전으로 인한 저신장으로 진단되었다. 유전학적 검사에서 c.412T>C (p.Trp 138Arg) (3/6 alleles, 50.0%)가 가장 흔했고 다음으로 p.Leu348Valfs*53 (1 allele), p.Pro191Leu (1 allele), p.Ala148Val (1 allele)가 확인되었다. 요산 강하제, 생 옥수수 전분 복용을 시작하였으며, 모든 환자가 중성구 감소 소견이 관찰되어 G-CSF 투여하였다. 이들 모두 구내염, 장염, 뇌농양과 같은 반복적인 감염이 관찰되었다. 또한 2명은 심한 골다공증으로 칼슘 보충제가 필요하였다. 비교적 일찍 진단된 2명에 비해 10세에 진단된 경우 중증 감염 및 간과 신장의 합병증을 보이고 있었다. 통계학적으로 유의하지 않지만, 비교적 전자의 환자들이 비교적 예후가 좋았다. 본 연구를 통해 동시에 한국의 GSD Ib형 환자의 임상적, 생화학적, 분자유전학적인 특징과 후기 합병증에 대해 보고하는 바이다.