Kim, Jeong-Soo;Lee, Su-Heon;Choi, Hong-Soo;Cho, Jeom-Deog;Noh, Tai-Whan;Kim, Jin-Young
Research in Plant Disease
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v.15
no.2
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pp.57-62
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2009
Genetic diagnosis method of Virion Captured (VC)/RT-PCR for Rice stripe virus (RSV) and Rice black-streaked dwarf virus (RBSDV), Korean major rice viruses transmitted by small brown plant hopper, Laodelphax striatellus, was developed. Virion extraction buffer for rice plant was 0.01M potassium phosphate buffer, pH 7.0, containing 0.5% sodium sulfite. However, the extraction buffer for L. striatellus was 0.01M potassium phosphate buffer, pH 7.0, containing 0.5% sodium sulfite and 2% polyvinylpyrrolidone wt 40,000 (PVP-40). Specific primers for detection of RSV and RBSDV were selected for VC/RT-PCR method. The specific primers were used as a duplex primer to detect viruliferous small brown plant hopper collected from Gimpo, Pyeongtaek and Siheung areas in Gyeonggi province. The genetic diagnosis methods of single and duplex VC/RT-PCR for RSV and RBSDV could be used easily and economically, especially on the diagnosis of L. striatellus. The rate of viruliferous insect (RVI) for RSV was compared with ELISA and VC/RT-PCR for L. striatellus collected from fields. RVI by ELISA was same as 9.2% with RVI by VC/RT-PCR. However, there were some different detection results between the methods. It could be suggested that there is a possibility of serological and/or genomic differences among RSV isolates. The portion of RVI detected simultaneously by ELISA and VC/RT-PCR was 71.0%, and the detection rate from VC/RT-PCR was higher as 3.2% than that from ELISA, which had a reason of simultaneous detection ability both RSV and RBSDV of VC/RT-PCR.
Indirect fluorescent antibody test(IFAT) and enzyme-linked imuunosorbent assay (IgG-ELISA) as serological diagnostic tools were conducted to evaluate the usefulness for diagnosis of canine babesiosis infected with Babesia gibsoni in domestic various dog breeds, american pit bullterrier, military shepherd, and mongrel dogs. The results obtained from this study were abstracted as follows. The nonionic detergent Triton X-100 and absorbent bio-bead $SM_2$ were useful reagents for the preparation of pure merozoite antigen of B gibsoni to be used in ELISA. The optimum reaction in ELISA was shown when the protein concentration of ELISA antigen was measured as 625ng/ml and the conjugate concentration was diluted into 1/6000 fold. The average OD value of ELISA in sera determined with negative responses in IFAT was measured as $0.255{\pm}0.051$(490nm) and the cut - off value of OD was determined as 0.399(490nm). The serum antibodies in both of IFAT and ELISA were detected on one week after artificially infected with B gibsoni and these high antibody titers, 512X in IFAT and 1024X in ELISA, were long lasted until 15 weeks after infection. The reproducibility of reaction and stability of the antigen absorbed microtitration polystyrene plate preserved in $4^{\circ}C$ refrigerator and $-20^{\circ}C$ freezer, respectively could be lasted until 135 days after storage. The positive rates in IFAT by dog breeds were shown 8.1%(60/744 heads) in mongrel dogs, 81.3%(78/96 heads) in american pit bullterrier and 15.6%(15/96 heads) in military shepherd, while the positive rate in ELISA shown 17.6%(131/744 heads) in mongrel dogs, 83.3%(80/96 heads) in american pit bullterrier and 36.5%(35/96 heads) in military shepherd, respiectively. In the total of 936 heads surveyed with IFAT and ELISA the positive rates in IFAT and ELISA were 16.4%(153/936 heads) and 26.3%(246/936 heads), respectivily. Agreement of reactions between IFAT and ELISA was shown 82.4% in 936 dog sera. The specificity and sensitivity of ELISA reaction were 83.5% and 76.5%, respectively. From the conclusion obtained in this study it was evaluated that IFAT and ELISA were useful as highly specific, sensitive and stable serelogical tools for the diagnosis of canine babesiosis in Korea.
Salmonella is an important food-and water-borne pathogen associated with acute gastrointestinal illnesses around the world. The most common serotypes isolated from humans are Salmonella enterica serotype Typhimurium (S. Typhimurium) and S. Enteritidis. Traditional detection methods for Salmonella are based on cultures using selective media and characterization of suspicious colonies by biochemical and serological tests. These methods are generally time-consuming and not so highly sensitive. Recently, the Loop Mediated Isothermal Amplification and real-time PCR has been used as a highly sensitive, specific, and rapid test for the presence of pathogenic bacteria. In this study, a LAMP and real-time PCR was used to detect S. Typhimurium and S. Enteritidis. We selected target genes, which were the in invA and a randomly cloned sequence specific for the genus Salmonella. With LAMP and real-time PCR, random sequence was detected from Salmonella spp, invA were detected from all strain of S. Typhimurium and S. Enteritidis. This assay indicate that the specificity, sensitivity and rapid of the LAMP and real-time PCR make them potentially valuable tools for detection of S. Typhimurium and S. Enteritidis.
Escherichia coli O157:H7 is a food-borne pathogen that causes bloody diarrhea, hemorrhagic colitis, and hemolytic uremic syndrome (HUS). We compared three selective media and evaluated the performance of immunomagnetic separation (IMS) for the detection of low levels of E. coli O157:H7 in ground beef and radish sprouts with different levels of background flora. Bulk food samples (500 g for each trial) were artificially inoculated with nalidixic acid-resistant E. coli O157:H7 at the lowest dose that would generate 20 partial-positive samples of 25 g each. All samples were homogenized in mTSB (225 mL) and incubated overnight at $37^{\circ}C$. IMS was performed using the enriched mTSB samples (1 mL) along with conventional spreads plated onto three different selective media: Sorbitol MacConkey agar (SMAC), Sorbitol MacConkey agar with cefixime and tellulite (CT-SMAC), and Sorbitol MacConkey agar with nalidixic acid (NAL-SMAC) as the gold standard. Two suspicious colonies from each medium were selected and confirmed usinga serological test after transfer to tryptic soy broth with yeast extract (TSAYE). CT-SMAC was better than SMAC for detecting E. coli O157:H7 in all food types. Although there was no statistical difference in the number of positive samples when using IMS vs. non-IMS techniques, more positive samples were detected when IMS was used in both ground beef and radish sprouts. It appears that the improvement was more significant in radish sprouts, which had a higher level of background flora than ground beef. The results also suggest that the combination of CT-SMAC and IMS is sufficient to recover low levels of E. coli O157:H7 in high background flora food samples.
Lyme disease is a tick-borne zoonotic infectious disease caused by Borrelia burgdorferi. The present study assessed the infection status of B. burgdorferi among horses reared in Korea using ELISA and PCR. Between 2009 and 2013, blood samples were collected from 727 horses throughout Korea. Data for each animal including age, gender, breed, and region of sample collection were used for epidemiological analysis. Overall, 38 (5.2%; true prevalence: 5.5%) of 727 horses were seropositive by ELISA. There were statistically significant differences according to breed and region (P<0.001) whose differences might be attributed to the ecology of vector ticks and climate conditions. Using 2 nested PCR, none of the samples tested positive for B. burgdorferi. Thus, a positive ELISA result can indicate only that the tested horse was previously exposed to B. burgdorferi, with no certainty over the time of exposure. Since global warming is likely to increase the abundance of ticks in Korea, continuous monitoring of tick-borne diseases in Korean horses is needed.
Western blot analysis was performed to diagnose vivax malaria using stage-specific recombinant antigens. Genomic DNA from the whole blood of a malaria patient was used as templates to amplify the coding regions for the antigenic domains of circumsporozoite protein (CSP-1), meroxoite surface protein (MSP-1), apical merozoite antigen (AMA- 1), serine repeat antigen (SERA), and exported antigen (EXP- 1) of Plasmodium vivax. Each amplified DNA fragment was inserted into a pGEX-4T plasmid to induce the expression of GST fusion protein in Escherichia coli by IPTG. The bacterial cell extracts were separated on 10% SDS-PAGE followed by western blot analysis with patient sera which was confirmed by blood smear examination. When applied with patient sera, 147 (91.9%) out of 160 vivax malaria, 12 (92.3%) out of 13 falciparum malaria, and all 9 vivax/falciparum mixed malaria reacted with at least one antigen, while no reactions occurred with 20 normal uninfected sera. In the case of vivax malaria, CSP-1 reacted with 128 (80.0%) sera, MSP-1 with 102 (63.8%), AMA-1 with 128 (80.0%), SERA with 115 (71.9%), and EXP-1 with 89 (55.6%), respectively. We obtained higher detection rates when using S antigens (91.9%) rather than using each antigen solely (55.6 - 80%), a combination of 2 (76.3 - 87.5%), 3 (85.6 - 90.6%), or 4 antigens (89.4 - 91.3%). This method can be applied to serological diagnosis, mass screening in endemic regions, or safety test in transfusion of prevalent vivax malaria.
Fascioliasis is a foodborne zoonotic parasitic disease. We report 4 cases occurring in the same family, in whom diagnosis of acute fascioliasis was established after series of tests. One case was hospitalized with fever, eosinophilia, and hepatic lesions. MRI showed hypodense changes in both liver lobes. The remaining 3 cases presented with the symptom of stomachache only. Stool analysis was positive for Fasciola eggs in 2 adult patients. The immunological test and molecular identification of eggs were confirmed at the National Institute of Parasitic Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Shanghai, China. The results of serological detection were positive in all the 4 patients. DNA sequencing of PCR products of the eggs demonstrated 100% homology with ITS and cox1 of Fasciola hepatica. The conditions of the patients were not improved by broad-spectrum anti-parasitic drugs until administration of triclabendazole.
Kim, Jong-Bae;Kim, Hong;Jin, Hyun-Seok;Kim, Young-Sam;Kim, Keun-Sung;Kang, Yun-Sook;Park, Jong-Seok;Lee, Dong-Ha;Woo, Gun-Jon
Biomedical Science Letters
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v.7
no.2
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pp.85-89
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2001
Many Staphylococcus aureus strains produce enterotoxins causing food poisoning. Staphylococcal enterotoxins are classified by serological criteria into five major groups - subtype A to E. It is difficult, time-consuming, and expensive to detect staphylococcal enterotoxins in the clinical laboratory. In this study, we fried to detect the enterotoxin genes of Staphylococcus aureus strains isolated from clinical specimens and Kimbap - rice rolled in a sheet of laver - using multiplex PCR technique. A total of 77 strains of Staphylococcus aureus from clinical specimens and 78 strains from Kimbap were isolated. Among clinical isolates of S. aureus, 60 strains (78.0%) were identified as producing enterotoxins. A total offs strains (91.6%) in the 60 staphylococcal enterotoxin producing strains were enterotoxin subtype C. In case of kimbap: 43 (55.1%) strains were detected to produce enterotoxins and 39 (90.6%) enterotoxin producing strains were subtype A.
This bio-acoustic study was aimed at classifying the different porcine wasting diseases through sound analysis with emphasis given to differences in the acoustic footprints of coughs in porcine circo virus type 2 (PCV2), porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) virus and Mycoplasma hyopneumoniae (MH) - infected pigs from a normal cough. A total of 36 pigs (Yorkshire${\times}$Landrace${\times}$Duroc) with average weight ranging between 25-30 kg were studied, and blood samples of the suspected infected pigs were collected and subjected to serological analysis to determine PCV2, PRRS and MH. Sounds emitted by coughing pigs were recorded individually for 30 minutes depending on cough attacks by a digital camcorder placed within a meter distance from the animal. Recorded signals were digitalized in a PC using the Cool Edit Program, classified through labeling method, and analyzed by one-way analysis of variance and discriminant analysis. Input features after classification showed that normal cough had the highest pitch level compared to other infectious diseases (p<0.002) but not statistically different from PRRS and MH. PCV2 differed statistically (p<0.002) from the normal cough and PRRS but not from MH. MH had the highest intensity and all coughs differed statistically from each other (p<0.0001). PCV2 was statistically different from others (p<0.0001) in formants 1, 2, 3 and 4. There was no statistical difference in duration between different porcine diseases and the normal cough (p>0.6863). Mechanisms of cough sound creation in the airway could be used to explain these observed acoustic differences and these findings indicated that the existence of acoustically different cough patterns depend on causes or the animals' respiratory system conditions. Conclusively, differences in the status of lungs results in different cough sounds. Finally, this study could be useful in supporting an early detection method based on the on-line cough counter algorithm for the initial diagnosis of sick animals in breeding farms.
This study was conducted to isolate the protozoan parasite Babesia gibsoni by intraerythrocytic culture method of micoraerophilous stationary phase(MASP) and evaluate the possibility of application for the detection of B gibsoni in canine babesiosis. Also, indirect fluorescent antibody test(IFAT) and thick blood smear(giemsa stain), direct light microscopy (DLM), as control diagnostic tests, were conducted to compare diagnostic effects between MASP, IFAT and DLM. The results obtained from this study were summarized as follows. The protozoan parasite B gibsoni multiplied in 24-well polystyrene plate containing 1.2ml of canine red blood cell suspension in RPMI 1640 medium(pH 7.0) which is contained 20~40% normal canine serum(NCS) under the MASP condition of 5% $CO_2$ and 95% air at $37^{\circ}C$ incubator. Under the above MASP culturing system the percentage of parasitized erythrocytes(PPE) after incubation for 9 days reached the peak. The levels of PPE in MASP culture were shown more higher by exchanging the medium at 24 hour intervals. The parasite were purely isolated from MASP culture of canine red blood cells collected from dogs(pit bullterrier) infected with B gibsoni naturally. Among the total of 83 heads of pit bullterrier blood samples the positive rate was 32 heads(38.5%) in DLM, 45 heads(54.2%) in IFAT and 42 heads(50.6) in MASP culture. In negative cases of IFAT and DLM the isolation rates of B gibsoni by MASP culture were 16 heads(42.1%) of 38 heads and 16 heads(28.6%)% of 56 heads, respectively. From this study it was suggested that MASP culture method by RPMI 1640 medium was a reliable and useful diagnostic test for the diagnosis of B gibsoni infections in canine babesiosis.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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