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넙치(Paralichthys olivaceus)자치어 장관백탁증(Bacterial white enteritis) 원인균의 신속 검출 (Rapid Detection of the pathogenic agent of Bacterial white enteritis of Larval and Juvenile Stages in Olive flounder (Paralichthys olivaceus))

  • 문영건;박근태;손홍주;이상현;이정민;허문수
    • 한국어병학회지
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    • 제17권3호
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    • pp.159-169
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    • 2004
  • 2003년 5월과 2003년 10월동안에 제주도내 5개소의 넙치 종묘배양장에서 초기 먹이로 공급 되어지는 동물성 플랑크톤인 rotifer와 20-30일령 넙치 자어에서 장관백탁증 원인균으로 알려진 V. ichthyoenteri를 분리하기 위해 실험한 결과 총 71개의 Vibrio sp. 분리가 되었고, 생화학적 동정결과 2개의 그룹에서 24개의 V ichthyoenteri가 동정 되었다. V. ichthyoenteri의 신속한 검출을 위한 종특이적 primer를 V. ichthyoenteri(KCCM 40870)ISR의 특이적인 서열을 이용하여 제작하였다. V. ichthyoenteri를 포함한 20종의 Vibrio속 균주의 genomic DNA와 18group 분리균주 genomic DNA를 PCR한 결과 V. ichthyoenteri 만의 특이적인 band가 생성됨을 알 수가 있다. 따라서 V. ichthyoenteri(KCCM 40870) ISR의 서열로 제작한 primer가 넙치 자치어에 발병하는 장관백탁증 원인균인 Vibrio ichthyoenteri의 신속한 검출과 정확한 동정을 할 수 있는 molecular marker로 이용할 수 있음을 확인하였다.

벼 Oryza sativa x O. minuta 여교배 계통에서 이입 염색체단편 검정 (Introgression of Oryza minuta into Rice, Oryza sativa)

  • 김봉학;강경호;권수진;정오영;리흥린;문헌팔;안상낙
    • 한국작물학회지
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    • 제49권6호
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    • pp.533-538
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    • 2004
  • 화성벼와 O. minuta 간 여교잡을 통해 반복친인 화성벼와 출수기, 간장 등 여러 작물학적 특성에서 뚜렷한 차이를 보이는 염색체단편 치환계통 "WH79006"을 육성하였는데 화성벼와 WH79006의 차이는 WH79006에 이입된 O. minuta 염색체 단편에 의한 것이라고 할 수 있다. WH79006이 화성벼의 유전적 배경에 O. minuta의 어느 염색체 단편을 가지고 있는지를 검정하기 위해 SSR마커를 이용하였다. 벼 염색체에 골고루 분포한 294개의 SSR 마커를 검정한 결과 최소한 28개의 이입 단편을 검정하였는데 이들은 2번 염색체를 제외한 모든 염색체에 분포하였으며 전체 길이는 약 168cm이었다. 간장 관여 QTL을 탐색하기 위해 화성벼/WH79006 조합의 75개 $F_2$ 개체를 육성, 간장을 조사하였다. QTL분석 결과 6번 염색체의 RM225부근에서 간장에 관여하는 QTL cl6가 탐지되었다. cl6는 전체 표현형변이의 $9.6\%$를 설명하였으며 O. minute의 대립유전자가 간장을 크게 하는 방향으로 작용하였다. 이 결과는 O. minuta가 포복형임에도 불구하고 간장 조절 유전자들 중에는 간장을 크게 하는 방향으로 작용하는 유전자가 있음을 제시하고 있으며, 이 유전자들은 앞으로 QTL 분석을 통해 그 작용을 밝힐 예정이다. 추후교잡 집단을 이용 O. minuta 특이적 단편들이 어느 형질과 관련이 있는지를 밝힐 예정이다.

담자균 Phanerochaete chrysosporium으로부터 유래한 Glycoside Hydrolase Family 74 유전자 클로닝과 전사산물 분석 (Molecular Cloning of Glycoside Hydrolase Family 74 Genes and Analysis of Transcript Products from the Basidiomycete Phanerochaete chrysosporium)

  • 이재원;鮫島正浩;최인규
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제34권3호
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    • pp.56-63
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    • 2006
  • 셀룰로오스의 가수분해 기작을 구명하기 위하여 Phanerochaete chrysosporium으로부터 74A (PcGHF74A) 유전자를 클로닝한 결과 2162 bp의 염기서열에 해당하는 721개의 아미노산을 가지고 있으며, 다른 사상균에서 유래한 GHF74와 70~77%의 상동성을 나타냈다. Phanerochaete chrysosporium GHF74B (PcGHF74B)는 family 1에 속하는 Cellulose Binding Module (CBM)을 가지고 있으며 셀룰로오스 배양계에서 다양한 전사산물이 존재하였다. PcGHF74B 전사산물에서 나타난 splice variants를 조사하기 위해서 annotation data와 sequence data로부터 primer를 설계하여 RT-PCR분석을 수행하였으며 그 결과 다양한 배양조건에서 splice variants가 존재함을 확인하였다. 첫 번째는 annotation data와 다르게 11번째 intron을 포함하고 있어 full length로 추정되어지는 것으로 2562 bp에 stop codon이 존재했으며, 두 번째는 7번째 exon 1187 bp에 stop codon을 가지고 있으며 12개의 exon으로 구성되어 있다. 세 번째는 10개의 exon과 9개의 intron을 포함하고 있으며 7번째 exon에 stop codon이 존재했다. Splice variants로서 intron에 나타난 stop codon으로 인해 활성단백질의 합성이 일어나지 않을 것이며 비활성 단백질을 생성하거나 원래의 GHF74의 기능이 아닌 다른 새로운 기능을 갖는 단백질을 생성할 수 있을 것으로 사료된다.

Characterization and Expression Profile Analysis of a New cDNA Encoding Taxadiene Synthase from Taxus media

  • Kai, Guoyin;Zhao, Lingxia;Zhang, Lei;Li, Zhugang;Guo, Binhui;Zhao, Dongli;Sun, Xiaofen;Miao, Zhiqi;Tang, Kexuan
    • BMB Reports
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    • 제38권6호
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    • pp.668-675
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    • 2005
  • A full-length cDNA encoding taxadiene synthase (designated as TmTXS), which catalyzes the first committed step in the Taxol biosynthetic pathway, was isolated from young leaves of Taxus media by rapid amplification of cDNA ends (RACE). The full-length cDNA of TmTXS had a 2586 bp open reading frame (ORF) encoding a protein of 862 amino acid residues. The deduced protein had isoelectric point (pI) of 5.32 and a calculated molecular weight of about 98 kDa, similar to previously cloned diterpene cyclases from other Taxus species such as T. brevifolia and T. chinenisis. Sequence comparison analysis showed that TmTXS had high similarity with other members of terpene synthase family of plant origin. Tissue expression pattern analysis revealed that TmTXS expressed strongly in leaves, weak in stems and no expression could be detected in fruits. This is the first report on the mRNA expression profile of genes encoding key enzymes involved in Taxol biosynthetic pathway in different tissues of Taxus plants. Phylogenetic tree analysis showed that TmTXS had closest relationship with taxadiene synthase from T. baccata followed by those from T. chinenisis and T. brevifolia. Expression profiles revealed by RT-PCR under different chemical elicitor treatments such as methyl jasmonate (MJ), silver nitrate (SN) and ammonium ceric sulphate (ACS) were also compared for the first time, and the results revealed that expression of TmTXS was all induced by the tested three treatments and the induction effect by MJ was the strongest, implying that TmTXS was high elicitor responsive.

MITE-AFLP를 이용한 자포니카 벼의 다양성 검정 (Diversity Analysis of Japonica Rice using MITE-transposon Display)

  • 홍성미;권수진;오창식;;안상낙
    • 한국작물학회지
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    • 제51권3호
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    • pp.259-268
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    • 2006
  • 1. 자포니카 벼 114 계통에 대해 다양성과 근연관계를 확인하고자 MITE 중에서 mPing family를 이용하여 MITE-TD 기법으로 분석하여 품종간의 다양성 정도를 산출한 결과 마커들의 PIC 값이 $0.293{\sim}0.499$ 범위로 나타났다. 2. 두 개의 mPing primer와 selective primer인 BfaI+G 와 BfaI+C의 조합을 이용하였을 때, 공시계통인 114개의 자포니카 벼 전체를 구분할 수 있었다. 3. NTSYS-pc를 이용한 근연관계 분석 결과, 유사계수의 범위는 0.802에서 부터 0.081까지였고, 자포니카 벼 114 품종은 크게 5 개의 그룹으로 분류되었다. 4. 8 개의 MITE-AFLP marker 연관분석을 밀양 23호/합천앵미 3호 조합 RIL을 이용하여 실시한 결과, 이들은 염색체 l번, 2번, 4번, 5번, 7번 그리고 9번에 각각 위치함을 확인하였다.

Epinephrine 합성효소인 phenylethanolamine N-methyltransferase의 인간 genomic DNA의 유전자 크로닝 (Molecular Cloning of Human Genomic DNA for Epinephrine Synthesizing Enzyme, Phenylethanolamine N-Methyltransferase)

  • 서유현;허성오;전양숙;김현식;임정규;박찬웅
    • 대한약리학회지
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    • 제24권1호
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    • pp.1-10
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    • 1988
  • 카테콜아민 생합성에 관여하는 마지막 효소인 phenylethanolamine N-methyltransferase는 Norepinephrine을 epinephrine으로 전환시키는 중요한 효소이다. PNMT효소의 발현은 epinephrine 신경세포의 발현에 필수적이다. 따라서 PNMT유전자를 크로닝하여 그 구조를 결정하고, 유전자 발현연구를 하는 것은 상당히 중요한 일이다. 그러나 최근에 저자가 bovine cDNA를 처음으로 분리하여 그 구조를 보고한 것 외에는 아직까지 인간 PNMT cDNA나, 전체 genomic DNA의 분리 보고는 없다. 이에 저자들은 인간 PNMT유전자의 전체구조와 여러 종(species) 사이의 진화적인 관계를 규명하기 위해서 human genomic library(Charon 4A)를 만들고, 이 library 이용하여 bovine cDNA를 probe로 13.1 Kb길이의 genomic clone을 분리 크로닝하는데 성공하였다. 이 유전자는 두개의 EcoRI site가 포함되어 있어서, EcoRI제한효소에 의해서 7.5 Kb, 5.0 Kb,0.6 Kb로 분리되었으며, Southern과 dot blot 실험 에서 보면 5.0 Kb와 0.6 Kb에 exon이 흩어져 존재하고 있으며, 7.5 Kb는 flanking sequence로 판명되었다.

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THE FINITE DIMENSIONAL PRIME RINGS

  • Koh, Kwangil
    • 대한수학회보
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    • 제20권1호
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    • pp.45-49
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    • 1983
  • If R is ring and M is a right (or left) R-module, then M is called a faithful R-module if, for some a in R, x.a=0 for all x.mem.M then a=0. In [4], R.E. Johnson defines that M is a prime module if every non-zero submodule of M is faithful. Let us define that M is of prime type provided that M is faithful if and only if every non-zero submodule is faithful. We call a right (left) ideal I of R is of prime type if R/I is of prime type as a R-module. This is equivalent to the condition that if xRy.subeq.I then either x.mem.I ro y.mem.I (see [5:3:1]). It is easy to see that in case R is a commutative ring then a right or left ideal of a prime type is just a prime ideal. We have defined in [5], that a chain of right ideals of prime type in a ring R is a finite strictly increasing sequence I$_{0}$.contnd.I$_{1}$.contnd....contnd.I$_{n}$; the length of the chain is n. By the right dimension of a ring R, which is denoted by dim, R, we mean the supremum of the length of all chains of right ideals of prime type in R. It is an integer .geq.0 or .inf.. The left dimension of R, which is denoted by dim$_{l}$ R is similarly defined. It was shown in [5], that dim$_{r}$R=0 if and only if dim$_{l}$ R=0 if and only if R modulo the prime radical is a strongly regular ring. By "a strongly regular ring", we mean that for every a in R there is x in R such that axa=a=a$^{2}$x. It was also shown that R is a simple ring if and only if every right ideal is of prime type if and only if every left ideal is of prime type. In case, R is a (right or left) primitive ring then dim$_{r}$R=n if and only if dim$_{l}$ R=n if and only if R.iden.D$_{n+1}$ , n+1 by n+1 matrix ring on a division ring D. in this paper, we establish the following results: (1) If R is prime ring and dim$_{r}$R=n then either R is a righe Ore domain such that every non-zero right ideal of a prime type contains a non-zero minimal prime ideal or the classical ring of ritght quotients is isomorphic to m*m matrix ring over a division ring where m.leq.n+1. (b) If R is prime ring and dim$_{r}$R=n then dim$_{l}$ R=n if dim$_{l}$ R=n if dim$_{l}$ R<.inf. (c) Let R be a principal right and left ideal domain. If dim$_{r}$R=1 then R is an unique factorization domain.TEX>R=1 then R is an unique factorization domain.

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DS/CDMA 시스템을 위한 새로운 복조 방식 (A Demodulation Method for DS/CDMA Systems)

  • 정범진;김명록;곽경섭
    • 전기전자학회논문지
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    • 제2권2호
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    • pp.212-224
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    • 1998
  • DS/CDMA 시스템의 순방향 링크에서 시스템의 성능을 열화 시키는 주요 원인으로는 다중 경로 전파에 의한 페이딩과 많은 사용자가 동시에 동일 주파수 대역을 사용함으로써 발생하는 다원 접속 간섭이 있다. 다중 경로 전파에 의한 다원 접속 간섭을 줄이기 위해서는 각각의 사용자들을 구별하게 하는 코드들 사이의 상호 상관 성질을 최소화시키는 PN 코드를 필요로 한다. IS-95A 시스템의 변조 방법에서 데이터의 대역 확산을 위해 전체 주기 $2^{15}$의 PN 시퀀스를 사용하며, 데이터 비트를 확산시키기 위해 PN 시퀀스 전체 길이 중 각각 64칩씩 사용된다. 이러한 경우, 실제 사용되는 비트는 전체 데이터에서 차지하는 비중이 아주 작아 상호 상관 성질이 상대적으로 커져 다중 경로 간섭을 억제하는데 있어 만족스럽지 못한 결과를 얻게된다. 이러한 점을 착안하여 순방향 링크의 복조 구간을 증가시켜 데이터를 복조 한다면 코드들간의 상호 상관 성질을 줄일 수 있다. 본 논문에서는 PN 코드들간의 상호 상관 성질을 감소시킬 수 있는 복조방법을 제안하고, 시뮬레이션을 통하여 검증하였다. 시뮬레이션에 사용된 채널은 다중 경로 레일리 페이딩 채널 및 부가 백색 가우시안 잡음 채널을 사용하였다. 제안된 방법은 시뮬레이션을 통해 성능 분석한 후, 기존의 IS-95A 시스템과 비교하여 동일 신호대 잡음비에서 비트 오율이 약 $0.25{\sim}0.5dB$의 성능 향상을 보였다.

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Molecular Cloning, Characterization and Functional Analysis of a 2C-methyl-D-erythritol 2, 4-cyclodiphosphate Synthase Gene from Ginkgo biloba

  • Gao, Shi;Lin, Juan;Liu, Xuefen;Deng, Zhongxiang;Li, Yingjun;Sun, Xiaofen;Tang, Kexuan
    • BMB Reports
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    • 제39권5호
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    • pp.502-510
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    • 2006
  • 2C-methyl-D-erythritol 2, 4-cyclodiphosphate synthase (MECPS, EC: 4.6.1.12) is the fifth enzyme of the non-mevalonate terpenoid pathway for isopentenyl diphosphate biosynthesis and is involved in the methylerythritol phosphate (MEP) pathway for ginkgolide biosynthesis. The full-length mecps cDNA sequence (designated as Gbmecps) was cloned and characterized for the first time from gymnosperm plant species, Ginkgo biloba, using RACE (rapid amplification of cDNA ends) technique. The full-length cDNA of Gbmecps was 874 bp containing a 720 bp open reading frame (ORF) encoding a peptide of 239 amino acids with a calculated molecular mass of 26.03 kDa and an isoelectric point of 8.83. Comparative and bioinformatic analyses revealed that GbMECPS showed extensive homology with MECPSs from other species and contained conserved residues owned by the MECPS protein family. Phylogenetic analysis indicated that GbMECPS was more ancient than other plant MECPSs. Tissue expression pattern analysis indicated that GbMECPS expressed the highest in roots, followed by in leaves, and the lowest in seeds. The color complementation assay indicated that GbMECPS could accelerate the accumulation of $\beta$-carotene. The cloning, characterization and functional analysis of GbMECPS will be helpful to understand more about the role of MECPS involved in the ginkgolides biosynthesis at the molecular level.

지진모의실험에 의한 비균열 및 균열콘크리트에 매입된 비보강 선설치앵커의 전단 저항강도 평가 (Shear Resistance of Unreinforced Cast-In-Place Anchors in Uncracked and Cracked Concrete by Seismic Qualification Tests)

  • 박용명;김태형;김동현;조성훈;이종한
    • 한국강구조학회 논문집
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    • 제27권3호
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    • pp.347-357
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    • 2015
  • 본 연구에서는 지진모의실험으로 비보강 선설치앵커의 전단에 대한 콘크리트 파열파괴강도를 평가하기 위한 실험 연구를 수행하였다. 이를 위해 앵커 직경 30mm, 연단거리 150mm, 매입깊이 240mm인 비균열 시험체와 전단하중에 수직 및 수평 방향 균열콘크리트 시험체들에 대해 각각 실험을 수행하였다. 지진모의실험 시 동적 가력은 CSA N287.2, ACI 355.2와 ETAG 001 기준을 참조하여 결정하였으며 이후 파괴 시까지 정적 재하를 실시하였다. 비균열 및 균열콘크리트 모두 지진모의실험에 의한 저항강도는 각각 정적 강도와 거의 동등한 수준이었다. 한편, 콘크리트 파괴단면의 깊이는 $8d_0$에 모두 미치지 못하였으며 이로부터 기존 강도식에 비해 유효지압길이를 고려하지 않는 ACI 318-11의 수정강도식이 콘크리트 파열파괴강도를 적절하게 평가하는 것으로 분석되었다.