• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제31권1호
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• pp.19-25
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• 2018

Objective: In practical breeding, selection is often performed by ignoring the accuracy of evaluations and applying economic weights directly to the selection index coefficients of genetically standardized traits. The denominator of the standardized component trait of estimated genetic evaluations in practical selection varies with its reliability. Whereas theoretical methods for calculating the selection index coefficients of genetically standardized traits account for this variation, practical selection ignores reliability and assumes that it is equal to unity for each trait. The purpose of this study was to clarify the effects of ignoring the accuracy of the standardized component trait in selection criteria on selection responses and economic weights in retrospect. Methods: Theoretical methods were presented accounting for reliability of estimated genetic evaluations for the selection index composed of genetically standardized traits. Results: Selection responses and economic weights in retrospect resulting from practical selection were greater than those resulting from theoretical selection accounting for reliability when the accuracy of the estimated breeding value (EBV) or genomically enhanced breeding value (GEBV) was lower than those of the other traits in the index, but the opposite occurred when the accuracy of the EBV or GEBV was greater than those of the other traits. This trend was more conspicuous for traits with low economic weights than for those with high weights. Conclusion: Failure of the practical index to account for reliability yielded economic weights in retrospect that differed from those obtained with the theoretical index. Our results indicated that practical indices that ignore reliability delay genetic improvement. Therefore, selection practices need to account for reliability, especially when the reliabilities of the traits included in the index vary widely.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제44권6호
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• pp.669-676
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• 2002

유전표지인자를 이용한 선발(marker assisted selection; MAS)과 전통적인 표현형기록에 근거한 반응의 비교분석을 위하여 고정효과모델(deterministic model)을 이용하여 시뮬레이션을 하였다. 자신의 단일 기록을 이용한 경우와 자신의 기록과 자신의 표지인자 정보를 이용할 경우 유전력이 높을수록 MAS의 효율성이 38%정도 높게 나타났다. 그러나 유전력이 높은 경우(50%) MAS의 효율성은 약 1%정도로서 효율성이 대단히 낮은 것으로 나타났다. 자신의 기록과 부모의 표현형 정보에 표지인자 정보를 추가할 경우 MAS의 효율성은 27% 정도였으며 마찬가지로 유전력이 높은 경우에는 효율성이 0에 가깝게 나타났다. MAS의 효율성은 유전력이 낮을수록 그리고 이용한 표지인자의 유전적 변이가 클수록 효율성이 높아지는 것으로 나타났다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제52권2호
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• pp.83-90
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• 2010

본 연구를 통하여 도체성적에 대한 경제적 가치를 산출하고 이를 토대로 새로운 한우 보증씨수소 선발지수를 제안하였다. 선발지수는 경제적으로 중요한 형질에 필요한 만큼의 가중치를 주어 개체를 효과적으로 선발하는 데 도움을 주는 강력한 도구로써 농장에서 일어나는 수입과 지출을 고려하여 선발지수를 산출할 수 있다. 최근에는 이러한 선발지수를 농장에서 자기 농장에 알맞게 개발할 수있도록 인터넷을 통하여 서비스를 제공하고 있다 (Lazenby 등. 1998). 그러나 우리나라는 조수입의 산출은 가능하지만 경비를 정확히 산출할 수 있는 농가가 드물기 때문에 아직 농가차원에서 적절한 선발지수를 만들어 사용하는 것은 어려운 것으로 보인다. 또한 이러한 이유로 인하여 한우 보증씨수소를 선발함에 있어 비용부분을 고려하지 못하고 조수익에 의존하여 지수를 만들 수밖에 없는 문제를 안고 있다. 아울러 선발에서 고려할 수 있는 갈비생산량, 등심생산량, 안심생산량, 정육율 등 도체에서 얻을 수 있는 다양한 형질의 개발과 측정이 필요하고, 암소선발을 위해서는 농가의 번식기록을 통해 얻을 수 있는 번식형질에 대한 조사가 이루어져야 미국과 같이 다양한 선발지수를 개발하고 활용 (Greiner, 2006)하여 다양화로 나가는 소비시장에 적절히 대응해 나갈 수 있을 것이다.

• Communications for Statistical Applications and Methods
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• 제26권1호
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• pp.69-78
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• 2019

A structured model with both single-index and varying coefficients is a powerful tool in modeling high dimensional data. It has been widely used because the single-index can overcome the curse of dimensionality and varying coefficients can allow nonlinear interaction effects in the model. For high dimensional index vectors, variable selection becomes an important question in the model building process. In this paper, we propose an efficient estimation and a variable selection method based on a smoothing spline approach in a partially linear single-index-coefficient regression model. We also propose an efficient algorithm for simultaneously estimating the coefficient functions in a data-adaptive lower-dimensional approximation space and selecting significant variables in the index with the adaptive LASSO penalty. The empirical performance of the proposed method is illustrated with simulated and real data examples.

• 한국작물학회지
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• 제3권
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• pp.89-98
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• 1965

대두증산의 중요성에 미추어 대두의 다수계통 선발을 위하여 전년에 공시한 22품종을 재료로 각 형질의 유전력, 각 형질상호간의 유전상관, 그리고 선발지수 등을 재검토하기 위하여 선발시험을 한 바 대체로 전보 전년의 결과와 같다. 1. 유전력 : 유전력을 추정하기 위하여 파종기별로 각 형질의 평균치의 변동을 보면 제1표와 같이 파종기가 지연됨에 따라 형질의 평균치는 감소하고 (Table 1), 형질중에는 환경에 따라 크게 영향을 받는 것도 있으며(Table 2), 각 형질별 유전력을 추정한 바 그 결과는 제3표와 같다. 즉 개화일수ㆍ결실일수ㆍ생육일수 등 생유기간에 관계되는 형질은 그의 유전력이 높고 형태적 특성에 관계되는 형질중에서도 경장 100입중은 높으나 수량에 관여하는 형질 등은 낮았다. 그리고 파종기에 따라서도 변동을 하며 대체로 파종기가 늦어짐에 따라 감소하는 경향이 보인다(Table 3). 2. 유전상관 : 각 형질 상호간의 유전상관ㆍ표현형상관을 알기 위하여 각 형질의 표현형분산과 각 형질 상호간의 표현형공분산ㆍ유전공분산. 그리고 환경공분산을 산출한 바 그 결과는 제4,5표와 같고(Table 4,5), 그들의 유전상관과 표현형상관은 제6표와 같다(Table 6). 대체로 유전사관의 정도는 표현형상관보다높으나 파종기에 따라서도 변동하고 있다. 일주입중 즉 수랴오가 타형질과의 상관을 보면 대체로 전보와 같이 100입중이외의 제형질은 정의 상관을 보이며, 파종기에 따라서도 그 값이 변동을 하나 전보에서는 일주입중과 분지수 사이에 고도의 상관관계가 보였으나, 본실험에 있어서는 상관의 경향이 보였을 따름이다. 그리고 본실험에 있어서는 일주협수와 일주입수간에서 유전상관이 1이상의 이상치를 보였다. 3. 선발지수 : 선발이 최종 대상형질을 일주입중(형질 Y)으로 하여 여기에 어려 형질을 조합한 선발지수(Selection index A)와 최종 대상형질을 수량과 높은 유전상관이 있는 일주협수(형질 Y')로 하여 여기에 여러 형질을 조합한 선발지수(Selection index B)를 Robinson et al.의 방법에 의하여 작성하여 본 바 제7표와 같다(Table 7). 전보의 결과와 같이 대두의 선발에 있어서는 최종 대상형질을 일주입중 대신에 일주협수로써 선발하여도 대차가 없고, 선발대상형질을 4개형질이상인 경우에는 그 효과가 조사와 산출에 요하는 노력에 비하여 크게 기대될 정도가 못된다. 이와 같은 점에서 다수확을 목표로 하는 선발은 탈곡조제 전에 일주협수ㆍ분지수ㆍ경직경 등에 대하여 조사를 하고 선발지수를 산출하여 Selection score가 큰 계통부터 선발하여 가면 될 것으로 믿는다. 그리고 선발을 위한 대상형질로는 생육일수(X$_1$)ㆍ분지수(X$_2$)ㆍ경직경(X$_3$), 그리고 일주협수(X$_4$)의 4개형질 혹은 분지수(X$_2$)ㆍ경직경(X$_3$), 그리고 일주협수(X$_4$)의 3개형질로 할 것이 요망되고, 이들 형질의 측정치로 선발지수를 작성하여 그 지수에서 산출된 Selection score가 큰 계통부터 선발해 나가는 것이 선발지수의 이용상 실용적이고 효과적인 방법이라 하겠다.

• 응용통계연구
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• 제25권3호
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• pp.471-483
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• 2012

One of the most important problems in cluster analysis is the selection of variables that truly define cluster structure, while eliminating noisy variables that mask such structure. Brusco and Cradit (2001) present VS-KM(variable-selection heuristic for K-means clustering) procedure for selecting true variables for K-means clustering based on adjusted Rand index. This procedure starts with the fixed number of clusters in K-means and adds variables sequentially based on an adjusted Rand index. This paper presents an updated procedure combining the VS-KM with the automated K-means procedure provided by Kim (2009). This automated variable selection procedure for K-means clustering calculates the cluster number and initial cluster center whenever new variable is added and adds a variable based on adjusted Rand index. Simulation result indicates that the proposed procedure is very effective at selecting true variables and at eliminating noisy variables. Implemented program using R can be obtained on the website "http://faculty.knou.ac.kr/sskim/nvarkm.r and vnvarkm.r".

• 무역학회지
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• 제47권5호
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• pp.21-37
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• 2022

Baltic Dry Index (BDI) is difficult to forecast because of the high volatility and complexity. To improve the BDI forecasting ability, this study apply Bayesian variable selection method with a large number of predictors. Our estimation results based on the BDI and all predictors from January 2000 to September 2021 indicate that the out-of-sample prediction ability of the ADL model with the variable selection is superior to that of the AR model in terms of point and density forecasting. We also find that critical predictors for the BDI change over forecasts horizon. The lagged BDI are being selected as an key predictor at all forecasts horizon, but commodity price, the clarksea index, and interest rates have additional information to predict BDI at mid-term horizon. This implies that time variations of predictors should be considered to predict the BDI.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제25권8호
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• pp.1073-1082
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• 2012

We first sought to clarify the effects of discounted rate, survival rate, and lactation persistency as a component trait of the selection index on net merit, defined as the first five lactation milks and herd life (HL) weighted by 1 and 0.389 (currently used in Japan), respectively, in units of genetic standard deviation. Survival rate increased the relative economic importance of later lactation traits and the first five lactation milk yields during the first 120 months from the start of the breeding scheme. In contrast, reliabilities of the estimated breeding value (EBV) in later lactation traits are lower than those of earlier lactation traits. We then sought to clarify the effects of applying single nucleotide polymorphism (SNP) on net merit to improve the reliability of EBV of later lactation traits to maximize their increased economic importance due to increase in survival rate. Net merit, selection accuracy, and HL increased by adding lactation persistency to the selection index whose component traits were only milk yields. Lactation persistency of the second and (especially) third parities contributed to increasing HL while maintaining the first five lactation milk yields compared with the selection index whose only component traits were milk yields. A selection index comprising the first three lactation milk yields and persistency accounted for 99.4% of net merit derived from a selection index whose components were identical to those for net merit. We consider that the selection index comprising the first three lactation milk yields and persistency is a practical method for increasing lifetime milk yield in the absence of data regarding HL. Applying SNP to the second- and third-lactation traits and HL increased net merit and HL by maximizing the increased economic importance of later lactation traits, reducing the effect of first-lactation milk yield on HL (genetic correlation ($r_G$) = -0.006), and by augmenting the effects of the second- and third-lactation milk yields on HL ($r_G$ = 0.118 and 0.257, respectively).

• 한국산림과학회지
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• 제94권2호통권159호
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• pp.82-89
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• 2005

The purpose of this paper is to investigate index numbers by conducting various comparisons among the widely used index formulas. The comparison is considered in three ways; 1) divergences in the magnitudes of index numbers due to the use of different formulas (Laspeyres, Paasche, Fisher, and Tornqvist); 2) the effect of selection of base year (fixed-year base vs. chain-type); 3) the degree of approximation of indirect to direct quantity index. The empirical application is to sawmills and planing mills industry of U.S. using a national time series data covering years of 1948-2000. The results show that the differences between Laspeyres and Paasche index can be substantial in some cases while the difference between Fisher and Tornqvist index is minimal. We also confirm that the selection of base year can cause significant divergences, especially when the variables undergo rapid price or quantity changes over time. We find that indirect quantity index approximates direct quantity index reasonably well in U.S. sawmill industry.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제13권8호
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• pp.3371-3380
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• 2012

본 논문은 기술개발지원사업의 선정 평가지표를 개발하고, 사례에 적용하여 그 타당성을 파악하고 있다. 개발된 선정평가지표의 기업선정순위와 기존 선정평가지표의 기업선정순위를 비교하여 성과를 낸 기업의 순위를 어떤 선정평가지표가 더 정확히 유추해 냈는지를 확인하고 있다. BSC 및 AHP기법을 이용하여 기술개발지원사업 선정평가지표를 개발하였다.