• 제목/요약/키워드: section Liseola

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Fusarium section Liseola 균주들에서 rDNA Intergenic Spacer 부위의 PCR-RFLP 분석 (PCR-RFLP Analysis of Ribosomal DNA Intergenic Spacer Region in Fusarium section Liseola.)

  • 이경은;최영길;민병례
    • 미생물학회지
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    • 제38권1호
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    • pp.7-12
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    • 2002
  • Fusarium section Liseola에 속하는 균주들의 rDNA IGS 부위를 중폭하고 여러개의 제한 효소로 처리하였다. 증폭된 IGS 부위의 길이는 F. moniliforme 12 만이 약 2.9 Kb 이고 나머지 균주들은 모두 약 2.6 Kb였다. 제한 효소 EcoRI, HincII, SalI, PstI 등은 ICS 부위를 절단하여 11균주들에서 9 haplotypes을 확인할 수 있었다. 본 연구에서의 Section Liseola에 속하는 균주들에 대한 결과에 앞서 연구되어진 Section Elegans에 속하는 균주들의 결과를 종합하여 dendrogram을 그렸을 때, IGS 부위를 종내에서와 마찬가지로 종간, section 간의 관계를 밝힐 수 있는 가능성을 제시하여 주었다.

Fusarium속 내의 section Elegans, section Liseola와 유사종의 Isozyme Patterns (Isozyme patterns of section Elegans, section Liseola and similar species in the genus Fusarium)

  • 민병례;권오영
    • 한국균학회지
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    • 제22권4호
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    • pp.386-393
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    • 1994
  • Fusarium 속내 종들의 분류학적 위치를 알아보기 위하여, 각 균의 $esterase-{\alpha},\;-{\beta},\;acid\;phosphatase,\;malate\;dehydrogenase,\;peroxidase,\;polygalacturonase$를 추출하여 전기영동의 방법으로 isozyme patterns를 비교하여 보았다. Banding patterns은 polygalacturonase만이 7종 모두에서 monozyme이었고, 나머지 효소는 종마다 약간씩 다르게 나타났다. Isozyme banding patterns을 바탕으로 genetic similarity를 산출하여 dendrogram으로 보았을 때, 동일한 section Liseola에 속하는 F. subglutinans와 F. moniliforme의 종간 유사도는 74.3%로 가장 높았으며, section Elegans와 section Liseola의 서로 다른 section 간의 유사도는 45.4%로 비교적 낮았다. F. napiforme와 F. nygamai의 유사도는 64.7%로 동일 section 내의 종간 유사도와 비슷한 수치를 나타내었다. 이들 두 종은 section Liseola에 대하여 55.2%, section Elegans에 대하여 45.4%의 유사도를 보여 분류학적 위치에 있어서 section Liseola에 더 가까운 경향을 나타내지만, 이는 다른 section 간의 유사도와 비슷한 수치로 하나의 독립된 section으로 추정된다. F. graminearum과 다른 6종 사이의 유사도는 28.2%의 낮은 수치를 나타내어 서로의 유사성이 매우 낮다는 것을 보여 주었다.

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Fusarium 균의 section Liseola에 대한 핵형 연구 (Study of Electrophoretic Karyotypes of Fusarium Section Liseola)

  • 밍병례;안미선;최영길
    • 미생물학회지
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    • 제35권3호
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    • pp.192-196
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    • 1999
  • Fusarium 균 중에서 section Liseola 에 속하는 8균주에 대하여 CHEF-PFGE를 이용하여 핵형을 분석비교하였다. 0.75 Mb에서 6.45Mb 크기의 DNA band가 9~13개로 분리되었고 전체 genome 크기는 38.19 Mb에서 43.22Mb 였으며 종간, 종내에서 염색체 길이 다형성을 볼 수 있었다. F. moniliforme 로부터 얻은 IGS sequence(2.6Kb), Neurospora crassa 의 chs-2 gene(2.8Kb) 과 trp-3gene(3.8 Kb)을 probe로 하여 hybridization을 통하여 이들 gene 의 위치를 확인하고자 하였다.

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Comparison of electrophoretic karyotypes in fusarium

  • Min, Byung-Re
    • Journal of Microbiology
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    • 제33권4호
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    • pp.334-338
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    • 1995
  • The electrophoretic karyotypes of 6 species in different Fusarium sections were examined by using contour-clamped homogeneous electric field (CHEF) gel electrophoresis. Intact chromosomal DNA was prepared from protoplasts and up to 9 distinct bands were separated on 0.7% or 0.8% agarose gel under several different conditions. Putative chromosome numbers varied from 6 to 9 amd polymorphic karyotypes were observed in different Fusarium sections. Using Schizosaccharomyces pombe and Saccharomyces cerevisiae chromosomes as standards, the sizes of the Fusarium spp. chromosomes were estimated. The electrophoretic karyotypes of F. moniliforme and F. subglutinans (section Liseola) were similar. Unidentified filamentour fungi, F. beomiforme was much closer to F. axysporum (section Elecgans) in karyotype and the karyotypes of F. napiforme were more similar to those of section Liseola than any other sections. F. graminearum (section Discolor) had a distinctive electrophoretic karyotype.

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이차 전기영동법을 이용한 Fusarium 속의 다당류 비교 (Comparision of Polypeptide Patterns by 2-D PAGE in Fusarium Species)

  • 민병례
    • 한국균학회지
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    • 제23권4호통권75호
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    • pp.359-368
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    • 1995
  • F. napiforme, F. beomiforme and F. nygamai could not be classified in any of the existing sections of the genus Fusarium. To discuss of the exact taxonomic relationships among these species, the cellular polypeptide patterns were compared by using 2-D PAGE. Polypeptide pattern of F. beomiforme was different from those of other two species and was more similar to F. oxysporum in section Elegans. F. nygamai and F. napiforme might be another same section which would lie between section Liseola and section Elegans. The results were consistent with the comparison of isoenzyme patterns in these species.

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Fusarium속에서 PFGE를 이용한 Electrophoretic Karyotyping (Electrophoretic Karyotyping by PFGE in the Genus Fusarium)

  • 민병례;정진숙;최영길
    • 한국균학회지
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    • 제26권2호통권85호
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    • pp.135-143
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    • 1998
  • CHEF (Contour-Clamped homogeneous electric field) gel electrophoresis를 이용하여 Fusarium section Sporotrichiella, Liseola, Gibbosum, Discolor와 Martiella에 속하는 10종의 electrophoretic karyotype을 비교하였다. Intact chromosomal DNA는 균류의 원형질체로부터 추출하였으며, 크기에 따라 다양한 조건을 주어 DNA 분자를 분리시켰다. Fusarium속에 속하는 종의 염색체는 0.78Mb에서 7.20Mb의 크기를 가진 염색체가 종에 따라 $5{\sim}13$개였다. 각 종의 total genome 크기는 18.32Mb에서 48.20Mb였다. Electrophoretic karyotype을 비교한 후 F. oxysporum formae speciales lilii로부터 무작위로 선택하여 만든 genomic DNA를 probe로 하여 Southern hybridization 분석을 수행하였다.

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PCR-RFLP and Sequence Analysis of the rDNA ITS Region in the Fusarium spp.

  • Min, Byung-Re;Lee, Young-Mi;Choi, Yong-Keel
    • Journal of Microbiology
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    • 제38권2호
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    • pp.66-73
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    • 2000
  • To investigate the genetic relationship among 12 species belonging to the Fusarium section Martiella, Dlaminia, Gibbosum, Arthrosporiella, Liseola and Elegans, the internal transcribed spacer(ITS) regions of ribosomal DNA (rDNA) were amplified with primer pITS1 and pITS4 using the polymerase chain reaction(PCR). After the amplified products were digested with 7 restriction enzymes, restriction fragment length polymorphism (RFLP) patterns were analyzed. The partial nucleotide sequences of the ITS region were determined and compared. Little variation was observed in the size of the amplified product having sizes of 550bp or 570bp. Based on the RFLP analysis, the 12 species studied were divided into 5 RFLP types. In particular, strains belonging to the section Martiella were separated into three RFLP types. Interestingly, the RFLP type of F. solani f. sp. piperis was identical with that of isolates belonging to the section Elegans. In the dendrogram derived from RFLP analysis of the ITS region, the Fusarium spp. examined were divided into two major groups. In general, section Martiella excluding F. solani f. sp. piperis showed relatively low similarity with the other section. The dendrogram based on the sequencing analysis of the ITS2 region also gave the same results as that of the RFLP analysis. As expected, 5.8S, a coding region, was highly conserved, whereas the ITS2 region was more variable and informative. The difference in the ITS2 region between the length of F. solani and its formae speciales excluding F. solani f. sp. piperis and that of other species was caused by the insertion/deletion of nucleotides in positions 143-148 and 179-192.

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인삼 뿌리썩음병(根 病) 관련 Fusarium species와 그 병원성 (Fusarium species Associated with Ginseng (Panax ginseng) and Their Role in the Root-Rot of Ginseng Plant)

  • 이순구
    • 식물병연구
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    • 제10권4호
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    • pp.248-259
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    • 2004
  • 1982년부터 1885년 동안, 인삼뿌리썩음병 및 근권 토양에서 분리한 Fusarium균(115균주)을 Snyder-Hansen 방식(주로 F. solani 및 F. oxysporum의 동정에 적용) 및 Gerlach-Nirenberg 방식(주로 F. moniliforme[Liseola section]의 균주 동정 및 F. roseum[Snyder-Hansen 분류개념에 의한]에 속하는 균주 동정에 적용), 그리고 Cylindrocarpon균은 Booth 방식으로 분류 동정한 결과, 11개의 종으로 나눌 수 있었다. 가장 많이 분리된 균은 Fusarium solani(55균주), F. oxysporum(35균주), 그리고 F. moniliforme(10균주) 등이었다. Snyder와 Hansen(1945) 분류방식에 의해 F. roseum으로 불리우는 나머지 균주들(15균주)은 매우 드물게 분리되었으며, 8개의 종으로 다시 분류할 수 있었다. 이들은 F. equiseti, F. avenaceum, F. graminum, F. arthrosporioides, F. sambucinum, F. reticulatum, F. semitectum and F. poa 등이었다. 1985년 6월 이들 Fusarium 균주들과 Cylindrocarpon destructans 균주들 및 주요 인삼의 토양전염성 병원균 균주들을 증평인삼시험장 3년생 격리포장에서 균총 절편으로 뿌리 상부에 접종시켜 그 병원성을 검정한 결과, Phytophthora cactorum과 Pythium ultimum은 접종 12일 만에 지상부 위조 및 뿌리의 물렁썩음을 일으키는 높은 병원성을 나타내었다. 접종 후 77일경에 뿌리를 채굴하여 뿌리의 마른 썩음을 조사한 결과, Fusarium solani 균은 34 균주 중 1개 균주만이 병원성을 보였으나, Cylindrocarpon destructans는 12개 접종 균주 모두 인삼의 뿌리썩음에 높은 병원성을 나타내었다 . Fusarium solani 및 Cylindrocarpon destructans는 전형적인 기주-위주의 인삼 토양병원균으로 추정할 수 있었다.

Population Genetic Analyses of Gibberella fujikuroi Isolated from maize in Korea

  • Park, Sook-Young;Seo, Jeong-Ah;Lee, Yin-Won;Lee, Yong-Hwan
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제17권5호
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    • pp.281-289
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    • 2001
  • We analyzed 88 strains of Gibberella fujikuroi (Analmorph: Fusarium section Liseola) from maize in Korea for mating population, mating type, fumonisin production vegetative compatibility, and random amplified polymorphic DNA (RAPD) patterns. We found 50 strains that were MATA-2, 22 that were MATA-1, 1 that was MATD-1, and 15 that were not reproducibly fertile with any of the mating type testers. Of the 50 MATA-2, 15 were female fertile, while 10 of the 22 MATA-1 strains were female fertile. A total of 1,138 nitrate non-utilizing (nit) mutants were recovered from a total of 88 strains. These strains were grouped into 39 vegetative compatability groups (VCGs) by demonstrating heterokaryosis between nit mutants. A single maize ear could be infected by more than one VCG of F. moniliforme. RAPD analysis measured genetic diversity among 63 strains of F. moniliforme. Several VCGs were distinguished by RAPD fingerprinting patterns. Most strains produced significant levels of fumonisins. However, 6 MATA-2 strains from a single VCG produced higher levels of fumonisin $\textrm{B}_3$ than that of fumonisin $\textrm{B}_1$ or $\textrm{B}_2$. From these data, we concluded that most Korean strains of F. moniliforme associated with maize belonged to mating population A and produced significant levels of fumonisins. Futhermore, RAPD analysis could differentiate strains associated with different VCGs.

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