2015년, 조 바이러스 발생양상을 구명하기 위하여 전국적인 조사를 실시하였다. 주요재배단지 7개 지역에서 이상 증상과 바이러스 병징을 보이는 식물체 100점을 수집하여, RT-PCR 진단과 RNA sequencing 방법을 이용하여 전체 4종의 바이러스를 동정하였다. 수집한 시료에서는 Barley virus G (BVG)가 10점, Rice stripe virus (RSV)는 4점, Northern cereal mosaic virus (NCMV), Sugarcane yellow leaf virus (ScYLV)가 각각 1점씩 검출되었다. 이들중에서 BVG와 NCMV는 국내 조에서 첫 발생보고이며, ScYLV는 Polerovirus속의 신종으로 예상된다. 본 연구결과는 조 식물체의 무병종자와 저항성 품종개발을 위한 기초연구 자료로 이용 가능할 것으로 생각된다.
다공성 세라믹 큐브를 이용한 RT-PCR 진단법은 별도의 핵산 추출 과정이나 용액 처리 없이, 식물체에 접촉시켜 큐브의 공극에 바이러스 입자나 핵산 등의 분자가 신속하게 흡수되면 이를 바로 RT-PCR 반응에 넣어 유전자를 증폭시키는 방법으로, 식물체로부터 빠르고 정확하게 바이러스를 진단하는 방법이다. 본 연구에서는 다공성 세라믹 큐브를 이용하여 벼에 발생하는 주요 바이러스인 벼줄무늬잎마름바이러스(RSV)를 진단하는 RT-PCR 진단법을 확립하였다. 벼의 잎, 잎집, 또는 줄기를 대상으로 큐브 1개 또는 3개를 사용하여 즙액을 흡수시킨 후, 이를 RT-PCR 주형으로 사용하였고, 그 결과 변성처리에 큰 차이 없이 증폭 효율이 나타났다. 또한 즙액을 흡수한 큐브는 9주차까지 상온에서 보관한 후 RT-PCR을 실시하여도 안정적으로 증폭 효율을 나타내었다.
Fang, Ying;Choi, Jae Young;Park, Dong Hwan;Park, Min Gu;Kim, Jun Young;Wang, Minghui;Kim, Hyun Ji;Kim, Woo Jin;Je, Yeon Ho
The Plant Pathology Journal
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제36권3호
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pp.280-288
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2020
RNA interference (RNAi) has attracted attention as a promising approach to control plant viruses in their insect vectors. In the present study, to suppress replication of the rice stripe virus (RSV) in its vector, Laodelphax striatellus, using RNAi, dsRNAs against L. striatellus genes that are strongly upregulated upon RSV infection were delivered through a rice leaf-mediated method. RNAi-based silencing of peroxiredoxin, cathepsin B, and cytochrome P450 resulted in significant down regulation of the NS3 gene of RSV, achieving a transcriptional reduction greater than 73.6% at a concentration of 100 ng/μl and, possibly compromising viral replication. L. striatellus genes might play crucial roles in the transmission of RSV; transcriptional silencing of these genes could suppress viral replication in L. striatellus. These results suggest effective RNAi-based approaches for controlling RSV and provide insight into RSV-L. striatellus interactions.
Yield losses due to diseases and insect pests were mentioned and emphasized the efficiency of resistant cultivars in curving the yield losses and increasing chemical efficiency. Present status of resistance breeding for blast, bacterial leaf blight viruses, brown planthopper and white backed planthopper were introduced and the resistance sources for those are discussed. Breeding strategies for above items were presented. Specially for the blast resistance, discussions were made in some detail. With brief future prospects of resistance breeding in Korea, a suggestion was made for pathologists to make clear about whether the blast spores will be brought from mainland China as we see with Bph and Wbph or not.
Viruses diagnosed on crops including rice plants from farmers or agricultural extension agencies cover the country were 11 species including Broad bean wilt virus 2 (BBWV2) in 2008. Tomato spotted wilt virus (TSWV) was the most important virus having the detection rate of 22.9%. Two viruses of Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) and Tobacco leaf curl virus (TLCV) inducing leaf yellow and curl diseases on tomatoes were occurred newly with the detection rate of 12.2% and 4.0%, respectively, in 2008. Rice stripe virus (RSV) was occurred on 869.5 ha mainly at Jindo and Haenam areas in Jeollanamdo province. At Jindo area, 12 plots were damaged severely with the infected hill rate of 83.8%. At the main production area of oriental melon at Seongju, almost all fruits from whole sale market at Seongju were infected with Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV) as the detection rate of 87%. The areas occurred TSWV in Korea were 25 totally from 2003 including 7 areas newly reported in 2008 including Naju in Jeoallanamdo. TSWV could be reduced as 0.1 % from 5.3% by covering insect proof net in vinyl house after chemical soil sterilization. Tomato yellow leaf curl disease was occurred on April in 2008 at Tongyoung area in Kyeongsangnamdo, and detected continuously at 13 areas, 7 in Kyeongsangnamdo, 4 in Jeollabukdo and 2 in Jejudo. Potato spindle tuber viroid (PSTVd) was occurred abruptly in a confined space of a civil breeding greenhouse and a cultivar evaluation field followed by disuse 17.4 M/T of potato tubers. No PSTVd was detected at 17 fields cultivated the related potatoes to the bred company by RT-PCR.
The severe damage induced by the important viruses of Rice stripe virus (RSV), Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV), Melon necrotic spot virus (MNSV), Tomato spotted wilt virus (TSWV) and Tomato bushy stunt virus (TBSV) was described on major crops in Korea. In 2007, the plot incidence rate of RSV was 100% on the precocious rice cultivars at the Western coastal provinces of Gyeonggido, Chungcheongnamdo, Jellabugdo and Jellanamdo, and Jejudo. RSV occurred in 2,441 ha with incidence rate of 70% over at 5 areas of Seocheon, Seosan, Boryung, Hongsung and Buyou in Chungcheongnamdo. At 4 areas of Buan, Gimje, Gunsan and Gochang in Jellabukdo, RSV occurred in 2.016 ha. CGMMV occurred on watermelon in 4.6 ha at Cheongyang area, and its outbreak was also 890 ha on oriental melon for 120 farmers with the incidence area of 23% against total cultivation areas of Seongju. MNSV was recorded firstly on watermelon in 2006 at Andong and it spread to 3 areas of Hapcheon, Gochang and Yanggu. TSWV occurred firstly at Danggin in Chungcheongnamdo in 2005. TSWV in 2006 spread to 6 areas; Taian, Hongsung and Seosan in Chungcheongnando, Namwon in Jellabukdo, and Sunchon and Kwangju in Jellanamdo. In 2007, TSWV covered 17 areas of western and southern parts; the 5 area including Taian in Chungcheongnamdo, Kwangju in Jellanamdo, Bucheon in Gyunggido, and so forth. TBSV was described firstly on table tomato at Sacheon in Kyungsangnamdo in 2004. TBSV occurred on cherry tomato at Chungju in 2006 and on table tomato at Busan area.
벼키다리병은 Fusarium fujikuroi의 감염에 의해 발생하는 대표적인 종자전염성 병이다. 이 병의 방제는 화학약제를 이용한 종자소독이 가장 효율적이지만 최근 약제에 저항성을 갖는 균주의 출현이 증가하고 있다. 미산성 차아염소산수는 환경이나 사람의 건강에는 유해성이 낮지만 바이러스, 박테리아, 곰팡이에 강력하고 광범위한 항균활성을 갖는 살균소독제로 알려져 있다. 본 연구는 화학 약제 저항성 또는 민감성 균주를 포함하는 16개의 F. fujikuroi 균주를 대상으로 미산성 차아염소산수의 항균활성을 조사하고, 이를 이용한 친환경적 병 방제 기술 개발을 목적으로 하였다. 미산성 차아염소산수는 화학약제 저항성 균주를 포함한 조사한 F. fujikuroi 균주 모두에 대해 유리염소 5±2.5 ppm 농도에서 비특이적이고 강한 항균 활성을 나타냈고, 처리 후 5분 이내에 F. fujikuroi 세포의 치명적 손상과 함께 완전한 살균 효과를 나타났다. F. fujikuroi 균주로 감염된 벼 종자를 20±10 ppm의 유리염소를 포함하는 미산성 차아염소산수로 12시간 침지 소독하였을 경우, 종자 소독 효과와 병 방제율은 각각 95~98%와 90.1~92.6%였다.
For a variety of viruses, the primary virus infection has been shown to prevent superinfection with a homologous secondary virus; however, the mechanism of exclusion has not been clearly understood. In this work, we demonstrated that BVDV -infected MDBK cells were protected from superinfection with a homologous superinfecting BVDV, one of the positive-sense RNA pestiviruses, but not with an unrelated rhabdovirus, such as vesicular stomatitis virus. Once superinfection exclusion was established by a primary infection with BVDV, the transfected infectious BVD viral RNA genome was shown to be competent for viral translation, but not viral replication. In addition, our results also demonstrated that upon superinfection, the. viral RNA genome of viral particles was not transferred into the cytoplasm of BVDV -infected cells. Using newly developed system involving rapid generation of the MDBK cells expressing BVD viral proteins, we subsequently found that expression of the viral structural proteins was dispensable for the block occurring at the level of viral RNA replication, but required for the exclusion at the level of viral entry step. Altogether, these findings provide evidence that the superinfection exclusion of BVDV occurs not only at the level of viral replication in which the viral replicase are involved, but also at the level of viral entry with which the viral structural proteins are associated, and that a cellular factor(s) play an essential role in this process.
Kim, Na-Kyeong;Lee, Hyo-Jeong;Kim, Sang-Min;Jeong, Rae-Dong
The Plant Pathology Journal
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제38권2호
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pp.159-166
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2022
Barley yellow dwarf virus (BYDV) has been a major viral pathogen causing significant losses of cereal crops including oats worldwide. It spreads naturally through aphids, and a rapid, specific, and reliable diagnostic method is imperative for disease monitoring and management. Here, we established a rapid and reliable method for isothermal reverse transcription recombinase polymerase amplification (RT-RPA) combined with a lateral flow strips (LFS) assay for the detection of BYDV-infected oat samples based on the conserved sequences of the BYDV coat protein gene. Specific primers and a probe for RT-RPA reacted and optimally incubated at 42℃ for 10 min, and the end-labeled amplification products were visualized on LFS within 10 min. The RT-RPA-LFS assay showed no cross-reactivity with other major cereal viruses, including barley mild mosaic virus, barley yellow mosaic virus, and rice black streaked dwarf virus, indicating high specificity of the assay. The sensitivity of the RT-RPA-LFS assay was similar to that of reverse transcription polymerase chain reaction, and it was successfully validated to detect BYDV in oat samples from six different regions and in individual aphids. These results confirm the outstanding potential of the RT-RPA-LFS assay for rapid detection of BYDV.
'삼광1호'는 중부지역 적응하는 고품질 품종을 육성할 목적으로 2005년 하계에 중생이고 단간이며 도복에 강한 '수원152호'와 중만생이고 흰잎마름병에 저항성이며 도정특성이 좋은 최고품질 품종 '삼광'를 인공교배한 잡종1세대에 삼광을 여교배하였다. 삼광이 여교배된 $F_1$개체를 양성하며 조기에 유전특성을 고정하고자 꽃가루 배양을 실시하고 육성계통 세대 진전 후 SR30176-HB2946-B-32-1-1계통을 선발하여 수원566호로 계통명을 부여하였다. 2013년부터 2015년까지 지역적응시험 3년을 실시한 결과 그 우수성이 인정되어 2015년 12월 농촌진흥청 직무육성 신품종선정위원회에서 신품종으로 선정됨과 동시에 '삼광1호'으로 명명되었다. '삼광1호'의 출수기는 보통기 재배에서 평균 출수기가 8월 8일로 '화성'보다 2일 빠른 중생종이고, 벼 간장은 77 cm로 '화성'보다 7 cm 작은 준단간이며, 이삭길이는 20 cm, 주당 이삭수 13개로 화성과 같은 특성이나, 이삭당 입수는 128개로 '화성'보다 많았고. 등숙률은 87.4%로 '화성'보다 낮았으며, 현미 천립중이 21.7 g으로 중소립종이다. '삼광1호'는 도열병에 강한 저항성을 보였고, 흰잎마름병은 K1, K2, K3 균계에 저항성을 보였지만, 오갈병 및 멸구류에 대한 저항성은 없었다. '삼광1호'는 도복에는 중정도이며, 수발아는 화성보다 강한 반응을 보였고, 내냉성은 '화성'과 비슷한 수준을 보였다. '삼광1호'의 백미외관은 심백이 0으로 아주 맑고 투명하였다. 알칼리붕괴도는 6.2, 단백질함량은 6.2%, 아밀로스함량은 18.9%로 '화성'보다 낮아서 미질특성이 우수하였고, 관능검정 결과 밥맛은 0.35로 '화성'보다 매우 우수한 품종이었다. 제현율, 현백률 및 도정률은 '화성'과 비슷하였으나 도정된 쌀의 완전립률이 94.2%로 '화성'의 81.6%보다 높은 편이었고 완전미도정수율도 70.5%로 '화성'보다 우수하였다. '삼광1호'의 쌀수량은 중부평야지와 중서부해안지 등 11개 지역에서 보통기 보비재배 평균 5.62 MT/ha로 '화성'의 5.22 MT/ha 보다 8% 높았다. 최고품질 품종 '삼광1호'의 적응지역은 중부 평야지와 중서부해안지이다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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