• 제목/요약/키워드: reverse transcriptase polymerase chain reaction

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신종 플루 폐렴으로 입원한 환자들에서 주요 합병증 발생과 관련된 인자 (Associated Factor Related to Major Complications of Patients with Hospitalized for 2009 H1N1 Influenza Pneumonia)

  • 최상식;김원영;김성한;홍상범;임채만;고윤석;김원;임경수
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제68권3호
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    • pp.162-167
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    • 2010
  • Background: To date, there are few data on the risk factors for severe cases and deaths associated with the 2009 pandemic H1N1 influenza A. Here, we describe the clinical and epidemiologic characteristics of patients hospitalized for pneumonia and identify those factors associated with the development of major complications (MC). Methods: We reviewed the medical records of 41 cases of pneumonia admitted to a university-affiliated tertiary hospital between Aug 26 and Dec 10, 2009, and who had confirmed H1N1 influenza A based on real-time reverse transcriptase-polymerase-chain-reaction assay. There were 7,962 patients that fit these criteria. We compared the clinical features and demographic characteristics of patients who developed MC to with those who did not develop MC. Results: During the study period, 10 patients developed MC (required admission to the intensive care unit, n=10; required ventilator therapy, n=6; death, n=4). Patients with MC were significantly older than those without MC and more frequently had underlying medical conditions (90.0% vs 41.9%, p-value <0.01). In the patients with developed MC, the median $PaO_2/FiO_2$ ratio of 230.0 (145.0~347.3) at admission and pneumonia severity index (PSI) score of 141.5 (88.3~158.5) were higher than patients without MC. However, no differences were observed in laboratory findings or in viral shedding between the 2 groups. Conclusion: In hospitalized pneumonia patients of 2009 H1N1 influenza, old age, a history of malignancy, initial hypoxemia, $PaO_2/FiO_2$ ratio, and PSI score appear to be risk factor significantly related to developing MC. These findings might be the basis to influence strategies for admitting patients to an intensive or intermediate care unit and for pre-emptive antiviral therapy.

야채스프의 RAW 264.7 세포에서 항염증 효과 (Anti-Inflammatory Effects of Vegetable Soup in Murine Macrophage RAW 264.7 Cells)

  • 심재근;이재혁;신태용;신혜영;정숙희;김미혜;구호준;박정숙
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제39권8호
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    • pp.1097-1101
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    • 2010
  • 본 연구의 목적은 일상생활에서 쉽게 섭취할 수 있는 당근, 무, 무청, 우엉, 표고버섯을 재료로 한 야채 스프의 항염증성을 검토하기 위한 것으로, RAW264.7 세포에서 LPS에 의해 유도되는 염증물질 중 NO와 염증성 사이토카인 TNF-$\alpha$에 대한 억제력을 관찰하였다. 실험결과 실험에 사용된 야채스프는 세포독성을 나타내지 않았다. 세포독성이 없음을 확인 한 후 LPS로 처리한 RAW264.7 세포에서 야채스프의 NO 생성억제를 평가한 결과 RAW264.7 세포만 배양한 대조군에서 NO의 농도는 매우 낮게 측정되었으며, LPS를 처리한군에서 NO의 농도는 현저히 증가되었다. 또한 야채스프를 처리한 실험군은 NO 생성이 유의성 있게 억제되었으며, RAW264.7 세포를 LPS로 처리 시 iNOS가 발현되어 NO를 생성하게 되므로 iNOS의 발현에 미치는 영향을 평가하였다. LPS 처리 시 iNOS 유전자 발현이 유의하게 증가되었으나, 야채스프를 전 처리한 실험군에서 iNOS의 양이 감소하였다. 야채스프에 의한 iNOS의 발현억제는 NO 생성억제를 유도를 의미한다. Proinflammatory cytokines인 TNF-$\alpha$ 분비 억제를 살펴본 결과 LPS를 처리한 군에서 TNF-$\alpha$의 분비가 현저하게 증가되었으나 야채스프를 처리한 군에서는 유의한 억제를 나타냈다. 이상과 같이 야채스프는 RAW264.7 세포에서 LPS에 의해 유도되는 NO의 생성억제, iNOS의 발현을 억제시켰으며, proinflammatory cytokines인 TNF-$\alpha$의 분비량도 억제시켰다. 이는 야채수프의 항염증성을 입증하기 위한 기초자료로 활용이 가능하다고 사료된다.

위암에서 정량적 역전사 중합효소연쇄반응을 이용한 다중 표지자 분석 (Multiple Genetic Marker Analysis with Using Quantitative RT-PCR in Gastric Cancer)

  • 유문원;이혁준;최수민;유지은;허근;김영국;양한광
    • Journal of Gastric Cancer
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    • 제7권2호
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    • pp.59-66
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    • 2007
  • 목적: 위암 세포주 및 조직에서 다중 표지자 mRNA 발현을 정량적 RT-PCR 검사를 통해 확인함으로써 이들 표지자를 이용하여 위암의 복강내 미세전이 진단이 가능한가를 평가하고자 본 연구를 시행하였다. 대상 및 방법: 12개의 인체 위암 세포주와 10개의 위암 조직을 대상으로 Carcinoembryonic antigen (CEA), Cytokeratin 20 (CK20), Dopa decarboxylase (DDC), L-3-phosphoserine phosphatase (L3PP)의 네 가지 mRNA를 이용한 정량적 RT-PCR 다중 표지자 분석을 시행하였다. 결과: 12개의 인체 위암 세포주 중 CEA는 4개(33%), CK-20는 1개(8%), DDC는 6개(50%), L3PP는 12개 세포주 모두(100%)에서 과발현되었다. 10개의 위암 조직 중 CEA는 9개, CK20은 3개, DDC는 9개, L3PP는 10개 조직 모두에서 과발현되었다. L3PP는 모든 위암 세포주와 조직에서 과발현을 나타내었으나 과발현 정도는 비교적 낮게 측정된 반면, CEA와 DDC는 일부 위암 세포주 및 조직에서만 과발현을 나타내었지만 파발현 시 충분한 발현도를 나타내었다. 결론: 위암 환자에서 하나 이상의 암 특이적 유전자를 이용한 다중 표지자 분석은 단일 표지자 분석이 가지는 단점을 보완할 수 있을 것으로 예상되며, CEA, DDC, 및 L3PP의 세 가지 mRNA가 후보 유전자로 사용될 수 있을 것으로 생각한다.

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Molecular analysis of alternative transcripts of equine AXL receptor tyrosine kinase gene

  • Park, Jeong-Woong;Song, Ki-Duk;Kim, Nam Young;Choi, Jae-Young;Hong, Seul A;Oh, Jin Hyeog;Kim, Si Won;Lee, Jeong Hyo;Park, Tae Sub;Kim, Jin-Kyoo;Kim, Jong Geun;Cho, Byung-Wook
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제30권10호
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    • pp.1471-1477
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    • 2017
  • Objective: Since athletic performance is a most importance trait in horses, most research focused on physiological and physical studies of horse athletic abilities. In contrast, the molecular analysis as well as the regulatory pathway studies remain insufficient for evaluation and prediction of horse athletic abilities. In our previous study, we identified AXL receptor tyrosine kinase (AXL) gene which was expressed as alternative spliced isoforms in skeletal muscle during exercise. In the present study, we validated two AXL alternative splicing transcripts (named as AXLa for long form and AXLb for short form) in equine skeletal muscle to gain insight(s) into the role of each alternative transcript during exercise. Methods: We validated two isoforms of AXL transcripts in horse tissues by reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR), and then cloned the transcripts to confirm the alternative locus and its sequences. Additionally, we examined the expression patterns of AXLa and AXLb transcripts in horse tissues by quantitative RT-PCR (qRT-PCR). Results: Both of AXLa and AXLb transcripts were expressed in horse skeletal muscle and the expression levels were significantly increased after exercise. The sequencing analysis showed that there was an alternative splicing event at exon 11 between AXLa and AXLb transcripts. 3-dimentional (3D) prediction of the alternative protein structures revealed that the structural distance of the connective region between fibronectin type 3 (FN3) and immunoglobin (Ig) domain was different between two alternative isoforms. Conclusion: It is assumed that the expression patterns of AXLa and AXLb transcripts would be involved in regulation of exercise-induced stress in horse muscle possibly through an $NF-{\kappa}B$ signaling pathway. Further study is necessary to uncover biological function(s) and significance of the alternative splicing isoforms in race horse skeletal muscle.

Cyclosporin A-induced Gingival Overgrowth is Closely Associated with Regulation Collagen Synthesis by the Beta Subunit of Prolyl 4-hydroxylase and Collagen Degradation by Testican 1-mediated Matrix Metalloproteinase-2 Expression

  • Park, Seong-Hee;Kim, Jae-Yoen;Kim, Hyun-Jeong;Park, Kwang-Kyun;Cho, Kyoo-Sung;Choi, Seong-Ho;Chung, Won-Yoon
    • International Journal of Oral Biology
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    • 제33권4호
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    • pp.205-211
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    • 2008
  • Gingival overgrowth can cause dental occlusion and seriously interfere with mastication, speech, and dental hygiene. It is observed in 25 to 81% of renal transplant patients treated with cyclosporine A (CsA). CsA-induced gingival overgrowth (CIGO) is caused by quantitative alteration of the extracellular matrix components, particularly collagen. However, the molecular mechanisms involved in the pathogenesis of CIGO remain poorly understood, despite intense clinical and laboratory investigations. The aim of the present work is to identify differentially expressed genes closely associated with CIGO. Human gingival fibroblasts were isolated by primary explant culture of gingival tissues from five healthy subjects (HGFs) and two patients with the CIGO (CIGO-HGFs). The proliferative activity of CsA-treated HGFs and CIGO-HGFs was examined using the MTT assay. The identification of differentially expressed genes in CsA-treated CIGO-HGF was performed by differential display reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) followed by DNA sequencing. CsA significantly increased the proliferation of two HGFs and two CIGO-HGFs, whereas three HGFs were not affected. Seven genes, including the beta subunit of prolyl 4-hydroxylase (P4HB) and testican 1, were upregulated by CsA in a highly proliferative CIGO-HGF. The increased P4HB and testican-1 mRNA levels were confirmed in CsA-treated CIGO-HGFs by semiquantitative RT-PCR. Furthermore, CsA increased type I collagen mRNA levels and suppressed MMP-2 mRNA levels, which are regulated by P4HB and testican-1, respectively. These results suggest that CsA may induce gingival overgrowth through the upregulation of P4HB and testican-1, resulting in the accumulation of extracellular matrix components.

생약복합조성물(HemoHIM)의 사람 비만세포주 활성 억제 효과 (Inhibitory Effects of a Herbal Composition (HemoHIM) on the Activation of Human Mast Cell Line (HMC-1))

  • 김종진;조성기;정우희;박혜란;이성태
    • 생명과학회지
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    • 제19권12호
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    • pp.1808-1814
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    • 2009
  • 방사선에 대한 방호와 면역기능 조절을 목적으로 새로운 생약복합조성물인 HemoHIM을 개발하였다. 식품 원료로 사용 가능한 생약재 3종 당귀, 천궁, 백작약의 에탄올 분획을 열수추출물에 첨가하여 HemoHIM을 제조하였다. HemoHIM의 항알레르기 효과를 검증하기 위하여 사람 비만세포주 HMC-1을 사용해 compound 48/80으로 유도되는 히스타민 분비량과 PMA/A23187로 유도되는 염증성 사이토카인의 분비량을 측정하였다. 히스타민의 양은 형광분석법으로, 염증성 사이토카인 IL-6, IL-8, TNF-$\alpha$, GM-CSF의 양은 효소결합 면역측정법으로 측정하였다. 저농도의 HemoHIM에 의해 히스타민 분비량이 억제되었고, 모든 농도에서 IL-6, TNF-$\alpha$, GM-CSF의 분비량은 억제되었지만 IL-8은 고농도에서만 억제되었다. 사이토카인의 mRNA 발현량은 HemoHIM의 농도 의존적으로 억제되었다. 그리고 c-kit와 Fc$\varepsilon$RI의 mRNA 발현량도 모든 농도에서 억제되었지만, tryptase의 mRNA 발현량은 저 농도에서만 억제되었다. 이상의 결과로 HemoHIM이 비만세포의 활성을 억제하는 효과가 있다는 것을 알 수 있었으며, 상대적으로 독성이 적은 항알레르기 제재로 개발할 가능성을 제시한 것으로 생각된다.

의사 돼지콜레라 발생농장 역학조사 (Epidemiological surveys of an outbreak of false positive classical swine fever in Gyeongbuk province)

  • 박노찬;조광현;김영환;김순태;김성국;박인화;조민희;오강희;손재권;정종식
    • 한국동물위생학회지
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    • 제26권2호
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    • pp.163-184
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    • 2003
  • This study was conducted to survey the farm which suffered from disease similar to classical swine fever(CSF) in Gyeongbuk province. Clinical signs appeared first in a few number of growing pigs which showed specific signs of diarrhea, depression, sleepiness, and reluctance to get up or to eat. Younger piglets may have appeared chilled, shiver and huddle together. As the disease progresses the affected pig's skin went red and purple. In histopathological signs, there were many haemorrhages throughout the body and larger haemorrhages in some organs such as lymph nodes. And there is a precipitous fall in the number of circulating leukocytes in the blood. In spite of insisting of farmer which did not vaccinate to classical swine fever, significant antibody production was detected in these affected pigs at enzyme-linked immuonsorbent assay. According to the above results at first glance, these affected pig suspected with CSF in clinical signs and histopathological lesions only. Because the symptoms and post-mortem picture were very similar to CSF, these false positive results would have been dangerous to diagnostician. But by reverse transcriptase polymerase chain reaction(RT-PCR) and comparative nucleotide sequence analysis, the disease was correctly diagnosed with post-weaning multisystemic wasting syndrome(PMWS) and porcine reproductive and respiratory syndrome(PRRS) compoundly. And the antigen which were detected the lesion similar to CSF virus, was confirmed with LOM vaccine strain of CSF. In most national CSF eradication program and in countries which are free of the CSF virus, vaccination against CSF is not practiced and generally is not allowed. But now in Korea, routine vaccination is practiced because of outbreaking the CSF repeatedly. When CSF is diagnosed the whole herd and other in contact animal are slaughtered continuously.

착상전 이배체 단위발생 돼지난자의 체외 배양에서 세포사멸과 세포사멸에 관여하는 유전자의 발현에 관한 연구 (Apoptosis and Apoptosis Related Gene Expression in Preimplantation Porcine Diploid Parthenotes Developing In Vitro)

  • X. S. Cui;Kim, I. H.;Kim, N. H.
    • 한국가축번식학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.169-177
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    • 2003
  • 본 연구는 착상전 이배체 단위발생 돼지난자를 체외 배양시 우태아혈청 (FBS), 우혈청 알부민 (BSA) 및 상피세포성장인자 (EGF)를 배양액에 첨가하였을 때 배반포, 총 세포수, 세포사멸 및 세포사멸에 관여하는 유전자의 발현을 조사하고자 수행하였다. 0.4% BSA를 배양액에 첨가하였을 때 2세포기 단위발생 난자의 배반포까지의 발달율이 증가되었다(P<0.01). FBS는 배반포의 총세포수를 감소시 켰고 세포사멸을 증가하였다(P<0.01). 그리고 EGF는 BSA가 존재하는 조건하에서 배반포의 총세포수를 증가하였는데 EGF와 BSA가 각각 단독으로 존재할 때는 이런 작용이 없었다. 세포사멸도 이와 이슷한 경향을 보였는데 EGF와 BSA가 각각 존재할 때에는 비처리군과 차이가 없었지만 함께 존재할 때에는 세포사멸을 감소시켰다. RT-PCR의 결과에 의하면 EGF는 BSA가 존재하는 배양액에서 Bcl-xL 유전자의 상대적 발현량을 증가시키고 Bak 유전자의 상대적 발현량에는 영향을 주지 않는 과정을 통하여 세포사멸을 감소시키는것 같다. 반면에 FBS는 Bcl-xL의 발현량을 감소시키고 Bak 유전자의 상대적 발현량을 증가시킨다. 이러한 결과는 세포사멸에 관여하는 유전자의 발현은 배양액의 첨가물에 따라 유의적으로 영향을 받으며, 체외배양시 배아의 초기발달에 관여함을 시사한다.

치아 우식증에 따른 치수내 유전자 발현 변화에 관한 분석 (GENE EXPRESSION ANALYSIS OF THE DENTAL PULP IN HEALTHY AND CARIES TEETH)

  • 오소희;김종수
    • 대한소아치과학회지
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    • 제37권3호
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    • pp.275-287
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    • 2010
  • 치아 우식증은 범발성 질환이고 이에 대한 생체반응은 단순하지 않으며 질병 과정과 숙주의 활성 모두를 반영하는 복합적인 반응이다. 이러한 반응을 이해하기 위해서는 질병의 세포학적, 분자학적인 면을 이해하는 것이 필수적이다. 이에 본 연구는 임상적으로 건강한 치아와 우식이 진행된 치아로부터 얻어진 치수 안의 유전자 발현을 규명하고 우식 병소에서 일어나는 치유 및 재생에 관계되는 분자와 면역 세포들 사이의 분자 생화학적 상호작용을 규명하기 위해서 우식치아와 건전치아의 치수를 이용하여 cDNA 미세배열(microarray) 분석과 역전사효소 중합효소 연쇄반응 (RT-PCR) 분석, 그리고 면역화학염색법 (immunohistochemistry)을 시행하여 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. cDNA 미세배열 분석 결과, 건전치아군인 대조군에서는 143개의 유전자가, 우식치아군인 실험군에서는 377개의 유전자가 1.6배이상 발현되었다. 2. 역전사효소 중합효소 연쇄반응 분석에서 14개의 유전자를 선택하였고 cDNA 미세배열 분석결과와 동일한 결과를 확인하였다. 3. TGF-${\beta}1$의 면역조직화학적 관찰 결과, 건전치에 비해 우식치의 상아모세포와 치수에서 특히 강하게 발현되었다.

인간치수세포에서 상아모세포의 분화과정 동안 Lysyl Oxidase Family의 역할 (Role of Lysyl Oxidase Family during Odontoblastic Differentiation of Human Dental Pulp Cells Induced with Odontogenic Supplement)

  • 이화정;한수연
    • 치위생과학회지
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    • 제13권3호
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    • pp.296-303
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    • 2013
  • LOX는 결합조직의 세포외기질에 존재하여 교원섬유와 탄성섬유의 교차결합을 촉진시키는 핵심적인 효소이다. 뼈세포에서 세포분화 및 세포이동과 관련된 LOX의 역할은 보고되었으나, 상아모세포 분화에서 LOX에 대한 직접적인 효과는 거의 알려지지 않았다. 이 연구에서는 인간치수세포에서 상아모세의 분화과정 동안 LOX의 역할에 대해 실험하였다. 치수세포에 저 혈청 분화유도 배지를 처리하여 0, 1, 3, 7, 14일 동안 배양하였다. 세포성장은 세포계수, 분화와 관련된 유전자들은 RT-PCR, 광물화는 alrizarin red S 염색으로 각각 실험하였다. LOX 유전자 발현은 RT-PCR로 측정하였고, LOX 효소활성은 고감도 형광분석을 시행하였다. 1. 세포성장은 저 혈청 분화유도 배지에서 시간 의존적으로 증가하였다. 2. 분화표지자인 ALP, OPN, OCN, DMP1, DSPP는 시간 의존적으로 발현되었으나 초기, 중기, 말기에 대한 차별화는 이루어지지 않았다. 3. 광물화는 3일부터 관찰되기 시작하여 14일까지 증가되었다. 4. LOX와 LOXL은 mRNA 발현이 7일까지 증가되었고, 14일에서 큰 감소를 보였다. 하지만, LOXL3와 LOXL4 mRNA는 낮은 발현을 보였고, LOXL2 mRNA는 발현되지않았다. 5. Collagen type I mRNA는 7일까지 증가하다가 14일에서 의미있게 감소를 보였고, collagen type IV는 낮은 mRNA 발현을 보였다. 6. LOX 효소 활성은 분화유도기간 중 7일에서 가장 많은 발현을 보였고, 교원질 1형 기질이 교원질 IV형 기질보다 두드러진 발현을 보였다. 이상의 결과를 종합해 볼 때, LOX isoform의 발현과 LOX 효소 활성은 인간치수세포에서 상아모세포 분화과정 동안 중요한 조절자로 사료된다.