Gunam, Ida Bagus Wayan;Yamamura, Kenta;Sujaya, I. Nengah;Antara, Nyoman Semadi;Aryanta, Wayan Redi;Tanaka, Michiko;Tomita, Fusao;Sone, Teruo;Asano, Kozo
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.23
no.4
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pp.473-482
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2013
The desulfurization ability of Sphingomonas subarctica T7b was evaluated using resting and immobilized cells with dibenzothiophene (DBT), alkyl DBTs, and commercial light gas oil (LGO) as the substrates. The resting cells of S. subarctica T7b degraded 239.2 mg of the initial 250 mg of DBT/l (1.36 mM) within 24 h at $27^{\circ}C$, while 127.5 mg of 2-hydroxybiphenyl (2-HBP)/l (0.75 mM) was formed, representing a 55% conversion of the DBT. The DBT desulfurization activity was significantly affected by the aqueous-to-oil phase ratio. In addition, the resting cells of S. subarctica T7b were able to desulfurize alkyl DBTs with long alkyl chains, although the desulfurization rate decreased with an increase in the total carbon number of the alkylated DBTs. LGO with a total sulfur content of 280 mg/l was desulfurized to 152 mg/l after 24 h of reaction. Cells immobilized by entrapment with polyvinyl alcohol (PVA) exhibited a high DBT desulfurization activity, including repeated use for more than 8 batch cycles without loss of biodesulfurization activity. The stability of the immobilized cells was better than that of the resting cells at different initial pHs, higher temperatures, and for DBT biodesulfurization in successive degradation cycles. The immobilized cells were also easily separated from the oil and water phases, giving this method great potential for oil biodesulfurization.
To gain a greater understanding of the potential for future harmful algal bloom (HAB) outbreaks and to trace the dispersal paths of dinoflagellates, sediment samples were collected from 13 stations in the southeastern Yellow Sea. 23 different types of dinoflagellate resting cysts were identified from the samples. Protoceratium reticulatum (1-391 cells/g dry weight), Gonyaulax scrippsae (0-254 cells/g dry weight), G. spinifera (0-301 cells/g dry weight) and Alexandrium spp. (ellipsoidal type) (0-76 cells/g dry weight) were the dominant species at all surveyed stations. The overall distribution pattern demonstrated that the resting cyst densities were highest in the offshore area and decreased gradually toward the Korean coast. On the other hand, the composition rate of resting cysts of the heterotrophic dinoflagellate species to the total dinoflagellates was higher in the Korean coast region than in the offshore area. We supposed that this distribution pattern of dinoflagellate resting cysts appeared to be influenced by the hydrographic features and environmental conditions of the Yellow Sea.
Joo Yeon Youn;Kyong Ha Han;Kyeong Yoon Kwak;Hyeon Ho Shin
Korean Journal of Environmental Biology
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v.41
no.4
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pp.608-615
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2023
The morphological features of germling cells were examined to identify an unspecified resting cyst (described as Cochlodinium cf. polykrikoides-like resting cyst) in the Korean coastal area. LSU rRNA gene sequences were also obtained from a strain established from the germling cells. The resting cysts isolated from Korean coastal sediment were characterized as being brown in color, having a large dark-red body, and fibrous lobed ornaments. The germling cells were ellipsoidal with an irregular outline and had an open comma-shaped ASC (apical structure complex), a wide and deep cingulum, and a deep sulcus. These morphological features were consistent with those of previously described harmful dinoflagellate Pseudocochlodinium profundisulcus. The molecular phylogeny revealed that the germling cells and P. profundisulcus were conspecific. Based on these morphological and phylogenetic data, this study documents the occurrence of P. profundisulcus in a Korean coastal area for the first time.
Kim, Dong-Hwa;Kim, Young-Jick;Shin, Ji-Won;Shin, Jung-Woog
Proceedings of the KSME Conference
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2008.11a
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pp.1580-1581
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2008
We investigated the effects of intermittent hydrostatic pressure with various duration of resting period on changes in calcium ($Ca^{2+}$) concentration and adhesive forces of cells on substrates. The quantitive adhesive forces of cells were measured under various resting periods. When the pressure applied to the cells, the concentration of $Ca^{2+}$ increased. Under intermittent hydrostatic pressure, the concentration of $Ca^{2+}$ was maintained under a resting period of 15 min, while it was not decreased with other resting periods of less than 15 min. With a resting period of 15 min, the magnitudes of adhesive forces were significantly increase. In addition, the adhesive forces were measured with and without $Ca^{2+}$ chelating agents to evaluate the effect of $Ca^{2+}$ on cell adhesiveness. When $Ca^{2+}$ ions were chelated, the adhesive forces dramatically decreased, even under intermittent hydrostatic pressure. We conclude that $Ca^{2+}$ plays an crucial role in modulating the adhesive forces of cells, and that the concentration of $Ca^{2+}$ can be increased by intermittent hydrostatic stimuli.
Membrane potential of cells in the isolated rabbit coronary sinus was measured by conventional glass microelectrode and investigated the effect of $[K^+]_0$ variation in control, 20 mM and Ach-containing Tyrode solution. The results obtained were as follows: 1) The resting membrane potential exposed to normal Tyrode solution containing 3 mM $K^+\;was\;about\;-60{\sim}\;-65mV$. At extracellular $K^+$ concentrations from 1 to 30 mM the resting Potential was reasonably well described by Goldman -Hodgkin -Katz equation on the assumption that $[K^+]_1$ was 150 mM and that the ratio of membrane permeability coefficient for $Na^+\;and\;K^+,\;P_{Na}/P_K\;({\alpha})$ was 0.07. 2) In 20 mM Na-Tyrode solution (replacing by equimolar Tris) the resting membrane potential was hyperpolarized by 15 to 20 mV and showed slightly deviated to depolarized direction compared to the predicted value by Goldman-Hodgkin -Katz equation. 3) In the presence of $10^{-6}M$ Ach, the resting potentials at $[K^+]_0$ levels from 1 to 30 mM were well fitted with the predicted value on the assumption that $P_{Na}/P_K$ was 0.0144. It could be concluded that the low resting membrane potential of coronary sinus cells reflects a relatively high ratio $P_{Na}/P_K$ of about 0.07.
Reactive humsn mesothelial cells were examined by immunocytochemical stain with intermediate filaments (cytokeratin [CK1, CK7, CK8, CK18, CD19), vimentin, desmin, actin), epithelial membrane antigen, carcinoembryonic antigen (CEA), MHC class II antigen (HLA-DR), LeuM-1 (CD15), $\alpha1-antitrypsin$(ACT), $\alpha1-antichymotrypsin$ (ACHT), CD68(KP-1) and FcyRIII(CD16). The mesothelial cells were isolated from patients with liver cirrhosis and pleural effusion, and short-term cultured in RPMI 1640 media containing 10% heat inactivated fetal calf serum and 1% identical supernatant fluid of the patients' transudates. The results obtained are as follows 1. The cultured-reactive mesothelial cells were positive for the protein of cytoskeleton such as cytokeratin and vimentin, but negative for desmin and actin. The resting mesothelial cells showed positive reactions for cylokeratin, but negative for vimentin, desmin and actin. 2. The primary antibodies to the cytokeratin were strongly reactive for CK1, CK8 and CK18 but negative for CK7 and CK19 in both reactive and resting mesothelial cells. 3. Resting mesothelial cells showed negative reactions for CEA, but strong positive reactions in cultured-reactive mesothelial cells. 4. The markers for the monocytes/histiocytes(CD11b, CD14, CD16, CD68, Iysozyme and $\alpha1-antitrypsin$ and $\alpha1-antichymotrypsin$) were nonreactive in resting mesothelial cells, but lysozyme and $\alpha1-antitrypsin$ were weakly reactive in reactive and proliferative mesothelial cells. 5. MHC Class II molecule(HLA-DR antigen) was negative in both resting and reactive mesothelial cells. These results suggest that the short-term cultured, reactive mesothelial cells show a newly aberrant expression of the vimentin and calcine-embryonic antigen. The reason of the aberrant expression of the intermediate filament and oncofetal antigen in reactive and proliferative mesothelial cells should be further evaluated.
The growth of subaerial microalgae on historic buildings or various cultural properties causes discoloration and physico-chemical deterioration of the surfaces. We collected a subaerial chlorophyte, Chlorella sp., from the stone Standing Buddha statue at Jungwon Miruksazi, which is a national treasure of Korea, and found dormant, thickwalled spores with regular pentagonal ornamentation along with the vegetative Chlorella cells. The morphology of Chlorella resting spores was compared to that of the other green algal resting cells. The ornamented spores and smooth-walled vegetative cells revived in 2 weeks in a liquid freshwater medium and started reproduction by autospores. To our knowledge, the ability of Chlorella to form ornamented dormant spores in drought condition was not previously recorded. The ornamentation of spores would supplement taxonomic characteristics of this genus.
Phomopsis sp. XP-8 (an endophytic fungus) was previously found to produce pinoresinol diglucoside (PDG), a major antihypertensive compound of Tu-Chung (the bark of Eucommia ulmoides Oliv.), which is widely used in Chinese traditional medicines. In the present study, two bioconversion systems were developed for the production of PDG in Tris-HCl buffer containing glucose and Phomopsis sp. XP-8 cells (both resting and freeze-dried). When other factors remained unchanged, the bioconversion time, glucose concentration, cell ages, cell dosage, pH, temperature, and stirring speed influenced PDG production in a similar and decreasing manner after an initial increase with increasing levels for each factor. Considering the simultaneous change of various factors, the optimal conditions for PDG production were established as 70 g/l cells (8-day-old), 14 g/l glucose, $28^{\circ}C$, pH 7.5, and 180 rpm for systems employing resting cells, and 3.87 g/l cells, 14.67 g/l glucose, $28^{\circ}C$, pH 7.5, and 180 rpm for systems employing freeze-dried cells. The systems employing freeze-dried cells showed lower peak PDG production ($110.28{\mu}g/l$), but at a much shorter time (12.65 h) compared with resting cells (23.62 mg/l, 91.5 h). The specific PDG production levels were 1.92 and $24{\mu}g$ per gram cells per gram glucose for freeze-dried cells and resting cells, respectively. Both systems indicated a new and potentially efficient way to produce PDG independent of microbial cell growth.
For the resolution of L-carnitine from DL-carnitine, resting cells of Enterobacter sp. NH-104, which had a higher capacity of D-carnitine decomposition, were harvested at maximal specific activity of D-carnitine decomposition of 47.05 unit/mg cell. The cells were frozen at $-80^{\circ}C$ to assess functions as enzyme sources. Optimal concentration of cells and DL-carnitine were 17 g/$\ell \; and \; 20 g/\ell$, respectively, and reaction buffer was best at 75 mM of Tris. HCl. Optimal temperature and pH were $36^{\circ}C$ and 8.2, respectively. When the reaction at optimal conditions was carried out for 14 h, the optical purity was 98.21 %, and the quantity and yield of remaining L-carnitine were 4.432 g/$\ell$ and 44.32%, respectively.
[ $CD8^+$ ] T Iymphocytes with the cytotoxic activity and capability to release various cytokines are the major players in immune responses against viral infection and cancer. To identify the proteins specific to resting or activated human CD8$^+$ T cells, human CD8$^+$ T cells were activated with anti-CD3+anti-CD28 mAb in the presence of IL-2. The solubilized proteins from resting and activated human CD8$^+$ T cells were separated by high-resolution two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis, and their proteomes were analyzed. Proteomic analysis of resting and activated T cells resulted in identification of 35 proteins with the altered expression. Mass spectrometry coupled with Profound and SWISS-PROT database analysis revealed that these identified proteins are to be functionally associated with cell proliferation, metabolic pathways, antigen presentation, and intracellular signal transduction pathways. We also identified six unknown proteins predicted from genomic DNA sequences specific to resting or activated CD8$^+$ T cells. Protein network studies and functional characterization of these novel proteins may provide new insight into the signaling transduction pathway of CD8$^+$ T cell activation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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